MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Yersinia pestis Pestoides F plasmid MT

Total Repeats: 2607

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009378	GCC	2	6	215	220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597193
2	NC_009378	CGC	2	6	229	234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597193
3	NC_009378	CTG	2	6	238	243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597193
4	NC_009378	TCGC	2	8	328	335	0 %	25 %	25 %	50 %	145597193
5	NC_009378	CATT	2	8	382	389	25 %	50 %	0 %	25 %	145597193
6	NC_009378	TC	4	8	393	400	0 %	50 %	0 %	50 %	145597193
7	NC_009378	CAGGAG	2	12	408	419	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	145597193
8	NC_009378	GTTCG	2	10	426	435	0 %	40 %	40 %	20 %	145597193
9	NC_009378	GAC	2	6	448	453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597193
10	NC_009378	CTT	2	6	605	610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597193
11	NC_009378	TGG	2	6	611	616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597193
12	NC_009378	CG	3	6	622	627	0 %	0 %	50 %	50 %	145597193
13	NC_009378	TC	3	6	736	741	0 %	50 %	0 %	50 %	145597193
14	NC_009378	GGT	2	6	782	787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597193
15	NC_009378	GCTG	2	8	895	902	0 %	25 %	50 %	25 %	145597193
16	NC_009378	AGC	2	6	970	975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597193
17	NC_009378	A	6	6	1002	1007	100 %	0 %	0 %	0 %	145597193
18	NC_009378	TGA	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597193
19	NC_009378	CAT	2	6	1062	1067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597193
20	NC_009378	TGA	2	6	1107	1112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597193
21	NC_009378	AGCGC	2	10	1175	1184	20 %	0 %	40 %	40 %	145597194
22	NC_009378	GAA	2	6	1253	1258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597194
23	NC_009378	TCA	2	6	1270	1275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597194
24	NC_009378	CGG	2	6	1314	1319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597194
25	NC_009378	CTCA	2	8	1390	1397	25 %	25 %	0 %	50 %	145597194
26	NC_009378	CAG	3	9	1518	1526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597194
27	NC_009378	ACG	2	6	1574	1579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597194
28	NC_009378	C	6	6	1599	1604	0 %	0 %	0 %	100 %	145597194
29	NC_009378	TCA	2	6	1611	1616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597194
30	NC_009378	TGA	2	6	1618	1623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597194
31	NC_009378	TCAG	2	8	1641	1648	25 %	25 %	25 %	25 %	145597194
32	NC_009378	GAA	2	6	1649	1654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597194
33	NC_009378	TTC	2	6	1664	1669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597194
34	NC_009378	GCA	2	6	1760	1765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597194
35	NC_009378	TCAAA	2	10	1813	1822	60 %	20 %	0 %	20 %	145597194
36	NC_009378	CAGA	2	8	1840	1847	50 %	0 %	25 %	25 %	145597194
37	NC_009378	TGG	2	6	1913	1918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009378	CGT	2	6	1944	1949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009378	TA	3	6	1998	2003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009378	CTAC	3	12	2009	2020	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009378	TTTA	2	8	2021	2028	25 %	75 %	0 %	0 %	145597195
42	NC_009378	TCT	2	6	2044	2049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597195
43	NC_009378	TCA	2	6	2155	2160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597195
44	NC_009378	TTG	2	6	2202	2207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597195
45	NC_009378	TTC	2	6	2215	2220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597195
46	NC_009378	TCT	2	6	2264	2269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597195
47	NC_009378	CTT	2	6	2273	2278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597195
48	NC_009378	GA	3	6	2327	2332	50 %	0 %	50 %	0 %	145597195
49	NC_009378	GAT	2	6	2417	2422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597195
50	NC_009378	CTT	2	6	2423	2428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597195
51	NC_009378	GTC	2	6	2482	2487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597195
52	NC_009378	GGT	2	6	2488	2493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597195
53	NC_009378	AT	3	6	2557	2562	50 %	50 %	0 %	0 %	145597195
54	NC_009378	CAG	2	6	2577	2582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597195
55	NC_009378	CCAA	2	8	2710	2717	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009378	AT	3	6	2752	2757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009378	A	6	6	2917	2922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009378	ATAGTG	2	12	3002	3013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597196
