MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Nepal516 chromosome

Total Repeats: 88956

< Previous12345678910111213...177178Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2253	NC_008149	AAT	2	6	118839	118844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108810251
2254	NC_008149	TGC	2	6	118952	118957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810251
2255	NC_008149	AAT	2	6	118960	118965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108810251
2256	NC_008149	AATG	2	8	119217	119224	50 %	25 %	25 %	0 %	108810251
2257	NC_008149	CCGC	2	8	119249	119256	0 %	0 %	25 %	75 %	108810251
2258	NC_008149	TAA	2	6	119484	119489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108810251
2259	NC_008149	TCG	2	6	119491	119496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810251
2260	NC_008149	TAA	2	6	119534	119539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108810251
2261	NC_008149	TTA	2	6	119569	119574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108810251
2262	NC_008149	CAT	2	6	119591	119596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108810251
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2264	NC_008149	A	7	7	119662	119668	100 %	0 %	0 %	0 %	108810251
2265	NC_008149	TCA	2	6	119674	119679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108810251
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2272	NC_008149	ATA	2	6	120118	120123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108810252
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2279	NC_008149	TAA	2	6	120516	120521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108810252
2280	NC_008149	AT	3	6	120552	120557	50 %	50 %	0 %	0 %	108810252
2281	NC_008149	ATG	2	6	120565	120570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108810252
2282	NC_008149	ACC	2	6	120606	120611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2283	NC_008149	TAA	2	6	120615	120620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2284	NC_008149	TTA	2	6	120627	120632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108810253
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2295	NC_008149	TAA	2	6	121212	121217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2296	NC_008149	TTGA	2	8	121234	121241	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2297	NC_008149	AT	4	8	121246	121253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2298	NC_008149	TAT	2	6	121272	121277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2299	NC_008149	T	8	8	121318	121325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2300	NC_008149	ATT	3	9	121333	121341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2301	NC_008149	TTA	2	6	121426	121431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2302	NC_008149	AAT	2	6	121432	121437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2303	NC_008149	T	6	6	121449	121454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2304	NC_008149	TTA	2	6	121460	121465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2306	NC_008149	TAT	2	6	121522	121527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2307	NC_008149	AT	3	6	121534	121539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2308	NC_008149	T	6	6	121551	121556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2309	NC_008149	TAAA	2	8	121580	121587	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2310	NC_008149	CTAAA	2	10	121681	121690	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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2312	NC_008149	TTA	2	6	121730	121735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2313	NC_008149	T	6	6	121744	121749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2314	NC_008149	GCGT	2	8	121754	121761	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2315	NC_008149	A	6	6	121817	121822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2317	NC_008149	GAC	2	6	121918	121923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2347	NC_008149	ATAA	2	8	124079	124086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2348	NC_008149	ATTTT	2	10	124091	124100	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2349	NC_008149	TAAC	2	8	124171	124178	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2350	NC_008149	TAA	2	6	124194	124199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2351	NC_008149	AGC	2	6	124222	124227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2358	NC_008149	ATT	2	6	124605	124610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2359	NC_008149	TGCG	2	8	124690	124697	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2360	NC_008149	A	6	6	124709	124714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2361	NC_008149	GCAG	2	8	124715	124722	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2362	NC_008149	T	8	8	124723	124730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2363	NC_008149	CAA	2	6	124808	124813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108810257
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2371	NC_008149	TGC	2	6	125181	125186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810257
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2376	NC_008149	GAC	2	6	125339	125344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108810257
2377	NC_008149	ACCC	2	8	125356	125363	25 %	0 %	0 %	75 %	108810257
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