MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Antiqua chromosome

Total Repeats: 92628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008150	TTTA	2	8	7	14	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008150	TTA	2	6	24	29	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008150	TTA	2	6	36	41	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008150	ATT	2	6	68	73	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008150	AGG	2	6	96	101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008150	TGT	2	6	108	113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008150	GTT	2	6	190	195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008150	TTCG	2	8	245	252	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008150	CG	3	6	251	256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008150	CTG	2	6	305	310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805999
11	NC_008150	TTG	2	6	387	392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108805999
12	NC_008150	AACC	2	8	443	450	50 %	0 %	0 %	50 %	108805999
13	NC_008150	TGT	2	6	484	489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108805999
14	NC_008150	TAA	2	6	501	506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108805999
15	NC_008150	CTT	2	6	626	631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108805999
16	NC_008150	TCA	2	6	867	872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806000
17	NC_008150	TTG	2	6	885	890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806000
18	NC_008150	CTG	2	6	899	904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806000
19	NC_008150	TAA	2	6	934	939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806000
20	NC_008150	GTG	2	6	957	962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806000
21	NC_008150	CTT	2	6	979	984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806000
22	NC_008150	T	6	6	998	1003	0 %	100 %	0 %	0 %	108806000
23	NC_008150	AGC	2	6	1051	1056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806000
24	NC_008150	CGT	2	6	1060	1065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806000
25	NC_008150	GTT	2	6	1072	1077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806000
26	NC_008150	GTGC	2	8	1194	1201	0 %	25 %	50 %	25 %	108806000
27	NC_008150	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806000
28	NC_008150	T	7	7	1275	1281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008150	ATT	2	6	1315	1320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008150	A	6	6	1437	1442	100 %	0 %	0 %	0 %	108806001
31	NC_008150	ACA	3	9	1457	1465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806001
32	NC_008150	CAA	2	6	1506	1511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806001
33	NC_008150	CATT	2	8	1644	1651	25 %	50 %	0 %	25 %	108806001
34	NC_008150	ATTC	2	8	1758	1765	25 %	50 %	0 %	25 %	108806001
35	NC_008150	GCG	2	6	1878	1883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806001
36	NC_008150	TGG	2	6	2036	2041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806001
37	NC_008150	ATG	2	6	2065	2070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806001
38	NC_008150	ATG	2	6	2086	2091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806001
39	NC_008150	ATT	2	6	2139	2144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806001
40	NC_008150	TCT	2	6	2181	2186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806001
41	NC_008150	ATCA	2	8	2269	2276	50 %	25 %	0 %	25 %	108806001
42	NC_008150	TGC	2	6	2344	2349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806001
43	NC_008150	ACA	2	6	2354	2359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806001
44	NC_008150	CTG	2	6	2418	2423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806001
45	NC_008150	GGC	2	6	2505	2510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008150	GCG	2	6	2537	2542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806002
47	NC_008150	TGG	2	6	2649	2654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806002
48	NC_008150	CTG	3	9	2657	2665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806002
49	NC_008150	TTTA	2	8	2762	2769	25 %	75 %	0 %	0 %	108806002
50	NC_008150	GCC	2	6	2787	2792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806002
51	NC_008150	ACC	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806002
52	NC_008150	GTTG	2	8	2815	2822	0 %	50 %	50 %	0 %	108806002
53	NC_008150	ATT	2	6	2874	2879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806002
54	NC_008150	ATG	2	6	2895	2900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806002
55	NC_008150	GCG	2	6	2906	2911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806002
56	NC_008150	TCA	2	6	3030	3035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806002
57	NC_008150	T	6	6	3067	3072	0 %	100 %	0 %	0 %	108806002
58	NC_008150	GCG	2	6	3125	3130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806002
59	NC_008150	ACTC	2	8	3148	3155	25 %	25 %	0 %	50 %	108806002
60	NC_008150	AAT	2	6	3183	3188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806002
61	NC_008150	TGA	2	6	3207	3212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806002
62	NC_008150	CCT	2	6	3223	3228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108806002
63	NC_008150	CTGG	2	8	3241	3248	0 %	25 %	50 %	25 %	108806002
64	NC_008150	GCA	2	6	3376	3381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806002
65	NC_008150	TGG	2	6	3451	3456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806002
66	NC_008150	CAC	2	6	3475	3480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806002
67	NC_008150	AAC	2	6	3534	3539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806002
68	NC_008150	TGA	3	9	3540	3548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806002
69	NC_008150	T	6	6	3627	3632	0 %	100 %	0 %	0 %	108806002
70	NC_008150	TCC	2	6	3741	3746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108806002
71	NC_008150	ATTC	2	8	3772	3779	25 %	50 %	0 %	25 %	108806002
72	NC_008150	GTT	2	6	3814	3819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806002
73	NC_008150	A	8	8	3884	3891	100 %	0 %	0 %	0 %	108806002
74	NC_008150	TGC	2	6	3905	3910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806002
75	NC_008150	ACC	2	6	3921	3926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806002
76	NC_008150	CAG	2	6	3959	3964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806002
77	NC_008150	TGT	2	6	4014	4019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806003
78	NC_008150	GTT	2	6	4030	4035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806003
