MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 88007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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75004	NC_010159	GCA	2	6	3844511	3844516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419028
75005	NC_010159	TGG	2	6	3844528	3844533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419028
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75124	NC_010159	ATCAGC	2	12	3849327	3849338	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	162420564
75125	NC_010159	TTG	2	6	3849416	3849421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420564
75126	NC_010159	AAG	2	6	3849465	3849470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420564
75127	NC_010159	TTA	2	6	3849479	3849484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162420564
75128	NC_010159	TC	3	6	3849492	3849497	0 %	50 %	0 %	50 %	162420564
75129	NC_010159	T	6	6	3849537	3849542	0 %	100 %	0 %	0 %	162420564
75130	NC_010159	TGC	2	6	3849627	3849632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420564
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75132	NC_010159	ATC	2	6	3849656	3849661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420564
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75140	NC_010159	GAT	2	6	3850102	3850107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420564
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75145	NC_010159	AAT	2	6	3850306	3850311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420564
75146	NC_010159	T	6	6	3850324	3850329	0 %	100 %	0 %	0 %	162420564
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75151	NC_010159	TG	3	6	3850520	3850525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75152	NC_010159	TC	3	6	3850585	3850590	0 %	50 %	0 %	50 %	162421188
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75163	NC_010159	ACCAA	2	10	3851342	3851351	60 %	0 %	0 %	40 %	162421188
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75183	NC_010159	TTG	2	6	3852822	3852827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421624
75184	NC_010159	ATC	2	6	3852866	3852871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421624
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75186	NC_010159	GCCA	2	8	3852948	3852955	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75187	NC_010159	TAT	2	6	3852986	3852991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75188	NC_010159	AGC	2	6	3853120	3853125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418452
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75222	NC_010159	TCG	2	6	3854868	3854873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421922
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75225	NC_010159	CGTT	2	8	3855042	3855049	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75226	NC_010159	T	7	7	3855066	3855072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75227	NC_010159	ATA	2	6	3855087	3855092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75228	NC_010159	AT	3	6	3855100	3855105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75229	NC_010159	TA	3	6	3855117	3855122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75230	NC_010159	TATT	2	8	3855156	3855163	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75231	NC_010159	GGATAA	2	12	3855280	3855291	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75232	NC_010159	CGG	2	6	3855519	3855524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75233	NC_010159	T	10	10	3855526	3855535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75234	NC_010159	CAC	2	6	3855539	3855544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75235	NC_010159	ACG	2	6	3855559	3855564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75236	NC_010159	CCA	2	6	3855590	3855595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75237	NC_010159	TCTG	2	8	3855661	3855668	0 %	50 %	25 %	25 %	162419845
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75240	NC_010159	TGC	2	6	3855743	3855748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419845
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75242	NC_010159	CTT	2	6	3855853	3855858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419845
75243	NC_010159	CTGA	2	8	3855860	3855867	25 %	25 %	25 %	25 %	162419845
75244	NC_010159	TCA	2	6	3855885	3855890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419845
75245	NC_010159	ATG	2	6	3855891	3855896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419845
75246	NC_010159	G	6	6	3855904	3855909	0 %	0 %	100 %	0 %	162419845
75247	NC_010159	CGT	2	6	3855929	3855934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419845
75248	NC_010159	CTG	3	9	3855982	3855990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419845
75249	NC_010159	TGAG	2	8	3856111	3856118	25 %	25 %	50 %	0 %	162419845
75250	NC_010159	CCG	2	6	3856189	3856194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419845
75251	NC_010159	TGA	2	6	3856233	3856238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419845
75252	NC_010159	TTC	2	6	3856250	3856255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419845
75253	NC_010159	TGT	2	6	3856308	3856313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419845
75254	NC_010159	GCGCT	2	10	3856324	3856333	0 %	20 %	40 %	40 %	162419845
75255	NC_010159	CAT	2	6	3856394	3856399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419845
75256	NC_010159	CTC	2	6	3856407	3856412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162419493
75257	NC_010159	GAT	2	6	3856440	3856445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419493
75258	NC_010159	TCA	2	6	3856478	3856483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419493
75259	NC_010159	T	6	6	3856501	3856506	0 %	100 %	0 %	0 %	162419493
75260	NC_010159	CTG	2	6	3856531	3856536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419493
75261	NC_010159	CAGC	2	8	3856606	3856613	25 %	0 %	25 %	50 %	162419493
75262	NC_010159	ACCTT	2	10	3856724	3856733	20 %	40 %	0 %	40 %	162419493
75263	NC_010159	GA	3	6	3856767	3856772	50 %	0 %	50 %	0 %	162419493
75264	NC_010159	ACA	2	6	3856872	3856877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419493
