MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 88900

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_009381	TGG	2	6	557938	557943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597807
11003	NC_009381	GCC	2	6	558009	558014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597807
11004	NC_009381	TGA	2	6	558077	558082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597807
11005	NC_009381	TGG	2	6	558097	558102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597807
11006	NC_009381	TTGA	2	8	558117	558124	25 %	50 %	25 %	0 %	145597807
11007	NC_009381	GTG	2	6	558127	558132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597807
11008	NC_009381	TGA	2	6	558245	558250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597807
11009	NC_009381	TGAA	2	8	558259	558266	50 %	25 %	25 %	0 %	145597807
11010	NC_009381	AGATG	2	10	558272	558281	40 %	20 %	40 %	0 %	145597807
11011	NC_009381	TTC	2	6	558288	558293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597807
11012	NC_009381	TGC	2	6	558412	558417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597807
11013	NC_009381	CAG	2	6	558432	558437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597807
11014	NC_009381	GA	3	6	558538	558543	50 %	0 %	50 %	0 %	145597807
11015	NC_009381	GTT	2	6	558554	558559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597807
11016	NC_009381	A	6	6	558594	558599	100 %	0 %	0 %	0 %	145597808
11017	NC_009381	CGGG	2	8	558607	558614	0 %	0 %	75 %	25 %	145597808
11018	NC_009381	TCA	2	6	558633	558638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597808
11019	NC_009381	CAGAC	2	10	558683	558692	40 %	0 %	20 %	40 %	145597808
11020	NC_009381	AGG	2	6	558737	558742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145597808
11021	NC_009381	ATG	2	6	558818	558823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597808
11022	NC_009381	ATG	2	6	558878	558883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597808
11023	NC_009381	AGC	2	6	558941	558946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597808
11024	NC_009381	GCC	2	6	558947	558952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597808
11025	NC_009381	TTA	2	6	558961	558966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597808
11026	NC_009381	TGG	2	6	558971	558976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597808
11027	NC_009381	GGC	2	6	559056	559061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597808
11028	NC_009381	ATG	2	6	559124	559129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597808
11029	NC_009381	GGC	2	6	559161	559166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597808
11030	NC_009381	TGG	2	6	559178	559183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597808
11031	NC_009381	CAG	2	6	559269	559274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597808
11032	NC_009381	T	6	6	559275	559280	0 %	100 %	0 %	0 %	145597808
11033	NC_009381	GCT	3	9	559387	559395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597809
11034	NC_009381	GGT	2	6	559474	559479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597809
11035	NC_009381	GTT	2	6	559576	559581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597809
11036	NC_009381	TTA	2	6	559608	559613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597809
11037	NC_009381	ATCC	2	8	559688	559695	25 %	25 %	0 %	50 %	145597809
11038	NC_009381	CGG	2	6	559703	559708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597809
11039	NC_009381	CTG	2	6	559754	559759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597809
11040	NC_009381	GT	3	6	559815	559820	0 %	50 %	50 %	0 %	145597809
11041	NC_009381	TGG	4	12	559857	559868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597809
11042	NC_009381	GCC	2	6	559925	559930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597809
11043	NC_009381	GTG	3	9	559946	559954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597809
11044	NC_009381	CGA	2	6	559966	559971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597809
11045	NC_009381	TGCCA	2	10	560006	560015	20 %	20 %	20 %	40 %	145597809
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11047	NC_009381	TGC	2	6	560049	560054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597809
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11050	NC_009381	CCA	2	6	560127	560132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597809
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11052	NC_009381	CAA	2	6	560237	560242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597809
11053	NC_009381	CAG	2	6	560381	560386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597809
11054	NC_009381	GCC	2	6	560393	560398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597809
11055	NC_009381	TAC	2	6	560504	560509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597809
11056	NC_009381	AGG	2	6	560535	560540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145597809
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11058	NC_009381	CCT	2	6	560595	560600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145597809
11059	NC_009381	AC	3	6	560643	560648	50 %	0 %	0 %	50 %	145597810
11060	NC_009381	GCTC	2	8	560676	560683	0 %	25 %	25 %	50 %	145597810
11061	NC_009381	CCAG	2	8	560694	560701	25 %	0 %	25 %	50 %	145597810
11062	NC_009381	GCA	2	6	560707	560712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597810
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11064	NC_009381	GAG	2	6	560774	560779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145597810