79	NC_008150	TTG	2	6	4046	4051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806003
80	NC_008150	TTG	2	6	4061	4066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806003
81	NC_008150	CCA	2	6	4081	4086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806003
82	NC_008150	GCCA	2	8	4113	4120	25 %	0 %	25 %	50 %	108806003
83	NC_008150	GAT	2	6	4122	4127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806003
84	NC_008150	TAAA	2	8	4132	4139	75 %	25 %	0 %	0 %	108806003
85	NC_008150	GTT	2	6	4168	4173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806003
86	NC_008150	CAG	3	9	4205	4213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806003
87	NC_008150	TGG	2	6	4217	4222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806003
88	NC_008150	TGGC	2	8	4262	4269	0 %	25 %	50 %	25 %	108806003
89	NC_008150	ATC	2	6	4301	4306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806003
90	NC_008150	GAT	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806003
91	NC_008150	CTGT	2	8	4470	4477	0 %	50 %	25 %	25 %	108806003
92	NC_008150	AGTG	2	8	4538	4545	25 %	25 %	50 %	0 %	108806003
93	NC_008150	TGG	2	6	4548	4553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806003
94	NC_008150	TGC	2	6	4560	4565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806003
95	NC_008150	TAA	2	6	4610	4615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806003
96	NC_008150	CAA	2	6	4643	4648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806003
97	NC_008150	TCA	2	6	4737	4742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806003
98	NC_008150	GAA	2	6	4751	4756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806003
99	NC_008150	GTA	2	6	4768	4773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806003
100	NC_008150	CTT	2	6	4784	4789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806003
101	NC_008150	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806003
102	NC_008150	TCAA	2	8	4890	4897	50 %	25 %	0 %	25 %	108806003
103	NC_008150	TGG	2	6	4908	4913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806003
104	NC_008150	TTC	2	6	4916	4921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806003
105	NC_008150	CTG	2	6	4971	4976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806003
106	NC_008150	CAG	2	6	4979	4984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806003
107	NC_008150	GCT	2	6	5060	5065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806003
108	NC_008150	CTT	3	9	5266	5274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806003
109	NC_008150	TCA	2	6	5329	5334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806003
110	NC_008150	GCG	2	6	5375	5380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806003
111	NC_008150	GGA	2	6	5406	5411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108806003
112	NC_008150	TGC	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806003
113	NC_008150	AACG	2	8	5469	5476	50 %	0 %	25 %	25 %	108806003
114	NC_008150	GCC	2	6	5680	5685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806004
115	NC_008150	CGC	2	6	5694	5699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806004
116	NC_008150	CTG	2	6	5703	5708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806004
117	NC_008150	TCGC	2	8	5793	5800	0 %	25 %	25 %	50 %	108806004
118	NC_008150	CATT	2	8	5847	5854	25 %	50 %	0 %	25 %	108806004
119	NC_008150	TC	4	8	5858	5865	0 %	50 %	0 %	50 %	108806004
120	NC_008150	CAGGAG	2	12	5873	5884	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	108806004
121	NC_008150	GTTCG	2	10	5891	5900	0 %	40 %	40 %	20 %	108806004
122	NC_008150	GAC	2	6	5913	5918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806004
123	NC_008150	CTT	2	6	6070	6075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806004
124	NC_008150	TGG	2	6	6076	6081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806004
125	NC_008150	CG	3	6	6087	6092	0 %	0 %	50 %	50 %	108806004
126	NC_008150	TC	3	6	6201	6206	0 %	50 %	0 %	50 %	108806004
127	NC_008150	AAGGT	2	10	6240	6249	40 %	20 %	40 %	0 %	108806004
128	NC_008150	GCTG	2	8	6360	6367	0 %	25 %	50 %	25 %	108806004
129	NC_008150	AGC	2	6	6435	6440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806004
130	NC_008150	A	6	6	6467	6472	100 %	0 %	0 %	0 %	108806004
131	NC_008150	TGA	2	6	6490	6495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806004
132	NC_008150	CAT	2	6	6527	6532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806004
133	NC_008150	TGA	2	6	6572	6577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806004
134	NC_008150	AGCGC	2	10	6640	6649	20 %	0 %	40 %	40 %	108806005
135	NC_008150	GAA	2	6	6718	6723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806005
136	NC_008150	TCA	2	6	6735	6740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806005
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268	NC_008150	G	6	6	12917	12922	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
269	NC_008150	TCT	2	6	12934	12939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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282	NC_008150	TCT	2	6	13685	13690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_008150	TAA	2	6	13741	13746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_008150	A	8	8	13783	13790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_008150	GGCA	2	8	14083	14090	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
293	NC_008150	ATA	2	6	14094	14099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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406	NC_008150	TTGA	2	8	21273	21280	25 %	50 %	25 %	0 %	108806013
407	NC_008150	TCG	2	6	21303	21308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
408	NC_008150	GGC	2	6	21325	21330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
409	NC_008150	GCC	2	6	21340	21345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
410	NC_008150	TAT	2	6	21346	21351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
411	NC_008150	CTTCC	2	10	21355	21364	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
412	NC_008150	TCCC	2	8	21376	21383	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
413	NC_008150	AAT	2	6	21436	21441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
414	NC_008150	CCT	2	6	21469	21474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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416	NC_008150	A	7	7	21504	21510	100 %	0 %	0 %	0 %	108806014
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442	NC_008150	ACC	2	6	22563	22568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806015
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