MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 31758 plasmid_153kb

Total Repeats: 3253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009705	TCC	2	6	48934	48939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_009705	ATT	2	6	49009	49014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930754
1003	NC_009705	T	6	6	49030	49035	0 %	100 %	0 %	0 %	153930754
1004	NC_009705	T	6	6	49044	49049	0 %	100 %	0 %	0 %	153930754
1005	NC_009705	CAT	2	6	49062	49067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930754
1006	NC_009705	ATT	2	6	49117	49122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930754
1007	NC_009705	AAT	2	6	49357	49362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930754
1008	NC_009705	GGT	2	6	49408	49413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153930754
1009	NC_009705	CTT	2	6	49464	49469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930754
1010	NC_009705	ATT	3	9	49537	49545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930754
1011	NC_009705	TA	3	6	49609	49614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_009705	AT	3	6	49624	49629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_009705	A	7	7	49640	49646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_009705	TAAT	2	8	49673	49680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_009705	GT	3	6	49763	49768	0 %	50 %	50 %	0 %	153930705
1016	NC_009705	A	6	6	49808	49813	100 %	0 %	0 %	0 %	153930705
1017	NC_009705	GTT	2	6	49831	49836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930705
1018	NC_009705	ATC	2	6	49857	49862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930705
1019	NC_009705	ATTC	2	8	49921	49928	25 %	50 %	0 %	25 %	153930705
1020	NC_009705	GATT	2	8	49981	49988	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_009705	AT	3	6	50011	50016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_009705	GAA	2	6	50026	50031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_009705	AT	3	6	50033	50038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_009705	CT	3	6	50050	50055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_009705	GATG	2	8	50084	50091	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_009705	ATG	2	6	50160	50165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_009705	ATC	2	6	50170	50175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_009705	TTG	2	6	50206	50211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_009705	TTG	2	6	50326	50331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_009705	TTA	2	6	50393	50398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_009705	TCTT	2	8	50407	50414	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_009705	AG	3	6	50434	50439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_009705	GGC	2	6	50453	50458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_009705	CTA	2	6	50524	50529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_009705	ATC	2	6	50570	50575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_009705	CAG	2	6	50596	50601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_009705	ATC	2	6	50639	50644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_009705	AT	4	8	50704	50711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_009705	TGC	2	6	50810	50815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_009705	A	8	8	50828	50835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_009705	GGGCA	2	10	50837	50846	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1042	NC_009705	ATC	2	6	50861	50866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_009705	AAG	2	6	50879	50884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_009705	GCT	2	6	50906	50911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_009705	TTA	2	6	50962	50967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_009705	GAAT	2	8	51005	51012	50 %	25 %	25 %	0 %	153930649
1047	NC_009705	TCG	2	6	51107	51112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930649
1048	NC_009705	GA	3	6	51124	51129	50 %	0 %	50 %	0 %	153930649
1049	NC_009705	AAG	2	6	51164	51169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930649
1050	NC_009705	ACC	2	6	51272	51277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_009705	TTG	2	6	51429	51434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930688
1052	NC_009705	AC	3	6	51465	51470	50 %	0 %	0 %	50 %	153930688
1053	NC_009705	TGC	2	6	51628	51633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930688
1054	NC_009705	TGAG	2	8	51642	51649	25 %	25 %	50 %	0 %	153930688
1055	NC_009705	CTCA	2	8	51711	51718	25 %	25 %	0 %	50 %	153930688
1056	NC_009705	GCG	2	6	51723	51728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153930688
1057	NC_009705	TCC	2	6	51845	51850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	153930688
1058	NC_009705	CGG	2	6	51998	52003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153930688
1059	NC_009705	ACC	2	6	52040	52045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_009705	AAT	2	6	52046	52051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_009705	CTTG	2	8	52245	52252	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1062	NC_009705	CA	3	6	52429	52434	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_009705	TAT	2	6	52435	52440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_009705	TTG	2	6	52486	52491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930740
1065	NC_009705	ATC	2	6	52586	52591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930740
