MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 31758 chromosome

Total Repeats: 93462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009708	CG	3	6	2	7	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009708	CTG	2	6	56	61	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153948430
3	NC_009708	TTG	2	6	138	143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153948430
4	NC_009708	AACC	2	8	194	201	50 %	0 %	0 %	50 %	153948430
5	NC_009708	TGT	2	6	235	240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153948430
6	NC_009708	TAA	2	6	252	257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153948430
7	NC_009708	CTT	2	6	377	382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153948430
8	NC_009708	TCA	2	6	618	623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153948571
9	NC_009708	TTG	2	6	636	641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153948571
10	NC_009708	CTG	2	6	650	655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153948571
11	NC_009708	TAA	2	6	685	690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153948571
12	NC_009708	GTG	2	6	708	713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153948571
13	NC_009708	CTT	2	6	730	735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153948571
14	NC_009708	T	6	6	749	754	0 %	100 %	0 %	0 %	153948571
15	NC_009708	AGC	2	6	802	807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153948571
16	NC_009708	CGT	2	6	811	816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153948571
17	NC_009708	GTT	2	6	823	828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153948571
18	NC_009708	GTGC	2	8	945	952	0 %	25 %	50 %	25 %	153948571
19	NC_009708	TGC	2	6	976	981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153948571
20	NC_009708	T	7	7	1026	1032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009708	ATT	2	6	1066	1071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009708	A	6	6	1188	1193	100 %	0 %	0 %	0 %	153947913
23	NC_009708	ACA	3	9	1208	1216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153947913
24	NC_009708	CAA	2	6	1257	1262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153947913
25	NC_009708	CATT	2	8	1395	1402	25 %	50 %	0 %	25 %	153947913
26	NC_009708	ATTC	2	8	1509	1516	25 %	50 %	0 %	25 %	153947913
27	NC_009708	GCG	2	6	1629	1634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153947913
28	NC_009708	TGG	2	6	1787	1792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153947913
29	NC_009708	ATG	2	6	1816	1821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153947913
30	NC_009708	ATG	2	6	1837	1842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153947913
31	NC_009708	ATT	2	6	1890	1895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153947913
32	NC_009708	TCT	2	6	1932	1937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153947913
33	NC_009708	ATCA	2	8	2020	2027	50 %	25 %	0 %	25 %	153947913
34	NC_009708	TGC	2	6	2095	2100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153947913
35	NC_009708	ACA	2	6	2105	2110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153947913
36	NC_009708	CTG	2	6	2169	2174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153947913
37	NC_009708	GGC	2	6	2256	2261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009708	GCG	2	6	2288	2293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153947140
39	NC_009708	TGG	2	6	2400	2405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153947140
40	NC_009708	CTG	3	9	2408	2416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153947140
41	NC_009708	TTTA	2	8	2513	2520	25 %	75 %	0 %	0 %	153947140
42	NC_009708	GCC	2	6	2538	2543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153947140
43	NC_009708	ACC	2	6	2552	2557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153947140
44	NC_009708	GTTG	2	8	2566	2573	0 %	50 %	50 %	0 %	153947140
45	NC_009708	ATT	2	6	2625	2630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153947140
46	NC_009708	ATG	2	6	2646	2651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153947140
47	NC_009708	GCG	2	6	2657	2662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153947140
48	NC_009708	TCA	2	6	2781	2786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153947140
49	NC_009708	T	6	6	2818	2823	0 %	100 %	0 %	0 %	153947140
50	NC_009708	GCG	2	6	2876	2881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153947140
51	NC_009708	ACTC	2	8	2899	2906	25 %	25 %	0 %	50 %	153947140
52	NC_009708	AAT	2	6	2934	2939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153947140
53	NC_009708	TGA	2	6	2958	2963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153947140
54	NC_009708	CCT	2	6	2974	2979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	153947140
55	NC_009708	CTGG	2	8	2992	2999	0 %	25 %	50 %	25 %	153947140
56	NC_009708	GCA	2	6	3127	3132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153947140
57	NC_009708	TGG	2	6	3202	3207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153947140
58	NC_009708	CAC	2	6	3226	3231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153947140
59	NC_009708	AAC	2	6	3285	3290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153947140
60	NC_009708	TGA	3	9	3291	3299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153947140
61	NC_009708	T	6	6	3378	3383	0 %	100 %	0 %	0 %	153947140
62	NC_009708	TCC	2	6	3492	3497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	153947140
63	NC_009708	ATTC	2	8	3523	3530	25 %	50 %	0 %	25 %	153947140
64	NC_009708	GTT	2	6	3565	3570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153947140
65	NC_009708	A	8	8	3635	3642	100 %	0 %	0 %	0 %	153947140
66	NC_009708	TGC	2	6	3656	3661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153947140
67	NC_009708	ACC	2	6	3672	3677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153947140
68	NC_009708	CAG	2	6	3710	3715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153947140
69	NC_009708	TGT	2	6	3765	3770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153946819
70	NC_009708	GTT	2	6	3781	3786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153946819
71	NC_009708	TTG	2	6	3797	3802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153946819
