MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 31758 plasmid_153kb

Total Repeats: 3253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009705	GAA	2	6	24517	24522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930642
502	NC_009705	TAT	2	6	24541	24546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930642
503	NC_009705	TC	4	8	24584	24591	0 %	50 %	0 %	50 %	153930642
504	NC_009705	AG	3	6	24649	24654	50 %	0 %	50 %	0 %	153930642
505	NC_009705	GCA	2	6	24770	24775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930642
506	NC_009705	ATG	2	6	24795	24800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930642
507	NC_009705	TATT	2	8	24863	24870	25 %	75 %	0 %	0 %	153930642
508	NC_009705	TGT	2	6	24901	24906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930642
509	NC_009705	T	7	7	24909	24915	0 %	100 %	0 %	0 %	153930642
510	NC_009705	CCT	2	6	24992	24997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	153930642
511	NC_009705	TA	3	6	25005	25010	50 %	50 %	0 %	0 %	153930642
512	NC_009705	T	6	6	25030	25035	0 %	100 %	0 %	0 %	153930642
513	NC_009705	AT	3	6	25041	25046	50 %	50 %	0 %	0 %	153930642
514	NC_009705	ATG	2	6	25052	25057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930642
515	NC_009705	CAG	2	6	25059	25064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930642
516	NC_009705	TTC	2	6	25105	25110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930642
517	NC_009705	AGA	2	6	25294	25299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930642
518	NC_009705	A	7	7	25436	25442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_009705	ACAAA	2	10	25477	25486	80 %	0 %	0 %	20 %	153930759
520	NC_009705	AAT	2	6	25512	25517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930759
521	NC_009705	GTC	2	6	25522	25527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930759
522	NC_009705	TGG	2	6	25548	25553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153930759
523	NC_009705	TTC	2	6	25575	25580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930759
524	NC_009705	TGT	2	6	25614	25619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930759
525	NC_009705	CAA	2	6	25629	25634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930759
526	NC_009705	AAC	2	6	25726	25731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930759
527	NC_009705	GTG	2	6	25757	25762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153930759
528	NC_009705	ATGC	2	8	25823	25830	25 %	25 %	25 %	25 %	153930759
529	NC_009705	TTAA	2	8	25864	25871	50 %	50 %	0 %	0 %	153930759
530	NC_009705	GAC	2	6	25875	25880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930759
531	NC_009705	TTG	2	6	25898	25903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930759
532	NC_009705	AAT	2	6	25976	25981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930759
533	NC_009705	T	6	6	25981	25986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_009705	T	6	6	26021	26026	0 %	100 %	0 %	0 %	153930637
535	NC_009705	TTG	2	6	26061	26066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930637
536	NC_009705	ATG	2	6	26217	26222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930637
537	NC_009705	CAC	2	6	26239	26244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153930637
538	NC_009705	AATT	2	8	26343	26350	50 %	50 %	0 %	0 %	153930637
539	NC_009705	ATGG	2	8	26363	26370	25 %	25 %	50 %	0 %	153930637
540	NC_009705	TTAATT	2	12	26372	26383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930637
541	NC_009705	TGA	2	6	26427	26432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930637
542	NC_009705	TCC	2	6	26479	26484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	153930637
543	NC_009705	AGC	2	6	26533	26538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930637
544	NC_009705	GGC	2	6	26552	26557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153930637
545	NC_009705	TCAA	2	8	26657	26664	50 %	25 %	0 %	25 %	153930637
546	NC_009705	TG	3	6	26733	26738	0 %	50 %	50 %	0 %	153930637
547	NC_009705	ATC	2	6	26795	26800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930637
548	NC_009705	GTT	2	6	26801	26806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930637
549	NC_009705	TGAGC	2	10	26845	26854	20 %	20 %	40 %	20 %	153930637
550	NC_009705	TTG	2	6	26862	26867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930637
551	NC_009705	ACA	2	6	26873	26878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930637
552	NC_009705	CAA	2	6	26918	26923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930637
553	NC_009705	CCA	2	6	26929	26934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153930637
554	NC_009705	CAA	2	6	26937	26942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930637
555	NC_009705	ATTA	2	8	26970	26977	50 %	50 %	0 %	0 %	153930637
556	NC_009705	GGT	2	6	26982	26987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_009705	TAT	2	6	27054	27059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930635
558	NC_009705	CTG	2	6	27062	27067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930635
559	NC_009705	CTT	2	6	27096	27101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930635
560	NC_009705	GTCAA	2	10	27111	27120	40 %	20 %	20 %	20 %	153930635
561	NC_009705	TGC	2	6	27121	27126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930635
562	NC_009705	ATT	2	6	27149	27154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930635
563	NC_009705	AT	3	6	27169	27174	50 %	50 %	0 %	0 %	153930635
564	NC_009705	GAA	2	6	27176	27181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930635
565	NC_009705	AAT	2	6	27182	27187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930635
