MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 88007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_010159	TTA	2	6	2238706	2238711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421638
44003	NC_010159	TATT	2	8	2238716	2238723	25 %	75 %	0 %	0 %	162421638
44004	NC_010159	ATTA	2	8	2238771	2238778	50 %	50 %	0 %	0 %	162421638
44005	NC_010159	GAA	2	6	2238826	2238831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421638
44006	NC_010159	TGA	2	6	2238864	2238869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421638
44007	NC_010159	AAG	2	6	2238905	2238910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421638
44008	NC_010159	TGAT	2	8	2238911	2238918	25 %	50 %	25 %	0 %	162421638
44009	NC_010159	AGC	2	6	2239030	2239035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421638
44010	NC_010159	AAAG	2	8	2239038	2239045	75 %	0 %	25 %	0 %	162421638
44011	NC_010159	CCA	2	6	2239049	2239054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421638
44012	NC_010159	GTT	2	6	2239111	2239116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421638
44013	NC_010159	ATG	2	6	2239208	2239213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421638
44014	NC_010159	GAA	2	6	2239258	2239263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421638
44015	NC_010159	ATC	2	6	2239274	2239279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421638
44016	NC_010159	TTG	2	6	2239304	2239309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421638
44017	NC_010159	CTG	2	6	2239352	2239357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421638
44018	NC_010159	TGC	3	9	2239383	2239391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421638
44019	NC_010159	CGCA	2	8	2239530	2239537	25 %	0 %	25 %	50 %	162421638
44020	NC_010159	TCA	2	6	2239566	2239571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421638
44021	NC_010159	CTGAT	2	10	2239577	2239586	20 %	40 %	20 %	20 %	162421638
44022	NC_010159	CCG	2	6	2239638	2239643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421638
44023	NC_010159	GGC	2	6	2239647	2239652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421638
44024	NC_010159	AGC	2	6	2239686	2239691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421638
44025	NC_010159	TAT	2	6	2239711	2239716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421638
44026	NC_010159	CGA	2	6	2239743	2239748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421638
44027	NC_010159	GAT	2	6	2239762	2239767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421638
44028	NC_010159	TGAA	2	8	2239781	2239788	50 %	25 %	25 %	0 %	162421638
44029	NC_010159	AAC	2	6	2239793	2239798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421638
44030	NC_010159	ATG	2	6	2239886	2239891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421638
44031	NC_010159	TGG	2	6	2239928	2239933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421638
44032	NC_010159	A	8	8	2239958	2239965	100 %	0 %	0 %	0 %	162421638
44033	NC_010159	CAC	2	6	2240090	2240095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421638
44034	NC_010159	ACTG	2	8	2240166	2240173	25 %	25 %	25 %	25 %	162421638
44035	NC_010159	ATG	2	6	2240174	2240179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421638
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44038	NC_010159	TGG	2	6	2240370	2240375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421638
44039	NC_010159	GGT	2	6	2240437	2240442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421638
44040	NC_010159	ATGGCA	2	12	2240495	2240506	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	162421638
44041	NC_010159	G	6	6	2240563	2240568	0 %	0 %	100 %	0 %	162421638
44042	NC_010159	AC	3	6	2240591	2240596	50 %	0 %	0 %	50 %	162421638
44043	NC_010159	GAA	2	6	2240610	2240615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421638
44044	NC_010159	GAT	2	6	2240662	2240667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421638
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44050	NC_010159	CGG	2	6	2240984	2240989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421638
44051	NC_010159	ATG	2	6	2241014	2241019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421638
44052	NC_010159	CTTT	2	8	2241091	2241098	0 %	75 %	0 %	25 %	162421638
44053	NC_010159	TTG	2	6	2241167	2241172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420113
44054	NC_010159	GAT	3	9	2241174	2241182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420113
44055	NC_010159	CGTT	2	8	2241215	2241222	0 %	50 %	25 %	25 %	162420113
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44062	NC_010159	TGG	2	6	2241594	2241599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420113
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44064	NC_010159	CGG	3	9	2241737	2241745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420113
44065	NC_010159	CAAAA	2	10	2241765	2241774	80 %	0 %	0 %	20 %	162420113
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44067	NC_010159	CGTTG	2	10	2241819	2241828	0 %	40 %	40 %	20 %	162420113
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44069	NC_010159	GGGTTT	2	12	2241869	2241880	0 %	50 %	50 %	0 %	162420113
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44073	NC_010159	TCAC	2	8	2242175	2242182	25 %	25 %	0 %	50 %	162420113
44074	NC_010159	GGT	2	6	2242284	2242289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420113
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44077	NC_010159	TATC	2	8	2242518	2242525	25 %	50 %	0 %	25 %	162420113
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44084	NC_010159	GATG	2	8	2243018	2243025	25 %	25 %	50 %	0 %	162420113
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44093	NC_010159	GA	3	6	2243310	2243315	50 %	0 %	50 %	0 %	162420902
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44100	NC_010159	ATTG	2	8	2243743	2243750	25 %	50 %	25 %	0 %	162420902
44101	NC_010159	CGC	2	6	2243845	2243850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420902
44102	NC_010159	GATATT	2	12	2243909	2243920	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	162420902
44103	NC_010159	TTC	2	6	2243954	2243959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420902
44104	NC_010159	CCG	2	6	2244091	2244096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420902
44105	NC_010159	GCT	2	6	2244103	2244108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420902
44106	NC_010159	GCC	2	6	2244196	2244201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420902
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44109	NC_010159	AAGCGT	2	12	2244419	2244430	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	162420902
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44112	NC_010159	GAC	2	6	2244654	2244659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421921
44113	NC_010159	CGT	2	6	2244696	2244701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421921
44114	NC_010159	GAT	3	9	2244772	2244780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421921
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44116	NC_010159	ATG	2	6	2244857	2244862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421921
44117	NC_010159	GC	3	6	2244944	2244949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44118	NC_010159	TAT	2	6	2244955	2244960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44119	NC_010159	TGAG	2	8	2244985	2244992	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44120	NC_010159	TAT	2	6	2244993	2244998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44121	NC_010159	TCA	2	6	2245048	2245053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44122	NC_010159	AATT	2	8	2245061	2245068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44123	NC_010159	ACC	2	6	2245114	2245119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44124	NC_010159	C	8	8	2245172	2245179	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44125	NC_010159	AGG	2	6	2245225	2245230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44126	NC_010159	AAG	2	6	2245231	2245236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44127	NC_010159	TTA	2	6	2245274	2245279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162420333
