MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 88007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50002	NC_010159	TAAT	2	8	2555340	2555347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50003	NC_010159	ATT	2	6	2555357	2555362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50004	NC_010159	GTA	2	6	2555367	2555372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50005	NC_010159	AGA	2	6	2555411	2555416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50006	NC_010159	TTC	2	6	2555490	2555495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50007	NC_010159	TTAA	2	8	2555613	2555620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50008	NC_010159	GA	3	6	2555655	2555660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50009	NC_010159	TCA	2	6	2555661	2555666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50010	NC_010159	GTA	2	6	2555679	2555684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50011	NC_010159	CAA	2	6	2555710	2555715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50012	NC_010159	TAA	2	6	2555734	2555739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50013	NC_010159	TTG	2	6	2555745	2555750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50014	NC_010159	ACTTC	2	10	2555776	2555785	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
50015	NC_010159	CAG	2	6	2555788	2555793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50016	NC_010159	GTA	2	6	2555805	2555810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50017	NC_010159	AT	3	6	2555827	2555832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50018	NC_010159	T	6	6	2555841	2555846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50019	NC_010159	CCTG	2	8	2555857	2555864	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50020	NC_010159	TCT	2	6	2555868	2555873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50021	NC_010159	ACC	2	6	2555904	2555909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50022	NC_010159	AAAT	2	8	2555936	2555943	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50023	NC_010159	TTA	2	6	2555949	2555954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50024	NC_010159	TAG	2	6	2556006	2556011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50025	NC_010159	TTTTA	2	10	2556023	2556032	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50026	NC_010159	CAA	2	6	2556094	2556099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50027	NC_010159	TAA	2	6	2556139	2556144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50028	NC_010159	ATT	2	6	2556176	2556181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50029	NC_010159	ATC	2	6	2556182	2556187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50030	NC_010159	CAC	2	6	2556247	2556252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50031	NC_010159	CAC	2	6	2556410	2556415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50032	NC_010159	CAT	2	6	2556463	2556468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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50034	NC_010159	ATT	2	6	2556503	2556508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50035	NC_010159	AT	3	6	2556543	2556548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50036	NC_010159	GA	3	6	2556558	2556563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50037	NC_010159	GGA	2	6	2556576	2556581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50038	NC_010159	TCACAC	2	12	2556592	2556603	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
50039	NC_010159	ATT	2	6	2556611	2556616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50040	NC_010159	GCT	2	6	2556663	2556668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50041	NC_010159	CAG	2	6	2556676	2556681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50042	NC_010159	AGATA	2	10	2556713	2556722	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50043	NC_010159	CTG	2	6	2556736	2556741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50044	NC_010159	ATTT	3	12	2556754	2556765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50045	NC_010159	GTTC	2	8	2556837	2556844	0 %	50 %	25 %	25 %	162419327
50046	NC_010159	TTA	2	6	2556848	2556853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419327
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50050	NC_010159	A	6	6	2557027	2557032	100 %	0 %	0 %	0 %	162419327
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50052	NC_010159	AG	3	6	2557205	2557210	50 %	0 %	50 %	0 %	162419327
50053	NC_010159	ATTT	2	8	2557261	2557268	25 %	75 %	0 %	0 %	162419327
50054	NC_010159	TGA	2	6	2557277	2557282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419327
50055	NC_010159	GAA	2	6	2557341	2557346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162419327
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50059	NC_010159	T	6	6	2557547	2557552	0 %	100 %	0 %	0 %	162419327
50060	NC_010159	CTTG	2	8	2557739	2557746	0 %	50 %	25 %	25 %	162419327
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50063	NC_010159	ATT	2	6	2557816	2557821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419327
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50082	NC_010159	TGAA	2	8	2558476	2558483	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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50092	NC_010159	T	7	7	2558712	2558718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50123	NC_010159	CAC	2	6	2560659	2560664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50124	NC_010159	TGATG	2	10	2560672	2560681	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
50125	NC_010159	GAT	2	6	2560693	2560698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50126	NC_010159	CAT	2	6	2560720	2560725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50127	NC_010159	CTG	2	6	2560729	2560734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50128	NC_010159	CAA	2	6	2560761	2560766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50129	NC_010159	AATGA	2	10	2560816	2560825	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50130	NC_010159	GTT	2	6	2560848	2560853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50131	NC_010159	TGG	2	6	2560928	2560933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50132	NC_010159	ACC	2	6	2560944	2560949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50133	NC_010159	GCT	2	6	2561148	2561153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50134	NC_010159	TGT	2	6	2561158	2561163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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50136	NC_010159	CCA	2	6	2561204	