MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 88007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_010159	TCA	2	6	686134	686139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13502	NC_010159	CT	3	6	686210	686215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13503	NC_010159	GGA	2	6	686324	686329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13504	NC_010159	TC	3	6	686334	686339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13505	NC_010159	GAG	2	6	686373	686378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_010159	GTT	2	6	686396	686401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13507	NC_010159	ATT	2	6	686418	686423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13508	NC_010159	AGG	2	6	686449	686454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13509	NC_010159	ATAA	2	8	686455	686462	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13510	NC_010159	TTA	2	6	686498	686503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13511	NC_010159	T	7	7	686507	686513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13512	NC_010159	G	7	7	686533	686539	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13513	NC_010159	TTAA	2	8	686605	686612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13514	NC_010159	TAA	2	6	686639	686644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13515	NC_010159	ATG	2	6	686656	686661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13516	NC_010159	ATA	2	6	686731	686736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13517	NC_010159	TACT	2	8	686746	686753	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13518	NC_010159	TTC	2	6	686761	686766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13519	NC_010159	GCC	2	6	686890	686895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13520	NC_010159	TAT	2	6	686907	686912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13521	NC_010159	TGT	2	6	686938	686943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13522	NC_010159	AGC	2	6	687182	687187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419578
13523	NC_010159	TTA	2	6	687227	687232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419578
13524	NC_010159	GGA	2	6	687351	687356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162419578
13525	NC_010159	TGG	2	6	687383	687388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419578
13526	NC_010159	GTG	2	6	687425	687430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419578
13527	NC_010159	GGC	2	6	687461	687466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419578
13528	NC_010159	T	7	7	687533	687539	0 %	100 %	0 %	0 %	162419578
13529	NC_010159	CGC	2	6	687548	687553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419578
13530	NC_010159	GCA	2	6	687603	687608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13531	NC_010159	AGCT	2	8	687711	687718	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13532	NC_010159	CGT	2	6	687724	687729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13533	NC_010159	CTG	4	12	687826	687837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419104
13534	NC_010159	TGCG	2	8	687926	687933	0 %	25 %	50 %	25 %	162419104
13535	NC_010159	GT	3	6	687939	687944	0 %	50 %	50 %	0 %	162419104
13536	NC_010159	AG	3	6	688032	688037	50 %	0 %	50 %	0 %	162419104
13537	NC_010159	CT	3	6	688066	688071	0 %	50 %	0 %	50 %	162419104
13538	NC_010159	TTTGG	2	10	688072	688081	0 %	60 %	40 %	0 %	162419104
13539	NC_010159	GGT	2	6	688179	688184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419104
13540	NC_010159	GCA	2	6	688192	688197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419104
13541	NC_010159	TGGT	2	8	688200	688207	0 %	50 %	50 %	0 %	162419104
13542	NC_010159	GCC	2	6	688225	688230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419104
13543	NC_010159	CTG	2	6	688254	688259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419104
13544	NC_010159	CTG	2	6	688281	688286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419104
13545	NC_010159	TGC	2	6	688400	688405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419104
13546	NC_010159	TTA	3	9	688417	688425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419104
13547	NC_010159	TGG	2	6	688427	688432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419104
13548	NC_010159	TGGC	2	8	688437	688444	0 %	25 %	50 %	25 %	162419104
13549	NC_010159	TCA	2	6	688503	688508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419104
13550	NC_010159	AGCGTG	2	12	688526	688537	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	162419104
13551	NC_010159	AAT	2	6	688564	688569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419104
13552	NC_010159	GGTT	2	8	688577	688584	0 %	50 %	50 %	0 %	162419104
13553	NC_010159	GGTAAT	2	12	688694	688705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13554	NC_010159	TCC	2	6	688711	688716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13555	NC_010159	TTAC	2	8	688811	688818	25 %	50 %	0 %	25 %	162418713
13556	NC_010159	CA	3	6	689093	689098	50 %	0 %	0 %	50 %	162418713
13557	NC_010159	TTG	2	6	689290	689295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418713
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13559	NC_010159	GCA	2	6	689724	689729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420940
13560	NC_010159	GCG	2	6	689765	689770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420940
13561	NC_010159	TTG	2	6	689797	689802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420940
13562	NC_010159	AAG	2	6	689829	689834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420940
13563	NC_010159	TGA	2	6	689961	689966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420420
13564	NC_010159	CAA	2	6	689981	689986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162420420
13565	NC_010159	GC	3	6	690000	690005	0 %	0 %	50 %	50 %	162420420
