MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 88007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_010159	A	6	6	2608531	2608536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51002	NC_010159	A	6	6	2608590	2608595	100 %	0 %	0 %	0 %	162419272
51003	NC_010159	AT	3	6	2608615	2608620	50 %	50 %	0 %	0 %	162419272
51004	NC_010159	TAT	2	6	2608714	2608719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51005	NC_010159	TAAT	2	8	2608752	2608759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51006	NC_010159	ATA	2	6	2608785	2608790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51007	NC_010159	A	6	6	2608814	2608819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51008	NC_010159	AG	3	6	2608824	2608829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51009	NC_010159	TCA	2	6	2608879	2608884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51010	NC_010159	CCG	2	6	2608885	2608890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51011	NC_010159	ATCA	2	8	2608913	2608920	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51012	NC_010159	AT	3	6	2608972	2608977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51013	NC_010159	A	6	6	2609025	2609030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51014	NC_010159	TAT	2	6	2609031	2609036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51015	NC_010159	A	9	9	2609075	2609083	100 %	0 %	0 %	0 %	162421304
51016	NC_010159	TGG	2	6	2609085	2609090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421304
51017	NC_010159	CT	3	6	2609102	2609107	0 %	50 %	0 %	50 %	162421304
51018	NC_010159	TTG	2	6	2609166	2609171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421304
51019	NC_010159	CTG	2	6	2609228	2609233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421304
51020	NC_010159	AAAACC	2	12	2609252	2609263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421304
51021	NC_010159	GGCC	2	8	2609288	2609295	0 %	0 %	50 %	50 %	162421304
51022	NC_010159	A	6	6	2609471	2609476	100 %	0 %	0 %	0 %	162421304
51023	NC_010159	ATCTT	2	10	2609479	2609488	20 %	60 %	0 %	20 %	162421304
51024	NC_010159	GGT	2	6	2609592	2609597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421304
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51030	NC_010159	TAT	2	6	2609857	2609862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421304
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51035	NC_010159	CT	3	6	2610212	2610217	0 %	50 %	0 %	50 %	162421304
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51044	NC_010159	AAC	2	6	2610616	2610621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421304
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51053	NC_010159	TTGG	2	8	2611101	2611108	0 %	50 %	50 %	0 %	162421304
51054	NC_010159	AT	3	6	2611109	2611114	50 %	50 %	0 %	0 %	162421304
51055	NC_010159	GA	3	6	2611189	2611194	50 %	0 %	50 %	0 %	162421304
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51060	NC_010159	CAA	2	6	2611314	2611319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51061	NC_010159	CGA	2	6	2611548	2611553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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51065	NC_010159	GCT	2	6	2611923	2611928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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51072	NC_010159	GAC	2	6	2612407	2612412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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51113	NC_010159	CCGA	2	8	2614435	2614442	25 %	0 %	25 %	50 %	162421776
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51117	NC_010159	GAG	2	6	2614523	2614528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51118	NC_010159	TGT	2	6	2614541	2614546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51119	NC_010159	CTTT	2	8	2614550	2614557	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51120	NC_010159	A	6	6	2614664	2614669	100 %	0 %	0 %	0 %	162421575
51121	NC_010159	CAGTTT	3	18	2614695	2614712	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	162421575
51122	NC_010159	AAT	2	6	2614727	2614732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421575
51123	NC_010159	ATACT	2	10	2614744	2614753	40 %	40 %	0 %	20 %	162421575
51124	NC_010159	AGCA	2	8	2614763	2614770	50 %	0 %	25 %	25 %	162421575
51125	NC_010159	AGA	2	6	2614813	2614818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421575
51126	NC_010159	ATG	2	6	2614994	2614999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421575
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51128	NC_010159	AGA	2	6	2615071	2615076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421575
51129	NC_010159	T	6	6	2615097	2615102	0 %	100 %	0 %	0 %	162421575
51130	NC_010159	CAG	2	6	2615119	2615124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421575
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51132	NC_010159	C	6	6	2615346	2615351	0 %	0 %	0 %	100 %	162418393
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51137	NC_010159	CAC	2	6	2615487	2615492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418393
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51141	NC_010159	GCCAG	2	10	2615657	2615666	20 %	0 %	40 %	40 %	162418393
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51181	NC_010159	CAAA	2	8	2617419	2617426	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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51192	NC_010159	TCG	2	6	2617820	2617825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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51200	NC_010159	CT	3	6	2618136	2618141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51201	NC_010159	TCA	2	6	2618142	2618147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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51204	NC_010159	ATT	2	6	2618210	2618215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162418444
