MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 31758 plasmid_153kb

Total Repeats: 3253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009705	GCT	2	6	119999	120004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_009705	ACA	2	6	120021	120026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2503	NC_009705	TGC	2	6	120042	120047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_009705	ACT	2	6	120106	120111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_009705	A	6	6	120119	120124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_009705	AAG	2	6	120156	120161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_009705	GCT	2	6	120184	120189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_009705	CTA	2	6	120192	120197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_009705	CTAT	2	8	120217	120224	25 %	50 %	0 %	25 %	153930756
2510	NC_009705	CTA	2	6	120267	120272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930756
2511	NC_009705	TCT	2	6	120382	120387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930756
2512	NC_009705	TA	3	6	120388	120393	50 %	50 %	0 %	0 %	153930756
2513	NC_009705	GTT	2	6	120399	120404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930756
2514	NC_009705	CTT	2	6	120456	120461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930756
2515	NC_009705	T	7	7	120490	120496	0 %	100 %	0 %	0 %	153930756
2516	NC_009705	C	6	6	120609	120614	0 %	0 %	0 %	100 %	153930671
2517	NC_009705	CAA	2	6	120644	120649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930671
2518	NC_009705	CTT	2	6	120704	120709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930671
2519	NC_009705	CTT	2	6	120764	120769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930671
2520	NC_009705	ATC	2	6	120807	120812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930671
2521	NC_009705	CAG	2	6	120917	120922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930671
2522	NC_009705	CGA	2	6	120997	121002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930671
2523	NC_009705	CAG	2	6	121010	121015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930671
2524	NC_009705	TTGC	2	8	121019	121026	0 %	50 %	25 %	25 %	153930671
2525	NC_009705	CCA	2	6	121060	121065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153930671
2526	NC_009705	GCA	2	6	121169	121174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2527	NC_009705	AATT	2	8	121204	121211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_009705	AGC	2	6	121277	121282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2529	NC_009705	GCA	2	6	121289	121294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_009705	AGC	2	6	121336	121341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2531	NC_009705	TGA	2	6	121426	121431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_009705	TGC	2	6	121455	121460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_009705	GCAG	2	8	121467	121474	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2534	NC_009705	AG	3	6	121481	121486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_009705	TGC	2	6	121532	121537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930633
2536	NC_009705	CAGA	2	8	121545	121552	50 %	0 %	25 %	25 %	153930633
2537	NC_009705	AG	3	6	121558	121563	50 %	0 %	50 %	0 %	153930633
2538	NC_009705	TGC	2	6	121587	121592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930633
2539	NC_009705	TGC	2	6	121598	121603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930633
2540	NC_009705	TGC	2	6	121653	121658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930633
2541	NC_009705	TGC	2	6	121664	121669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930633
2542	NC_009705	TAA	2	6	121674	121679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_009705	AAT	2	6	121724	121729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_009705	GAT	2	6	121772	121777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_009705	CAT	2	6	121780	121785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930695
2546	NC_009705	GAT	2	6	121813	121818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930695
2547	NC_009705	AG	3	6	121847	121852	50 %	0 %	50 %	0 %	153930695
2548	NC_009705	TCA	2	6	121868	121873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930695
2549	NC_009705	CT	3	6	121960	121965	0 %	50 %	0 %	50 %	153930695
2550	NC_009705	TGC	2	6	121966	121971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930695
2551	NC_009705	GTT	2	6	122024	122029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930695
2552	NC_009705	CAA	2	6	122031	122036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930695
2553	NC_009705	AGC	2	6	122047	122052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930695
2554	NC_009705	CCG	2	6	122097	122102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153930695
2555	NC_009705	AGC	2	6	122149	122154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930695
2556	NC_009705	ACG	2	6	122218	122223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930695
2557	NC_009705	ACT	2	6	122251	122256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930695
2558	NC_009705	CAA	2	6	122344	122349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930695
2559	NC_009705	GAT	2	6	122389	122394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930695
2560	NC_009705	GTC	2	6	122405	122410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930695
2561	NC_009705	AGA	2	6	122419	122424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930695
2562	NC_009705	AGGGGG	2	12	122504	122515	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	153930695
