MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 plasmid pYptb32953

Total Repeats: 593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006154	TA	5	10	30	39	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006154	TGT	2	6	52	57	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006154	TTTG	2	8	62	69	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006154	TTGAT	2	10	140	149	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006154	A	6	6	170	175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006154	AGG	2	6	188	193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006154	AAT	2	6	238	243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593943
8	NC_006154	ACA	2	6	260	265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51593943
9	NC_006154	ATAG	2	8	310	317	50 %	25 %	25 %	0 %	51593943
10	NC_006154	TA	3	6	341	346	50 %	50 %	0 %	0 %	51593943
11	NC_006154	CTG	2	6	356	361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593943
12	NC_006154	TCA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593943
13	NC_006154	A	6	6	411	416	100 %	0 %	0 %	0 %	51593943
14	NC_006154	TCG	2	6	424	429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593943
15	NC_006154	A	6	6	436	441	100 %	0 %	0 %	0 %	51593943
16	NC_006154	GAA	2	6	468	473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593943
17	NC_006154	ATG	2	6	521	526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593943
18	NC_006154	TC	3	6	560	565	0 %	50 %	0 %	50 %	51593943
19	NC_006154	TTTA	2	8	578	585	25 %	75 %	0 %	0 %	51593943
20	NC_006154	AAAG	2	8	594	601	75 %	0 %	25 %	0 %	51593943
21	NC_006154	TTTGC	2	10	652	661	0 %	60 %	20 %	20 %	51593943
22	NC_006154	TA	3	6	665	670	50 %	50 %	0 %	0 %	51593943
23	NC_006154	TTA	2	6	722	727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593943
24	NC_006154	GAAA	2	8	756	763	75 %	0 %	25 %	0 %	51593943
25	NC_006154	AG	3	6	806	811	50 %	0 %	50 %	0 %	51593943
26	NC_006154	AT	3	6	812	817	50 %	50 %	0 %	0 %	51593943
27	NC_006154	TAAT	2	8	836	843	50 %	50 %	0 %	0 %	51593943
28	NC_006154	GAA	2	6	922	927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593943
29	NC_006154	A	7	7	926	932	100 %	0 %	0 %	0 %	51593943
30	NC_006154	AGA	2	6	970	975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593943
31	NC_006154	TAT	2	6	1032	1037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593943
32	NC_006154	GAGT	2	8	1038	1045	25 %	25 %	50 %	0 %	51593943
33	NC_006154	A	6	6	1048	1053	100 %	0 %	0 %	0 %	51593943
34	NC_006154	A	6	6	1079	1084	100 %	0 %	0 %	0 %	51593943
35	NC_006154	A	7	7	1101	1107	100 %	0 %	0 %	0 %	51593943
36	NC_006154	ATT	2	6	1126	1131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593943
37	NC_006154	TAA	2	6	1154	1159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593943
38	NC_006154	TGGAA	2	10	1194	1203	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006154	ATTGA	2	10	1215	1224	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006154	CAA	2	6	1257	1262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_006154	AGG	2	6	1305	1310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006154	GTA	2	6	1415	1420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593944
43	NC_006154	GGT	2	6	1421	1426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593944
44	NC_006154	A	8	8	1474	1481	100 %	0 %	0 %	0 %	51593944
45	NC_006154	T	7	7	1539	1545	0 %	100 %	0 %	0 %	51593944
46	NC_006154	ACAA	2	8	1573	1580	75 %	0 %	0 %	25 %	51593944
47	NC_006154	ATT	2	6	1586	1591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593944
48	NC_006154	ATTT	2	8	1611	1618	25 %	75 %	0 %	0 %	51593944
49	NC_006154	T	7	7	1663	1669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006154	TG	3	6	1690	1695	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006154	CAAT	2	8	1724	1731	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_006154	A	7	7	1741	1747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006154	TAA	2	6	1758	1763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006154	ATGTAT	2	12	1773	1784	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006154	AT	3	6	1803	1808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006154	AGA	2	6	1917	1922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593945
57	NC_006154	GAT	2	6	1940	1945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593945
58	NC_006154	TCT	2	6	1955	1960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593945
59	NC_006154	CAA	2	6	1977	1982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51593945
60	NC_006154	ATTTT	2	10	2013	2022	20 %	80 %	0 %	0 %	51593945
61	NC_006154	CTA	2	6	2036	2041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593945
62	NC_006154	ATCTAA	2	12	2047	2058	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	51593945
63	NC_006154	TAA	2	6	2116	2121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593945
64	NC_006154	TG	3	6	2149	2154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006154	ACTA	2	8	2166	2173	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_006154	T	8	8	2226	2233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006154	ATT	2	6	2236	2241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006154	TAAT	2	8	2331	2338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006154	AT	3	6	2500	2505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006154	GCC	2	6	2522	2527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_006154	GAG	2	6	2559	2564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006154	CTG	2	6	2582	2587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593946
73	NC_006154	A	8	8	2699	2706	100 %	0 %	0 %	0 %	51593946
74	NC_006154	TAA	2	6	2721	2726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593946
75	NC_006154	AGA	2	6	2727	2732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593946
76	NC_006154	ATCA	2	8	2797	2804	50 %	25 %	0 %	25 %	51593946
77	NC_006154	TCTG	2	8	2862	2869	0 %	50 %	25 %	25 %	51593946
78	NC_006154	AAT	2	6	2880	2885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593946
79	NC_006154	GTT	2	6	2930	2935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593946
80	NC_006154	ATT	2	6	2936	2941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593946