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51233	NC_010159	CTG	2	6	2620036	2620041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418190
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51239	NC_010159	C	6	6	2620205	2620210	0 %	0 %	0 %	100 %	162418190
51240	NC_010159	GAT	2	6	2620271	2620276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418190
51241	NC_010159	TCA	2	6	2620377	2620382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418190
51242	NC_010159	CAT	2	6	2620396	2620401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418190
51243	NC_010159	T	6	6	2620501	2620506	0 %	100 %	0 %	0 %	162418190
51244	NC_010159	GTA	2	6	2620668	2620673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51245	NC_010159	GTT	2	6	2620724	2620729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51246	NC_010159	TGC	2	6	2620853	2620858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51247	NC_010159	CTG	2	6	2620908	2620913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51248	NC_010159	GGAG	2	8	2620934	2620941	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
51249	NC_010159	AAACT	2	10	2620948	2620957	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51250	NC_010159	CAGC	2	8	2621267	2621274	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51251	NC_010159	TCAA	2	8	2621289	2621296	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51252	NC_010159	GT	3	6	2621360	2621365	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51253	NC_010159	CTC	2	6	2621410	2621415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162421220
51254	NC_010159	GC	3	6	2621417	2621422	0 %	0 %	50 %	50 %	162421220
51255	NC_010159	GCCA	2	8	2621433	2621440	25 %	0 %	25 %	50 %	162421220
51256	NC_010159	TTCT	2	8	2621559	2621566	0 %	75 %	0 %	25 %	162421220
51257	NC_010159	GCC	2	6	2621596	2621601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421220
51258	NC_010159	GCT	2	6	2621654	2621659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421220
51259	NC_010159	CGT	2	6	2621741	2621746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421220
51260	NC_010159	CAT	2	6	2621760	2621765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421220
51261	NC_010159	CTC	2	6	2621813	2621818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162421220
51262	NC_010159	GCA	2	6	2621828	2621833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421220
51263	NC_010159	GTT	2	6	2621852	2621857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421220
51264	NC_010159	GCA	2	6	2621858	2621863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421220
51265	NC_010159	GTG	2	6	2621926	2621931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421220
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51271	NC_010159	CGG	2	6	2622107	2622112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421220
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51276	NC_010159	CCCG	2	8	2622314	2622321	0 %	0 %	25 %	75 %	162421220
51277	NC_010159	TGC	2	6	2622360	2622365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421220
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51279	NC_010159	CTG	2	6	2622459	2622464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51280	NC_010159	TCA	2	6	2622510	2622515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51281	NC_010159	CGG	2	6	2622516	2622521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51282	NC_010159	GCC	2	6	2622545	2622550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51283	NC_010159	GATA	2	8	2622570	2622577	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51284	NC_010159	CCA	2	6	2622579	2622584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51285	NC_010159	T	6	6	2622687	2622692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51286	NC_010159	AAT	2	6	2622708	2622713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51289	NC_010159	TCA	2	6	2622948	2622953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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51297	NC_010159	TAA	2	6	2623418	2623423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51298	NC_010159	AGAT	2	8	2623437	2623444	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51299	NC_010159	GGC	2	6	2623504	2623509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51300	NC_010159	ATT	2	6	2623515	2623520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51301	NC_010159	TAT	2	6	2623617	2623622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51302	NC_010159	AT	3	6	2623642	2623647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51303	NC_010159	CTTC	2	8	2623652	2623659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51304	NC_010159	CCT	3	9	2623672	2623680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51305	NC_010159	AG	3	6	2623738	2623743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51306	NC_010159	TCC	2	6	2623863	2623868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51307	NC_010159	CATT	2	8	2623876	2623883	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51308	NC_010159	ATT	2	6	2623886	2623891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51309	NC_010159	AACT	2	8	2623968	2623975	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51310	NC_010159	ATA	3	9	2623984	2623992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51311	NC_010159	TGA	2	6	2623994	2623999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51312	NC_010159	A	7	7	2624025	2624031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51313	NC_010159	TAAT	2	8	2624032	2624039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51314	NC_010159	GAT	2	6	2624060	2624065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51315	NC_010159	A	6	6	2624110	2624115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51316	NC_010159	ACC	2	6	2624119	2624124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51317	NC_010159	TACACC	4	24	2624132	2624155	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
