MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Yersinia pestis Antiqua plasmid pCD

Total Repeats: 1425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008122	CTG	2	6	46789	46794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793697
1002	NC_008122	GGC	2	6	46800	46805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793697
1003	NC_008122	A	6	6	46807	46812	100 %	0 %	0 %	0 %	108793697
1004	NC_008122	ATCG	2	8	46960	46967	25 %	25 %	25 %	25 %	108793697
1005	NC_008122	CTG	2	6	47026	47031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793697
1006	NC_008122	TCC	2	6	47034	47039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108793697
1007	NC_008122	AGC	2	6	47081	47086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_008122	GAG	2	6	47159	47164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_008122	T	8	8	47269	47276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_008122	TGG	2	6	47316	47321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_008122	CGC	2	6	47325	47330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_008122	CTC	2	6	47331	47336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_008122	GAG	2	6	47346	47351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_008122	GA	3	6	47446	47451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_008122	A	7	7	47455	47461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_008122	GAA	2	6	47520	47525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793698
1017	NC_008122	GAA	2	6	47547	47552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793698
1018	NC_008122	GTA	2	6	47604	47609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793698
1019	NC_008122	GAT	2	6	47751	47756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793698
1020	NC_008122	GAA	2	6	47870	47875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793698
1021	NC_008122	AGG	2	6	47878	47883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108793698
1022	NC_008122	ATC	2	6	47887	47892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793698
1023	NC_008122	TCA	2	6	47898	47903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793698
1024	NC_008122	CAA	2	6	48015	48020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_008122	TCCC	2	8	48040	48047	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1026	NC_008122	TGA	2	6	48088	48093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793699
1027	NC_008122	GAA	2	6	48130	48135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793699
1028	NC_008122	GCC	2	6	48161	48166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793699
1029	NC_008122	TCTG	2	8	48361	48368	0 %	50 %	25 %	25 %	108793699
1030	NC_008122	CAT	2	6	48425	48430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793699
1031	NC_008122	GACC	2	8	48446	48453	25 %	0 %	25 %	50 %	108793699
1032	NC_008122	CGTG	2	8	48580	48587	0 %	25 %	50 %	25 %	108793699
1033	NC_008122	GCC	2	6	48608	48613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793699
1034	NC_008122	AGCC	2	8	48682	48689	25 %	0 %	25 %	50 %	108793699
1035	NC_008122	TC	3	6	48691	48696	0 %	50 %	0 %	50 %	108793699
1036	NC_008122	GCA	2	6	48698	48703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793699
1037	NC_008122	CAT	2	6	48819	48824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793699
1038	NC_008122	CGC	2	6	48858	48863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_008122	CAG	2	6	48864	48869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_008122	T	6	6	48909	48914	0 %	100 %	0 %	0 %	108793700
1041	NC_008122	GCA	2	6	48928	48933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793700
1042	NC_008122	CCA	2	6	48958	48963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793700
1043	NC_008122	CTT	3	9	49037	49045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793700
1044	NC_008122	CTT	2	6	49090	49095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793700
1045	NC_008122	TTC	2	6	49142	49147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793700
1046	NC_008122	AAG	2	6	49195	49200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_008122	TTGT	2	8	49257	49264	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_008122	ATT	2	6	49267	49272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_008122	CTC	2	6	49288	49293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_008122	TAT	2	6	49331	49336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_008122	ATC	2	6	49337	49342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_008122	ATT	3	9	49364	49372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_008122	CTC	2	6	49407	49412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_008122	TCA	2	6	49428	49433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_008122	TTA	2	6	49453	49458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_008122	GTT	2	6	49518	49523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_008122	TTG	2	6	49551	49556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_008122	AGT	2	6	49570	49575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_008122	A	6	6	49583	49588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_008122	GT	3	6	49606	49611	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_008122	TTTA	2	8	49722	49729	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_008122	AAG	2	6	49805	49810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_008122	TTCTT	2	10	49898	49907	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1064	NC_008122	TTG	2	6	49966	49971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_008122	TA	3	6	49975	49980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_008122	ATA	2	6	50087	50092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_008122	ATT	2	6	50120	50125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_008122	ATT	2	6	50183	50188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_008122	TGA	2	6	50233	50238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793701
1070	NC_008122	T	7	7	50269	50275	0 %	100 %	0 %	0 %	108793701
1071	NC_008122	AGT	2	6	50316	50321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793701
1072	NC_008122	TC	3	6	50379	50384	0 %	50 %	0 %	50 %	108793701
1073	NC_008122	CTG	2	6	50431	50436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793701
1074	NC_008122	TCA	2	6	50487	50492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793701
1075	NC_008122	TGGA	2	8	50499	50506	25 %	25 %	50 %	0 %	108793701
1076	NC_008122	CTT	2	6	50576	50581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793701
1077	NC_008122	CTT	2	6	50599	50604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793701
1078	NC_008122	GCA	2	6	50617	50622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793701
1079	NC_008122	CCCT	2	8	50631	50638	0 %	25 %	0 %	75 %	108793701
1080	NC_008122	CG	3	6	50748	50753	0 %	0 %	50 %	50 %	108793701
