MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 31758 chromosome

Total Repeats: 93462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009708	AAT	3	9	53097	53105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153947911
1002	NC_009708	GGC	2	6	53126	53131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153947911
1003	NC_009708	AAT	2	6	53175	53180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153947911
1004	NC_009708	GTTA	2	8	53293	53300	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_009708	CATT	2	8	53320	53327	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_009708	ATTT	2	8	53330	53337	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_009708	A	7	7	53342	53348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_009708	GTA	2	6	53386	53391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_009708	ATT	2	6	53458	53463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_009708	AATG	2	8	53470	53477	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_009708	AGT	2	6	53482	53487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_009708	TCA	2	6	53507	53512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_009708	AAT	2	6	53607	53612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_009708	AATC	2	8	53623	53630	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_009708	T	6	6	53689	53694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_009708	T	6	6	53854	53859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_009708	CCA	2	6	53933	53938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_009708	A	6	6	53960	53965	100 %	0 %	0 %	0 %	153947220
1019	NC_009708	AGC	2	6	54165	54170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153947220
1020	NC_009708	GACAC	2	10	54176	54185	40 %	0 %	20 %	40 %	153947220
1021	NC_009708	GCG	2	6	54201	54206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153947220
1022	NC_009708	GATT	2	8	54304	54311	25 %	50 %	25 %	0 %	153947220
1023	NC_009708	GCC	2	6	54316	54321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_009708	TGG	2	6	54324	54329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_009708	CGC	2	6	54411	54416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153950103
1026	NC_009708	TTG	2	6	54445	54450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153950103
1027	NC_009708	ATA	2	6	54517	54522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153950103
1028	NC_009708	TCG	2	6	54546	54551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_009708	CAT	2	6	54578	54583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153950543
1030	NC_009708	CGG	2	6	54598	54603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153950543
1031	NC_009708	TTC	2	6	54666	54671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153950543
1032	NC_009708	GGC	2	6	54710	54715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153950543
1033	NC_009708	TCCTCG	2	12	54846	54857	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	153950543
1034	NC_009708	ATG	2	6	54945	54950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153950543
1035	NC_009708	GGA	2	6	54982	54987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153950543
1036	NC_009708	AGC	2	6	55098	55103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153950543
1037	NC_009708	TTC	2	6	55157	55162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153950543
1038	NC_009708	GCCA	2	8	55269	55276	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_009708	TATT	2	8	55333	55340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_009708	TTTA	2	8	55359	55366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_009708	GAA	2	6	55373	55378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_009708	CT	3	6	55416	55421	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_009708	CAAA	2	8	55449	55456	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_009708	AG	3	6	55498	55503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_009708	TCC	2	6	55523	55528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_009708	TAA	2	6	55577	55582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_009708	GCTG	2	8	55638	55645	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_009708	TCT	2	6	55702	55707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_009708	C	8	8	55748	55755	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1050	NC_009708	AAC	2	6	55776	55781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_009708	ATC	3	9	55803	55811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_009708	ATT	2	6	55813	55818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_009708	T	6	6	55877	55882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_009708	TCT	2	6	55924	55929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153948963
1055	NC_009708	ACT	2	6	55979	55984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153948963
1056	NC_009708	CTGAC	2	10	56047	56056	20 %	20 %	20 %	40 %	153948963
1057	NC_009708	ACC	2	6	56164	56169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153948963
1058	NC_009708	TAA	2	6	56195	56200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153948963
1059	NC_009708	TAG	2	6	56229	56234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153948963
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1061	NC_009708	CT	3	6	56310	56315	0 %	50 %	0 %	50 %	153948963
1062	NC_009708	CAG	2	6	56352	56357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153948963
1063	NC_009708	TTCA	2	8	56362	56369	25 %	50 %	0 %	25 %	153948963
