MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 31758 chromosome

Total Repeats: 93462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_009708	ACG	2	6	210149	210154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153947394
4003	NC_009708	GGT	2	6	210168	210173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153947394
4004	NC_009708	GCC	2	6	210208	210213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153947394
4005	NC_009708	TGA	2	6	210276	210281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153947394
4006	NC_009708	CAG	2	6	210296	210301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153947394
4007	NC_009708	GTT	2	6	210349	210354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153947394
4008	NC_009708	ACA	2	6	210426	210431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153947394
4009	NC_009708	TGG	2	6	210452	210457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153947394
4010	NC_009708	TTG	2	6	210509	210514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153947394
4011	NC_009708	GGT	2	6	210581	210586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153949720
4012	NC_009708	ATT	2	6	210594	210599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153949720
4013	NC_009708	GTG	3	9	210618	210626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153949720
4014	NC_009708	CGC	2	6	210815	210820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153949720
4015	NC_009708	CAA	2	6	210882	210887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153949720
4016	NC_009708	AGC	2	6	211002	211007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153949720
4017	NC_009708	AAT	2	6	211098	211103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153949720
4018	NC_009708	TGTA	2	8	211213	211220	25 %	50 %	25 %	0 %	153949720
4019	NC_009708	GGT	2	6	211247	211252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153949720
4020	NC_009708	GTG	2	6	211263	211268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153949720
4021	NC_009708	CGG	2	6	211286	211291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153949720
4022	NC_009708	AGT	2	6	211316	211321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153949720
4023	NC_009708	GC	3	6	211333	211338	0 %	0 %	50 %	50 %	153949720
4024	NC_009708	CGG	2	6	211366	211371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153949720
4025	NC_009708	TGATT	2	10	211388	211397	20 %	60 %	20 %	0 %	153949720
4026	NC_009708	CCGG	2	8	211412	211419	0 %	0 %	50 %	50 %	153949720
4027	NC_009708	AAT	2	6	211530	211535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153949720
4028	NC_009708	TGG	2	6	211542	211547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153949720
4029	NC_009708	CGT	2	6	211548	211553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153949720
4030	NC_009708	CTTG	2	8	211685	211692	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4031	NC_009708	ATC	2	6	211764	211769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_009708	ATG	2	6	211795	211800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_009708	GTAT	2	8	211843	211850	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_009708	TGTA	2	8	211859	211866	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_009708	TGTA	2	8	211876	211883	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_009708	CTGG	2	8	211911	211918	0 %	25 %	50 %	25 %	153948584
4037	NC_009708	CGT	2	6	212071	212076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153948584
4038	NC_009708	TGA	2	6	212099	212104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153948584
4039	NC_009708	ATA	2	6	212218	212223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153948584
4040	NC_009708	CGC	2	6	212264	212269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153948584
4041	NC_009708	CAG	2	6	212274	212279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153948584
4042	NC_009708	TGA	2	6	212339	212344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153948584
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4044	NC_009708	GAA	2	6	212367	212372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153948584
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4049	NC_009708	GAT	3	9	212679	212687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153948584
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4052	NC_009708	GCT	2	6	212869	212874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153950869
4053	NC_009708	TACC	2	8	212897	212904	25 %	25 %	0 %	50 %	153950869
4054	NC_009708	AAG	2	6	212993	212998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153950869
4055	NC_009708	TGC	2	6	213093	213098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153950869
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4057	NC_009708	GTG	2	6	213363	213368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153950869
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4060	NC_009708	TGC	2	6	213420	213425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153950869
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4062	NC_009708	GATGA	2	10	213488	213497	40 %	20 %	40 %	0 %	153950869
4063	NC_009708	TGG	2	6	213580	213585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153949202
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4065	NC_009708	TGGA	2	8	213608	213615	25 %	25 %	50 %	0 %	153949202
