MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia enterocolitica subsp. enterocolitica 8081 chromosome

Total Repeats: 92496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008800	TTTA	2	8	7	14	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008800	TTA	2	6	24	29	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008800	TTA	2	6	36	41	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008800	ATT	2	6	68	73	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008800	AGG	2	6	96	101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008800	GTT	2	6	190	195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008800	CTTA	2	8	231	238	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008800	TTCG	2	8	245	252	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008800	TGA	2	6	332	337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440404
10	NC_008800	GAT	2	6	378	383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440404
11	NC_008800	CAC	2	6	410	415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123440404
12	NC_008800	GA	3	6	469	474	50 %	0 %	50 %	0 %	123440404
13	NC_008800	CTG	2	6	483	488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440404
14	NC_008800	TAA	2	6	501	506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	123440404
15	NC_008800	ATT	2	6	553	558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123440404
16	NC_008800	ATG	2	6	821	826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440405
17	NC_008800	TCA	2	6	866	871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123440405
18	NC_008800	TTG	2	6	884	889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440405
19	NC_008800	TAA	2	6	933	938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	123440405
20	NC_008800	GTG	2	6	956	961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	123440405
21	NC_008800	CTT	2	6	978	983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123440405
22	NC_008800	T	7	7	997	1003	0 %	100 %	0 %	0 %	123440405
23	NC_008800	ATG	2	6	1037	1042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440405
24	NC_008800	AC	3	6	1054	1059	50 %	0 %	0 %	50 %	123440405
25	NC_008800	CCTG	2	8	1112	1119	0 %	25 %	25 %	50 %	123440405
26	NC_008800	T	6	6	1125	1130	0 %	100 %	0 %	0 %	123440405
27	NC_008800	GC	3	6	1195	1200	0 %	0 %	50 %	50 %	123440405
28	NC_008800	T	7	7	1274	1280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008800	ATT	2	6	1285	1290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008800	ATGA	2	8	1310	1317	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008800	ACA	3	9	1472	1480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	123440406
32	NC_008800	CTT	2	6	1499	1504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123440406
33	NC_008800	AGC	2	6	1519	1524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123440406
34	NC_008800	GTAAAA	2	12	1617	1628	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	123440406
35	NC_008800	GTT	2	6	1653	1658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440406
36	NC_008800	CATT	2	8	1659	1666	25 %	50 %	0 %	25 %	123440406
37	NC_008800	TGA	2	6	1751	1756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440406
38	NC_008800	CATT	2	8	1772	1779	25 %	50 %	0 %	25 %	123440406
39	NC_008800	AGC	2	6	1892	1897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123440406
40	NC_008800	GC	3	6	1967	1972	0 %	0 %	50 %	50 %	123440406
41	NC_008800	GATTGG	2	12	2042	2053	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	123440406
42	NC_008800	ATG	2	6	2080	2085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440406
43	NC_008800	ATG	2	6	2101	2106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440406
44	NC_008800	ATT	2	6	2154	2159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123440406
45	NC_008800	TGA	2	6	2255	2260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440406
46	NC_008800	TGG	2	6	2321	2326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	123440406
47	NC_008800	TTG	2	6	2358	2363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440406
48	NC_008800	CAA	3	9	2364	2372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	123440406
49	NC_008800	TAA	2	6	2439	2444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	123440406
50	NC_008800	TAT	2	6	2465	2470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008800	ATA	3	9	2555	2563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008800	ATT	3	9	2642	2650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123440407
53	NC_008800	AAT	2	6	2666	2671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	123440407
54	NC_008800	TGT	2	6	2752	2757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440407
55	NC_008800	ATT	2	6	2771	2776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123440407
56	NC_008800	A	7	7	2790	2796	100 %	0 %	0 %	0 %	123440407
57	NC_008800	ATT	2	6	2960	2965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123440407
58	NC_008800	ATTT	2	8	3013	3020	25 %	75 %	0 %	0 %	123440407
59	NC_008800	TTCA	2	8	3110	3117	25 %	50 %	0 %	25 %	123440407
60	NC_008800	CGT	2	6	3171	3176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440407
61	NC_008800	GTG	2	6	3177	3182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	123440407
62	NC_008800	CAGT	2	8	3189	3196	25 %	25 %	25 %	25 %	123440407
63	NC_008800	GCG	2	6	3288	3293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	123440408
64	NC_008800	TGC	2	6	3409	3414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440408
65	NC_008800	AAT	2	6	3471	3476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	123440408
66	NC_008800	CAT	2	6	3488	3493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123440408
67	NC_008800	GCC	2	6	3538	3543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	123440408
68	NC_008800	GCC	2	6	3552	3557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	123440408
69	NC_008800	TGA	2	6	3606	3611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440408
70	NC_008800	ATG	2	6	3646	3651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440408
71	NC_008800	GCG	2	6	3657	3662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	123440408
72	NC_008800	TCC	2	6	3667	3672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	123440408
73	NC_008800	GTT	2	6	3776	3781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440408
74	NC_008800	T	6	6	3818	3823	0 %	100 %	0 %	0 %	123440408