1064	NC_009708	T	6	6	56407	56412	0 %	100 %	0 %	0 %	153948963
1065	NC_009708	AC	3	6	56448	56453	50 %	0 %	0 %	50 %	153948963
1066	NC_009708	GCA	2	6	56459	56464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153948963
1067	NC_009708	GAC	2	6	56469	56474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153948963
1068	NC_009708	ATTG	2	8	56488	56495	25 %	50 %	25 %	0 %	153948963
1069	NC_009708	GCA	2	6	56633	56638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153948963
1070	NC_009708	CGGG	2	8	56705	56712	0 %	0 %	75 %	25 %	153948963
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1072	NC_009708	A	6	6	56748	56753	100 %	0 %	0 %	0 %	153948963
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1074	NC_009708	CGG	2	6	56849	56854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153948963
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1078	NC_009708	GTC	2	6	57055	57060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_009708	CGA	2	6	57075	57080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_009708	ACC	2	6	57084	57089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_009708	AAAG	2	8	57095	57102	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_009708	T	6	6	57194	57199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_009708	TA	4	8	57201	57208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_009708	A	6	6	57274	57279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_009708	CAA	2	6	57295	57300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_009708	CAA	2	6	57316	57321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_009708	CAGT	2	8	57369	57376	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1088	NC_009708	TTG	2	6	57426	57431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_009708	AAATT	2	10	57454	57463	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_009708	AAAC	2	8	57471	57478	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1091	NC_009708	AACT	2	8	57502	57509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1092	NC_009708	ATAA	2	8	57536	57543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_009708	CTGG	2	8	57552	57559	0 %	25 %	50 %	25 %	153949407
1094	NC_009708	TG	3	6	57718	57723	0 %	50 %	50 %	0 %	153948323
1095	NC_009708	CGG	2	6	57724	57729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153948323
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1097	NC_009708	GCG	2	6	57889	57894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153948323
1098	NC_009708	CAT	2	6	57920	57925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153948323
1099	NC_009708	GCG	2	6	58002	58007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153948323
1100	NC_009708	GAT	2	6	58049	58054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153948323
1101	NC_009708	ATG	2	6	58068	58073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153948323
1102	NC_009708	AG	3	6	58122	58127	50 %	0 %	50 %	0 %	153948323
1103	NC_009708	CACCC	2	10	58187	58196	20 %	0 %	0 %	80 %	153948323
1104	NC_009708	GCG	2	6	58305	58310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153948323
1105	NC_009708	ACG	2	6	58364	58369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153948323
1106	NC_009708	GCCTT	2	10	58374	58383	0 %	40 %	20 %	40 %	153948323
1107	NC_009708	CAA	2	6	58498	58503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153948323
1108	NC_009708	TGT	2	6	58559	58564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153948323
1109	NC_009708	CTG	2	6	58674	58679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153948323
1110	NC_009708	CTGG	2	8	58691	58698	0 %	25 %	50 %	25 %	153948323
1111	NC_009708	GCCA	2	8	58721	58728	25 %	0 %	25 %	50 %	153948323
1112	NC_009708	ATC	2	6	58770	58775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153948323
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1114	NC_009708	TG	3	6	58929	58934	0 %	50 %	50 %	0 %	153948765
1115	NC_009708	TG	3	6	58962	58967	0 %	50 %	50 %	0 %	153948765
1116	NC_009708	GCC	2	6	59060	59065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153948765
1117	NC_009708	CTG	2	6	59079	59084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153948765
1118	NC_009708	CCT	2	6	59103	59108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	153948765
1119	NC_009708	GCT	2	6	59422	59427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153948765
1120	NC_009708	CTG	2	6	59496	59501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153948765
1121	NC_009708	ATT	2	6	59662	59667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153948765
1122	NC_009708	CAC	2	6	59682	59687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153948765
1123	NC_009708	ACG	2	6	59698	59703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153948765
1124	NC_009708	GCG	2	6	59800	59805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153947153
1125	NC_009708	GT	3	6	59810	59815	0 %	50 %	50 %	0 %	153947153
1126	NC_009708	TGG	2	6	59863	59868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153947153
1127	NC_009708	TA	3	6	59873	59878	50 %	50 %	0 %	0 %	153947153
1128	NC_009708	TAAC	2	8	59891	59898	50 %	25 %	0 %	25 %	153947153
1129	NC_009708	GGC	2	6	59921	59926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153947153
1130	NC_009708	GAT	2	6	60037	60042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153947153
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1132	NC_009708	AGC	2	6	60104	60109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153947153
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