MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 88007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_010159	AG	3	6	579996	580001	50 %	0 %	50 %	0 %	162419505
11502	NC_010159	ATT	2	6	580120	580125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419505
11503	NC_010159	GGC	2	6	580147	580152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419505
11504	NC_010159	CGC	2	6	580200	580205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419505
11505	NC_010159	AC	3	6	580225	580230	50 %	0 %	0 %	50 %	162419505
11506	NC_010159	GTGG	2	8	580242	580249	0 %	25 %	75 %	0 %	162419505
11507	NC_010159	TGG	2	6	580282	580287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419505
11508	NC_010159	ATT	2	6	580296	580301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419505
11509	NC_010159	CAC	2	6	580319	580324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419505
11510	NC_010159	TAT	2	6	580330	580335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419505
11511	NC_010159	GGT	2	6	580358	580363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419505
11512	NC_010159	G	6	6	580425	580430	0 %	0 %	100 %	0 %	162419505
11513	NC_010159	ATCA	2	8	580531	580538	50 %	25 %	0 %	25 %	162419505
11514	NC_010159	CCA	2	6	580563	580568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11515	NC_010159	TGT	2	6	580596	580601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418859
11516	NC_010159	GCT	2	6	580623	580628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418859
11517	NC_010159	GAAA	2	8	580659	580666	75 %	0 %	25 %	0 %	162418859
11518	NC_010159	CCA	2	6	580719	580724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418859
11519	NC_010159	CAT	2	6	580873	580878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418859
11520	NC_010159	CGA	2	6	580911	580916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418859
11521	NC_010159	AAG	2	6	580946	580951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418859
11522	NC_010159	TTC	2	6	580954	580959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162418859
11523	NC_010159	CCTG	2	8	581126	581133	0 %	25 %	25 %	50 %	162418859
11524	NC_010159	GCG	3	9	581144	581152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418859
11525	NC_010159	ATC	2	6	581188	581193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418859
11526	NC_010159	ATGA	2	8	581233	581240	50 %	25 %	25 %	0 %	162418859
11527	NC_010159	TGT	2	6	581249	581254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418859
11528	NC_010159	CAT	2	6	581274	581279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418859
11529	NC_010159	TGA	2	6	581343	581348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418859
11530	NC_010159	ACT	2	6	581360	581365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418859
11531	NC_010159	AGT	2	6	581410	581415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_010159	ATG	3	9	581416	581424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418344
11533	NC_010159	TCC	2	6	581455	581460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162418344
11534	NC_010159	G	7	7	581472	581478	0 %	0 %	100 %	0 %	162418344
11535	NC_010159	ATC	2	6	581505	581510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418344
11536	NC_010159	ATT	2	6	581548	581553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_010159	TAA	2	6	581574	581579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_010159	TA	3	6	581597	581602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_010159	TTTAA	2	10	581630	581639	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_010159	C	6	6	581696	581701	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11541	NC_010159	ATA	2	6	581741	581746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_010159	AGA	2	6	581771	581776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_010159	TAA	2	6	581790	581795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_010159	A	6	6	581829	581834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_010159	A	7	7	581836	581842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_010159	AATA	2	8	581847	581854	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_010159	GAA	2	6	581862	581867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_010159	TAG	2	6	581871	581876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_010159	GAG	2	6	581890	581895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_010159	A	8	8	581942	581949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_010159	AGA	2	6	581970	581975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_010159	ACC	2	6	582020	582025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11553	NC_010159	CAG	2	6	582033	582038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11554	NC_010159	TAT	2	6	582066	582071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_010159	CTT	2	6	582094	582099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11556	NC_010159	ACA	2	6	582328	582333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11557	NC_010159	AG	3	6	582408	582413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_010159	C	6	6	582446	582451	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11559	NC_010159	TGA	2	6	582465	582470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_010159	ATT	2	6	582562	582567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_010159	CAGG	2	8	582708	582715	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11562	NC_010159	AAT	2	6	582729	582734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_010159	TCT	2	6	582775	582780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11564	NC_010159	TTC	2	6	582789	582794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11565	NC_010159	A	7	7	582833	582839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_010159	AAT	2	6	582869	582874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_010159	CT	3	6	582884	582889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11568	NC_010159	GAAGA	2	10	582905	582914	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_010159	A	6	6	582920	582925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_010159	TTAT	2	8	582947	582954	25 %	75 %	0 %	0 %	162421176