75	NC_008800	GCG	2	6	3876	3881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	123440408
76	NC_008800	ACTC	2	8	3899	3906	25 %	25 %	0 %	50 %	123440408
77	NC_008800	TCGG	2	8	3925	3932	0 %	25 %	50 %	25 %	123440408
78	NC_008800	AAT	2	6	3934	3939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	123440408
79	NC_008800	GCT	2	6	4100	4105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440408
80	NC_008800	GCA	2	6	4127	4132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123440408
81	NC_008800	CAC	2	6	4145	4150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123440408
82	NC_008800	GCC	2	6	4181	4186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	123440408
83	NC_008800	GCC	2	6	4189	4194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	123440408
84	NC_008800	CAT	2	6	4196	4201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123440408
85	NC_008800	CAC	2	6	4226	4231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123440408
86	NC_008800	TGT	2	6	4246	4251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440408
87	NC_008800	AGT	2	6	4285	4290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440408
88	NC_008800	TGA	2	6	4291	4296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440408
89	NC_008800	GATGGT	2	12	4299	4310	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	123440408
90	NC_008800	AG	3	6	4346	4351	50 %	0 %	50 %	0 %	123440408
91	NC_008800	TC	3	6	4380	4385	0 %	50 %	0 %	50 %	123440408
92	NC_008800	GCA	2	6	4400	4405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123440408
93	NC_008800	TG	3	6	4417	4422	0 %	50 %	50 %	0 %	123440408
94	NC_008800	TTG	2	6	4440	4445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440408
95	NC_008800	CAC	2	6	4452	4457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123440408
96	NC_008800	TGT	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440408
97	NC_008800	CAC	2	6	4671	4676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123440408
98	NC_008800	TCACTT	2	12	4693	4704	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	123440408
99	NC_008800	AGC	2	6	4711	4716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123440408
100	NC_008800	TGT	2	6	4765	4770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440409
101	NC_008800	CAAG	2	8	4842	4849	50 %	0 %	25 %	25 %	123440409
102	NC_008800	GCC	2	6	4868	4873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	123440409
103	NC_008800	CCA	2	6	4910	4915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123440409
104	NC_008800	G	6	6	4923	4928	0 %	0 %	100 %	0 %	123440409
105	NC_008800	TGA	2	6	4965	4970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440409
106	NC_008800	ATC	2	6	5007	5012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123440409
107	NC_008800	TTTA	2	8	5076	5083	25 %	75 %	0 %	0 %	123440409
108	NC_008800	GAT	2	6	5117	5122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440409
109	NC_008800	TTTG	2	8	5231	5238	0 %	75 %	25 %	0 %	123440409
110	NC_008800	TGC	2	6	5266	5271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440409
111	NC_008800	TTG	2	6	5325	5330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440409
112	NC_008800	GAA	2	6	5457	5462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	123440409
113	NC_008800	GCT	2	6	5540	5545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440409
114	NC_008800	GCT	2	6	5766	5771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440409
115	NC_008800	TCT	2	6	5827	5832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123440409
116	NC_008800	CGT	2	6	5851	5856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440409
117	NC_008800	CTT	2	6	5975	5980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123440409
118	NC_008800	ATAG	2	8	5992	5999	50 %	25 %	25 %	0 %	123440409
119	NC_008800	CTT	2	6	6011	6016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123440409
120	NC_008800	TCA	2	6	6035	6040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123440409
121	NC_008800	TTCT	2	8	6224	6231	0 %	75 %	0 %	25 %	123440409
122	NC_008800	TGA	2	6	6240	6245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440409
123	NC_008800	TTGA	2	8	6278	6285	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008800	ATC	2	6	6380	6385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008800	TGT	2	6	6419	6424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008800	A	6	6	6579	6584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008800	CGG	2	6	6595	6600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008800	GA	3	6	6662	6667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008800	GTCC	2	8	6696	6703	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_008800	T	6	6	6719	6724	0 %	100 %	0 %	0 %	123440410
131	NC_008800	TCT	2	6	6733	6738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123440410
132	NC_008800	GC	3	6	6785	6790	0 %	0 %	50 %	50 %	123440410
133	NC_008800	G	6	6	6807	6812	0 %	0 %	100 %	0 %	123440410
134	NC_008800	CTT	2	6	6899	6904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123440410
135	NC_008800	GGT	2	6	6914	6919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	123440410
136	NC_008800	GCCA	2	8	6926	6933	25 %	0 %	25 %	50 %	123440410
137	NC_008800	CTG	2	6	7023	7028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440410
138	NC_008800	ATT	2	6	7067	7072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123440410
139	NC_008800	TGGTT	2	10	7087	7096	0 %	60 %	40 %	0 %	123440410
140	NC_008800	GCT	2	6	7109	7114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440410
141	NC_008800	GCA	2	6	7123	7128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123440410
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143	NC_008800	TTTC	2	8	7204	7211	0 %	75 %	0 %	25 %	123440410
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160	NC_008800	TGC	2	6	7906	7911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440410
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169	NC_008800	CTG	2	6	8549	8554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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235	NC_008800	ATA	2	6	11708	11713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
236	NC_008800	CTA	2	6	11718	11723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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246	NC_008800	A	7	7	12283	12289	100 %	0 %	0 %	0 %	123440414
