MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 88007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45501	NC_010159	GATG	2	8	2320444	2320451	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45502	NC_010159	GA	3	6	2320477	2320482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45503	NC_010159	AAG	2	6	2320536	2320541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45504	NC_010159	T	6	6	2320555	2320560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45505	NC_010159	CCT	2	6	2320597	2320602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45506	NC_010159	A	7	7	2320607	2320613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45507	NC_010159	A	7	7	2320690	2320696	100 %	0 %	0 %	0 %	162418253
45508	NC_010159	CAT	2	6	2320710	2320715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418253
45509	NC_010159	GGT	2	6	2320725	2320730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162418253
45510	NC_010159	AGC	3	9	2320734	2320742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418253
45511	NC_010159	GAT	2	6	2320797	2320802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418253
45512	NC_010159	ACTGA	2	10	2320804	2320813	40 %	20 %	20 %	20 %	162418253
45513	NC_010159	CAA	2	6	2320825	2320830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162418253
45514	NC_010159	AAG	2	6	2320844	2320849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418253
45515	NC_010159	GCGG	2	8	2320860	2320867	0 %	0 %	75 %	25 %	162418253
45516	NC_010159	A	6	6	2320873	2320878	100 %	0 %	0 %	0 %	162418253
45517	NC_010159	CAT	2	6	2320905	2320910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418253
45518	NC_010159	CAC	2	6	2320923	2320928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418253
45519	NC_010159	GCA	2	6	2320945	2320950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418253
45520	NC_010159	AGG	2	6	2320953	2320958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162418253
45521	NC_010159	TTCAA	2	10	2320970	2320979	40 %	40 %	0 %	20 %	162418253
45522	NC_010159	AATA	2	8	2321023	2321030	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45523	NC_010159	ATA	2	6	2321040	2321045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45524	NC_010159	T	6	6	2321099	2321104	0 %	100 %	0 %	0 %	162420612
45525	NC_010159	TTA	2	6	2321112	2321117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162420612
45526	NC_010159	CAAT	2	8	2321191	2321198	50 %	25 %	0 %	25 %	162420612
45527	NC_010159	T	6	6	2321214	2321219	0 %	100 %	0 %	0 %	162420612
45528	NC_010159	AGC	2	6	2321220	2321225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420612
45529	NC_010159	GCG	2	6	2321484	2321489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420612
45530	NC_010159	GGA	2	6	2321637	2321642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162420612
45531	NC_010159	CGG	2	6	2321659	2321664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420612
45532	NC_010159	GGC	2	6	2321752	2321757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420612
45533	NC_010159	TGTT	2	8	2321758	2321765	0 %	75 %	25 %	0 %	162420612
45534	NC_010159	ATC	2	6	2321777	2321782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420612
45535	NC_010159	A	6	6	2321789	2321794	100 %	0 %	0 %	0 %	162420612
45536	NC_010159	TCCG	2	8	2321825	2321832	0 %	25 %	25 %	50 %	162420612
45537	NC_010159	GGT	2	6	2321852	2321857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420612
45538	NC_010159	TAA	3	9	2321882	2321890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420612
45539	NC_010159	ATAA	2	8	2321901	2321908	75 %	25 %	0 %	0 %	162420612
45540	NC_010159	T	6	6	2321919	2321924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45541	NC_010159	ATC	2	6	2321937	2321942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45542	NC_010159	AC	3	6	2321948	2321953	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45543	NC_010159	GCT	2	6	2321973	2321978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45544	NC_010159	GGC	2	6	2322032	2322037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45545	NC_010159	TAAA	2	8	2322051	2322058	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45546	NC_010159	A	7	7	2322056	2322062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45547	NC_010159	AAT	2	6	2322099	2322104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45548	NC_010159	AAAT	2	8	2322108	2322115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45549	NC_010159	GCG	2	6	2322117	2322122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45550	NC_010159	A	6	6	2322145	2322150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45551	NC_010159	T	6	6	2322339	2322344	0 %	100 %	0 %	0 %	162419126
45552	NC_010159	T	6	6	2322365	2322370	0 %	100 %	0 %	0 %	162419126
45553	NC_010159	GTG	2	6	2322371	2322376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419126
45554	NC_010159	CTG	2	6	2322403	2322408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419126