2563	NC_009705	AT	3	6	122577	122582	50 %	50 %	0 %	0 %	153930695
2564	NC_009705	TTG	2	6	122628	122633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930695
2565	NC_009705	T	6	6	122665	122670	0 %	100 %	0 %	0 %	153930695
2566	NC_009705	ACT	3	9	122692	122700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930695
2567	NC_009705	ATG	2	6	122810	122815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930695
2568	NC_009705	TTA	2	6	122950	122955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930710
2569	NC_009705	TAC	2	6	122960	122965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930710
2570	NC_009705	TTCC	2	8	123146	123153	0 %	50 %	0 %	50 %	153930710
2571	NC_009705	ATC	2	6	123175	123180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930710
2572	NC_009705	AAATT	2	10	123221	123230	60 %	40 %	0 %	0 %	153930710
2573	NC_009705	CAT	2	6	123257	123262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930710
2574	NC_009705	TTC	2	6	123288	123293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930710
2575	NC_009705	T	6	6	123298	123303	0 %	100 %	0 %	0 %	153930710
2576	NC_009705	AGT	2	6	123359	123364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930710
2577	NC_009705	TGA	2	6	123384	123389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930710
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2579	NC_009705	ATC	2	6	123508	123513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930710
2580	NC_009705	CTT	2	6	123555	123560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930710
2581	NC_009705	ATT	2	6	123567	123572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930710
2582	NC_009705	ATT	2	6	123576	123581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930710
2583	NC_009705	AGC	2	6	123654	123659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930710
2584	NC_009705	T	6	6	123667	123672	0 %	100 %	0 %	0 %	153930710
2585	NC_009705	ATC	2	6	123681	123686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930710
2586	NC_009705	TGAATC	2	12	123699	123710	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	153930710
2587	NC_009705	ATC	2	6	123735	123740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930710
2588	NC_009705	TGC	2	6	123757	123762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930710
2589	NC_009705	AGG	2	6	123771	123776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153930710
2590	NC_009705	TTAT	2	8	123803	123810	25 %	75 %	0 %	0 %	153930672
2591	NC_009705	T	6	6	123826	123831	0 %	100 %	0 %	0 %	153930672
2592	NC_009705	TCC	2	6	123940	123945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	153930672
2593	NC_009705	TAA	2	6	123995	124000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930672
2594	NC_009705	ATT	2	6	124082	124087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930672
2595	NC_009705	AAG	2	6	124088	124093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930672
2596	NC_009705	GCT	2	6	124119	124124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930672
2597	NC_009705	T	6	6	124179	124184	0 %	100 %	0 %	0 %	153930672
2598	NC_009705	GTA	2	6	124218	124223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930672
2599	NC_009705	AGT	2	6	124224	124229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930672
2600	NC_009705	T	6	6	124247	124252	0 %	100 %	0 %	0 %	153930672
2601	NC_009705	A	7	7	124259	124265	100 %	0 %	0 %	0 %	153930672
2602	NC_009705	T	6	6	124283	124288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_009705	AATT	2	8	124362	124369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_009705	ATT	2	6	124406	124411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_009705	T	8	8	124414	124421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_009705	T	6	6	124442	124447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_009705	TAA	2	6	124460	124465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_009705	TTA	2	6	124468	124473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_009705	AC	3	6	124484	124489	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2610	NC_009705	ACAT	2	8	124503	124510	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2611	NC_009705	TAGA	2	8	124521	124528	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_009705	GGC	2	6	124548	124553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_009705	ACC	2	6	124559	124564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2614	NC_009705	CA	3	6	124572	124577	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2615	NC_009705	TAA	2	6	124593	124598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_009705	AGA	2	6	124721	124726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_009705	ATG	2	6	124759	124764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_009705	AAAC	2	8	124766	124773	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2619	NC_009705	AAC	2	6	124777	124782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_009705	AAATT	2	10	124814	124823	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_009705	AAAAAG	2	12	124855	124866	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_009705	AC	3	6	124874	124879	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2623	NC_009705	GCA	2	6	124932	124937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2624	NC_009705	GA	3	6	124960	124965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_009705	AAT	2	6	124966	124971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_009705	A	6	6	125004	125009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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