MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 88900

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_009381	TAA	2	6	2224845	2224850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145599248
44002	NC_009381	ATTT	2	8	2225041	2225048	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44003	NC_009381	TC	3	6	2225061	2225066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44004	NC_009381	GACC	2	8	2225093	2225100	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44005	NC_009381	CAA	2	6	2225101	2225106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44006	NC_009381	CTTTT	2	10	2225148	2225157	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44007	NC_009381	T	6	6	2225168	2225173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44008	NC_009381	CAG	2	6	2225194	2225199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44009	NC_009381	AACC	2	8	2225230	2225237	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44010	NC_009381	AC	3	6	2225294	2225299	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44011	NC_009381	TAC	2	6	2225313	2225318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44012	NC_009381	ACC	2	6	2225354	2225359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145599249
44013	NC_009381	CAGTA	2	10	2225380	2225389	40 %	20 %	20 %	20 %	145599249
44014	NC_009381	AGC	2	6	2225482	2225487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599249
44015	NC_009381	AAT	2	6	2225503	2225508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145599249
44016	NC_009381	CGG	2	6	2225577	2225582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145599249
44017	NC_009381	TCG	2	6	2225610	2225615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145599249
44018	NC_009381	CA	3	6	2225616	2225621	50 %	0 %	0 %	50 %	145599249
44019	NC_009381	CAG	2	6	2225635	2225640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599249
44020	NC_009381	CAT	2	6	2225734	2225739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145599249
44021	NC_009381	ACAG	2	8	2225820	2225827	50 %	0 %	25 %	25 %	145599249
44022	NC_009381	CCA	2	6	2225829	2225834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145599249
44023	NC_009381	GTCA	2	8	2225860	2225867	25 %	25 %	25 %	25 %	145599249
44024	NC_009381	CAT	2	6	2225869	2225874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145599249
44025	NC_009381	TGGC	2	8	2225922	2225929	0 %	25 %	50 %	25 %	145599249
44026	NC_009381	TCA	2	6	2225936	2225941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145599249
44027	NC_009381	TAACTG	2	12	2225983	2225994	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	145599249
44028	NC_009381	TCA	2	6	2226050	2226055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145599249
44029	NC_009381	GCG	2	6	2226085	2226090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145599249
44030	NC_009381	CAC	2	6	2226097	2226102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145599249
44031	NC_009381	CAC	2	6	2226222	2226227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145599249
44032	NC_009381	ATCA	2	8	2226295	2226302	50 %	25 %	0 %	25 %	145599249
44033	NC_009381	CAT	2	6	2226309	2226314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145599249
44034	NC_009381	CGA	2	6	2226328	2226333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599249
44035	NC_009381	CGA	2	6	2226356	2226361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599249
44036	NC_009381	CGC	2	6	2226365	2226370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145599249
44037	NC_009381	GC	3	6	2226407	2226412	0 %	0 %	50 %	50 %	145599249
44038	NC_009381	CAAT	2	8	2226438	2226445	50 %	25 %	0 %	25 %	145599249
44039	NC_009381	GAC	2	6	2226468	2226473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599249
44040	NC_009381	CGC	2	6	2226521	2226526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145599249
44041	NC_009381	GT	3	6	2226545	2226550	0 %	50 %	50 %	0 %	145599249
44042	NC_009381	C	6	6	2226560	2226565	0 %	0 %	0 %	100 %	145599249
44043	NC_009381	GAA	2	6	2226637	2226642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145599249
44044	NC_009381	ACC	2	6	2226683	2226688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145599249
44045	NC_009381	TCA	2	6	2226714	2226719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145599249
44046	NC_009381	CAT	2	6	2226751	2226756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145599249
44047	NC_009381	ACG	2	6	2226821	2226826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599249
44048	NC_009381	GGCC	2	8	2226900	2226907	0 %	0 %	50 %	50 %	145599249
44049	NC_009381	ACCA	2	8	2226914	2226921	50 %	0 %	0 %	50 %	145599249
44050	NC_009381	GCA	2	6	2226980	2226985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599249
44051	NC_009381	TCA	2	6	2227047	2227052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145599249
44052	NC_009381	AAT	2	6	2227060	2227065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145599249
44053	NC_009381	CAA	2	6	2227069	2227074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145599249
44054	NC_009381	CGA	2	6	2227077	2227082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599249
44055	NC_009381	CAG	2	6	2227126	2227131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599249
44056	NC_009381	AGT	2	6	2227148	2227153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145599249
44057	NC_009381	CAAAA	2	10	2227179	2227188	80 %	0 %	0 %	20 %	145599249
44058	NC_009381	AAT	2	6	2227255	2227260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44059	NC_009381	CGGA	2	8	2227344	2227351	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44060	NC_009381	A	6	6	2227370	2227375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44061	NC_009381	CTA	2	6	2227393	2227398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44062	NC_009381	GCC	2	6	2227443	2227448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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44074	NC_009381	CT	3	6	2228132	2228137	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44075	NC_009381	CGG	2	6	2228166	2228171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44076	NC_009381	ATT	2	6	2228178	2228183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44085	NC_009381	TTTGA	2	10	2228831	2228840	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44086	NC_009381	ACAA	2	8	2228870	2228877	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44087	NC_009381	ACA	2	6	2228915	2228920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44088	NC_009381	CTG	2	6	2228987	2228992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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44091	NC_009381	C	7	7	2229324	2229330	0 %	0 %	0 %	100 %	145599252