45555	NC_010159	TAC	2	6	2322437	2322442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419126
45556	NC_010159	GCA	2	6	2322483	2322488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419126
45557	NC_010159	CAC	2	6	2322650	2322655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45558	NC_010159	TG	3	6	2322662	2322667	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45559	NC_010159	AGTG	2	8	2322728	2322735	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45560	NC_010159	TGC	2	6	2322749	2322754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45561	NC_010159	TAA	2	6	2322758	2322763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45562	NC_010159	AT	4	8	2322771	2322778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45563	NC_010159	TATT	2	8	2322779	2322786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45564	NC_010159	TGTA	2	8	2322792	2322799	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45565	NC_010159	TA	3	6	2322822	2322827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45566	NC_010159	AGTTG	2	10	2322834	2322843	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
45567	NC_010159	A	6	6	2322908	2322913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45568	NC_010159	AAC	2	6	2322970	2322975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45569	NC_010159	TGAT	2	8	2322984	2322991	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45570	NC_010159	AAT	2	6	2323007	2323012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45571	NC_010159	AT	3	6	2323030	2323035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45572	NC_010159	TA	3	6	2323038	2323043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45573	NC_010159	AAAT	2	8	2323044	2323051	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45574	NC_010159	TAA	2	6	2323066	2323071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45575	NC_010159	TGT	2	6	2323080	2323085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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45578	NC_010159	TGGT	2	8	2323168	2323175	0 %	50 %	50 %	0 %	162418554
45579	NC_010159	ATGG	2	8	2323212	2323219	25 %	25 %	50 %	0 %	162418554
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45581	NC_010159	TGGT	2	8	2323239	2323246	0 %	50 %	50 %	0 %	162418554
45582	NC_010159	TA	3	6	2323403	2323408	50 %	50 %	0 %	0 %	162418554
45583	NC_010159	TAT	2	6	2323676	2323681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45589	NC_010159	TGAAG	2	10	2324026	2324035	40 %	20 %	40 %	0 %	162418913
45590	NC_010159	CAGGG	2	10	2324118	2324127	20 %	0 %	60 %	20 %	162418913
45591	NC_010159	G	7	7	2324139	2324145	0 %	0 %	100 %	0 %	162418913
45592	NC_010159	AAG	2	6	2324226	2324231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418913
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45595	NC_010159	AG	4	8	2324440	2324447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45596	NC_010159	TCA	2	6	2324450	2324455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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45598	NC_010159	CT	3	6	2324494	2324499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45599	NC_010159	TGAA	2	8	2324554	2324561	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45600	NC_010159	AGG	2	6	2324593	2324598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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45602	NC_010159	TGGT	2	8	2324734	2324741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45603	NC_010159	T	6	6	2324848	2324853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45604	NC_010159	CTC	2	6	2324955	2324960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45605	NC_010159	T	6	6	2324997	2325002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45606	NC_010159	CCT	2	6	2325015	2325020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45607	NC_010159	GAA	2	6	2325029	2325034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45608	NC_010159	TCA	2	6	2325051	2325056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45609	NC_010159	TTTA	2	8	2325137	2325144	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45610	NC_010159	ATG	2	6	2325170	2325175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45611	NC_010159	GA	3	6	2325236	2325241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45612	NC_010159	CAC	2	6	2325247	2325252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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45616	NC_010159	TC	4	8	2325361	2325368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45617	NC_010159	ATT	2	6	2325430	2325435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45619	NC_010159	T	6	6	2325604	2325609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45625	NC_010159	TATT	2	8	2325779	2325786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45627	NC_010159	ATT	2	6	2325859	2325864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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