4066	NC_009708	TGA	2	6	213706	213711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153949202
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4071	NC_009708	AGA	2	6	213943	213948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153949202
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4073	NC_009708	G	7	7	214058	214064	0 %	0 %	100 %	0 %	153949202
4074	NC_009708	ATTG	2	8	214087	214094	25 %	50 %	25 %	0 %	153949202
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4088	NC_009708	TGG	2	6	214693	214698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153947454
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4090	NC_009708	ATC	2	6	214831	214836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153947454
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4092	NC_009708	GC	3	6	214982	214987	0 %	0 %	50 %	50 %	153947454
4093	NC_009708	ATATT	2	10	215111	215120	40 %	60 %	0 %	0 %	153947454
4094	NC_009708	GTTG	2	8	215177	215184	0 %	50 %	50 %	0 %	153947454
4095	NC_009708	GCG	2	6	215196	215201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153947454
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4102	NC_009708	GGC	2	6	215537	215542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153947454
4103	NC_009708	GTT	3	9	215585	215593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153947454
4104	NC_009708	AATG	2	8	215774	215781	50 %	25 %	25 %	0 %	153947454
4105	NC_009708	CT	3	6	215783	215788	0 %	50 %	0 %	50 %	153947454
4106	NC_009708	A	7	7	215899	215905	100 %	0 %	0 %	0 %	153950283
4107	NC_009708	TGCC	2	8	215992	215999	0 %	25 %	25 %	50 %	153950283
4108	NC_009708	A	6	6	216091	216096	100 %	0 %	0 %	0 %	153950283
4109	NC_009708	CT	3	6	216176	216181	0 %	50 %	0 %	50 %	153950283
4110	NC_009708	CTG	2	6	216289	216294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153950283
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4112	NC_009708	CAG	2	6	216358	216363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153950283
4113	NC_009708	TGG	2	6	216470	216475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153950283
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4123	NC_009708	TATT	2	8	217019	217026	25 %	75 %	0 %	0 %	153948608
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4244	NC_009708	T	9	9	222442	222450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4245	NC_009708	AGC	2	6	222470	222475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4250	NC_009708	GCT	2	6	222693	222698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153949571
4251	NC_009708	TGC	2	6	222783	222788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153949571
4252	NC_009708	TCA	2	6	222867	222872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153949571
4253	NC_009708	CAT	2	6	222913	222918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153949571
4254	NC_009708	ATC	2	6	222920	222925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153949571
4255	NC_009708	CCA	2	6	222998	223003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153949571
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4257	NC_009708	TTG	2	6	223064	223069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153949571
4258	NC_009708	CTT	2	6	223084	223089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153949571
4259	NC_009708	GTG	2	6	223201	223206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153949571
4260	NC_009708	CAA	2	6	223214	223219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153949571
4261	NC_009708	GGCG	2	8	223234	223241	0 %	0 %	75 %	25 %	153949571
4262	NC_009708	CG	3	6	223322	223327	0 %	0 %	50 %	50 %	153949571
4263	NC_009708	ATTG	2	8	223336	223343	25 %	50 %	25 %	0 %	153949571
4264	NC_009708	GGC	2	6	223370	223375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153949571
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4269	NC_009708	CGC	2	6	223481	223486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153949571
4270	NC_009708	GTA	2	6	223567	223572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153949571
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4273	NC_009708	CCA	2	6	223594	223599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153949571
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4277	NC_009708	TGGC	2	8	223831	223838	0 %	25 %	50 %	25 %	153946970
4278	NC_009708	CAG	2	6	224020	224025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153946970
4279	NC_009708	CTA	2	6	224087	224092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153946970
4280	NC_009708	CGG	2	6	224096	224101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153946970
4281	NC_009708	AG	3	6	224164	224169	50 %	0 %	50 %	0 %	153946970
4282	NC_009708	TCA	2	6	224210	224215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153946970
4283	NC_009708	ATA	2	6	224276	224281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153946970
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4285	NC_009708	AG	3	6	224308	224313	50 %	0 %	50 %	0 %	153946970
4286	NC_009708	TCT	2	6	224324	224329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153946970
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4288	NC_009708	TCAT	2	8	224363	224370	25 %	50 %	0 %	25 %	153946970