51318	NC_010159	AC	3	6	2624157	2624162	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51319	NC_010159	GTT	2	6	2624263	2624268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419616
51320	NC_010159	CCG	2	6	2624296	2624301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419616
51321	NC_010159	CAA	3	9	2624306	2624314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419616
51322	NC_010159	C	6	6	2624362	2624367	0 %	0 %	0 %	100 %	162419616
51323	NC_010159	GATA	2	8	2624377	2624384	50 %	25 %	25 %	0 %	162419616
51324	NC_010159	CAA	2	6	2624480	2624485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419062
51325	NC_010159	TC	3	6	2624556	2624561	0 %	50 %	0 %	50 %	162419062
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51329	NC_010159	TCGG	2	8	2624651	2624658	0 %	25 %	50 %	25 %	162419062
51330	NC_010159	GGC	2	6	2624668	2624673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419062
51331	NC_010159	CAG	2	6	2624714	2624719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419062
51332	NC_010159	GCG	2	6	2624745	2624750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419062
51333	NC_010159	TCC	2	6	2624777	2624782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162419062
51334	NC_010159	TCG	2	6	2624787	2624792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419062
51335	NC_010159	AATTGG	2	12	2624856	2624867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419062
51336	NC_010159	ACT	2	6	2624914	2624919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419062
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51338	NC_010159	TGC	2	6	2625015	2625020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419062
51339	NC_010159	CAA	2	6	2625061	2625066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419062
51340	NC_010159	ATCT	2	8	2625070	2625077	25 %	50 %	0 %	25 %	162419062
51341	NC_010159	ATC	2	6	2625082	2625087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419062
51342	NC_010159	AAC	2	6	2625126	2625131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419062
51343	NC_010159	ATG	2	6	2625144	2625149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419062
51344	NC_010159	AAT	2	6	2625152	2625157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419062
51345	NC_010159	AGAA	2	8	2625199	2625206	75 %	0 %	25 %	0 %	162419062
51346	NC_010159	CTA	2	6	2625240	2625245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419062
51347	NC_010159	ATA	2	6	2625336	2625341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419062
51348	NC_010159	ATAA	2	8	2625374	2625381	75 %	25 %	0 %	0 %	162419062
51349	NC_010159	GTC	2	6	2625511	2625516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419062
51350	NC_010159	TCA	2	6	2625541	2625546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419062
51351	NC_010159	CT	3	6	2625596	2625601	0 %	50 %	0 %	50 %	162419062
51352	NC_010159	GTT	2	6	2625602	2625607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419062
51353	NC_010159	CCT	2	6	2625696	2625701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162419062
51354	NC_010159	ATC	2	6	2625786	2625791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419062
51355	NC_010159	GCAA	2	8	2625796	2625803	50 %	0 %	25 %	25 %	162419062
51356	NC_010159	AGC	3	9	2625836	2625844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419062
51357	NC_010159	AG	3	6	2625892	2625897	50 %	0 %	50 %	0 %	162419062
51358	NC_010159	AGA	2	6	2625976	2625981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162419062
51359	NC_010159	GCC	2	6	2626053	2626058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51360	NC_010159	TAC	2	6	2626062	2626067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51361	NC_010159	AAACC	2	10	2626069	2626078	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
51362	NC_010159	TGAC	2	8	2626173	2626180	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51363	NC_010159	ACT	2	6	2626217	2626222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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51401	NC_010159	AATT	2	8	2628218	2628225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51402	NC_010159	TA	3	6	2628240	2628245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51475	NC_010159	A	7	7	2632769	2632775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51476	NC_010159	CATTAT	2	12	2632776	2632787	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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51478	NC_010159	TAA	2	6	2632847	2632852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51479	NC_010159	A	6	6	2632851	2632856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51480	NC_010159	ATT	2	6	2632898	2632903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51481	NC_010159	AAT	2	6	2632940	2632945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51482	NC_010159	ATT	2	6	2632964	2632969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51483	NC_010159	TTAAA	2	10	2632981	2632990	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51484	NC_010159	AAAT	2	8	2633002	2633009	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51485	NC_010159	ATT	2	6	2633014	2633019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51487	NC_010159	A	6	6	2633107	2633112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51488	NC_010159	ATTT	2	8	2633116	2633123	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51489	NC_010159	TA	3	6	2633124	2633129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51490	NC_010159	ATA	2	6	2633146	2633151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421225
51491	NC_010159	A	8	8	2633233	2633240	100 %	0 %	0 %	0 %	162421225
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51496	NC_010159	CAA	2	6	2633365	2633370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51497	NC_010159	CA	3	6	2633396	2633401	50 %	0 %	0 %	50 %	162420934
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