59	NC_009378	TG	3	6	3012	3017	0 %	50 %	50 %	0 %	145597196
60	NC_009378	TGAG	2	8	3064	3071	25 %	25 %	50 %	0 %	145597196
61	NC_009378	CAG	2	6	3117	3122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597196
62	NC_009378	ACT	2	6	3154	3159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597196
63	NC_009378	CTG	2	6	3190	3195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597196
64	NC_009378	TG	3	6	3194	3199	0 %	50 %	50 %	0 %	145597196
65	NC_009378	TGT	2	6	3394	3399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597196
66	NC_009378	GGTT	2	8	3400	3407	0 %	50 %	50 %	0 %	145597196
67	NC_009378	ACA	2	6	3477	3482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597196
68	NC_009378	ATC	2	6	3509	3514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597196
69	NC_009378	AC	3	6	3534	3539	50 %	0 %	0 %	50 %	145597196
70	NC_009378	GCC	2	6	3554	3559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597196
71	NC_009378	AC	3	6	3570	3575	50 %	0 %	0 %	50 %	145597196
72	NC_009378	ATG	2	6	3599	3604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597196
73	NC_009378	GGT	2	6	3671	3676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597196
74	NC_009378	ACT	2	6	3682	3687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597196
75	NC_009378	AT	3	6	3693	3698	50 %	50 %	0 %	0 %	145597196
76	NC_009378	AAC	2	6	3755	3760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597196
77	NC_009378	ATT	2	6	3772	3777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597196
78	NC_009378	CTG	2	6	3882	3887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597196
79	NC_009378	ACC	2	6	4062	4067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597196
80	NC_009378	AAT	2	6	4124	4129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597196
81	NC_009378	AGCC	2	8	4173	4180	25 %	0 %	25 %	50 %	145597196
82	NC_009378	CAA	2	6	4198	4203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597196
83	NC_009378	TCCA	2	8	4258	4265	25 %	25 %	0 %	50 %	145597196
84	NC_009378	GCT	2	6	4269	4274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597196
85	NC_009378	GCA	2	6	4328	4333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597196
86	NC_009378	CAA	2	6	4374	4379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597196
87	NC_009378	CAG	3	9	4428	4436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597196
88	NC_009378	CTAT	2	8	4481	4488	25 %	50 %	0 %	25 %	145597196
89	NC_009378	ACT	2	6	4573	4578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597196
90	NC_009378	AAC	2	6	4585	4590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597196
91	NC_009378	CTG	2	6	4594	4599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597196
92	NC_009378	GTT	2	6	4604	4609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597196
93	NC_009378	TGC	2	6	4623	4628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597196
94	NC_009378	CCG	2	6	4731	4736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597196
95	NC_009378	GCT	2	6	4763	4768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597196
96	NC_009378	AGC	2	6	4831	4836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597196
97	NC_009378	CAT	2	6	4884	4889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597196
98	NC_009378	GCT	2	6	4991	4996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597196
99	NC_009378	AGC	4	12	5002	5013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597196
100	NC_009378	GAA	2	6	5072	5077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597196
101	NC_009378	GCA	2	6	5093	5098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597196
102	NC_009378	GCTGAA	2	12	5261	5272	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	145597196
103	NC_009378	GC	3	6	5333	5338	0 %	0 %	50 %	50 %	145597196
104	NC_009378	CGA	2	6	5424	5429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597196
105	NC_009378	TCA	2	6	5486	5491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597196
106	NC_009378	TGA	2	6	5595	5600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597196
107	NC_009378	CTTC	2	8	5613	5620	0 %	50 %	0 %	50 %	145597196
108	NC_009378	TTG	2	6	5693	5698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597196
109	NC_009378	GTGCCA	2	12	5756	5767	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145597196
110	NC_009378	ACTT	2	8	5867	5874	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_009378	AAAG	2	8	5889	5896	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009378	CCG	2	6	5904	5909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597197
113	NC_009378	C	6	6	5921	5926	0 %	0 %	0 %	100 %	145597197
114	NC_009378	CA	3	6	5960	5965	50 %	0 %	0 %	50 %	145597197
115	NC_009378	T	6	6	5979	5984	0 %	100 %	0 %	0 %	145597197
116	NC_009378	TCGT	2	8	5997	6004	0 %	50 %	25 %	25 %	145597197
