MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 88007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20119	NC_010159	CG	4	8	1027429	1027436	0 %	0 %	50 %	50 %	162421293
20120	NC_010159	GC	3	6	1027461	1027466	0 %	0 %	50 %	50 %	162421293
20121	NC_010159	CGGC	2	8	1027484	1027491	0 %	0 %	50 %	50 %	162421293
20122	NC_010159	GCC	2	6	1027545	1027550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421293
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20125	NC_010159	GCC	2	6	1027608	1027613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421293
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20132	NC_010159	CTGA	2	8	1027934	1027941	25 %	25 %	25 %	25 %	162421293
20133	NC_010159	ACC	2	6	1028013	1028018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421293
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20136	NC_010159	CGGAG	2	10	1028360	1028369	20 %	0 %	60 %	20 %	162421293
20137	NC_010159	ATC	2	6	1028429	1028434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421293
20138	NC_010159	TCA	2	6	1028505	1028510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421293
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20152	NC_010159	CTCA	2	8	1028909	1028916	25 %	25 %	0 %	50 %	162421293
20153	NC_010159	CAT	2	6	1028987	1028992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421293
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20178	NC_010159	CCTT	2	8	1030496	1030503	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20179	NC_010159	AAT	2	6	1030530	1030535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419894
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20189	NC_010159	CGT	2	6	1030997	1031002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419894
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20191	NC_010159	GCT	3	9	1031282	1031290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419973
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20209	NC_010159	TGATT	2	10	1031986	1031995	20 %	60 %	20 %	0 %	162419973
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20211	NC_010159	TA	3	6	1032053	1032058	50 %	50 %	0 %	0 %	162419973
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20215	NC_010159	AGTA	2	8	1032308	1032315	50 %	25 %	25 %	0 %	162419973
20216	NC_010159	TTAT	2	8	1032355	1032362	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20217	NC_010159	TGA	2	6	1032446	1032451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419203
20218	NC_010159	AG	3	6	1032500	1032505	50 %	0 %	50 %	0 %	162419203
20219	NC_010159	GTC	2	6	1032548	1032553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419203
20220	NC_010159	ATT	2	6	1032576	1032581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419203
20221	NC_010159	TGG	2	6	1032676	1032681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420585
20222	NC_010159	GCG	2	6	1032682	1032687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420585
20223	NC_010159	CTG	3	9	1032699	1032707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420585
20224	NC_010159	CAC	2	6	1032734	1032739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420585
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20227	NC_010159	CCA	2	6	1032860	1032865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420585
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20230	NC_010159	CTC	2	6	1032899	1032904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162420585
20231	NC_010159	CAG	2	6	1032906	1032911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420585
20232	NC_010159	TGC	2	6	1032928	1032933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420585
20233	NC_010159	ACA	2	6	1032937	1032942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162420585
20234	NC_010159	GAT	2	6	1032960	1032965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420585
20235	NC_010159	CTA	2	6	1032998	1033003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420585
20236	NC_010159	CGG	2	6	1033037	1033042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420585
20237	NC_010159	TAT	2	6	1033064	1033069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162420585
20238	NC_010159	TGC	2	6	1033120	1033125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420585
20239	NC_010159	CCCG	3	12	1033217	1033228	0 %	0 %	25 %	75 %	162420585
20240	NC_010159	GAG	2	6	1033236	1033241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162420585
20241	NC_010159	GCT	2	6	1033250	1033255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420585
20242	NC_010159	CGGCTA	2	12	1033262	1033273	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	162420585
20243	NC_010159	ACC	2	6	1033402	1033407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420585
20244	NC_010159	CTT	2	6	1033439	1033444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420585
20245	NC_010159	GCG	2	6	1033449	1033454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420585
20246	NC_010159	TGCATT	2	12	1033523	1033534	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	162420585
20247	NC_010159	ATGA	2	8	1033539	1033546	50 %	25 %	25 %	0 %	162420585
20248	NC_010159	GTT	2	6	1033616	1033621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420585
20249	NC_010159	CGT	2	6	1033638	1033643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420585
20250	NC_010159	GGC	2	6	1033688	1033693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420585
20251	NC_010159	A	7	7	1033726	1033732	100 %	0 %	0 %	0 %	162420585
20252	NC_010159	GTG	2	6	1033757	1033762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420585