1066	NC_009705	GGC	2	6	52611	52616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153930740
1067	NC_009705	TGT	2	6	52711	52716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930740
1068	NC_009705	TTA	2	6	52789	52794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930740
1069	NC_009705	TGA	2	6	52830	52835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930740
1070	NC_009705	AACACC	2	12	52838	52849	50 %	0 %	0 %	50 %	153930740
1071	NC_009705	CAAA	2	8	52873	52880	75 %	0 %	0 %	25 %	153930740
1072	NC_009705	CAG	2	6	52933	52938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930740
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1074	NC_009705	GCG	2	6	52991	52996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153930740
1075	NC_009705	ACA	2	6	53032	53037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930740
1076	NC_009705	A	6	6	53101	53106	100 %	0 %	0 %	0 %	153930740
1077	NC_009705	TTA	2	6	53178	53183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930740
1078	NC_009705	TAAC	2	8	53200	53207	50 %	25 %	0 %	25 %	153930740
1079	NC_009705	ATT	2	6	53257	53262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_009705	TG	4	8	53286	53293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_009705	TAA	2	6	53375	53380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_009705	AGCC	2	8	53403	53410	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_009705	GCTT	2	8	53499	53506	0 %	50 %	25 %	25 %	153930685
1084	NC_009705	CTT	2	6	53558	53563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930685
1085	NC_009705	ATG	2	6	53608	53613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930685
1086	NC_009705	CTGAT	2	10	53691	53700	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1087	NC_009705	CGG	2	6	53757	53762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_009705	ACA	2	6	53879	53884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930751
1089	NC_009705	AAC	2	6	53904	53909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930751
1090	NC_009705	TTA	2	6	53962	53967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930751
1091	NC_009705	ATT	2	6	53991	53996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930751
1092	NC_009705	TCTT	2	8	54018	54025	0 %	75 %	0 %	25 %	153930751
1093	NC_009705	AGA	2	6	54042	54047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930751
1094	NC_009705	ACCGC	2	10	54049	54058	20 %	0 %	20 %	60 %	153930751
1095	NC_009705	CAA	2	6	54092	54097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930751
1096	NC_009705	A	6	6	54162	54167	100 %	0 %	0 %	0 %	153930751
1097	NC_009705	ATAAA	2	10	54170	54179	80 %	20 %	0 %	0 %	153930751
1098	NC_009705	TTC	2	6	54187	54192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930751
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1100	NC_009705	A	6	6	54226	54231	100 %	0 %	0 %	0 %	153930712
1101	NC_009705	AAT	2	6	54296	54301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930712
1102	NC_009705	CAT	2	6	54402	54407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930712
1103	NC_009705	ACT	2	6	54419	54424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930712
1104	NC_009705	T	6	6	54433	54438	0 %	100 %	0 %	0 %	153930712
1105	NC_009705	TC	3	6	54611	54616	0 %	50 %	0 %	50 %	153930712
1106	NC_009705	TGC	2	6	54763	54768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930712
1107	NC_009705	GGTC	2	8	54785	54792	0 %	25 %	50 %	25 %	153930712
1108	NC_009705	A	7	7	54807	54813	100 %	0 %	0 %	0 %	153930712
1109	NC_009705	GCA	2	6	54836	54841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930712
1110	NC_009705	T	7	7	54899	54905	0 %	100 %	0 %	0 %	153930712
1111	NC_009705	AT	3	6	54969	54974	50 %	50 %	0 %	0 %	153930712
1112	NC_009705	TGA	2	6	55117	55122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930712
1113	NC_009705	GCA	2	6	55137	55142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930712
1114	NC_009705	ATA	2	6	55169	55174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930712
1115	NC_009705	ATC	2	6	55192	55197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930712
1116	NC_009705	AAT	2	6	55264	55269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930712
1117	NC_009705	AT	3	6	55268	55273	50 %	50 %	0 %	0 %	153930712
1118	NC_009705	TGATA	2	10	55356	55365	40 %	40 %	20 %	0 %	153930712
1119	NC_009705	AATC	2	8	55375	55382	50 %	25 %	0 %	25 %	153930712
1120	NC_009705	AAT	2	6	55386	55391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930670
1121	NC_009705	TCA	2	6	55447	55452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930670
1122	NC_009705	ATC	2	6	55524	55529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930670
1123	NC_009705	TGT	2	6	55576	55581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930670
1124	NC_009705	TGA	2	6	55590	55595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930670
1125	NC_009705	TG	3	6	55645	55650	0 %	50 %	50 %	0 %	153930670
1126	NC_009705	CTGAG	2	10	55737	55746	20 %	20 %	40 %	20 %	153930670
1127	NC_009705	AGATGC	2	12	55830	55841	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	153930670
1128	NC_009705	GAT	2	6	55845	55850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930670
1129	NC_009705	CAT	2	6	55937	55942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_009705	CCTAA	2	10	55956	55965	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1131	NC_009705	GACT	2	8	56044	56051	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1132	NC_009705	GAC	2	6	56158	56163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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