11571	NC_010159	GCTGTT	2	12	582955	582966	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	162421176
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11573	NC_010159	CAT	2	6	583109	583114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421176
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11577	NC_010159	AAC	2	6	583354	583359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162420528
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11581	NC_010159	GTC	2	6	583543	583548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420528
11582	NC_010159	GCC	2	6	583583	583588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420528
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11586	NC_010159	GCCA	2	8	583841	583848	25 %	0 %	25 %	50 %	162420528
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11590	NC_010159	TG	3	6	584144	584149	0 %	50 %	50 %	0 %	162420528
11591	NC_010159	CGT	2	6	584229	584234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420528
11592	NC_010159	GTT	2	6	584464	584469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_010159	TC	3	6	584516	584521	0 %	50 %	0 %	50 %	162420109
11594	NC_010159	CTTC	2	8	584551	584558	0 %	50 %	0 %	50 %	162420109
11595	NC_010159	CAGT	2	8	584637	584644	25 %	25 %	25 %	25 %	162420109
11596	NC_010159	ATCC	2	8	584672	584679	25 %	25 %	0 %	50 %	162420109
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11599	NC_010159	TGAA	2	8	584892	584899	50 %	25 %	25 %	0 %	162420109
11600	NC_010159	TATCAA	2	12	584989	585000	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	162420109
11601	NC_010159	ATA	2	6	585053	585058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420109
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11604	NC_010159	AGTG	2	8	585219	585226	25 %	25 %	50 %	0 %	162420109
11605	NC_010159	GAC	2	6	585263	585268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420109
11606	NC_010159	GCAGAT	2	12	585279	585290	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	162420109
11607	NC_010159	GCA	2	6	585312	585317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420109
11608	NC_010159	GCC	2	6	585339	585344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420109
11609	NC_010159	CTT	2	6	585416	585421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11610	NC_010159	TGC	2	6	585431	585436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11611	NC_010159	GCC	3	9	585472	585480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11612	NC_010159	GCC	2	6	585485	585490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11613	NC_010159	GTC	2	6	585503	585508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11614	NC_010159	GCT	2	6	585534	585539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11615	NC_010159	AGTC	2	8	585565	585572	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11616	NC_010159	T	6	6	585657	585662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_010159	ATT	2	6	585691	585696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_010159	CGT	2	6	585711	585716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11619	NC_010159	ATA	2	6	585745	585750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_010159	G	6	6	585766	585771	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11621	NC_010159	CGG	2	6	585802	585807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11622	NC_010159	ATT	2	6	585820	585825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11623	NC_010159	TAA	2	6	585843	585848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11624	NC_010159	ATCA	2	8	585928	585935	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11625	NC_010159	CAG	2	6	585976	585981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11626	NC_010159	TCA	2	6	586044	586049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11627	NC_010159	TCGC	2	8	586080	586087	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11628	NC_010159	CCG	2	6	586096	586101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11629	NC_010159	GAA	2	6	586229	586234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11630	NC_010159	TCA	2	6	586290	586295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11631	NC_010159	CT	3	6	586309	586314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11632	NC_010159	TTG	2	6	586541	586546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11633	NC_010159	GT	3	6	586569	586574	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11634	NC_010159	TGC	2	6	586633	586638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11636	NC_010159	GTA	2	6	586856	586861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11638	NC_010159	GAT	3	9	586973	586981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11639	NC_010159	TGA	2	6	587076	587081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11641	NC_010159	CGG	2	6	587241	587246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11642	NC_010159	GTT	2	6	587275	587280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11643	NC_010159	GT	3	6	587309	587314	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11644	NC_010159	CCG	2	6	587331	587336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11648	NC_010159	ATC	2	6	587670	587675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419627
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11872	NC_010159	GAA	2	6	599716	599721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420030
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11994	NC_010159	CTG	2	6	606958	606963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420975
11995	NC_010159	TGC	2	6	607097	607102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420975
11996	NC_010159	GGC	2	6	607185	607190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420975
11997	NC_010159	CTG	2	6	607204	607209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420975
11998	NC_010159	TGC	2	6	607336	607341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420975
11999	NC_010159	GGT	3	9	607431	607439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420975
12000	NC_010159	AAG	2	6	607497	607502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420975

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