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44137	NC_010159	ATG	2	6	2245699	2245704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420333
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44145	NC_010159	GCC	2	6	2246143	2246148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420333
44146	NC_010159	TATT	2	8	2246183	2246190	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44147	NC_010159	T	7	7	2246189	2246195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44148	NC_010159	A	7	7	2246236	2246242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44149	NC_010159	CAT	2	6	2246303	2246308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44150	NC_010159	A	6	6	2246328	2246333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44151	NC_010159	TTA	2	6	2246347	2246352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44152	NC_010159	T	7	7	2246353	2246359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44153	NC_010159	ATC	2	6	2246402	2246407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44154	NC_010159	AG	3	6	2246532	2246537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44155	NC_010159	CAA	2	6	2246682	2246687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44156	NC_010159	CGA	2	6	2246916	2246921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419053
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44200	NC_010159	TTGG	2	8	2249615	2249622	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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44203	NC_010159	A	7	7	2249738	2249744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44209	NC_010159	TTAA	2	8	2249853	2249860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44215	NC_010159	TAA	3	9	2250321	2250329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421703
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44224	NC_010159	TTTAT	2	10	2250962	2250971	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44225	NC_010159	ATT	2	6	2250982	2250987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44226	NC_010159	ATT	2	6	2250994	2250999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44227	NC_010159	A	7	7	2251023	2251029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44228	NC_010159	CAA	2	6	2251047	2251052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44229	NC_010159	AG	3	6	2251053	2251058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44230	NC_010159	AAT	2	6	2251066	2251071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44231	NC_010159	T	6	6	2251080	2251085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44232	NC_010159	TAA	2	6	2251122	2251127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44233	NC_010159	TAAA	2	8	2251145	2251152	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44234	NC_010159	AAAAT	2	10	2251184	2251193	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44235	NC_010159	TC	3	6	2251235	2251240	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44236	NC_010159	CAAAA	2	10	2251290	2251299	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
44237	NC_010159	TTA	2	6	2251320	2251325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44238	NC_010159	ATA	2	6	2251328	2251333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44239	NC_010159	AAC	2	6	2251364	2251369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421706
44240	NC_010159	GATGCT	2	12	2251377	2251388	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	162421706
44241	NC_010159	GCA	2	6	2251473	2251478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421706
44242	NC_010159	TTC	2	6	2251523	2251528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44243	NC_010159	ACG	2	6	2251540	2251545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44244	NC_010159	CCA	2	6	2251571	2251576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44245	NC_010159	TCTG	2	8	2251642	2251649	0 %	50 %	25 %	25 %	162420468
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44255	NC_010159	CGT	2	6	2251910	2251915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420468
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44285	NC_010159	CCAT	2	8	2253501	2253508	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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44289	NC_010159	CCT	2	6	2253771	2253776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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44339	NC_010159	TA	3	6	2256115	2256120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44340	NC_010159	TCG	2	6	2256255	2256260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421885
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44343	NC_010159	CT	3	6	2256309	2256314	0 %	50 %	0 %	50 %	162421885
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44348	NC_010159	TTAA	2	8	2256444	2256451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44349	NC_010159	AAAT	2	8	2256505	2256512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44350	NC_010159	ATTT	2	8	2256536	2256543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44351	NC_010159	TAAAT	2	10	2256548	2256557	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44352	NC_010159	TTAAT	2	10	2256583	2256592	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44353	NC_010159	AT	3	6	2256614	2256619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44354	NC_010159	AAT	2	6	2256626	2256631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44355	NC_010159	GGC	2	6	2256646	2256651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44356	NC_010159	CAA	3	9	2256689	2256697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44357	NC_010159	TTGC	2	8	2256745	2256752	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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44359	NC_010159	TAT	2	6	2256877	2256882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44479	NC_010159	A	7	7	2263255	2263261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44480	NC_010159	CCA	2	6	2263270	2263275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44481	NC_010159	CAG	2	6	2263429	2263434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418659
44482	NC_010159	CAAC	2	8	2263465	2263472	50 %	0 %	0 %	50 %	162418659
44483	NC_010159	ACA	2	6	2263601	2263606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162418659
44484	NC_010159	T	6	6	2263635	2263640	0 %	100 %	0 %	0 %	162418659
44485	NC_010159	ATC	2	6	2263679	2263684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418659
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44491	NC_010159	A	6	6	2263918	2263923	100 %	0 %	0 %	0 %	162418659
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44493	NC_010159	CT	4	8	2264033	2264040	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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44495	NC_010159	TAAAT	2	10	2264178	2264187	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44496	NC_010159	TAAG	2	8	2264211	2264218	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44497	NC_010159	CAC	2	6	2264239	2264244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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44499	NC_010159	CG	3	6	2264302	2264307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44500	NC_010159	TATCC	2	10	2264367	2264376	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding

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