44092	NC_009381	T	8	8	2229558	2229565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44093	NC_009381	AT	3	6	2229597	2229602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44094	NC_009381	AGA	2	6	2229653	2229658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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44097	NC_009381	T	6	6	2229769	2229774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44099	NC_009381	TTA	2	6	2229843	2229848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44100	NC_009381	A	6	6	2229906	2229911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44101	NC_009381	CTC	2	6	2229984	2229989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145599253
44102	NC_009381	ATC	2	6	2230003	2230008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145599253
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44105	NC_009381	GCA	2	6	2230126	2230131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599253
44106	NC_009381	CA	3	6	2230130	2230135	50 %	0 %	0 %	50 %	145599253
44107	NC_009381	CGG	2	6	2230227	2230232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145599253
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44109	NC_009381	CCG	2	6	2230473	2230478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145599253
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44114	NC_009381	TAT	2	6	2230695	2230700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145599253
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44116	NC_009381	ATCAA	2	10	2230736	2230745	60 %	20 %	0 %	20 %	145599253
44117	NC_009381	CTGA	2	8	2230780	2230787	25 %	25 %	25 %	25 %	145599253
44118	NC_009381	CCA	2	6	2230826	2230831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145599253
44119	NC_009381	GATG	2	8	2230851	2230858	25 %	25 %	50 %	0 %	145599253
44120	NC_009381	AT	3	6	2230881	2230886	50 %	50 %	0 %	0 %	145599253
44121	NC_009381	GATG	2	8	2230905	2230912	25 %	25 %	50 %	0 %	145599253
44122	NC_009381	GTC	2	6	2230913	2230918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145599253
44123	NC_009381	GTC	2	6	2230927	2230932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145599253
44124	NC_009381	GGT	2	6	2230939	2230944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145599253
44125	NC_009381	TGC	2	6	2230956	2230961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145599253
44126	NC_009381	CTG	2	6	2230996	2231001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145599253
44127	NC_009381	GCA	2	6	2231032	2231037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599253
44128	NC_009381	AGC	2	6	2231071	2231076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599253
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44130	NC_009381	ATA	2	6	2231149	2231154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44131	NC_009381	GTAG	2	8	2231181	2231188	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44132	NC_009381	CGAA	2	8	2231193	2231200	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44133	NC_009381	GTGA	2	8	2231250	2231257	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44134	NC_009381	AAT	2	6	2231327	2231332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145599254
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44197	NC_009381	TAA	2	6	2235025	2235030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44200	NC_009381	CT	4	8	2235308	2235315	0 %	50 %	0 %	50 %	145599256
44201	NC_009381	TCA	2	6	2235327	2235332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145599256
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44204	NC_009381	AT	3	6	2235545	2235550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44205	NC_009381	GCG	2	6	2235584	2235589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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44207	NC_009381	A	6	6	2235680	2235685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44208	NC_009381	GAAA	2	8	2235687	2235694	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44209	NC_009381	TGA	2	6	2235738	2235743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145599257
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44214	NC_009381	A	6	6	2236085	2236090	100 %	0 %	0 %	0 %	145599258
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44222	NC_009381	ATG	2	6	2236430	2236435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145599258
44223	NC_009381	GTT	2	6	2236457	2236462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145599258
44224	NC_009381	TCT	2	6	2236476	2236481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145599258
44225	NC_009381	GAA	2	6	2236507	2236512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145599258
44226	NC_009381	TGA	2	6	2236525	2236530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145599258
44227	NC_009381	TAA	2	6	2236597	2236602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145599258
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44229	NC_009381	CCTG	2	8	2236704	2236711	0 %	25 %	25 %	50 %	145599258
44230	NC_009381	GCCGG	2	10	2236715	2236724	0 %	0 %	60 %	40 %	145599258
44231	NC_009381	GTG	2	6	2236727	2236732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145599258
44232	NC_009381	TAT	2	6	2236807	2236812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145599258
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44235	NC_009381	ATC	2	6	2237018	2237023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145599258
44236	NC_009381	CGT	2	6	2237029	2237034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145599258
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44238	NC_009381	TGC	2	6	2237053	2237058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145599258
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44343	NC_009381	ATT	2	6	2241568	2241573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145599262
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44353	NC_009381	C	7	7	2242406	2242412	0 %	0 %	0 %	100 %	145599263
44354	NC_009381	GAC	2	6	2242415	2242420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599263
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