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11067	NC_009381	GTA	2	6	560948	560953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597810
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11069	NC_009381	AAG	2	6	560967	560972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597810
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11071	NC_009381	CAG	2	6	561044	561049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597810
11072	NC_009381	A	7	7	561088	561094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_009381	T	6	6	561125	561130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_009381	TGGG	2	8	561133	561140	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_009381	ACT	2	6	561157	561162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11077	NC_009381	GCT	2	6	561418	561423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597811
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11080	NC_009381	GA	3	6	561564	561569	50 %	0 %	50 %	0 %	145597811
11081	NC_009381	CTT	2	6	561583	561588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597811
11082	NC_009381	AATTGC	2	12	561600	561611	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	145597811
11083	NC_009381	TAT	2	6	561640	561645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597811
11084	NC_009381	CAG	2	6	561785	561790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597811
11085	NC_009381	TTC	2	6	561880	561885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597812
11086	NC_009381	GGC	2	6	561905	561910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597812
11087	NC_009381	GTT	2	6	561983	561988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597812
11088	NC_009381	GTC	2	6	562063	562068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597812
11089	NC_009381	TTA	2	6	562127	562132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11090	NC_009381	ACTTA	2	10	562218	562227	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11091	NC_009381	TAACT	2	10	562235	562244	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11092	NC_009381	GCC	2	6	562284	562289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11093	NC_009381	TGA	2	6	562302	562307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_009381	CCCG	2	8	562348	562355	0 %	0 %	25 %	75 %	145597813
11095	NC_009381	CAC	2	6	562376	562381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597813
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11097	NC_009381	T	6	6	562398	562403	0 %	100 %	0 %	0 %	145597813
11098	NC_009381	T	7	7	562431	562437	0 %	100 %	0 %	0 %	145597813
11099	NC_009381	GCC	2	6	562610	562615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597813
11100	NC_009381	TTC	4	12	562632	562643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597813
11101	NC_009381	TGT	2	6	562794	562799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597813
11102	NC_009381	GTT	2	6	562979	562984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597813
11103	NC_009381	CA	3	6	563008	563013	50 %	0 %	0 %	50 %	145597813
11104	NC_009381	GACG	2	8	563050	563057	25 %	0 %	50 %	25 %	145597813
11105	NC_009381	AATAAA	2	12	563110	563121	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	145597813
11106	NC_009381	A	6	6	563119	563124	100 %	0 %	0 %	0 %	145597813
11107	NC_009381	ATTA	2	8	563129	563136	50 %	50 %	0 %	0 %	145597813
11108	NC_009381	GTG	2	6	563171	563176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597813
11109	NC_009381	CAA	2	6	563187	563192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597813
11110	NC_009381	ATC	2	6	563416	563421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597814
11111	NC_009381	TCA	2	6	563447	563452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597814
11112	NC_009381	GTC	2	6	563461	563466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597814
11113	NC_009381	ATG	2	6	563474	563479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597814
11114	NC_009381	CAC	2	6	563484	563489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597814
11115	NC_009381	GTC	2	6	563497	563502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597814
11116	NC_009381	A	6	6	563587	563592	100 %	0 %	0 %	0 %	145597814
11117	NC_009381	TGGC	2	8	563699	563706	0 %	25 %	50 %	25 %	145597815
11118	NC_009381	CGG	2	6	563774	563779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597815
11119	NC_009381	CTG	2	6	563783	563788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597815
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11121	NC_009381	GGC	2	6	563905	563910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597815
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11231	NC_009381	CAC	2	6	569181	569186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597821
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11233	NC_009381	GGT	2	6	569215	569220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597821
11234	NC_009381	GCG	3	9	569246	569254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597821
11235	NC_009381	GATGGT	2	12	569383	569394	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	145597821
11236	NC_009381	TGA	2	6	569455	569460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597821
11237	NC_009381	CAT	2	6	569461	569466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597821
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11239	NC_009381	ATC	2	6	569557	569562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597822
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11491	NC_009381	TA	3	6	580118	580123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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