4289	NC_009708	GGT	2	6	224413	224418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153946970
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4292	NC_009708	TTG	2	6	224560	224565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153946970
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4298	NC_009708	GAA	2	6	225050	225055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153948434
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4304	NC_009708	GCA	2	6	225297	225302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153948434
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4310	NC_009708	ATCA	2	8	225562	225569	50 %	25 %	0 %	25 %	153948434
4311	NC_009708	CAG	2	6	225627	225632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153948434
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4317	NC_009708	CTC	2	6	226026	226031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	153949991
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4319	NC_009708	GGC	2	6	226202	226207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153949991
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4321	NC_009708	CTGC	2	8	226231	226238	0 %	25 %	25 %	50 %	153949991
4322	NC_009708	ATC	2	6	226245	226250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153949991
4323	NC_009708	GACGA	2	10	226267	226276	40 %	0 %	40 %	20 %	153949991
4324	NC_009708	CG	3	6	226283	226288	0 %	0 %	50 %	50 %	153949991
4325	NC_009708	CAG	2	6	226386	226391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153949991
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4328	NC_009708	A	7	7	226693	226699	100 %	0 %	0 %	0 %	153950294
4329	NC_009708	CAA	2	6	226744	226749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4330	NC_009708	ATGT	2	8	226750	226757	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4331	NC_009708	TGA	2	6	226789	226794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4332	NC_009708	TGC	3	9	226822	226830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153949769
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4334	NC_009708	AAT	2	6	226968	226973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153949769
4335	NC_009708	TTC	2	6	226984	226989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153949769
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4337	NC_009708	CAA	2	6	227014	227019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153949769
4338	NC_009708	T	6	6	227056	227061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4339	NC_009708	AAT	2	6	227073	227078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4340	NC_009708	GGC	2	6	227163	227168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153949133
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4342	NC_009708	TCA	2	6	227223	227228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153949133
4343	NC_009708	GTCT	2	8	227272	227279	0 %	50 %	25 %	25 %	153949133
4344	NC_009708	ACA	2	6	227298	227303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153949133
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4350	NC_009708	GGC	2	6	227520	227525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153949133
4351	NC_009708	TTC	2	6	227548	227553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153949133
4352	NC_009708	TGA	2	6	227559	227564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153949133
4353	NC_009708	G	8	8	227598	227605	0 %	0 %	100 %	0 %	153949133
4354	NC_009708	AGA	3	9	227709	227717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153949133
4355	NC_009708	GAT	2	6	227725	227730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153949133
4356	NC_009708	CGAA	2	8	227768	227775	50 %	0 %	25 %	25 %	153949133
4357	NC_009708	CAG	2	6	227807	227812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153949133
4358	NC_009708	TTG	2	6	227887	227892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153949133
4359	NC_009708	AAC	2	6	227948	227953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153949133
4360	NC_009708	ATG	2	6	228001	228006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153949133
4361	NC_009708	GCT	2	6	228071	228076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153949133
4362	NC_009708	GT	3	6	228088	228093	0 %	50 %	50 %	0 %	153949133
4363	NC_009708	CCAG	2	8	228112	228119	25 %	0 %	25 %	50 %	153949133
4364	NC_009708	GGC	2	6	228128	228133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153949133
4365	NC_009708	GTGA	2	8	228154	228161	25 %	25 %	50 %	0 %	153949133
4366	NC_009708	ATT	2	6	228246	228251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153949133
4367	NC_009708	GAT	2	6	228258	228263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153949133
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4495	NC_009708	GCG	2	6	234379	234384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153948314
4496	NC_009708	CGG	2	6	234439	234444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153948314
4497	NC_009708	TGGC	2	8	234462	234469	0 %	25 %	50 %	25 %	153948314
4498	NC_009708	G	6	6	234568	234573	0 %	0 %	100 %	0 %	153948314
4499	NC_009708	GTG	2	6	234649	234654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153948314
4500	NC_009708	ACC	2	6	234696	234701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153948314

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