MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Yersinia pestis Pestoides F plasmid CD

Total Repeats: 1442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009377	AAC	2	6	48406	48411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597163
1002	NC_009377	TTG	2	6	48420	48425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597163
1003	NC_009377	AAATGT	2	12	48468	48479	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	145597163
1004	NC_009377	CAAGC	2	10	48510	48519	40 %	0 %	20 %	40 %	145597163
1005	NC_009377	CCT	2	6	48568	48573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145597164
1006	NC_009377	GAA	2	6	48713	48718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597164
1007	NC_009377	CGC	2	6	48746	48751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597164
1008	NC_009377	GA	3	6	48777	48782	50 %	0 %	50 %	0 %	145597164
1009	NC_009377	T	7	7	48787	48793	0 %	100 %	0 %	0 %	145597164
1010	NC_009377	TAA	2	6	48833	48838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597164
1011	NC_009377	CGT	2	6	48860	48865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597164
1012	NC_009377	CGCC	2	8	49038	49045	0 %	0 %	25 %	75 %	145597164
1013	NC_009377	TAT	2	6	49145	49150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597164
1014	NC_009377	GAA	2	6	49156	49161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597164
1015	NC_009377	CT	3	6	49220	49225	0 %	50 %	0 %	50 %	145597164
1016	NC_009377	GCT	2	6	49292	49297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597164
1017	NC_009377	TGG	2	6	49369	49374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_009377	AAT	2	6	49485	49490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_009377	ATT	2	6	49555	49560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_009377	AT	3	6	49581	49586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_009377	T	6	6	49698	49703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_009377	TAT	2	6	49725	49730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_009377	ATGTT	2	10	49756	49765	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_009377	TAA	2	6	49797	49802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_009377	TAA	2	6	49828	49833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_009377	AT	3	6	49836	49841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_009377	ATAA	2	8	49865	49872	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_009377	GGA	2	6	49882	49887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_009377	TTA	2	6	49985	49990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_009377	AGT	2	6	50020	50025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_009377	TTA	2	6	50034	50039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_009377	AAT	2	6	50098	50103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_009377	AGA	2	6	50116	50121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_009377	TAC	2	6	50132	50137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_009377	TGTT	2	8	50167	50174	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_009377	AGA	2	6	50233	50238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_009377	GTATA	2	10	50256	50265	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_009377	AAT	2	6	50324	50329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_009377	A	6	6	50390	50395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_009377	CT	3	6	50434	50439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_009377	ATG	2	6	50451	50456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_009377	A	7	7	50461	50467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_009377	ATG	2	6	50475	50480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_009377	TAT	2	6	50500	50505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_009377	ATC	2	6	50510	50515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_009377	GGA	2	6	50530	50535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_009377	TAT	2	6	50566	50571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_009377	A	6	6	50644	50649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_009377	ATC	2	6	50662	50667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_009377	CCT	2	6	50760	50765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145597165
1051	NC_009377	CGC	2	6	50779	50784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597165
1052	NC_009377	AAC	2	6	50792	50797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597165
1053	NC_009377	GTCG	2	8	50856	50863	0 %	25 %	50 %	25 %	145597165
1054	NC_009377	GGTG	2	8	50894	50901	0 %	25 %	75 %	0 %	145597165
1055	NC_009377	GAT	2	6	50928	50933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597165
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1057	NC_009377	GAT	2	6	51061	51066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_009377	GAA	2	6	51069	51074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_009377	A	7	7	51157	51163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_009377	A	6	6	51244	51249	100 %	0 %	0 %	0 %	145597166
1061	NC_009377	C	6	6	51279	51284	0 %	0 %	0 %	100 %	145597166
1062	NC_009377	AGA	2	6	51334	51339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597166
1063	NC_009377	TGC	2	6	51430	51435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597166