117	NC_009378	AAC	2	6	6025	6030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597197
118	NC_009378	TTA	2	6	6088	6093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597197
119	NC_009378	AGA	2	6	6107	6112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597197
120	NC_009378	GCT	2	6	6136	6141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597197
121	NC_009378	ATTA	2	8	6246	6253	50 %	50 %	0 %	0 %	145597197
122	NC_009378	ACC	2	6	6315	6320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597197
123	NC_009378	CAG	2	6	6491	6496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597197
124	NC_009378	ATA	2	6	6517	6522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597197
125	NC_009378	TTCA	2	8	6566	6573	25 %	50 %	0 %	25 %	145597198
126	NC_009378	TAA	2	6	6648	6653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597198
127	NC_009378	GATT	2	8	6666	6673	25 %	50 %	25 %	0 %	145597198
128	NC_009378	TC	3	6	6684	6689	0 %	50 %	0 %	50 %	145597198
129	NC_009378	AT	3	6	6695	6700	50 %	50 %	0 %	0 %	145597198
130	NC_009378	CTG	2	6	6701	6706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597198
131	NC_009378	TCC	2	6	6762	6767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145597198
132	NC_009378	TAG	2	6	6780	6785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597198
133	NC_009378	CTG	2	6	6840	6845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597198
134	NC_009378	GCA	2	6	6957	6962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597198
135	NC_009378	GTT	2	6	6983	6988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597198
136	NC_009378	CTGC	2	8	7029	7036	0 %	25 %	25 %	50 %	145597198
137	NC_009378	CTGC	2	8	7189	7196	0 %	25 %	25 %	50 %	145597198
138	NC_009378	CGC	2	6	7261	7266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597198
139	NC_009378	GCA	2	6	7296	7301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597198
140	NC_009378	CTT	2	6	7307	7312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597198
141	NC_009378	TGC	2	6	7338	7343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597198
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143	NC_009378	AGC	2	6	7445	7450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597198
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149	NC_009378	TTGTC	2	10	7897	7906	0 %	60 %	20 %	20 %	145597198
150	NC_009378	TTC	2	6	7976	7981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597198
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156	NC_009378	TTG	2	6	8399	8404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597198
157	NC_009378	CGT	2	6	8410	8415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597198
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159	NC_009378	TGTT	2	8	8550	8557	0 %	75 %	25 %	0 %	145597198
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170	NC_009378	GTT	2	6	9104	9109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597198
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174	NC_009378	ATT	2	6	9317	9322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597198
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176	NC_009378	TCA	2	6	9430	9435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597198
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194	NC_009378	GCA	2	6	10540	10545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597198
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197	NC_009378	CGT	2	6	10819	10824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597198
198	NC_009378	TGAC	2	8	10846	10853	25 %	25 %	25 %	25 %	145597198
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200	NC_009378	CCA	2	6	10999	11004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597198
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243	NC_009378	ATA	2	6	13303	13308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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246	NC_009378	TGA	2	6	13506	13511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597202
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249	NC_009378	GTTA	2	8	13718	13725	25 %	50 %	25 %	0 %	145597203
250	NC_009378	TGCGC	2	10	13799	13808	0 %	20 %	40 %	40 %	145597203
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254	NC_009378	TTG	2	6	14140	14145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597203
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263	NC_009378	CCA	2	6	14876	14881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597203
264	NC_009378	TGA	2	6	15026	15031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597203
265	NC_009378	ATC	2	6	15061	15066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597203
266	NC_009378	GCG	2	6	15078	15083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597203
