MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 88900

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22004	NC_009381	TGACC	2	10	1108704	1108713	20 %	20 %	20 %	40 %	145598274
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22009	NC_009381	GATCT	2	10	1108951	1108960	20 %	40 %	20 %	20 %	145598274
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22118	NC_009381	TGC	2	6	1115160	1115165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598279
22119	NC_009381	CGT	2	6	1115276	1115281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598279
22120	NC_009381	ATC	2	6	1115303	1115308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598279
22121	NC_009381	AGA	2	6	1115335	1115340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145598279
22122	NC_009381	TGG	2	6	1115351	1115356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145598279
22123	NC_009381	GCC	2	6	1115477	1115482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145598279
22124	NC_009381	TTG	2	6	1115573	1115578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145598279
22125	NC_009381	AGC	2	6	1115781	1115786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598279
22126	NC_009381	ATG	2	6	1115805	1115810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145598279
22127	NC_009381	CAT	2	6	1115846	1115851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598279
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22129	NC_009381	ATC	2	6	1115997	1116002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598279
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22131	NC_009381	GTT	2	6	1116206	1116211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145598280
22132	NC_009381	CAT	2	6	1116219	1116224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598280
22133	NC_009381	TAC	2	6	1116237	1116242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598280
22134	NC_009381	CTG	2	6	1116284	1116289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598280
22135	NC_009381	TGA	2	6	1116304	1116309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145598280
22136	NC_009381	GCA	2	6	1116485	1116490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598280
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22138	NC_009381	ATC	2	6	1116739	1116744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598280
22139	NC_009381	CGG	2	6	1116850	1116855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145598280
22140	NC_009381	GCG	2	6	1116892	1116897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145598280
22141	NC_009381	GTA	2	6	1116927	1116932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145598280
22142	NC_009381	CT	4	8	1116963	1116970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22143	NC_009381	TAA	2	6	1116974	1116979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22144	NC_009381	TGAT	2	8	1117098	1117105	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22145	NC_009381	ATG	2	6	1117132	1117137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22146	NC_009381	A	6	6	1117157	1117162	100 %	0 %	0 %	0 %	145598281
22147	NC_009381	AAC	2	6	1117251	1117256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145598281
22148	NC_009381	CGA	2	6	1117305	1117310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598281
22149	NC_009381	CGG	2	6	1117408	1117413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145598281
22150	NC_009381	TGCAGG	2	12	1117447	1117458	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	145598281
22151	NC_009381	GAG	2	6	1117469	1117474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145598281
22152	NC_009381	GGC	2	6	1117502	1117507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145598281
22153	NC_009381	TCG	2	6	1117582	1117587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598281
22154	NC_009381	CAC	2	6	1117686	1117691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145598281
22155	NC_009381	TAC	2	6	1117830	1117835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598281
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22157	NC_009381	CTG	2	6	1117889	1117894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598281
22158	NC_009381	CGA	2	6	1117912	1117917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598281
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22160	NC_009381	TGG	2	6	1117990	1117995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145598281
22161	NC_009381	T	6	6	1118086	1118091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22162	NC_009381	TGA	2	6	1118094	1118099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22163	NC_009381	GATC	2	8	1118341	1118348	25 %	25 %	25 %	25 %	145598282
22164	NC_009381	TCTA	2	8	1118349	1118356	25 %	50 %	0 %	25 %	145598282
22165	NC_009381	TAG	2	6	1118389	1118394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145598282
22166	NC_009381	TCAA	2	8	1118407	1118414	50 %	25 %	0 %	25 %	145598282
22167	NC_009381	TAT	2	6	1118500	1118505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145598282
22168	NC_009381	TGC	2	6	1118603	1118608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598282
22169	NC_009381	GTG	2	6	1118615	1118620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145598282
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22171	NC_009381	TGGC	2	8	1118749	1118756	0 %	25 %	50 %	25 %	145598282
22172	NC_009381	CCCG	2	8	1118829	1118836	0 %	0 %	25 %	75 %	145598282
22173	NC_009381	A	6	6	1118869	1118874	100 %	0 %	0 %	0 %	145598282
22174	NC_009381	GGCAT	2	10	1118939	1118948	20 %	20 %	40 %	20 %	145598282
22175	NC_009381	CAGT	2	8	1119051	1119058	25 %	25 %	25 %	25 %	145598282
22176	NC_009381	T	7	7	1119058	1119064	0 %	100 %	0 %	0 %	145598282
22177	NC_009381	ATT	2	6	1119074	1119079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145598282
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22184	NC_009381	GCTG	2	8	1119403	1119410	0 %	25 %	50 %	25 %	145598282
22185	NC_009381	GC	3	6	1119427	1119432	0 %	0 %	50 %	50 %	145598282
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22189	NC_009381	ATC	2	6	1119584	1119589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598283
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22193	NC_009381	CAC	2	6	1119781	1119786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145598283
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22197	NC_009381	ATC	2	6	1119893	1119898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598283
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22200	NC_009381	CA	3	6	1120093	1120098	50 %	0 %	0 %	50 %	145598283
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22202	NC_009381	TCA	2	6	1120224	1120229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598283
22203	NC_009381	CAG	2	6	1120310	1120315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598283