20253	NC_010159	CGC	2	6	1033851	1033856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420585
20254	NC_010159	AAG	2	6	1033879	1033884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420585
20255	NC_010159	ACA	2	6	1033947	1033952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421637
20256	NC_010159	TAG	2	6	1034000	1034005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421637
20257	NC_010159	CCA	2	6	1034095	1034100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421637
20258	NC_010159	CA	4	8	1034116	1034123	50 %	0 %	0 %	50 %	162421637
20259	NC_010159	AGC	2	6	1034159	1034164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421637
20260	NC_010159	CTGGAT	2	12	1034182	1034193	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	162421637
20261	NC_010159	TGT	2	6	1034198	1034203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421637
20262	NC_010159	CA	3	6	1034391	1034396	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20263	NC_010159	TTC	2	6	1034430	1034435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20264	NC_010159	TTG	2	6	1034606	1034611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420296
20265	NC_010159	GTT	2	6	1034617	1034622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420296
20266	NC_010159	TGA	2	6	1034646	1034651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420296
20267	NC_010159	ACC	3	9	1034654	1034662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420296
20268	NC_010159	ATG	2	6	1034721	1034726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418863
20269	NC_010159	TGG	2	6	1034772	1034777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162418863
20270	NC_010159	GTG	2	6	1034868	1034873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162418863
20271	NC_010159	GCTG	2	8	1034997	1035004	0 %	25 %	50 %	25 %	162418863
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20273	NC_010159	CGG	2	6	1035088	1035093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418863
20274	NC_010159	GAA	2	6	1035113	1035118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418863
20275	NC_010159	GGC	2	6	1035121	1035126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418863
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20278	NC_010159	ATG	2	6	1035294	1035299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418863
20279	NC_010159	CA	3	6	1035351	1035356	50 %	0 %	0 %	50 %	162418863
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20282	NC_010159	G	7	7	1035406	1035412	0 %	0 %	100 %	0 %	162418863
20283	NC_010159	CTG	2	6	1035420	1035425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418863
20284	NC_010159	TCT	2	6	1035462	1035467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20285	NC_010159	TCC	2	6	1035493	1035498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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20298	NC_010159	GAA	3	9	1036115	1036123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418333
20299	NC_010159	GGC	2	6	1036216	1036221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418333
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20302	NC_010159	TGAT	2	8	1036353	1036360	25 %	50 %	25 %	0 %	162418333
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20304	NC_010159	GTGA	2	8	1036538	1036545	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20305	NC_010159	GA	3	6	1036544	1036549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20306	NC_010159	AATGA	2	10	1036574	1036583	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20307	NC_010159	CAA	2	6	1036589	1036594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20308	NC_010159	ATCA	2	8	1036615	1036622	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20309	NC_010159	T	6	6	1036661	1036666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20310	NC_010159	ATCT	2	8	1036703	1036710	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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20313	NC_010159	GCA	2	6	1037020	1037025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419985
20314	NC_010159	TGC	3	9	1037082	1037090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419985
20315	NC_010159	CAC	2	6	1037098	1037103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419985
20316	NC_010159	ATA	2	6	1037247	1037252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20317	NC_010159	TAAA	2	8	1037274	1037281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20318	NC_010159	CCTT	2	8	1037286	1037293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20319	NC_010159	CCGGG	2	10	1037368	1037377	0 %	0 %	60 %	40 %	162419420
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20327	NC_010159	TTCAG	2	10	1037727	1037736	20 %	40 %	20 %	20 %	162419420
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20334	NC_010159	GTT	2	6	1038326	1038331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419420
20335	NC_010159	T	7	7	1038330	1038336	0 %	100 %	0 %	0 %	162419420
20336	NC_010159	TTA	2	6	1038342	1038347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419420
20337	NC_010159	ATC	2	6	1038359	1038364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419420
20338	NC_010159	CTT	2	6	1038445	1038450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419420
20339	NC_010159	ACCA	2	8	1038479	1038486	50 %	0 %	0 %	50 %	162419420
20340	NC_010159	TCA	2	6	1038514	1038519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419420
20341	NC_010159	TGG	2	6	1038527	1038532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419420
20342	NC_010159	ATT	2	6	1038579	1038584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419420