267	NC_009378	GTC	2	6	15102	15107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597203
268	NC_009378	ATC	2	6	15151	15156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597203
269	NC_009378	TGA	2	6	15164	15169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597203
270	NC_009378	TGG	2	6	15209	15214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597203
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272	NC_009378	GCCG	2	8	15309	15316	0 %	0 %	50 %	50 %	145597203
273	NC_009378	CTTC	2	8	15338	15345	0 %	50 %	0 %	50 %	145597203
274	NC_009378	GCT	2	6	15394	15399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597203
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277	NC_009378	GCA	2	6	15442	15447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597203
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336	NC_009378	CAG	2	6	18553	18558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
337	NC_009378	TCA	2	6	18691	18696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597205
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360	NC_009378	TA	3	6	19833	19838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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369	NC_009378	GATA	2	8	20388	20395	50 %	25 %	25 %	0 %	145597208
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375	NC_009378	ACG	2	6	20939	20944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597209
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377	NC_009378	AAT	2	6	21127	21132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
378	NC_009378	CAG	2	6	21185	21190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597210
379	NC_009378	CGGTA	2	10	21232	21241	20 %	20 %	40 %	20 %	145597210
380	NC_009378	CAGA	2	8	21268	21275	50 %	0 %	25 %	25 %	145597210
381	NC_009378	AGT	2	6	21364	21369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597210
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383	NC_009378	TGG	2	6	21550	21555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597210
384	NC_009378	CGACA	2	10	21800	21809	40 %	0 %	20 %	40 %	145597210
385	NC_009378	CGA	2	6	21856	21861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597210
386	NC_009378	TTC	2	6	22102	22107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597211
387	NC_009378	GCC	2	6	22178	22183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597211
388	NC_009378	GTC	2	6	22195	22200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597211
389	NC_009378	GCT	2	6	22219	22224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597211
390	NC_009378	GCT	2	6	22290	22295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597211
391	NC_009378	TTC	3	9	22410	22418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597211
392	NC_009378	GGC	2	6	22429	22434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
393	NC_009378	GCC	2	6	22438	22443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
394	NC_009378	TGC	2	6	22466	22471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597212
395	NC_009378	T	6	6	22613	22618	0 %	100 %	0 %	0 %	145597212
396	NC_009378	GTTACG	2	12	22695	22706	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	145597212
397	NC_009378	TGAA	2	8	22861	22868	50 %	25 %	25 %	0 %	145597212
398	NC_009378	ACGG	2	8	22926	22933	25 %	0 %	50 %	25 %	145597212
399	NC_009378	AAGC	2	8	22980	22987	50 %	0 %	25 %	25 %	145597212
400	NC_009378	GAT	2	6	22993	22998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597212
401	NC_009378	CTG	2	6	23000	23005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597212
402	NC_009378	GCTC	2	8	23008	23015	0 %	25 %	25 %	50 %	145597212
403	NC_009378	CGGCA	2	10	23047	23056	20 %	0 %	40 %	40 %	145597212
404	NC_009378	TTAC	2	8	23171	23178	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
405	NC_009378	GCG	2	6	23213	23218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597213
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432	NC_009378	TCG	3	9	24820	24828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597214
433	NC_009378	CAG	2	6	24896	24901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597214
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444	NC_009378	AG	3	6	25328	25333	50 %	0 %	50 %	0 %	145597215
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493	NC_009378	TTC	2	6	27584	27589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597216
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497	NC_009378	ATG	2	6	27740	27745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597216
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499	NC_009378	GAC	2	6	27860	27865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597216
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