22204	NC_009381	CAT	2	6	1120333	1120338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598283
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22207	NC_009381	C	6	6	1120403	1120408	0 %	0 %	0 %	100 %	145598283
22208	NC_009381	TTG	2	6	1120497	1120502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145598283
22209	NC_009381	GCT	2	6	1120562	1120567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598283
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22212	NC_009381	CAC	2	6	1120778	1120783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145598283
22213	NC_009381	ATA	2	6	1120840	1120845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22214	NC_009381	A	6	6	1120874	1120879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22215	NC_009381	ATTA	2	8	1120891	1120898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22216	NC_009381	TC	3	6	1120913	1120918	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22217	NC_009381	AATT	2	8	1120919	1120926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22218	NC_009381	GCA	2	6	1120966	1120971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22219	NC_009381	TAT	3	9	1121021	1121029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22220	NC_009381	GAAT	2	8	1121045	1121052	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22221	NC_009381	T	6	6	1121070	1121075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22222	NC_009381	A	8	8	1121094	1121101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22223	NC_009381	AAT	2	6	1121113	1121118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22224	NC_009381	GAA	2	6	1121159	1121164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22225	NC_009381	TTG	2	6	1121203	1121208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22226	NC_009381	CTGA	2	8	1121318	1121325	25 %	25 %	25 %	25 %	145598284
22227	NC_009381	ATG	2	6	1121444	1121449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145598284
22228	NC_009381	A	6	6	1121504	1121509	100 %	0 %	0 %	0 %	145598284
22229	NC_009381	TTA	2	6	1121568	1121573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145598284
22230	NC_009381	CTT	2	6	1121665	1121670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145598284
22231	NC_009381	TATT	2	8	1121681	1121688	25 %	75 %	0 %	0 %	145598284
22232	NC_009381	CG	3	6	1121690	1121695	0 %	0 %	50 %	50 %	145598284
22233	NC_009381	CTAC	2	8	1121722	1121729	25 %	25 %	0 %	50 %	145598284
22234	NC_009381	A	6	6	1121850	1121855	100 %	0 %	0 %	0 %	145598284
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22339	NC_009381	AAT	2	6	1127270	1127275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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22342	NC_009381	TAA	2	6	1127469	1127474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22343	NC_009381	T	7	7	1127500	1127506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22344	NC_009381	AGA	2	6	1127513	1127518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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22347	NC_009381	TGA	2	6	1127555	1127560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22348	NC_009381	ATT	2	6	1127583	1127588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22349	NC_009381	A	6	6	1127700	1127705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22350	NC_009381	AG	3	6	1127718	1127723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22351	NC_009381	T	6	6	1127791	1127796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22352	NC_009381	ATTT	2	8	1127798	1127805	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22353	NC_009381	ATT	3	9	1127841	1127849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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22355	NC_009381	TA	3	6	1127882	1127887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22356	NC_009381	T	6	6	1127894	1127899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22357	NC_009381	AAT	2	6	1127908	1127913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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22359	NC_009381	CTT	2	6	1127979	1127984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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22473	NC_009381	AT	3	6	1134080	1134085	50 %	50 %	0 %	0 %	145598296
22474	NC_009381	GCTG	2	8	1134124	1134131	0 %	25 %	50 %	25 %	145598297
22475	NC_009381	CTA	2	6	1134167	1134172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598297
22476	NC_009381	CAT	2	6	1134353	1134358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598297
22477	NC_009381	AAAT	2	8	1134396	1134403	75 %	25 %	0 %	0 %	145598297
22478	NC_009381	TAA	2	6	1134473	1134478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145598297
22479	NC_009381	CAA	2	6	1134572	1134577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145598297
22480	NC_009381	CTG	2	6	1134578	1134583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598297
22481	NC_009381	T	6	6	1134587	1134592	0 %	100 %	0 %	0 %	145598297
22482	NC_009381	GCT	2	6	1134601	1134606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598297
22483	NC_009381	TC	3	6	1134707	1134712	0 %	50 %	0 %	50 %	145598297
22484	NC_009381	TGC	2	6	1134727	1134732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598297
22485	NC_009381	TCA	2	6	1134790	1134795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598297
22486	NC_009381	GTC	2	6	1134834	1134839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598297
22487	NC_009381	CAAT	2	8	1134892	1134899	50 %	25 %	0 %	25 %	145598297
22488	NC_009381	CCTGC	2	10	1134953	1134962	0 %	20 %	20 %	60 %	145598297
22489	NC_009381	CAG	2	6	1135034	1135039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598297
22490	NC_009381	GGA	2	6	1135150	1135155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145598297
22491	NC_009381	GCTG	2	8	1135353	1135360	0 %	25 %	50 %	25 %	145598297
22492	NC_009381	GGT	2	6	1135383	1135388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145598297
22493	NC_009381	AAC	2	6	1135428	1135433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145598297
22494	NC_009381	CGGG	2	8	1135457	1135464	0 %	0 %	75 %	25 %	145598297
22495	NC_009381	TCA	2	6	1135483	1135488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598297
22496	NC_009381	TGTA	2	8	1135550	1135557	25 %	50 %	25 %	0 %	145598297
22497	NC_009381	GTC	2	6	1135560	1135565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598297
22498	NC_009381	ATC	2	6	1135608	1135613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598297
22499	NC_009381	GCT	2	6	1135639	1135644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598297
22500	NC_009381	AG	3	6	1135830	1135835	50 %	0 %	50 %	0 %	145598297

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