MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 88900

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_009381	GTA	2	6	1163531	1163536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23002	NC_009381	TGA	2	6	1163562	1163567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23003	NC_009381	TAA	2	6	1163656	1163661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145598327
23004	NC_009381	TCA	3	9	1163695	1163703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598327
23005	NC_009381	TGC	2	6	1163820	1163825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598327
23006	NC_009381	ACCT	2	8	1163865	1163872	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23007	NC_009381	CT	3	6	1163871	1163876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23008	NC_009381	AATG	2	8	1163938	1163945	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23009	NC_009381	ATT	2	6	1164003	1164008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23010	NC_009381	GGA	2	6	1164120	1164125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23011	NC_009381	T	6	6	1164196	1164201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23012	NC_009381	T	6	6	1164251	1164256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23013	NC_009381	TGC	2	6	1164308	1164313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598328
23014	NC_009381	TCA	2	6	1164433	1164438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598328
23015	NC_009381	ATA	2	6	1164442	1164447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145598328
23016	NC_009381	CTG	2	6	1164476	1164481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598328
23017	NC_009381	TTA	2	6	1164500	1164505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145598328
23018	NC_009381	GGGTG	2	10	1164507	1164516	0 %	20 %	80 %	0 %	145598328
23019	NC_009381	CTT	2	6	1164524	1164529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145598328
23020	NC_009381	TCG	2	6	1164703	1164708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598328
23021	NC_009381	GAT	2	6	1164875	1164880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23022	NC_009381	CAC	2	6	1164881	1164886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23023	NC_009381	GTG	2	6	1164907	1164912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23024	NC_009381	CAA	2	6	1164941	1164946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23025	NC_009381	CCA	2	6	1164980	1164985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23026	NC_009381	A	7	7	1165015	1165021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23027	NC_009381	GTT	2	6	1165040	1165045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23028	NC_009381	GCT	2	6	1165126	1165131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598329
23029	NC_009381	TAA	2	6	1165288	1165293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145598329
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23032	NC_009381	TCT	2	6	1165450	1165455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145598329
23033	NC_009381	TAT	2	6	1165457	1165462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145598329
23034	NC_009381	T	6	6	1165530	1165535	0 %	100 %	0 %	0 %	145598330
23035	NC_009381	TCA	2	6	1165582	1165587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598330
23036	NC_009381	GGT	2	6	1165691	1165696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145598330
23037	NC_009381	CTGTT	2	10	1165959	1165968	0 %	60 %	20 %	20 %	145598330
23038	NC_009381	TCA	2	6	1166032	1166037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598330
23039	NC_009381	CAC	3	9	1166038	1166046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145598330
23040	NC_009381	T	6	6	1166098	1166103	0 %	100 %	0 %	0 %	145598330
23041	NC_009381	ATT	2	6	1166169	1166174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23042	NC_009381	TGC	2	6	1166194	1166199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598331
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23045	NC_009381	CGGCG	2	10	1166648	1166657	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
23046	NC_009381	TCA	2	6	1166863	1166868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598332
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23050	NC_009381	GCA	2	6	1166988	1166993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598332
23051	NC_009381	TTG	2	6	1167082	1167087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145598332
23052	NC_009381	ATG	2	6	1167151	1167156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145598332
23053	NC_009381	ACA	2	6	1167217	1167222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145598332
23054	NC_009381	CGGA	2	8	1167284	1167291	25 %	0 %	50 %	25 %	145598332
23055	NC_009381	AGC	2	6	1167353	1167358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598332
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23057	NC_009381	CGG	2	6	1167403	1167408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23058	NC_009381	GCG	2	6	1167413	1167418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23059	NC_009381	TGG	2	6	1167422	1167427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23060	NC_009381	TG	3	6	1167450	1167455	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23061	NC_009381	CAA	2	6	1167467	1167472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23062	NC_009381	TAA	2	6	1167491	1167496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23063	NC_009381	ACT	2	6	1167497	1167502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23064	NC_009381	ACA	2	6	1167523	1167528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23065	NC_009381	AGA	2	6	1167703	1167708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23066	NC_009381	CGCC	2	8	1167754	1167761	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23067	NC_009381	ATGG	2	8	1167769	1167776	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23068	NC_009381	ATAC	2	8	1167787	1167794	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23069	NC_009381	AAT	2	6	1167832	1167837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23070	NC_009381	ACA	2	6	1167840	1167845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23071	NC_009381	AGG	2	6	1167893	1167898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23072	NC_009381	CAA	2	6	1167937	1167942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23073	NC_009381	ACG	2	6	1168029	1168034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23074	NC_009381	CCA	2	6	1168060	1168065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23075	NC_009381	TCTG	2	8	1168131	1168138	0 %	50 %	25 %	25 %	145598333
