MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 88007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43002	NC_010159	GCG	2	6	2190386	2190391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421511
43003	NC_010159	GCA	2	6	2190482	2190487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421511
43004	NC_010159	CGC	2	6	2190608	2190613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421511
43005	NC_010159	CG	3	6	2190622	2190627	0 %	0 %	50 %	50 %	162421511
43006	NC_010159	ATC	2	6	2190628	2190633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421511
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43010	NC_010159	CGCC	2	8	2190732	2190739	0 %	0 %	25 %	75 %	162421511
43011	NC_010159	GC	3	6	2190775	2190780	0 %	0 %	50 %	50 %	162421511
43012	NC_010159	GCG	2	6	2190793	2190798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421511
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43016	NC_010159	GTGG	2	8	2191035	2191042	0 %	25 %	75 %	0 %	162421511
43017	NC_010159	CTG	2	6	2191051	2191056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421511
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43117	NC_010159	ATG	2	6	2194722	2194727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420704
43118	NC_010159	CTG	3	9	2194740	2194748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420704
43119	NC_010159	GTCCA	2	10	2194773	2194782	20 %	20 %	20 %	40 %	162420704
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43121	NC_010159	GTCT	2	8	2194803	2194810	0 %	50 %	25 %	25 %	162420704
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43127	NC_010159	CGA	2	6	2195128	2195133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43128	NC_010159	AGA	3	9	2195159	2195167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43129	NC_010159	TGA	2	6	2195264	2195269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43130	NC_010159	GC	3	6	2195311	2195316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43131	NC_010159	GCG	2	6	2195382	2195387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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43134	NC_010159	CCG	2	6	2195497	2195502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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43138	NC_010159	GC	4	8	2195613	2195620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43139	NC_010159	CCG	2	6	2195633	2195638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43140	NC_010159	CG	3	6	2195665	2195670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43141	NC_010159	GGCA	2	8	2195722	2195729	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43142	NC_010159	AC	3	6	2195731	2195736	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43143	NC_010159	AGGA	2	8	2195761	2195768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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43145	NC_010159	CTG	2	6	2195898	2195903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43147	NC_010159	GTG	2	6	2195988	2195993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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43149	NC_010159	CGC	2	6	2196175	2196180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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43152	NC_010159	GCT	2	6	2196271	2196276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43157	NC_010159	ACC	2	6	2196519	2196524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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43159	NC_010159	ACC	2	6	2196648	2196653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418528
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43192	NC_010159	TGAT	2	8	2198188	2198195	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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43198	NC_010159	ATA	2	6	2198487	2198492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43204	NC_010159	AGAC	2	8	2198804	2198811	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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43230	NC_010159	ATA	2	6	2200449	2200454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43231	NC_010159	ATGC	2	8	2200457	2200464	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43232	NC_010159	AC	3	6	2200494	2200499	50 %	0 %	0 %	50 %	162420017
43233	NC_010159	CT	3	6	2200581	2200586	0 %	50 %	0 %	50 %	162420017
43234	NC_010159	CTC	2	6	2200616	2200621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162420017
43235	NC_010159	ACG	2	6	2200707	2200712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420017
43236	NC_010159	GA	4	8	2200874	2200881	50 %	0 %	50 %	0 %	162420017
43237	NC_010159	GT	3	6	2200882	2200887	0 %	50 %	50 %	0 %	162420017
43238	NC_010159	CAC	2	6	2200969	2200974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420017
43239	NC_010159	CGC	2	6	2201032	2201037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420017
43240	NC_010159	TGG	2	6	2201119	2201124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420017
43241	NC_010159	GTTG	2	8	2201165	2201172	0 %	50 %	50 %	0 %	162420017
43242	NC_010159	CTG	2	6	2201265	2201270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420017
43243	NC_010159	GGAA	2	8	2201320	2201327	50 %	0 %	50 %	0 %	162420017
43244	NC_010159	GT	3	6	2201362	2201367	0 %	50 %	50 %	0 %	162420017
43245	NC_010159	CTG	2	6	2201438	2201443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420017
43246	NC_010159	ATC	2	6	2201522	2201527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420017
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43253	NC_010159	ATC	2	6	2202272	2202277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420017
43254	NC_010159	GC	3	6	2202375	2202380	0 %	0 %	50 %	50 %	162420017
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43257	NC_010159	CTT	2	6	2202757	2202762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420017
