MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 31758 plasmid_153kb

Total Repeats: 3253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009705	A	7	7	141423	141429	100 %	0 %	0 %	0 %	153930745
3002	NC_009705	GTTA	2	8	141521	141528	25 %	50 %	25 %	0 %	153930745
3003	NC_009705	AG	3	6	141532	141537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_009705	CA	3	6	141551	141556	50 %	0 %	0 %	50 %	153930701
3005	NC_009705	GTG	2	6	141584	141589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153930701
3006	NC_009705	GA	3	6	141620	141625	50 %	0 %	50 %	0 %	153930701
3007	NC_009705	CT	3	6	141640	141645	0 %	50 %	0 %	50 %	153930701
3008	NC_009705	AAT	2	6	141676	141681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930701
3009	NC_009705	ATT	2	6	141717	141722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930701
3010	NC_009705	A	7	7	141756	141762	100 %	0 %	0 %	0 %	153930701
3011	NC_009705	TTAC	2	8	141798	141805	25 %	50 %	0 %	25 %	153930701
3012	NC_009705	ACC	2	6	141933	141938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153930701
3013	NC_009705	GAA	2	6	142015	142020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930701
3014	NC_009705	TGA	2	6	142032	142037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930701
3015	NC_009705	CA	3	6	142067	142072	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3016	NC_009705	T	6	6	142106	142111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_009705	T	6	6	142120	142125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_009705	ATG	2	6	142136	142141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930660
3019	NC_009705	GCC	2	6	142176	142181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153930660
3020	NC_009705	ACT	2	6	142208	142213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930660
3021	NC_009705	CAG	2	6	142256	142261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930660
3022	NC_009705	TGA	2	6	142300	142305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930660
3023	NC_009705	GTA	2	6	142308	142313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930660
3024	NC_009705	ATG	2	6	142343	142348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930660
3025	NC_009705	AAG	2	6	142407	142412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_009705	CCAAAG	2	12	142419	142430	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_009705	CAG	2	6	142431	142436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_009705	GAC	2	6	142449	142454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_009705	ATA	2	6	142481	142486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_009705	TGC	2	6	142681	142686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_009705	ACA	2	6	142741	142746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_009705	AGT	2	6	142750	142755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_009705	GCAGG	2	10	142780	142789	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3034	NC_009705	AAT	2	6	142833	142838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_009705	AGA	2	6	142943	142948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_009705	ACA	2	6	143067	143072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_009705	ATA	3	9	143122	143130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_009705	TTC	2	6	143215	143220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930651
3039	NC_009705	TTTC	2	8	143230	143237	0 %	75 %	0 %	25 %	153930651
3040	NC_009705	AAT	2	6	143243	143248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930651
3041	NC_009705	ATC	2	6	143253	143258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930651
3042	NC_009705	ATG	2	6	143269	143274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930651
3043	NC_009705	ATA	2	6	143278	143283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930651
3044	NC_009705	AG	3	6	143299	143304	50 %	0 %	50 %	0 %	153930651
3045	NC_009705	ATT	2	6	143324	143329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930651
3046	NC_009705	CTT	2	6	143349	143354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930651
3047	NC_009705	GCA	2	6	143448	143453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930651
3048	NC_009705	AAC	2	6	143456	143461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930651
3049	NC_009705	ATA	2	6	143556	143561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930651
3050	NC_009705	A	7	7	143561	143567	100 %	0 %	0 %	0 %	153930651
3051	NC_009705	AAT	2	6	143634	143639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930651
3052	NC_009705	T	6	6	143642	143647	0 %	100 %	0 %	0 %	153930651
3053	NC_009705	TGA	2	6	143657	143662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930651
3054	NC_009705	ATA	2	6	143673	143678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930651
3055	NC_009705	AT	3	6	143729	143734	50 %	50 %	0 %	0 %	153930651
3056	NC_009705	AAT	2	6	143829	143834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930651
3057	NC_009705	AT	3	6	143833	143838	50 %	50 %	0 %	0 %	153930651
3058	NC_009705	GAA	2	6	143886	143891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930651
