MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 88900

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_009381	CTG	2	6	651995	652000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597883
13003	NC_009381	TGT	3	9	652125	652133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597883
13004	NC_009381	GCG	2	6	652211	652216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597884
13005	NC_009381	GCG	2	6	652248	652253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597884
13006	NC_009381	CAAAT	2	10	652262	652271	60 %	20 %	0 %	20 %	145597884
13007	NC_009381	GAG	2	6	652344	652349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145597884
13008	NC_009381	AGA	2	6	652522	652527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597884
13009	NC_009381	GC	3	6	652556	652561	0 %	0 %	50 %	50 %	145597884
13010	NC_009381	ATT	2	6	652760	652765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597884
13011	NC_009381	GTA	2	6	652789	652794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597884
13012	NC_009381	TAAT	2	8	652831	652838	50 %	50 %	0 %	0 %	145597884
13013	NC_009381	TAT	2	6	652843	652848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597884
13014	NC_009381	GAT	2	6	652928	652933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597884
13015	NC_009381	GCA	2	6	653022	653027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597884
13016	NC_009381	A	7	7	653065	653071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_009381	CTG	2	6	653101	653106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_009381	CGC	2	6	653115	653120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13019	NC_009381	TGCT	2	8	653230	653237	0 %	50 %	25 %	25 %	145597885
13020	NC_009381	CGA	2	6	653411	653416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597885
13021	NC_009381	GTT	2	6	653433	653438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597885
13022	NC_009381	CCAT	2	8	653444	653451	25 %	25 %	0 %	50 %	145597885
13023	NC_009381	TGC	2	6	653513	653518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597885
13024	NC_009381	AAT	2	6	653626	653631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597885
13025	NC_009381	CTGC	2	8	653705	653712	0 %	25 %	25 %	50 %	145597886
13026	NC_009381	GCC	2	6	653807	653812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597886
13027	NC_009381	TAA	2	6	653835	653840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597886
13028	NC_009381	GGT	2	6	653889	653894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597886
13029	NC_009381	ATC	2	6	653896	653901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597886
13030	NC_009381	TAC	2	6	653994	653999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597886
13031	NC_009381	ATG	2	6	654192	654197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597886
13032	NC_009381	TAT	2	6	654212	654217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_009381	ACACC	2	10	654303	654312	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
13034	NC_009381	CACG	2	8	654411	654418	25 %	0 %	25 %	50 %	145597887
13035	NC_009381	AAT	2	6	654460	654465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597887
13036	NC_009381	CCAAC	2	10	654468	654477	40 %	0 %	0 %	60 %	145597887
13037	NC_009381	GGGC	2	8	654548	654555	0 %	0 %	75 %	25 %	145597887
13038	NC_009381	CTT	2	6	654666	654671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597887
13039	NC_009381	AAG	2	6	654683	654688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597887
13040	NC_009381	GCT	2	6	654709	654714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597887
13041	NC_009381	C	6	6	654785	654790	0 %	0 %	0 %	100 %	145597887
13042	NC_009381	GAT	2	6	654811	654816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597887
13043	NC_009381	TGG	2	6	654830	654835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597887
13044	NC_009381	CAC	2	6	654946	654951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597887
13045	NC_009381	TCT	2	6	654965	654970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597887
13046	NC_009381	CGG	2	6	655015	655020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597887
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13048	NC_009381	GCGCT	2	10	655195	655204	0 %	20 %	40 %	40 %	145597887
13049	NC_009381	ATAGC	2	10	655209	655218	40 %	20 %	20 %	20 %	145597887
13050	NC_009381	TCTT	2	8	655229	655236	0 %	75 %	0 %	25 %	145597887
13051	NC_009381	GCA	2	6	655375	655380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597888
13052	NC_009381	CAG	2	6	655391	655396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597888
13053	NC_009381	TCA	2	6	655434	655439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597888
13054	NC_009381	AG	3	6	655442	655447	50 %	0 %	50 %	0 %	145597888
13055	NC_009381	TGAG	2	8	655483	655490	25 %	25 %	50 %	0 %	145597888
13056	NC_009381	AGGG	2	8	655493	655500	25 %	0 %	75 %	0 %	145597888
13057	NC_009381	GGC	2	6	655628	655633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597888
13058	NC_009381	T	6	6	655642	655647	0 %	100 %	0 %	0 %	145597888
13059	NC_009381	T	7	7	655660	655666	0 %	100 %	0 %	0 %	145597888
13060	NC_009381	T	6	6	655768	655773	0 %	100 %	0 %	0 %	145597888
13061	NC_009381	AAT	2	6	655914	655919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597888
13062	NC_009381	GTA	2	6	655945	655950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597888
13063	NC_009381	TCA	2	6	655974	655979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597888
13064	NC_009381	GGT	2	6	656017	656022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597888
13065	NC_009381	TGA	2	6	656083	656088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597889
13066	NC_009381	CG	3	6	656093	656098	0 %	0 %	50 %	50 %	145597889
13067	NC_009381	ATAA	2	8	656112	656119	75 %	25 %	0 %	0 %	145597889
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13070	NC_009381	TCA	2	6	656214	656219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597889
13071	NC_009381	GCTG	2	8	656430	656437	0 %	25 %	50 %	25 %	145597890
13072	NC_009381	CAC	2	6	656490	656495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597890
13073	NC_009381	GGT	2	6	656507	656512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597890
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13080	NC_009381	T	6	6	656783	656788	0 %	100 %	0 %	0 %	145597890
13081	NC_009381	T	6	6	656827	656832	0 %	100 %	0 %	0 %	145597890
13082	NC_009381	GTGACT	2	12	656932	656943	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	145597890
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13084	NC_009381	TGA	2	6	657115	657120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597891
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13086	NC_009381	GCA	2	6	657169	657174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597891
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13088	NC_009381	CAT	2	6	657302	657307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597891
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13090	NC_009381	TCA	2	6	657390	657395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597891
13091	NC_009381	GCT	2	6	657403	657408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597891
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13094	NC_009381	CAC	2	6	657656	657661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13095	NC_009381	GGGTT	2	10	657662	657671	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_009381	ACC	2	6	657726	657731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13097	NC_009381	TTC	2	6	657758	657763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13098	NC_009381	ATTT	2	8	657801	657808	25 %	75 %	0 %	0 %	145597892
13099	NC_009381	GCA	2	6	657816	657821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597892
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13101	NC_009381	GCT	2	6	657834	657839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597892
13102	NC_009381	T	6	6	657847	657852	0 %	100 %	0 %	0 %	145597892
13103	NC_009381	GAA	2	6	657956	657961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597892
13104	NC_009381	CAG	2	6	657971	657976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597892
13105	NC_009381	CTG	2	6	657988	657993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597892
13106	NC_009381	ATG	2	6	658023	658028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597892
13107	NC_009381	CGC	2	6	658091	658096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597892
13108	NC_009381	GCA	2	6	658122	658127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597892
13109	NC_009381	GCC	2	6	658175	658180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597892
13110	NC_009381	GCC	2	6	658196	658201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597892
13111	NC_009381	CAA	2	6	658210	658215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597892
13112	NC_009381	CAG	2	6	658315	658320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597892
13113	NC_009381	TGA	2	6	658333	658338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597892
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13115	NC_009381	TCT	2	6	658380	658385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597892
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