75265	NC_010159	CG	3	6	3856881	3856886	0 %	0 %	50 %	50 %	162419493
75266	NC_010159	CAC	2	6	3856890	3856895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419493
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75268	NC_010159	GTC	2	6	3857055	3857060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419493
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75271	NC_010159	GAAT	2	8	3857112	3857119	50 %	25 %	25 %	0 %	162419493
75272	NC_010159	GCGA	2	8	3857167	3857174	25 %	0 %	50 %	25 %	162419493
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75274	NC_010159	GGC	2	6	3857282	3857287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419493
75275	NC_010159	CGTT	2	8	3857491	3857498	0 %	50 %	25 %	25 %	162420700
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75277	NC_010159	CTT	2	6	3857657	3857662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420700
75278	NC_010159	CGA	2	6	3857717	3857722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420700
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75280	NC_010159	TGC	2	6	3857847	3857852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420700
75281	NC_010159	TGA	2	6	3857926	3857931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420700
75282	NC_010159	GGC	2	6	3858012	3858017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75283	NC_010159	CTAT	2	8	3858056	3858063	25 %	50 %	0 %	25 %	162420363
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75293	NC_010159	AAAC	2	8	3858567	3858574	75 %	0 %	0 %	25 %	162420363
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75302	NC_010159	CTT	2	6	3858941	3858946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420028
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75304	NC_010159	GTA	2	6	3858997	3859002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420028
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75308	NC_010159	CCAG	2	8	3859374	3859381	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75309	NC_010159	GACCA	2	10	3859425	3859434	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
75310	NC_010159	TTC	2	6	3859512	3859517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421642
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75312	NC_010159	CAT	2	6	3859568	3859573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421642
75313	NC_010159	TGG	2	6	3859596	3859601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421642
75314	NC_010159	ATC	2	6	3859611	3859616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421642
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75316	NC_010159	GTTT	2	8	3859676	3859683	0 %	75 %	25 %	0 %	162421642
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75320	NC_010159	TAT	2	6	3859791	3859796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75321	NC_010159	TA	3	6	3859871	3859876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75322	NC_010159	TTC	2	6	3859910	3859915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75323	NC_010159	ATAA	2	8	3859919	3859926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75324	NC_010159	GTT	2	6	3860080	3860085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418946
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75330	NC_010159	GC	3	6	3860387	3860392	0 %	0 %	50 %	50 %	162418946
75331	NC_010159	CCAG	2	8	3860516	3860523	25 %	0 %	25 %	50 %	162418946
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75347	NC_010159	TAA	2	6	3861073	3861078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418946
75348	NC_010159	ATC	2	6	3861191	3861196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418946
75349	NC_010159	C	8	8	3861214	3861221	0 %	0 %	0 %	100 %	162418946
75350	NC_010159	AAG	2	6	3861262	3861267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418946
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75352	NC_010159	CAT	2	6	3861335	3861340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418946
75353	NC_010159	A	7	7	3861433	3861439	100 %	0 %	0 %	0 %	162418946
75354	NC_010159	AATT	2	8	3861485	3861492	50 %	50 %	0 %	0 %	162418946
75355	NC_010159	AAG	2	6	3861510	3861515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418946
75356	NC_010159	AAT	2	6	3861521	3861526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418946
75357	NC_010159	ATT	2	6	3861558	3861563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162418946
75358	NC_010159	CTT	2	6	3861624	3861629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162418676
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75360	NC_010159	CTC	2	6	3861673	3861678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162418676
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75417	NC_010159	ATAA	2	8	3864661	3864668	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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75435	NC_010159	GAGT	2	8	3865422	3865429	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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75461	NC_010159	AC	3	6	3866610	3866615	50 %	0 %	0 %	50 %	162418363
75462	NC_010159	AAC	2	6	3866654	3866659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162418363
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75479	NC_010159	TC	3	6	3867388	3867393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75480	NC_010159	GTG	2	6	3867498	3867503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75481	NC_010159	GA	3	6	3867522	3867527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75482	NC_010159	TGG	2	6	3867590	3867595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75483	NC_010159	A	6	6	3867699	3867704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75484	NC_010159	A	6	6	3867715	3867720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75485	NC_010159	A	6	6	3867735	3867740	100 %	0 %	0 %	0 %	162421049
75486	NC_010159	AG	3	6	3867863	3867868	50 %	0 %	50 %	0 %	162421049
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75499	NC_010159	CAG	2	6	3868682	3868687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421353
75500	NC_010159	CTA	2	6	3868702	3868707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421353

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