3059	NC_009705	TGA	2	6	144010	144015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_009705	AGA	2	6	144052	144057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_009705	ATA	2	6	144113	144118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_009705	T	7	7	144141	144147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_009705	TAA	2	6	144196	144201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_009705	CT	3	6	144225	144230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3065	NC_009705	T	8	8	144244	144251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_009705	ACG	2	6	144260	144265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_009705	ACC	2	6	144275	144280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3068	NC_009705	TTA	2	6	144414	144419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_009705	AGTA	2	8	144428	144435	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_009705	ACA	2	6	144467	144472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_009705	TA	3	6	144505	144510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_009705	CAAG	2	8	144530	144537	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3073	NC_009705	TGT	2	6	144548	144553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_009705	TGT	2	6	144560	144565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_009705	T	6	6	144565	144570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_009705	ACTT	2	8	144612	144619	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3077	NC_009705	GCAC	2	8	144689	144696	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3078	NC_009705	ATT	2	6	144700	144705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_009705	TGA	3	9	144770	144778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930686
3080	NC_009705	TGA	2	6	144794	144799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930686
3081	NC_009705	ATT	2	6	144837	144842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930686
3082	NC_009705	AT	3	6	144854	144859	50 %	50 %	0 %	0 %	153930686
3083	NC_009705	A	6	6	144870	144875	100 %	0 %	0 %	0 %	153930686
3084	NC_009705	TGT	2	6	144884	144889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930686
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3087	NC_009705	A	7	7	144985	144991	100 %	0 %	0 %	0 %	153930686
3088	NC_009705	AAC	2	6	144993	144998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930686
3089	NC_009705	AT	3	6	145002	145007	50 %	50 %	0 %	0 %	153930686
3090	NC_009705	ATT	2	6	145023	145028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930686
3091	NC_009705	TA	3	6	145141	145146	50 %	50 %	0 %	0 %	153930686
3092	NC_009705	ACC	2	6	145212	145217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153930686
3093	NC_009705	ATTG	2	8	145295	145302	25 %	50 %	25 %	0 %	153930686
3094	NC_009705	ATA	2	6	145306	145311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930686
3095	NC_009705	AGGA	2	8	145363	145370	50 %	0 %	50 %	0 %	153930686
3096	NC_009705	CAT	2	6	145476	145481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930686
3097	NC_009705	CAT	2	6	145523	145528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930686
3098	NC_009705	TAA	2	6	145562	145567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930686
3099	NC_009705	AT	3	6	145589	145594	50 %	50 %	0 %	0 %	153930686
3100	NC_009705	GA	3	6	145646	145651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_009705	A	7	7	145651	145657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_009705	GTACC	2	10	145663	145672	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3103	NC_009705	TCC	2	6	145715	145720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	153930650
3104	NC_009705	GGT	2	6	145745	145750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153930650
3105	NC_009705	TGC	2	6	145762	145767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930650
3106	NC_009705	AAG	2	6	145791	145796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930650
3107	NC_009705	A	6	6	145829	145834	100 %	0 %	0 %	0 %	153930650
3108	NC_009705	ATA	2	6	145883	145888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_009705	GCA	2	6	145976	145981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_009705	CCAG	2	8	146014	146021	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3111	NC_009705	ATT	2	6	146195	146200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930746
3112	NC_009705	ATT	2	6	146213	146218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930746
3113	NC_009705	CATAT	2	10	146305	146314	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3114	NC_009705	GGC	2	6	146368	146373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_009705	AAAT	2	8	146422	146429	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_009705	TAT	2	6	146449	146454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_009705	AGT	2	6	146461	146466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_009705	CGG	3	9	146489	146497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_009705	ATC	2	6	146544	146549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_009705	TAA	2	6	146648	146653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930661
3121	NC_009705	TTA	2	6	146671	146676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930661
3122	NC_009705	AGA	2	6	146723	146728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930661
3123	NC_009705	A	6	6	146811	146816	100 %	0 %	0 %	0 %	153930661
3124	NC_009705	TTA	2	6	146837	146842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930661
3125	NC_009705	CAA	2	6	146847	146852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930661
3126	NC_009705	ATG	2	6	146887	146892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930661
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3128	NC_009705	ATA	2	6	146993	146998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930661
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3252	NC_009705	TTACT	2	10	153085	153094	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3253	NC_009705	TTAA	2	8	153118	153125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.