MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Nepal516 chromosome

Total Repeats: 88956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_008149	TCA	2	6	131884	131889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108810262
2503	NC_008149	ATA	2	6	131929	131934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108810262
2504	NC_008149	TG	3	6	131985	131990	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_008149	TAGC	2	8	131991	131998	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2506	NC_008149	TA	3	6	132039	132044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_008149	TA	3	6	132055	132060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_008149	ACGCC	2	10	132099	132108	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2509	NC_008149	T	6	6	132119	132124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_008149	AAT	2	6	132212	132217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_008149	GGC	2	6	132232	132237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2512	NC_008149	TGAA	2	8	132282	132289	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_008149	TACA	2	8	132301	132308	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2514	NC_008149	ATC	2	6	132385	132390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_008149	TGT	2	6	132452	132457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_008149	AG	3	6	132468	132473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_008149	AATT	2	8	132508	132515	50 %	50 %	0 %	0 %	108810263
2518	NC_008149	TTG	2	6	132547	132552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108810263
2519	NC_008149	TGG	2	6	132628	132633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108810263
2520	NC_008149	G	6	6	132632	132637	0 %	0 %	100 %	0 %	108810263
2521	NC_008149	GAT	2	6	132750	132755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108810263
2522	NC_008149	GAT	2	6	132812	132817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108810263
2523	NC_008149	GGC	2	6	132920	132925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108810263
2524	NC_008149	TGT	2	6	133009	133014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108810263
2525	NC_008149	CCA	2	6	133063	133068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108810263
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2528	NC_008149	TCG	2	6	133271	133276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810263
2529	NC_008149	TC	3	6	133300	133305	0 %	50 %	0 %	50 %	108810263
2530	NC_008149	TCA	2	6	133322	133327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108810263
2531	NC_008149	TCA	2	6	133372	133377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108810263
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2533	NC_008149	CTTG	2	8	133463	133470	0 %	50 %	25 %	25 %	108810263
2534	NC_008149	GCG	2	6	133547	133552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108810263
2535	NC_008149	TGA	2	6	133599	133604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2541	NC_008149	TAT	2	6	133835	133840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162139456
2542	NC_008149	CAG	2	6	133847	133852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162139456
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2547	NC_008149	ATG	2	6	134196	134201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162139456
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2549	NC_008149	GGC	2	6	134296	134301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162139456
2550	NC_008149	AAGC	2	8	134306	134313	50 %	0 %	25 %	25 %	162139456
2551	NC_008149	CAA	2	6	134330	134335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162139456
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2555	NC_008149	CGT	2	6	134585	134590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139456
2556	NC_008149	GT	3	6	134589	134594	0 %	50 %	50 %	0 %	162139456
2557	NC_008149	CTG	2	6	134597	134602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139456
2558	NC_008149	CGC	2	6	134654	134659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162139456
2559	NC_008149	AGT	2	6	134755	134760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_008149	TGTA	2	8	134761	134768	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_008149	TA	3	6	134797	134802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_008149	TCA	2	6	134839	134844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2564	NC_008149	CAT	2	6	135134	135139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108810265
2565	NC_008149	ACCACA	2	12	135243	135254	50 %	0 %	0 %	50 %	108810265
2566	NC_008149	GGCTG	2	10	135308	135317	0 %	20 %	60 %	20 %	108810265
2567	NC_008149	GGA	2	6	135347	135352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108810265
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2569	NC_008149	CCGA	2	8	135399	135406	25 %	0 %	25 %	50 %	108810265
2570	NC_008149	TGAT	2	8	135475	135482	25 %	50 %	25 %	0 %	108810265
2571	NC_008149	GTT	2	6	135485	135490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108810265
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2580	NC_008149	CTGA	2	8	135816	135823	25 %	25 %	25 %	25 %	108810265
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2584	NC_008149	TGG	2	6	135928	135933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108810265
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2595	NC_008149	GGC	2	6	136274	136279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108810266
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2597	NC_008149	TGGC	2	8	136478	136485	0 %	25 %	50 %	25 %	108810266
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2604	NC_008149	GGT	2	6	136871	136876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108810266
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2996	NC_008149	AAG	2	6	157053	157058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108810282
2997	NC_008149	A	6	6	157109	157114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2998	NC_008149	GA	3	6	157161	157166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2999	NC_008149	CTC	2	6	157242	157247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3000	NC_008149	CAG	2	6	157289	157294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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