MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 88007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_010159	GTA	2	6	607546	607551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420975
12003	NC_010159	A	6	6	607551	607556	100 %	0 %	0 %	0 %	162420975
12004	NC_010159	TC	3	6	607583	607588	0 %	50 %	0 %	50 %	162420192
12005	NC_010159	GAA	2	6	607621	607626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420192
12006	NC_010159	AAG	2	6	607655	607660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420192
12007	NC_010159	CGT	2	6	607679	607684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420192
12008	NC_010159	GTC	2	6	607734	607739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420192
12009	NC_010159	GGTC	2	8	607771	607778	0 %	25 %	50 %	25 %	162420192
12010	NC_010159	AGG	2	6	607856	607861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12011	NC_010159	TTC	2	6	607899	607904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419522
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12013	NC_010159	A	6	6	607987	607992	100 %	0 %	0 %	0 %	162419522
12014	NC_010159	GCT	2	6	607993	607998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419522
12015	NC_010159	AAG	2	6	608008	608013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162419522
12016	NC_010159	GAT	2	6	608065	608070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419522
12017	NC_010159	CGT	2	6	608592	608597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419812
12018	NC_010159	CGT	2	6	608607	608612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419812
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12020	NC_010159	CG	3	6	608702	608707	0 %	0 %	50 %	50 %	162419812
12021	NC_010159	TGCG	2	8	608749	608756	0 %	25 %	50 %	25 %	162419812
12022	NC_010159	ACA	2	6	608767	608772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419812
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12025	NC_010159	GCT	2	6	608850	608855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419812
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12033	NC_010159	CCAG	2	8	609215	609222	25 %	0 %	25 %	50 %	162419392
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12041	NC_010159	GGC	2	6	609430	609435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418523
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12043	NC_010159	CGT	2	6	609476	609481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418523
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12045	NC_010159	ACTG	2	8	609505	609512	25 %	25 %	25 %	25 %	162418523
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12053	NC_010159	ATA	2	6	609803	609808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12054	NC_010159	T	6	6	609834	609839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12055	NC_010159	AGT	3	9	609934	609942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12088	NC_010159	GTC	2	6	611430	611435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419100
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12091	NC_010159	CTC	2	6	611650	611655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162419623
12092	NC_010159	GAAG	2	8	611686	611693	50 %	0 %	50 %	0 %	162419623
12093	NC_010159	A	6	6	611828	611833	100 %	0 %	0 %	0 %	162419623
12094	NC_010159	TGG	2	6	611929	611934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419623
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12103	NC_010159	GCA	2	6	612406	612411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418250
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12110	NC_010159	TGG	2	6	612593	612598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162418772
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12115	NC_010159	TGC	2	6	612840	612845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418772
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12117	NC_010159	GCA	2	6	613127	613132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421679
12118	NC_010159	TAT	2	6	613196	613201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421679
12119	NC_010159	GGT	2	6	613206	613211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421679
12120	NC_010159	GC	3	6	613217	613222	0 %	0 %	50 %	50 %	162421679
12121	NC_010159	CTA	2	6	613273	613278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421679
12122	NC_010159	GAA	2	6	613368	613373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421679
12123	NC_010159	CAAA	2	8	613415	613422	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12124	NC_010159	CGT	2	6	613478	613483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12125	NC_010159	CTG	2	6	613515	613520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12126	NC_010159	GAG	2	6	613562	613567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12127	NC_010159	TGG	3	9	613699	613707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420331
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12173	NC_010159	TAG	2	6	615630	615635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12204	NC_010159	ACGC	2	8	617147	617154	25 %	0 %	25 %	50 %	162420536
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12221	NC_010159	TCTT	2	8	618016	618023	0 %	75 %	0 %	25 %	162420536
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12225	NC_010159	ATC	2	6	618210	618215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419495
12226	NC_010159	GAC	2	6	618218	618223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419495
12227	NC_010159	CGAAAG	2	12	618229	618240	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	162419495
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12229	NC_010159	TCG	2	6	618299	618304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419495
12230	NC_010159	GGT	2	6	618387	618392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419495
12231	NC_010159	AGTT	2	8	618454	618461	25 %	50 %	25 %	0 %	162419495
12232	NC_010159	TGC	2	6	618467	618472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419495
12233	NC_010159	AGT	2	6	618485	618490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419495
12234	NC_010159	TGC	2	6	618491	618496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419495
12235	NC_010159	A	7	7	618517	618523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12236	NC_010159	T	7	7	618538	618544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12237	NC_010159	CCA	2	6	618549	618554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12238	NC_010159	TAC	3	9	618582	618590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12239	NC_010159	TTAA	2	8	618626	618633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12240	NC_010159	GTT	2	6	618642	618647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12241	NC_010159	TTAA	2	8	618664	618671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12242	NC_010159	ATT	2	6	618691	618696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12243	NC_010159	ATC	2	6	618718	618723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12244	NC_010159	TTG	2	6	618742	618747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12245	NC_010159	T	6	6	618856	618861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12246	NC_010159	ATG	2	6	618880	618885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12247	NC_010159	TAC	2	6	619007	619012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418390