566	NC_009705	GCA	3	9	27200	27208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930635
567	NC_009705	ACC	2	6	27209	27214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153930635
568	NC_009705	TCA	2	6	27225	27230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930635
569	NC_009705	ACC	2	6	27233	27238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153930635
570	NC_009705	AT	3	6	27259	27264	50 %	50 %	0 %	0 %	153930635
571	NC_009705	CAG	2	6	27327	27332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930635
572	NC_009705	GTG	2	6	27363	27368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153930635
573	NC_009705	AC	3	6	27408	27413	50 %	0 %	0 %	50 %	153930635
574	NC_009705	GGT	2	6	27425	27430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153930635
575	NC_009705	CTA	2	6	27450	27455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930635
576	NC_009705	GAAT	2	8	27615	27622	50 %	25 %	25 %	0 %	153930635
577	NC_009705	ATA	2	6	27645	27650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930635
578	NC_009705	ACC	2	6	27752	27757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153930635
579	NC_009705	GGC	2	6	27779	27784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153930635
580	NC_009705	AAC	2	6	27793	27798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930635
581	NC_009705	CGG	2	6	27805	27810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153930635
582	NC_009705	GCA	2	6	27915	27920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930635
583	NC_009705	AGG	2	6	27931	27936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153930635
584	NC_009705	TAA	2	6	27949	27954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930635
585	NC_009705	GCA	2	6	28073	28078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930635
586	NC_009705	GT	3	6	28104	28109	0 %	50 %	50 %	0 %	153930635
587	NC_009705	ATT	2	6	28137	28142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930635
588	NC_009705	G	6	6	28166	28171	0 %	0 %	100 %	0 %	153930635
589	NC_009705	CAA	2	6	28172	28177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930635
590	NC_009705	GGA	2	6	28208	28213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153930635
591	NC_009705	ACG	2	6	28284	28289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_009705	AGG	2	6	28316	28321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_009705	ATG	2	6	28348	28353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_009705	TGA	2	6	28361	28366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_009705	CAC	2	6	28378	28383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_009705	AAGTA	2	10	28433	28442	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
597	NC_009705	CCAG	2	8	28508	28515	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
598	NC_009705	CCCAT	2	10	28521	28530	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
599	NC_009705	TA	3	6	28811	28816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_009705	A	6	6	28878	28883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_009705	TAGC	2	8	28900	28907	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
602	NC_009705	CA	3	6	28915	28920	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
603	NC_009705	TCCC	2	8	28965	28972	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
604	NC_009705	A	6	6	29062	29067	100 %	0 %	0 %	0 %	153930697
605	NC_009705	ATA	2	6	29135	29140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930697
606	NC_009705	TTC	2	6	29211	29216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930697
607	NC_009705	TAT	2	6	29243	29248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930697
608	NC_009705	TTG	2	6	29305	29310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930697
609	NC_009705	ACCT	2	8	29510	29517	25 %	25 %	0 %	50 %	153930697
610	NC_009705	ATT	2	6	29653	29658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930697
611	NC_009705	TC	3	6	29711	29716	0 %	50 %	0 %	50 %	153930697
612	NC_009705	TGC	2	6	29754	29759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930697
613	NC_009705	AGA	2	6	29843	29848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930697
614	NC_009705	TGA	2	6	29940	29945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930697
615	NC_009705	TGA	2	6	29955	29960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930697
616	NC_009705	A	7	7	29960	29966	100 %	0 %	0 %	0 %	153930697
617	NC_009705	TTA	2	6	30001	30006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930697
618	NC_009705	TCAAT	2	10	30125	30134	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
619	NC_009705	TAAGC	2	10	30142	30151	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
620	NC_009705	ACA	2	6	30223	30228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_009705	T	6	6	30361	30366	0 %	100 %	0 %	0 %	153930763
622	NC_009705	TGC	2	6	30370	30375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930763
623	NC_009705	GAA	2	6	30380	30385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930763
624	NC_009705	GCA	2	6	30397	30402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930763
625	NC_009705	ATC	2	6	30433	30438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930763
626	NC_009705	TCT	2	6	30458	30463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930763
627	NC_009705	T	6	6	30512	30517	0 %	100 %	0 %	0 %	153930763
628	NC_009705	AC	3	6	30576	30581	50 %	0 %	0 %	50 %	153930763
629	NC_009705	TGGCT	2	10	30620	30629	0 %	40 %	40 %	20 %	153930763
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631	NC_009705	CGA	2	6	30714	30719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930763
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