72	NC_009708	CCA	2	6	3817	3822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153946819
73	NC_009708	GCCA	2	8	3849	3856	25 %	0 %	25 %	50 %	153946819
74	NC_009708	GAT	2	6	3858	3863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153946819
75	NC_009708	TAAA	2	8	3868	3875	75 %	25 %	0 %	0 %	153946819
76	NC_009708	GTT	2	6	3904	3909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153946819
77	NC_009708	CAG	3	9	3941	3949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153946819
78	NC_009708	TGG	2	6	3953	3958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153946819
79	NC_009708	TGGC	2	8	3998	4005	0 %	25 %	50 %	25 %	153946819
80	NC_009708	ATC	2	6	4037	4042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153946819
81	NC_009708	GAT	2	6	4147	4152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153946819
82	NC_009708	CTGT	2	8	4206	4213	0 %	50 %	25 %	25 %	153946819
83	NC_009708	AGTG	2	8	4274	4281	25 %	25 %	50 %	0 %	153946819
84	NC_009708	TGG	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153946819
85	NC_009708	TGC	2	6	4296	4301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153946819
86	NC_009708	TAA	2	6	4346	4351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153946819
87	NC_009708	CAA	2	6	4379	4384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153946819
88	NC_009708	TCA	2	6	4473	4478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153946819
89	NC_009708	GAA	2	6	4487	4492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153946819
90	NC_009708	GTA	2	6	4504	4509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153946819
91	NC_009708	CTT	2	6	4520	4525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153946819
92	NC_009708	GCG	2	6	4529	4534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153946819
93	NC_009708	TCAA	2	8	4626	4633	50 %	25 %	0 %	25 %	153946819
94	NC_009708	TGG	2	6	4644	4649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153946819
95	NC_009708	TTC	2	6	4652	4657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153946819
96	NC_009708	CTG	2	6	4707	4712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153946819
97	NC_009708	CAG	2	6	4715	4720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153946819
98	NC_009708	GCT	2	6	4796	4801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153946819
99	NC_009708	CTT	3	9	5002	5010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153946819
100	NC_009708	TCA	2	6	5065	5070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153946819
101	NC_009708	GCG	2	6	5111	5116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153946819
102	NC_009708	GGA	2	6	5142	5147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153946819
103	NC_009708	TGC	2	6	5177	5182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153946819
104	NC_009708	TTCT	2	8	5254	5261	0 %	75 %	0 %	25 %	153946819
105	NC_009708	GAT	2	6	5271	5276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153946819
106	NC_009708	TGA	2	6	5305	5310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009708	TTG	2	6	5365	5370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009708	ATC	2	6	5388	5393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009708	ATT	2	6	5395	5400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009708	AAT	2	6	5460	5465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009708	TCT	2	6	5506	5511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009708	GA	3	6	5653	5658	50 %	0 %	50 %	0 %	153950934
113	NC_009708	T	6	6	5710	5715	0 %	100 %	0 %	0 %	153950934
114	NC_009708	GTC	2	6	5744	5749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153950934
115	NC_009708	AGG	2	6	5797	5802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153950934
116	NC_009708	TGG	2	6	5862	5867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153950934
117	NC_009708	TGG	2	6	5881	5886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153950934
118	NC_009708	CTT	2	6	5890	5895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153950934
119	NC_009708	CGC	2	6	5959	5964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153950934
120	NC_009708	TAT	2	6	6118	6123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153950934
121	NC_009708	T	6	6	6173	6178	0 %	100 %	0 %	0 %	153950934
122	NC_009708	T	6	6	6200	6205	0 %	100 %	0 %	0 %	153950934
123	NC_009708	CGT	2	6	6315	6320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153950934
124	NC_009708	ATT	2	6	6330	6335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153950934
125	NC_009708	TTA	2	6	6350	6355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153950934
126	NC_009708	CTT	2	6	6385	6390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153950934
127	NC_009708	ACC	2	6	6520	6525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153950934
128	NC_009708	ATT	2	6	6533	6538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153950934
129	NC_009708	AT	4	8	6566	6573	50 %	50 %	0 %	0 %	153950934
130	NC_009708	GGT	2	6	6604	6609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153950934
131	NC_009708	GGC	3	9	6646	6654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153950934
132	NC_009708	TCG	2	6	6744	6749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153950934
133	NC_009708	TTG	2	6	6767	6772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153950934
134	NC_009708	ATT	2	6	6811	6816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153950934
135	NC_009708	GTTG	2	8	6825	6832	0 %	50 %	50 %	0 %	153950934
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270	NC_009708	TCA	2	6	13199	13204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_009708	AC	3	6	13225	13230	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
272	NC_009708	AC	3	6	13394	13399	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
273	NC_009708	GTAG	2	8	13435	13442	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
274	NC_009708	CCT	2	6	13535	13540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
275	NC_009708	CA	3	6	13569	13574	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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