MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Nepal516 chromosome

Total Repeats: 88956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008149	TTTA	2	8	7	14	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008149	TTA	2	6	24	29	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008149	TTA	2	6	36	41	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008149	ATT	2	6	68	73	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008149	AGG	2	6	96	101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008149	TGT	2	6	108	113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008149	GTT	2	6	190	195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008149	TTCG	2	8	245	252	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008149	CG	3	6	251	256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008149	CTG	2	6	305	310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810167
11	NC_008149	TTG	2	6	387	392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108810167
12	NC_008149	AACC	2	8	443	450	50 %	0 %	0 %	50 %	108810167
13	NC_008149	TGT	2	6	484	489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108810167
14	NC_008149	TAA	2	6	501	506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108810167
15	NC_008149	CTT	2	6	626	631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108810167
16	NC_008149	TCA	2	6	867	872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108810168
17	NC_008149	TTG	2	6	885	890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108810168
18	NC_008149	CTG	2	6	899	904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810168
19	NC_008149	TAA	2	6	934	939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108810168
20	NC_008149	GTG	2	6	957	962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108810168
21	NC_008149	CTT	2	6	979	984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108810168
22	NC_008149	T	6	6	998	1003	0 %	100 %	0 %	0 %	108810168
23	NC_008149	AGC	2	6	1051	1056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108810168
24	NC_008149	CGT	2	6	1060	1065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810168
25	NC_008149	GTT	2	6	1072	1077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108810168
26	NC_008149	GTGC	2	8	1194	1201	0 %	25 %	50 %	25 %	108810168
27	NC_008149	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810168
28	NC_008149	T	7	7	1275	1281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008149	ATT	2	6	1315	1320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008149	A	6	6	1437	1442	100 %	0 %	0 %	0 %	108810169
31	NC_008149	ACA	3	9	1457	1465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108810169
32	NC_008149	CAA	2	6	1506	1511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108810169
33	NC_008149	CATT	2	8	1644	1651	25 %	50 %	0 %	25 %	108810169
34	NC_008149	ATTC	2	8	1758	1765	25 %	50 %	0 %	25 %	108810169
35	NC_008149	GCG	2	6	1878	1883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108810169
36	NC_008149	TGG	2	6	2036	2041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108810169
37	NC_008149	ATG	2	6	2065	2070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108810169
38	NC_008149	ATG	2	6	2086	2091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108810169
39	NC_008149	ATT	2	6	2139	2144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108810169
40	NC_008149	TCT	2	6	2181	2186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108810169
41	NC_008149	ATCA	2	8	2269	2276	50 %	25 %	0 %	25 %	108810169
42	NC_008149	TGC	2	6	2344	2349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810169
43	NC_008149	ACA	2	6	2354	2359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108810169
44	NC_008149	CTG	2	6	2418	2423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810169
45	NC_008149	GGC	2	6	2505	2510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008149	GCG	2	6	2537	2542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108810170
47	NC_008149	TGG	2	6	2649	2654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108810170
48	NC_008149	CTG	3	9	2657	2665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810170
49	NC_008149	TTTA	2	8	2762	2769	25 %	75 %	0 %	0 %	108810170
50	NC_008149	GCC	2	6	2787	2792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108810170
51	NC_008149	ACC	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108810170
52	NC_008149	GTTG	2	8	2815	2822	0 %	50 %	50 %	0 %	108810170
53	NC_008149	ATT	2	6	2874	2879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108810170
54	NC_008149	ATG	2	6	2895	2900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108810170
55	NC_008149	GCG	2	6	2906	2911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108810170
56	NC_008149	TCA	2	6	3030	3035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108810170
57	NC_008149	T	6	6	3067	3072	0 %	100 %	0 %	0 %	108810170
58	NC_008149	GCG	2	6	3125	3130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108810170
59	NC_008149	ACTC	2	8	3148	3155	25 %	25 %	0 %	50 %	108810170
60	NC_008149	AAT	2	6	3183	3188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108810170
61	NC_008149	TGA	2	6	3207	3212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108810170
62	NC_008149	CCT	2	6	3223	3228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108810170
63	NC_008149	CTGG	2	8	3241	3248	0 %	25 %	50 %	25 %	108810170
64	NC_008149	GCA	2	6	3376	3381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108810170
65	NC_008149	TGG	2	6	3451	3456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108810170
66	NC_008149	CAC	2	6	3475	3480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108810170
67	NC_008149	AAC	2	6	3534	3539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108810170
68	NC_008149	TGA	3	9	3540	3548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108810170
69	NC_008149	T	6	6	3627	3632	0 %	100 %	0 %	0 %	108810170
70	NC_008149	TCC	2	6	3741	3746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108810170
71	NC_008149	ATTC	2	8	3772	3779	25 %	50 %	0 %	25 %	108810170
72	NC_008149	GTT	2	6	3814	3819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108810170
73	NC_008149	A	8	8	3884	3891	100 %	0 %	0 %	0 %	108810170
74	NC_008149	TGC	2	6	3905	3910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810170
75	NC_008149	ACC	2	6	3921	3926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108810170
76	NC_008149	CAG	2	6	3959	3964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108810170
77	NC_008149	TGT	2	6	4014	4019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108810171
78	NC_008149	GTT	2	6	4030	4035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108810171
79	NC_008149	TTG	2	6	4046	4051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108810171
80	NC_008149	TTG	2	6	4061	4066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108810171
81	NC_008149	CCA	2	6	4081	4086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108810171
82	NC_008149	GCCA	2	8	4113	4120	25 %	0 %	25 %	50 %	108810171
83	NC_008149	GAT	2	6	4122	4127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108810171
84	NC_008149	TAAA	2	8	4132	4139	75 %	25 %	0 %	0 %	108810171
85	NC_008149	GTT	2	6	4168	4173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108810171