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12258	NC_010159	TAT	2	6	619415	619420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12259	NC_010159	TAC	2	6	619446	619451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12260	NC_010159	ACA	2	6	619466	619471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421083
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12262	NC_010159	CAAT	2	8	619631	619638	50 %	25 %	0 %	25 %	162421083
12263	NC_010159	T	6	6	619642	619647	0 %	100 %	0 %	0 %	162421083
12264	NC_010159	ACT	2	6	619648	619653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421083
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12272	NC_010159	GTC	2	6	620097	620102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421653
12273	NC_010159	GCC	2	6	620137	620142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421653
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12277	NC_010159	GCCA	2	8	620395	620402	25 %	0 %	25 %	50 %	162421653
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12282	NC_010159	CGT	2	6	620783	620788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421653
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12284	NC_010159	TG	3	6	621102	621107	0 %	50 %	50 %	0 %	162420048
12285	NC_010159	TAA	2	6	621117	621122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420048
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12293	NC_010159	ATGA	2	8	621530	621537	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12294	NC_010159	AAT	2	6	621552	621557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12295	NC_010159	TAT	2	6	621561	621566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12296	NC_010159	ATT	2	6	621591	621596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12297	NC_010159	ATT	2	6	621640	621645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12298	NC_010159	GAA	2	6	621654	621659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420072
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12302	NC_010159	ATT	2	6	621718	621723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162420072
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12305	NC_010159	GTT	2	6	621799	621804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420072
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12310	NC_010159	ATA	2	6	622087	622092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420072
12311	NC_010159	TCA	3	9	622099	622107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420072
12312	NC_010159	TTC	2	6	622146	622151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420072
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12314	NC_010159	ACTC	2	8	622352	622359	25 %	25 %	0 %	50 %	162420072
12315	NC_010159	A	6	6	622392	622397	100 %	0 %	0 %	0 %	162420072
12316	NC_010159	TCA	2	6	622402	622407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420072
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12319	NC_010159	TAG	2	6	622540	622545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420072
12320	NC_010159	CTG	2	6	622553	622558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420072
12321	NC_010159	GTT	2	6	622643	622648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420072
12322	NC_010159	TA	3	6	622710	622715	50 %	50 %	0 %	0 %	162420072
12323	NC_010159	AAT	2	6	622756	622761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420072
12324	NC_010159	GGCA	2	8	622775	622782	25 %	0 %	50 %	25 %	162420072
12325	NC_010159	TCA	2	6	622795	622800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420072
12326	NC_010159	TAC	2	6	622881	622886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420072
12327	NC_010159	CACC	2	8	622961	622968	25 %	0 %	0 %	75 %	162420072
12328	NC_010159	TGCCC	2	10	622996	623005	0 %	20 %	20 %	60 %	162420072
12329	NC_010159	AAT	2	6	623010	623015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420072
12330	NC_010159	T	6	6	623083	623088	0 %	100 %	0 %	0 %	162420599
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12334	NC_010159	CTG	2	6	623215	623220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420599
12335	NC_010159	CCA	2	6	623267	623272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420599
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12344	NC_010159	CGC	2	6	624076	624081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420599
12345	NC_010159	GTT	2	6	624147	624152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420599
12346	NC_010159	GTT	2	6	624177	624182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420599
12347	NC_010159	GCA	2	6	624237	624242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420599
12348	NC_010159	T	7	7	624266	624272	0 %	100 %	0 %	0 %	162420599
12349	NC_010159	AGC	2	6	624334	624339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420599
12350	NC_010159	A	6	6	624374	624379	100 %	0 %	0 %	0 %	162420599
12351	NC_010159	TAT	2	6	624444	624449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12352	NC_010159	TAA	2	6	624508	624513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419460
12353	NC_010159	T	6	6	624532	624537	0 %	100 %	0 %	0 %	162419460
12354	NC_010159	TG	3	6	624554	624559	0 %	50 %	50 %	0 %	162419460
12355	NC_010159	CAG	2	6	624576	624581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419460
12356	NC_010159	CAG	2	6	624642	624647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419460
12357	NC_010159	TCA	2	6	624683	624688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419460
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12359	NC_010159	TCT	2	6	624923	624928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419460
12360	NC_010159	GCA	2	6	624954	624959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419460
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12362	NC_010159	TGC	2	6	625045	625050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419460
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12468	NC_010159	CATC	2	8	631138	631145	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12482	NC_010159	ACT	2	6	631643	631648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12483	NC_010159	TAG	2	6	631740	631745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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