20343	NC_010159	TGTT	2	8	1038640	1038647	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20344	NC_010159	GA	3	6	1038708	1038713	50 %	0 %	50 %	0 %	162419215
20345	NC_010159	ATTT	2	8	1038751	1038758	25 %	75 %	0 %	0 %	162419215
20346	NC_010159	AGGGA	2	10	1038832	1038841	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
20347	NC_010159	TCAA	2	8	1038872	1038879	50 %	25 %	0 %	25 %	162419122
20348	NC_010159	CCACGC	2	12	1038883	1038894	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	162419122
20349	NC_010159	CTGC	2	8	1039017	1039024	0 %	25 %	25 %	50 %	162419122
20350	NC_010159	AAT	2	6	1039037	1039042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419122
20351	NC_010159	TCA	2	6	1039112	1039117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419122
20352	NC_010159	CAA	2	6	1039141	1039146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419122
20353	NC_010159	TCC	2	6	1039147	1039152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162419122
20354	NC_010159	GAA	2	6	1039225	1039230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162419122
20355	NC_010159	CG	3	6	1039269	1039274	0 %	0 %	50 %	50 %	162419122
20356	NC_010159	CCACC	2	10	1039275	1039284	20 %	0 %	0 %	80 %	162419122
20357	NC_010159	ATA	2	6	1039298	1039303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419122
20358	NC_010159	GCC	2	6	1039376	1039381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419122
20359	NC_010159	CAT	2	6	1039411	1039416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419122
20360	NC_010159	C	6	6	1039454	1039459	0 %	0 %	0 %	100 %	162419122
20361	NC_010159	AG	3	6	1039506	1039511	50 %	0 %	50 %	0 %	162419122
20362	NC_010159	TC	3	6	1039622	1039627	0 %	50 %	0 %	50 %	162419863
20363	NC_010159	TGG	2	6	1039883	1039888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419863
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20366	NC_010159	CGT	2	6	1039962	1039967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419863
20367	NC_010159	AAT	2	6	1039971	1039976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419863
20368	NC_010159	CGT	2	6	1039977	1039982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419863
20369	NC_010159	CCG	2	6	1040045	1040050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419863
20370	NC_010159	ATC	2	6	1040101	1040106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419863
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20372	NC_010159	ACTG	2	8	1040171	1040178	25 %	25 %	25 %	25 %	162419863
20373	NC_010159	GTA	2	6	1040223	1040228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419863
20374	NC_010159	AAATT	2	10	1040275	1040284	60 %	40 %	0 %	0 %	162419863
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20383	NC_010159	TGA	2	6	1040768	1040773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418254
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20389	NC_010159	TTC	2	6	1041029	1041034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162418254
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20392	NC_010159	TTG	2	6	1041166	1041171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418254
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20409	NC_010159	ACCGAT	2	12	1042169	1042180	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20410	NC_010159	AC	3	6	1042215	1042220	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20411	NC_010159	AGG	2	6	1042224	1042229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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20418	NC_010159	ACCG	2	8	1043035	1043042	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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20443	NC_010159	GAT	2	6	1044670	1044675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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20445	NC_010159	AC	3	6	1044781	1044786	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20446	NC_010159	GTC	2	6	1044789	1044794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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20452	NC_010159	TG	3	6	1044927	1044932	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20453	NC_010159	AATA	2	8	1044948	1044955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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20469	NC_010159	A	7	7	1045667	1045673	100 %	0 %	0 %	0 %	162420219
20470	NC_010159	ATC	2	6	1045680	1045685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420219
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20472	NC_010159	GCC	2	6	1045720	1045725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420219
20473	NC_010159	TGG	2	6	1045750	1045755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420219
20474	NC_010159	GCC	2	6	1045783	1045788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420219
20475	NC_010159	CGA	2	6	1045847	1045852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420219
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20477	NC_010159	G	7	7	1045985	1045991	0 %	0 %	100 %	0 %	162420219
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20479	NC_010159	CGG	2	6	1046114	1046119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420219
20480	NC_010159	TAT	2	6	1046120	1046125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162420219
20481	NC_010159	CTA	2	6	1046219	1046224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420219
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20485	NC_010159	A	6	6	1046354	1046359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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