23076	NC_009381	TTTGA	2	10	1168156	1168165	20 %	60 %	20 %	0 %	145598333
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23078	NC_009381	TGC	2	6	1168213	1168218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598333
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23088	NC_009381	CCG	2	6	1168659	1168664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145598333
23089	NC_009381	TGA	2	6	1168703	1168708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145598333
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23091	NC_009381	TGT	2	6	1168778	1168783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145598333
23092	NC_009381	GCGCT	2	10	1168794	1168803	0 %	20 %	40 %	40 %	145598333
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23101	NC_009381	GA	3	6	1169237	1169242	50 %	0 %	50 %	0 %	145598334
23102	NC_009381	ACA	2	6	1169342	1169347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145598334
23103	NC_009381	CG	3	6	1169351	1169356	0 %	0 %	50 %	50 %	145598334
23104	NC_009381	CAC	2	6	1169360	1169365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145598334
23105	NC_009381	AAG	2	6	1169368	1169373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145598334
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23107	NC_009381	CGAAC	2	10	1169543	1169552	40 %	0 %	20 %	40 %	145598334
23108	NC_009381	GCTCCT	2	12	1169558	1169569	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	145598334
23109	NC_009381	GA	4	8	1169578	1169585	50 %	0 %	50 %	0 %	145598334
23110	NC_009381	GAAT	2	8	1169588	1169595	50 %	25 %	25 %	0 %	145598334
23111	NC_009381	GCGA	2	8	1169643	1169650	25 %	0 %	50 %	25 %	145598334
23112	NC_009381	CAG	2	6	1169735	1169740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598334
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23117	NC_009381	CTCAA	2	10	1170142	1170151	40 %	20 %	0 %	40 %	145598335
23118	NC_009381	GGA	2	6	1170266	1170271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145598335
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23120	NC_009381	A	6	6	1170375	1170380	100 %	0 %	0 %	0 %	145598335
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23230	NC_009381	TATT	2	8	1176540	1176547	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23231	NC_009381	TA	4	8	1176575	1176582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23232	NC_009381	CAT	2	6	1176588	1176593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23237	NC_009381	T	6	6	1176961	1176966	0 %	100 %	0 %	0 %	145598343
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23357	NC_009381	CGA	2	6	1183218	1183223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598346
23358	NC_009381	CAC	2	6	1183232	1183237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145598346
23359	NC_009381	CTG	2	6	1183363	1183368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598346
23360	NC_009381	ACCA	2	8	1183369	1183376	50 %	0 %	0 %	50 %	145598346
23361	NC_009381	CTG	2	6	1183433	1183438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598346
23362	NC_009381	CAT	2	6	1183517	1183522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598346
23363	NC_009381	GAT	2	6	1183574	1183579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145598346
23364	NC_009381	TACCGG	2	12	1183627	1183638	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145598346
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23367	NC_009381	GCCAA	2	10	1183814	1183823	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
23368	NC_009381	CA	3	6	1183836	1183841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23369	NC_009381	GA	3	6	1183917	1183922	50 %	0 %	50 %	0 %	145598347
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23379	NC_009381	ATC	2	6	1184397	1184402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598348
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23395	NC_009381	TGA	2	6	1185325	1185330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23399	NC_009381	AAACC	2	10	1185418	1185427	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
23400	NC_009381	GA	4	8	1185466	1185473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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23403	NC_009381	T	8	8	1185585	1185592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23457	NC_009381	CATC	2	8	1188335	1188342	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23458	NC_009381	GTA	2	6	1188501	1188506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145598352
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23467	NC_009381	A	7	7	1188962	1188968	100 %	0 %	0 %	0 %	145598352
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23472	NC_009381	TGG	2	6	1189149	1189154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145598352
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23478	NC_009381	TAT	2	6	1189509	1189514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23479	NC_009381	GA	3	6	1189516	1189521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23480	NC_009381	TCG	2	6	1189525	1189530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23481	NC_009381	TCA	2	6	1189548	1189553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23482	NC_009381	AAT	2	6	1189558	1189563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23483	NC_009381	ATA	2	6	1189615	1189620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23484	NC_009381	AAC	2	6	1189741	1189746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23485	NC_009381	TAC	2	6	1189809	1189814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598353
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