2561209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50137	NC_010159	TGGC	2	8	2561335	2561342	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50138	NC_010159	TAC	2	6	2561345	2561350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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50140	NC_010159	C	6	6	2561524	2561529	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50141	NC_010159	T	6	6	2561553	2561558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50142	NC_010159	CGT	2	6	2561582	2561587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50143	NC_010159	CTG	2	6	2561613	2561618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50144	NC_010159	T	6	6	2561651	2561656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50145	NC_010159	AAT	2	6	2561740	2561745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50146	NC_010159	CAC	2	6	2561817	2561822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50147	NC_010159	AG	4	8	2561842	2561849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50148	NC_010159	TTC	2	6	2561862	2561867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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50150	NC_010159	CGG	2	6	2561972	2561977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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50152	NC_010159	TGT	2	6	2562091	2562096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50153	NC_010159	T	6	6	2562137	2562142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50154	NC_010159	GAGT	2	8	2562155	2562162	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50155	NC_010159	GTTA	2	8	2562292	2562299	25 %	50 %	25 %	0 %	162419866
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50165	NC_010159	TAGAC	2	10	2562863	2562872	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50166	NC_010159	GCC	2	6	2562946	2562951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50167	NC_010159	ATT	2	6	2562972	2562977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50199	NC_010159	TAT	2	6	2564661	2564666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50200	NC_010159	CAT	2	6	2564697	2564702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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50212	NC_010159	CAGT	2	8	2565420	2565427	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50213	NC_010159	GCG	2	6	2565476	2565481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50214	NC_010159	GCA	2	6	2565527	2565532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50215	NC_010159	AGTG	2	8	2565578	2565585	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50216	NC_010159	GCT	2	6	2565594	2565599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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50229	NC_010159	GCT	2	6	2566241	2566246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421361
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50234	NC_010159	TAA	2	6	2566553	2566558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421361
50235	NC_010159	ATC	2	6	2566588	2566593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421361
50236	NC_010159	GGC	2	6	2566605	2566610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421361
50237	NC_010159	GCG	2	6	2566619	2566624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421361
50238	NC_010159	CAAC	2	8	2566751	2566758	50 %	0 %	0 %	50 %	162421361
50239	NC_010159	TTC	2	6	2566849	2566854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421361
50240	NC_010159	ACT	2	6	2566942	2566947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420994
50241	NC_010159	TTG	2	6	2567101	2567106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420994
50242	NC_010159	A	6	6	2567224	2567229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50243	NC_010159	GCCC	2	8	2567307	2567314	0 %	0 %	25 %	75 %	162420338
50244	NC_010159	CGG	2	6	2567322	2567327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420338
50245	NC_010159	CAG	3	9	2567329	2567337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420338
50246	NC_010159	GAT	2	6	2567358	2567363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420338
50247	NC_010159	TGA	2	6	2567388	2567393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420338
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50353	NC_010159	CTTC	2	8	2572681	2572688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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50366	NC_010159	TGC	2	6	2573798	2573803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420678
50367	NC_010159	CTG	2	6	2573866	2573871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420678
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50373	NC_010159	TGG	2	6	2574015	2574020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420678
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50401	NC_010159	GGT	2	6	2575705	2575710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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50482	NC_010159	ATA	3	9	2580478	2580486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420025
50483	NC_010159	AAT	2	6	2580585	2580590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420025
50484	NC_010159	GC	3	6	2580621	2580626	0 %	0 %	50 %	50 %	162420025
50485	NC_010159	AAT	2	6	2580658	2580663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420025
50486	NC_010159	GCA	2	6	2580712	2580717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420025
50487	NC_010159	T	6	6	2580849	2580854	0 %	100 %	0 %	0 %	162420025
50488	NC_010159	ATG	2	6	2580942	2580947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420025
50489	NC_010159	ACA	2	6	2581076	2581081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162420025
50490	NC_010159	CAT	2	6	2581308	2581313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50491	NC_010159	TAT	2	6	2581320	2581325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50492	NC_010159	AAT	2	6	2581340	2581345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50493	NC_010159	CTG	2	6	2581353	2581358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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50495	NC_010159	TCA	2	6	2581468	2581473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50496	NC_010159	CTG	2	6	2581553	2581558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421577
50497	NC_010159	CT	3	6	2581567	2581572	0 %	50 %	0 %	50 %	162421577
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50499	NC_010159	GCT	2	6	2581580	2581585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421577
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