86	NC_008149	CAG	3	9	4205	4213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108810171
87	NC_008149	TGG	2	6	4217	4222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108810171
88	NC_008149	TGGC	2	8	4262	4269	0 %	25 %	50 %	25 %	108810171
89	NC_008149	ATC	2	6	4301	4306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108810171
90	NC_008149	GAT	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108810171
91	NC_008149	CTGT	2	8	4470	4477	0 %	50 %	25 %	25 %	108810171
92	NC_008149	AGTG	2	8	4538	4545	25 %	25 %	50 %	0 %	108810171
93	NC_008149	TGG	2	6	4548	4553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108810171
94	NC_008149	TGC	2	6	4560	4565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810171
95	NC_008149	TAA	2	6	4610	4615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108810171
96	NC_008149	CAA	2	6	4643	4648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108810171
97	NC_008149	TCA	2	6	4737	4742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108810171
98	NC_008149	GAA	2	6	4751	4756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108810171
99	NC_008149	GTA	2	6	4768	4773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108810171
100	NC_008149	CTT	2	6	4784	4789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108810171
101	NC_008149	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108810171
102	NC_008149	TCAA	2	8	4890	4897	50 %	25 %	0 %	25 %	108810171
103	NC_008149	TGG	2	6	4908	4913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108810171
104	NC_008149	TTC	2	6	4916	4921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108810171
105	NC_008149	CTG	2	6	4971	4976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810171
106	NC_008149	CAG	2	6	4979	4984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108810171
107	NC_008149	GCT	2	6	5060	5065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810171
108	NC_008149	CTT	3	9	5266	5274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108810171
109	NC_008149	TCA	2	6	5329	5334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108810171
110	NC_008149	GCG	2	6	5375	5380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108810171
111	NC_008149	GGA	2	6	5406	5411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108810171
112	NC_008149	TGC	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810171
113	NC_008149	TTCT	2	8	5518	5525	0 %	75 %	0 %	25 %	108810171
114	NC_008149	GAT	2	6	5535	5540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108810171
115	NC_008149	TGA	2	6	5569	5574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008149	TTG	2	6	5629	5634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008149	ATC	2	6	5652	5657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008149	ATT	2	6	5659	5664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008149	AAT	2	6	5724	5729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008149	TCT	2	6	5770	5775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008149	GA	3	6	5917	5922	50 %	0 %	50 %	0 %	108810172
122	NC_008149	T	6	6	5974	5979	0 %	100 %	0 %	0 %	108810172
123	NC_008149	GTC	2	6	6008	6013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810172
124	NC_008149	AGG	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108810172
125	NC_008149	TGG	2	6	6126	6131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108810172
126	NC_008149	TGG	2	6	6145	6150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108810172
127	NC_008149	CTT	2	6	6154	6159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108810172
128	NC_008149	CGC	2	6	6223	6228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108810172
129	NC_008149	TAT	2	6	6382	6387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108810172
130	NC_008149	T	6	6	6437	6442	0 %	100 %	0 %	0 %	108810172
131	NC_008149	T	6	6	6464	6469	0 %	100 %	0 %	0 %	108810172
132	NC_008149	CGT	2	6	6579	6584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810172
133	NC_008149	ATT	2	6	6594	6599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108810172
134	NC_008149	TTA	2	6	6614	6619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108810172
135	NC_008149	CTT	2	6	6649	6654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108810172
136	NC_008149	ACC	2	6	6784	6789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108810172
137	NC_008149	ATT	2	6	6797	6802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108810172
138	NC_008149	AT	4	8	6830	6837	50 %	50 %	0 %	0 %	108810172
139	NC_008149	GGT	2	6	6868	6873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108810172
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150	NC_008149	ATT	2	6	7291	7296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108810172
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157	NC_008149	ATC	2	6	7723	7728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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159	NC_008149	CAT	2	6	7743	7748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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161	NC_008149	TCT	2	6	7834	7839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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250	NC_008149	TAT	2	6	12000	12005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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254	NC_008149	ATA	2	6	12132	12137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_008149	TAG	2	6	12512	12517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
263	NC_008149	CGA	2	6	12540	12545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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265	NC_008149	GT	3	6	12667	12672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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267	NC_008149	GAG	2	6	12707	12712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
268	NC_008149	AGA	2	6	12756	12761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_008149	G	6	6	12929	12934	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
271	NC_008149	GGA	2	6	12973	12978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
272	NC_008149	GGC	2	6	12993	12998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_008149	GAA	2	6	13236	13241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
274	NC_008149	TGC	2	6	13312	13317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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276	NC_008149	TTG	2	6	13385	13390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_008149	GGA	2	6	13438	13443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_008149	AC	3	6	13658	13663	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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403	NC_008149	ACC	2	6	20600	20605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108810180
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408	NC_008149	CCG	2	6	20936	20941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108810180
409	NC_008149	TG	3	6	21046	21051	0 %	50 %	50 %	0 %	108810180
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499	NC_008149	TTTC	2	8	25029	25036	0 %	75 %	0 %	25 %	108810183
500	NC_008149	AAC	2	6	25094	25099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108810183

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