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43259	NC_010159	ACAG	2	8	2202789	2202796	50 %	0 %	25 %	25 %	162420017
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43262	NC_010159	TGT	2	6	2202856	2202861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420017
43263	NC_010159	CGT	2	6	2202892	2202897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420017
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43267	NC_010159	AT	3	6	2202970	2202975	50 %	50 %	0 %	0 %	162420017
43268	NC_010159	GTC	2	6	2202977	2202982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420017
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43286	NC_010159	CTGC	2	8	2203895	2203902	0 %	25 %	25 %	50 %	162419196
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43294	NC_010159	T	7	7	2204376	2204382	0 %	100 %	0 %	0 %	162419196
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43297	NC_010159	A	6	6	2204601	2204606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43298	NC_010159	TA	3	6	2204681	2204686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43299	NC_010159	A	9	9	2204711	2204719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43300	NC_010159	AAG	2	6	2204724	2204729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43301	NC_010159	TAA	2	6	2204820	2204825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43302	NC_010159	GCT	2	6	2204875	2204880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43303	NC_010159	ATCA	2	8	2204943	2204950	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43304	NC_010159	CTGC	2	8	2205025	2205032	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43305	NC_010159	GAC	2	6	2205041	2205046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43308	NC_010159	C	7	7	2205243	2205249	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43309	NC_010159	T	7	7	2205349	2205355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43310	NC_010159	TCT	2	6	2205391	2205396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43311	NC_010159	CATT	2	8	2205497	2205504	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43312	NC_010159	TGC	2	6	2205522	2205527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43313	NC_010159	TTC	2	6	2205531	2205536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43317	NC_010159	TTA	2	6	2205644	2205649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43329	NC_010159	TCG	2	6	2206111	2206116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43331	NC_010159	CCAA	2	8	2206247	2206254	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43332	NC_010159	GAT	2	6	2206383	2206388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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43334	NC_010159	CTGA	2	8	2206614	2206621	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43335	NC_010159	AGCC	2	8	2206627	2206634	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43336	NC_010159	ATT	2	6	2206656	2206661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43337	NC_010159	AAT	2	6	2206668	2206673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43338	NC_010159	TTGA	2	8	2206821	2206828	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43339	NC_010159	CAC	2	6	2206889	2206894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43340	NC_010159	GAAT	2	8	2206904	2206911	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43341	NC_010159	CTG	2	6	2206944	2206949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43342	NC_010159	CAA	2	6	2206965	2206970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43343	NC_010159	AGC	2	6	2207018	2207023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43344	NC_010159	ATC	2	6	2207045	2207050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43345	NC_010159	TCA	2	6	2207075	2207080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43346	NC_010159	CACT	2	8	2207111	2207118	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43347	NC_010159	GGTTA	2	10	2207119	2207128	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
43348	NC_010159	AAT	2	6	2207167	2207172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43349	NC_010159	CAT	2	6	2207212	2207217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43350	NC_010159	AGT	2	6	2207280	2207285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43351	NC_010159	TCA	2	6	2207292	2207297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43352	NC_010159	CAA	2	6	2207367	2207372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43353	NC_010159	TAA	2	6	2207403	2207408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43354	NC_010159	TGC	2	6	2207409	2207414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43355	NC_010159	GAG	3	9	2207525	2207533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43356	NC_010159	ATT	2	6	2207539	2207544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43357	NC_010159	CAA	2	6	2207568	2207573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43358	NC_010159	TAA	2	6	2207578	2207583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43360	NC_010159	TCCGG	2	10	2207710	2207719	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
43361	NC_010159	CAC	2	6	2207767	2207772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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43482	NC_010159	CGG	2	6	2213207	2213212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418162
43483	NC_010159	TGT	2	6	2213260	2213265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418162
43484	NC_010159	TCA	2	6	2213360	2213365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418162
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43486	NC_010159	TGAA	2	8	2213472	2213479	50 %	25 %	25 %	0 %	162418162
43487	NC_010159	GCTC	2	8	2213481	2213488	0 %	25 %	25 %	50 %	162418162
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