MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 88007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_010159	GCC	2	6	401430	401435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162418409
8002	NC_010159	CAC	2	6	401472	401477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418409
8003	NC_010159	CAT	2	6	401495	401500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418409
8004	NC_010159	TAC	2	6	401513	401518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418409
8005	NC_010159	GAA	2	6	401607	401612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418409
8006	NC_010159	TTC	2	6	401679	401684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162418409
8007	NC_010159	GAC	2	6	401745	401750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418409
8008	NC_010159	CAC	2	6	401763	401768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418409
8009	NC_010159	ACT	2	6	401862	401867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418409
8010	NC_010159	GTCT	2	8	401941	401948	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8011	NC_010159	TTTA	2	8	401972	401979	25 %	75 %	0 %	0 %	162418804
8012	NC_010159	T	6	6	401992	401997	0 %	100 %	0 %	0 %	162418804
8013	NC_010159	AG	3	6	402086	402091	50 %	0 %	50 %	0 %	162418804
8014	NC_010159	CTG	2	6	402110	402115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418804
8015	NC_010159	AGA	2	6	402119	402124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418804
8016	NC_010159	CAT	2	6	402140	402145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418804
8017	NC_010159	TTG	2	6	402257	402262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418804
8018	NC_010159	CAA	2	6	402392	402397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162418804
8019	NC_010159	CCA	2	6	402502	402507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418804
8020	NC_010159	TCT	2	6	402540	402545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162418804
8021	NC_010159	ATT	2	6	402593	402598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162418804
8022	NC_010159	GGT	2	6	402641	402646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162418804
8023	NC_010159	ATT	2	6	402650	402655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162418804
8024	NC_010159	CAT	2	6	402680	402685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418804
8025	NC_010159	AG	3	6	402717	402722	50 %	0 %	50 %	0 %	162418804
8026	NC_010159	TCC	2	6	402753	402758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162418804
8027	NC_010159	GCA	2	6	402816	402821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418804
8028	NC_010159	ATGCC	2	10	402827	402836	20 %	20 %	20 %	40 %	162418804
8029	NC_010159	CCG	2	6	402852	402857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162418804
8030	NC_010159	ACC	3	9	402882	402890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418804
8031	NC_010159	AAT	2	6	402909	402914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418804
8032	NC_010159	T	6	6	402933	402938	0 %	100 %	0 %	0 %	162418804
8033	NC_010159	CTG	2	6	402950	402955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418804
8034	NC_010159	TTG	2	6	402977	402982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418804
8035	NC_010159	TGG	2	6	403087	403092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162418804
8036	NC_010159	T	6	6	403110	403115	0 %	100 %	0 %	0 %	162418804
8037	NC_010159	ATG	2	6	403161	403166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418804
8038	NC_010159	T	6	6	403192	403197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_010159	TTC	2	6	403207	403212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8040	NC_010159	TTA	2	6	403220	403225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_010159	TTG	2	6	403291	403296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_010159	GGC	2	6	403304	403309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_010159	CGC	2	6	403322	403327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8044	NC_010159	CGC	2	6	403348	403353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8045	NC_010159	TCG	2	6	403395	403400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8046	NC_010159	TGG	2	6	403411	403416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_010159	CCA	2	6	403446	403451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8048	NC_010159	CAA	2	6	403458	403463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8049	NC_010159	CTG	2	6	403465	403470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_010159	TTG	2	6	403483	403488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_010159	GC	3	6	403508	403513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8052	NC_010159	TGG	2	6	403527	403532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_010159	TGT	2	6	403551	403556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_010159	TGC	2	6	403601	403606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_010159	C	6	6	403702	403707	0 %	0 %	0 %	100 %	162419925
8056	NC_010159	CTG	2	6	403737	403742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419925
8057	NC_010159	CCATCA	2	12	403852	403863	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	162419925
8058	NC_010159	CAC	2	6	403944	403949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419925
8059	NC_010159	GCC	2	6	403963	403968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419925
8060	NC_010159	CGGCA	2	10	403991	404000	20 %	0 %	40 %	40 %	162419925
8061	NC_010159	CAG	2	6	404028	404033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419925
8062	NC_010159	CAG	2	6	404199	404204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419925
8063	NC_010159	AGA	2	6	404329	404334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162419593
8064	NC_010159	GCC	2	6	404336	404341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419593
8065	NC_010159	GGC	2	6	404438	404443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419593
8066	NC_010159	C	6	6	404462	404467	0 %	0 %	0 %	100 %	162419593
8067	NC_010159	GCT	2	6	404475	404480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419593
8068	NC_010159	TCA	2	6	404485	404490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419593
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8070	NC_010159	CGC	2	6	404575	404580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419593
8071	NC_010159	AGTGA	2	10	404621	404630	40 %	20 %	40 %	0 %	162419593
8072	NC_010159	GAT	2	6	404837	404842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419593
8073	NC_010159	CAT	2	6	404855	404860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419593
8074	NC_010159	CGA	2	6	404866	404871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419593
8075	NC_010159	GCA	2	6	404896	404901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419593
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8080	NC_010159	GC	3	6	405223	405228	0 %	0 %	50 %	50 %	162419593
8081	NC_010159	CAG	3	9	405242	405250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419593
8082	NC_010159	CAATCA	2	12	405259	405270	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	162419593
8083	NC_010159	CAA	2	6	405392	405397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419593
8084	NC_010159	AGTG	2	8	405441	405448	25 %	25 %	50 %	0 %	162419593
8085	NC_010159	GCCA	2	8	405465	405472	25 %	0 %	25 %	50 %	162419593
8086	NC_010159	AGG	2	6	405481	405486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162419593
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8088	NC_010159	GCC	2	6	405515	405520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419593
8089	NC_010159	ATA	2	6	405533	405538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419593
8090	NC_010159	ATG	2	6	405646	405651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419593
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8092	NC_010159	GTA	2	6	405733	405738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419593
8093	NC_010159	GA	3	6	405784	405789	50 %	0 %	50 %	0 %	162419593
8094	NC_010159	AAT	2	6	405806	405811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419593
8095	NC_010159	CCG	2	6	405825	405830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419593
8096	NC_010159	CAA	2	6	405912	405917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419593
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8101	NC_010159	AT	3	6	406052	406057	50 %	50 %	0 %	0 %	162419593
8102	NC_010159	CAGA	2	8	406058	406065	50 %	0 %	25 %	25 %	162419593
8103	NC_010159	CAT	2	6	406121	406126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419593
8104	NC_010159	CG	3	6	406140	406145	0 %	0 %	50 %	50 %	162419593
8105	NC_010159	CAG	3	9	406169	406177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419593
8106	NC_010159	CGCCAA	2	12	406184	406195	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	162419593
8107	NC_010159	ATA	2	6	406198	406203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419593
8108	NC_010159	A	6	6	406203	406208	100 %	0 %	0 %	0 %	162419593
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8110	NC_010159	GCC	2	6	406265	406270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420023
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8112	NC_010159	CTT	2	6	406344	406349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420023
8113	NC_010159	CAT	2	6	406461	406466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420023
8114	NC_010159	GCC	2	6	406528	406533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420023
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8118	NC_010159	GTT	2	6	406844	406849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420664
8119	NC_010159	CGG	2	6	406861	406866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420664
8120	NC_010159	TGC	2	6	406891	406896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420664
8121	NC_010159	A	6	6	406983	406988	100 %	0 %	0 %	0 %	162420664
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8497	NC_010159	GTG	2	6	427376	427381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162418611
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