1081	NC_008122	TAT	2	6	50810	50815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_008122	A	6	6	50819	50824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_008122	AC	3	6	50837	50842	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_008122	GT	3	6	50859	50864	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_008122	GTT	2	6	50898	50903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_008122	CAGG	2	8	50917	50924	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1087	NC_008122	GTT	2	6	50977	50982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793703
1088	NC_008122	GCG	2	6	51059	51064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793703
1089	NC_008122	TTA	2	6	51127	51132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793703
1090	NC_008122	CTG	2	6	51321	51326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793703
1091	NC_008122	GCT	2	6	51389	51394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793703
1092	NC_008122	GCC	2	6	51489	51494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793703
1093	NC_008122	A	6	6	51525	51530	100 %	0 %	0 %	0 %	108793703
1094	NC_008122	CCT	2	6	51533	51538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108793703
1095	NC_008122	GAT	2	6	51540	51545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793703
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1097	NC_008122	CTG	2	6	51633	51638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793703
1098	NC_008122	GTT	2	6	51716	51721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793703
1099	NC_008122	ACA	2	6	51800	51805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793703
1100	NC_008122	CAG	2	6	51911	51916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793703
1101	NC_008122	GGA	2	6	51929	51934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108793703
1102	NC_008122	CCG	2	6	51981	51986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793703
1103	NC_008122	CGC	2	6	52275	52280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793703
1104	NC_008122	GGC	2	6	52287	52292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793703
1105	NC_008122	CAG	2	6	52491	52496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793703
1106	NC_008122	GACA	2	8	52523	52530	50 %	0 %	25 %	25 %	108793703
1107	NC_008122	C	6	6	52588	52593	0 %	0 %	0 %	100 %	108793703
1108	NC_008122	TGA	2	6	52658	52663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793703
1109	NC_008122	GATGA	2	10	52710	52719	40 %	20 %	40 %	0 %	108793703
1110	NC_008122	ACT	2	6	52778	52783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793703
1111	NC_008122	GGCT	2	8	52804	52811	0 %	25 %	50 %	25 %	108793703
1112	NC_008122	CAT	2	6	52817	52822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793703
1113	NC_008122	TCT	2	6	52853	52858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793703
1114	NC_008122	TGA	3	9	52868	52876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793703
1115	NC_008122	TCG	2	6	52883	52888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793703
1116	NC_008122	GA	3	6	52915	52920	50 %	0 %	50 %	0 %	108793703
1117	NC_008122	GCC	2	6	52921	52926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793703
1118	NC_008122	GAA	2	6	53094	53099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793703
1119	NC_008122	GAT	2	6	53184	53189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793703
1120	NC_008122	ACGT	2	8	53249	53256	25 %	25 %	25 %	25 %	108793703
1121	NC_008122	TGA	2	6	53326	53331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793702
1122	NC_008122	ATC	2	6	53387	53392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793702
1123	NC_008122	CA	3	6	53393	53398	50 %	0 %	0 %	50 %	108793702
1124	NC_008122	GTT	2	6	53488	53493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793702
1125	NC_008122	GCG	2	6	53501	53506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793702
1126	NC_008122	T	7	7	53650	53656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_008122	CTC	2	6	53668	53673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1128	NC_008122	TACAG	2	10	53735	53744	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1129	NC_008122	ATT	2	6	53745	53750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_008122	TA	3	6	53752	53757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_008122	TTA	2	6	53760	53765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1133	NC_008122	T	6	6	53781	53786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_008122	ATA	2	6	53799	53804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1136	NC_008122	T	7	7	53867	53873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1145	NC_008122	AT	3	6	54162	54167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1397	NC_008122	ATGA	2	8	68821	68828	50 %	25 %	25 %	0 %	108793717
1398	NC_008122	AGA	2	6	68853	68858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793717
1399	NC_008122	TAT	2	6	68892	68897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793717
1400	NC_008122	ATT	2	6	68958	68963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793717
1401	NC_008122	TAAA	2	8	68996	69003	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1402	NC_008122	CTG	2	6	69084	69089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1403	NC_008122	AAT	2	6	69093	69098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1404	NC_008122	ACA	2	6	69116	69121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1405	NC_008122	ATA	2	6	69228	69233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793718
1406	NC_008122	T	6	6	69278	69283	0 %	100 %	0 %	0 %	108793718
1407	NC_008122	ATAA	2	8	69305	69312	75 %	25 %	0 %	0 %	108793718
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1409	NC_008122	GTG	2	6	69399	69404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1410	NC_008122	GAA	2	6	69437	69442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1411	NC_008122	GT	3	6	69461	69466	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_008122	CCT	2	6	69475	69480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1413	NC_008122	ACC	2	6	69490	69495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793719
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1420	NC_008122	CAG	2	6	69896	69901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793720
1421	NC_008122	CAA	2	6	70107	70112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793720
1422	NC_008122	AAT	2	6	70140	70145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793720
1423	NC_008122	GCA	2	6	70146	70151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793720
1424	NC_008122	TCA	2	6	70209	70214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1425	NC_008122	T	7	7	70254	70260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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