13566	NC_010159	AATC	2	8	690118	690125	50 %	25 %	0 %	25 %	162420420
13567	NC_010159	CGA	2	6	690162	690167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420420
13568	NC_010159	ACTG	2	8	690290	690297	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13569	NC_010159	CTG	2	6	690330	690335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13570	NC_010159	CTG	2	6	690390	690395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13571	NC_010159	ACTT	2	8	690444	690451	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13572	NC_010159	CA	3	6	690469	690474	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13573	NC_010159	CAC	2	6	690504	690509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13574	NC_010159	ATC	2	6	690542	690547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419609
13575	NC_010159	CGT	2	6	690661	690666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419609
13576	NC_010159	GTTT	2	8	690677	690684	0 %	75 %	25 %	0 %	162419609
13577	NC_010159	ATCG	2	8	690692	690699	25 %	25 %	25 %	25 %	162419609
13578	NC_010159	CGG	2	6	690774	690779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419609
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13581	NC_010159	ATT	2	6	690927	690932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13582	NC_010159	CCT	2	6	690936	690941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13583	NC_010159	TG	3	6	690982	690987	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13584	NC_010159	T	6	6	691088	691093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13585	NC_010159	TCAA	2	8	691186	691193	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13586	NC_010159	CAA	2	6	691211	691216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13587	NC_010159	AAT	2	6	691237	691242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13588	NC_010159	A	7	7	691289	691295	100 %	0 %	0 %	0 %	162418951
13589	NC_010159	ATT	2	6	691364	691369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162418951
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13591	NC_010159	CAT	2	6	691429	691434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418951
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13593	NC_010159	TGA	2	6	691485	691490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418951
13594	NC_010159	AAGTA	2	10	691591	691600	60 %	20 %	20 %	0 %	162418951
13595	NC_010159	C	6	6	691671	691676	0 %	0 %	0 %	100 %	162418951
13596	NC_010159	TCAA	2	8	691710	691717	50 %	25 %	0 %	25 %	162418951
13597	NC_010159	TCA	2	6	691755	691760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418951
13598	NC_010159	CATG	2	8	691828	691835	25 %	25 %	25 %	25 %	162418951
13599	NC_010159	CTGC	2	8	691864	691871	0 %	25 %	25 %	50 %	162418951
13600	NC_010159	AGA	2	6	691927	691932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418951
13601	NC_010159	ACAA	2	8	692048	692055	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13602	NC_010159	TTC	2	6	692150	692155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13603	NC_010159	AT	3	6	692160	692165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13604	NC_010159	AATG	2	8	692209	692216	50 %	25 %	25 %	0 %	162418762
13605	NC_010159	TGC	2	6	692245	692250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418762
13606	NC_010159	CCA	2	6	692298	692303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418762
13607	NC_010159	TAC	2	6	692451	692456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418108
13608	NC_010159	TGA	2	6	692464	692469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418108
13609	NC_010159	CTG	2	6	692511	692516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418108
13610	NC_010159	AT	3	6	692652	692657	50 %	50 %	0 %	0 %	162421077
13611	NC_010159	GAT	2	6	692665	692670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421077
13612	NC_010159	AGT	2	6	692721	692726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421077
13613	NC_010159	GCCC	2	8	692766	692773	0 %	0 %	25 %	75 %	162421077
13614	NC_010159	CTT	2	6	692779	692784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421077
13615	NC_010159	TTC	2	6	692790	692795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421077
13616	NC_010159	GTT	2	6	692800	692805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421077
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13619	NC_010159	ACTC	2	8	692986	692993	25 %	25 %	0 %	50 %	162421077
13620	NC_010159	CA	3	6	693058	693063	50 %	0 %	0 %	50 %	162421077
13621	NC_010159	GCG	2	6	693075	693080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421077
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13623	NC_010159	GCT	2	6	693214	693219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421077
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13989	NC_010159	AAT	2	6	712531	712536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420261
13990	NC_010159	AGAA	2	8	712540	712547	75 %	0 %	25 %	0 %	162420261
13991	NC_010159	CCG	2	6	712559	712564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420261
13992	NC_010159	ACC	2	6	712646	712651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420261
13993	NC_010159	ACC	2	6	712654	712659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420261
13994	NC_010159	ACG	2	6	712712	712717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420261
13995	NC_010159	AGC	2	6	712735	712740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420261
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13997	NC_010159	TAAGT	2	10	712798	712807	40 %	40 %	20 %	0 %	162420261
13998	NC_010159	GCATCC	2	12	712808	712819	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	162420261
13999	NC_010159	CGA	2	6	712896	712901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420261
14000	NC_010159	CGG	2	6	712941	712946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420261

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