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249	NC_008800	TGGT	2	8	12466	12473	0 %	50 %	50 %	0 %	123440414
250	NC_008800	CCAGA	2	10	12543	12552	40 %	0 %	20 %	40 %	123440414
251	NC_008800	ATA	2	6	12644	12649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	123440414
252	NC_008800	AGT	2	6	12663	12668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
253	NC_008800	GCA	2	6	12709	12714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_008800	TGAA	2	8	12717	12724	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
255	NC_008800	GTGA	2	8	12757	12764	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
256	NC_008800	AATA	2	8	12801	12808	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_008800	TGG	2	6	12827	12832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	123440415
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263	NC_008800	GAT	2	6	13006	13011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440415
264	NC_008800	ACC	2	6	13084	13089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123440415
265	NC_008800	ATT	2	6	13218	13223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123440415
266	NC_008800	CGC	3	9	13257	13265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	123440415
267	NC_008800	TGG	2	6	13346	13351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	123440415
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397	NC_008800	AGA	2	6	19650	19655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
398	NC_008800	CGA	2	6	19779	19784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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400	NC_008800	GAG	2	6	19934	19939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
401	NC_008800	G	6	6	20079	20084	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
402	NC_008800	TCC	2	6	20089	20094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
403	NC_008800	CTGA	2	8	20109	20116	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
404	NC_008800	GTAC	2	8	20193	20200	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
405	NC_008800	GTG	2	6	20220	20225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
406	NC_008800	GGA	2	6	20397	20402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
407	NC_008800	GAA	2	6	20595	20600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
408	NC_008800	AC	3	6	20615	20620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
409	NC_008800	CGTC	2	8	20633	20640	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
410	NC_008800	AAC	2	6	20652	20657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
411	NC_008800	AGC	2	6	20742	20747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
412	NC_008800	CAT	2	6	20748	20753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
413	NC_008800	AAAG	2	8	20756	20763	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
414	NC_008800	CGTT	2	8	20936	20943	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
415	NC_008800	G	6	6	21180	21185	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
416	NC_008800	AGGCT	2	10	21193	21202	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
417	NC_008800	TGA	2	6	21282	21287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
418	NC_008800	TGA	2	6	21301	21306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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421	NC_008800	GA	3	6	21411	21416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
422	NC_008800	GCTG	2	8	21524	21531	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
423	NC_008800	TAA	2	6	21540	21545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
424	NC_008800	CGG	2	6	21665	21670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
425	NC_008800	ATG	2	6	21741	21746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
426	NC_008800	ACC	2	6	21936	21941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
427	NC_008800	TGG	2	6	21996	22001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
428	NC_008800	TCC	2	6	22022	22027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
429	NC_008800	GGA	2	6	22039	22044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
430	NC_008800	AGCT	2	8	22099	22106	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
431	NC_008800	GGT	2	6	22159	22164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
432	NC_008800	CGG	2	6	22246	22251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_008800	TCA	2	6	22274	22279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
434	NC_008800	CGT	2	6	22354	22359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
435	NC_008800	GCT	2	6	22408	22413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
436	NC_008800	GT	3	6	22607	22612	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
437	NC_008800	ACA	2	6	22668	22673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
438	NC_008800	GA	3	6	22693	22698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
439	NC_008800	GCTG	3	12	22733	22744	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
440	NC_008800	GGC	2	6	22789	22794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
441	NC_008800	ATCAA	2	10	22902	22911	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
442	NC_008800	A	7	7	22959	22965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_008800	AAAG	2	8	22968	22975	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
444	NC_008800	CTG	2	6	22982	22987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
445	NC_008800	GGCG	2	8	23174	23181	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
446	NC_008800	T	6	6	23185	23190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_008800	TCA	2	6	23294	23299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123440419
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450	NC_008800	GCA	2	6	23426	23431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123440419
451	NC_008800	CTG	2	6	23438	23443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440419
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465	NC_008800	CT	3	6	24396	24401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
466	NC_008800	TG	3	6	24407	24412	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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483	NC_008800	GAG	2	6	25270	25275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	123440422
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