1064	NC_009377	ATTGG	2	10	51503	51512	20 %	40 %	40 %	0 %	145597166
1065	NC_009377	TTG	2	6	51522	51527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597166
1066	NC_009377	ACC	2	6	51605	51610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597166
1067	NC_009377	GGC	2	6	51628	51633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597166
1068	NC_009377	CA	3	6	51673	51678	50 %	0 %	0 %	50 %	145597166
1069	NC_009377	CAA	2	6	51685	51690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597166
1070	NC_009377	TTC	2	6	51715	51720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597166
1071	NC_009377	GAA	2	6	51746	51751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597166
1072	NC_009377	CCGG	2	8	51754	51761	0 %	0 %	50 %	50 %	145597166
1073	NC_009377	TTAAT	2	10	51878	51887	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_009377	AGA	2	6	52067	52072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597167
1075	NC_009377	TGGAAA	2	12	52156	52167	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	145597167
1076	NC_009377	GCAG	2	8	52181	52188	25 %	0 %	50 %	25 %	145597167
1077	NC_009377	TGA	2	6	52195	52200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597167
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1080	NC_009377	GCA	2	6	52377	52382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597168
1081	NC_009377	CTG	2	6	52394	52399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597168
1082	NC_009377	GTG	2	6	52421	52426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597168
1083	NC_009377	GCTG	2	8	52428	52435	0 %	25 %	50 %	25 %	145597168
1084	NC_009377	GT	3	6	52569	52574	0 %	50 %	50 %	0 %	145597168
1085	NC_009377	AT	3	6	52582	52587	50 %	50 %	0 %	0 %	145597168
1086	NC_009377	TGG	2	6	52606	52611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597168
1087	NC_009377	GT	3	6	52697	52702	0 %	50 %	50 %	0 %	145597168
1088	NC_009377	GCT	2	6	52747	52752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_009377	AGGG	2	8	52767	52774	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_009377	GGA	2	6	52809	52814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1094	NC_009377	C	7	7	52980	52986	0 %	0 %	0 %	100 %	145597169
1095	NC_009377	TGG	2	6	52997	53002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597169
1096	NC_009377	CACTA	2	10	53068	53077	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1097	NC_009377	TAA	2	6	53107	53112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_009377	GGTCC	2	10	53113	53122	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1099	NC_009377	ATG	2	6	53219	53224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597170
1100	NC_009377	GCG	2	6	53246	53251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597170
1101	NC_009377	GTG	2	6	53364	53369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_009377	ACTG	2	8	53458	53465	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1103	NC_009377	T	6	6	53476	53481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_009377	TA	3	6	53535	53540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_009377	CTG	2	6	53551	53556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_009377	CGA	2	6	53561	53566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_009377	AAAG	2	8	53571	53578	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_009377	CAG	2	6	53587	53592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_009377	GTC	2	6	53628	53633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_009377	GCG	2	6	53710	53715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_009377	TA	3	6	53733	53738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_009377	GTT	2	6	53755	53760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_009377	T	6	6	53768	53773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_009377	ATA	2	6	53808	53813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597171
1115	NC_009377	GCT	2	6	53910	53915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597171
1116	NC_009377	GCT	2	6	53949	53954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597171
1117	NC_009377	TCCA	2	8	54063	54070	25 %	25 %	0 %	50 %	145597171
1118	NC_009377	CCAAA	2	10	54112	54121	60 %	0 %	0 %	40 %	145597171
1119	NC_009377	TGT	2	6	54134	54139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597171
1120	NC_009377	GGT	2	6	54162	54167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597171
1121	NC_009377	GACATC	2	12	54176	54187	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	145597171
1122	NC_009377	ATGG	2	8	54203	54210	25 %	25 %	50 %	0 %	145597171
1123	NC_009377	TTGA	2	8	54234	54241	25 %	50 %	25 %	0 %	145597171
1124	NC_009377	GAA	2	6	54306	54311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597171
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1126	NC_009377	GAT	2	6	54345	54350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597171
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1128	NC_009377	CTT	2	6	54400	54405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597171
1129	NC_009377	TGC	2	6	54491	54496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597171
1130	NC_009377	AGTC	2	8	54502	54509	25 %	25 %	25 %	25 %	145597171
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