81	NC_006154	A	6	6	2965	2970	100 %	0 %	0 %	0 %	51593946
82	NC_006154	CG	3	6	3004	3009	0 %	0 %	50 %	50 %	51593946
83	NC_006154	CAC	2	6	3023	3028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51593946
84	NC_006154	G	6	6	3149	3154	0 %	0 %	100 %	0 %	51593946
85	NC_006154	TCG	2	6	3158	3163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593946
86	NC_006154	GTT	2	6	3199	3204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593947
87	NC_006154	A	6	6	3207	3212	100 %	0 %	0 %	0 %	51593947
88	NC_006154	CATCC	2	10	3230	3239	20 %	20 %	0 %	60 %	51593947
89	NC_006154	TGTC	2	8	3339	3346	0 %	50 %	25 %	25 %	51593947
90	NC_006154	TGGG	2	8	3371	3378	0 %	25 %	75 %	0 %	51593947
91	NC_006154	ATT	2	6	3428	3433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593947
92	NC_006154	ATT	2	6	3446	3451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593947
93	NC_006154	GTT	2	6	3472	3477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593947
94	NC_006154	G	6	6	3493	3498	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006154	TTA	2	6	3570	3575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593948
96	NC_006154	GGC	2	6	3598	3603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593948
97	NC_006154	CAA	2	6	3615	3620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51593948
98	NC_006154	TTC	2	6	3626	3631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593948
99	NC_006154	GTG	2	6	3646	3651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593948
100	NC_006154	TGGC	2	8	3761	3768	0 %	25 %	50 %	25 %	51593948
101	NC_006154	TCA	2	6	3857	3862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593948
102	NC_006154	G	6	6	3923	3928	0 %	0 %	100 %	0 %	51593948
103	NC_006154	GT	3	6	3930	3935	0 %	50 %	50 %	0 %	51593948
104	NC_006154	CGA	2	6	3949	3954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593948
105	NC_006154	ATA	2	6	4032	4037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593948
106	NC_006154	CAA	2	6	4064	4069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51593948
107	NC_006154	TGA	2	6	4090	4095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593948
108	NC_006154	ATG	2	6	4169	4174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593948
109	NC_006154	C	6	6	4175	4180	0 %	0 %	0 %	100 %	51593948
110	NC_006154	GAAA	2	8	4199	4206	75 %	0 %	25 %	0 %	51593948
111	NC_006154	CGC	2	6	4296	4301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51593948
112	NC_006154	GAA	2	6	4328	4333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593948
113	NC_006154	GTG	2	6	4340	4345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593948
114	NC_006154	CTT	2	6	4372	4377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593948
115	NC_006154	A	6	6	4395	4400	100 %	0 %	0 %	0 %	51593948
116	NC_006154	CTT	2	6	4450	4455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593948
117	NC_006154	ATT	2	6	4524	4529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593948
118	NC_006154	AGG	2	6	4629	4634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51593948
119	NC_006154	GAT	2	6	4673	4678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593948
120	NC_006154	GACT	2	8	4693	4700	25 %	25 %	25 %	25 %	51593948
121	NC_006154	AGC	2	6	4870	4875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593948
122	NC_006154	AGT	2	6	4934	4939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593948
123	NC_006154	GC	3	6	5043	5048	0 %	0 %	50 %	50 %	51593948
124	NC_006154	CTG	2	6	5072	5077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593948
125	NC_006154	A	7	7	5097	5103	100 %	0 %	0 %	0 %	51593948
126	NC_006154	GCTG	2	8	5160	5167	0 %	25 %	50 %	25 %	51593948
127	NC_006154	ATG	2	6	5174	5179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593948
128	NC_006154	GCA	2	6	5191	5196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593948
129	NC_006154	A	8	8	5219	5226	100 %	0 %	0 %	0 %	51593948
130	NC_006154	G	6	6	5288	5293	0 %	0 %	100 %	0 %	51593948
131	NC_006154	TCA	2	6	5373	5378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593948
132	NC_006154	G	8	8	5593	5600	0 %	0 %	100 %	0 %	51593948
133	NC_006154	AGTG	2	8	5645	5652	25 %	25 %	50 %	0 %	51593948
134	NC_006154	TG	3	6	5698	5703	0 %	50 %	50 %	0 %	51593948
135	NC_006154	TGT	2	6	5724	5729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593948
136	NC_006154	TGGA	2	8	5748	5755	25 %	25 %	50 %	0 %	51593948
137	NC_006154	TGA	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593948
138	NC_006154	AAG	2	6	5813	5818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593948
139	NC_006154	TCT	2	6	5830	5835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593948
140	NC_006154	GT	3	6	6332	6337	0 %	50 %	50 %	0 %	51593949
141	NC_006154	CTG	2	6	6345	6350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593949
142	NC_006154	CGG	2	6	6382	6387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593949
143	NC_006154	TAT	2	6	6389	6394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593949
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271	NC_006154	GTG	2	6	12039	12044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593956
272	NC_006154	TTG	2	6	12072	12077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
273	NC_006154	TTG	2	6	12081	12086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
274	NC_006154	TTG	2	6	12090	12095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
275	NC_006154	TGT	2	6	12103	12108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
276	NC_006154	ATT	2	6	12151	12156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_006154	T	7	7	12192	12198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_006154	ATT	2	6	12218	12223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_006154	TTA	2	6	12237	12242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_006154	TC	3	6	12277	12282	0 %	50 %	0 %	50 %	51593957
281	NC_006154	TGCA	2	8	12424	12431	25 %	25 %	25 %	25 %	51593957
282	NC_006154	ACA	2	6	12455	12460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51593957
283	NC_006154	TCA	2	6	12600	12605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593957
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390	NC_006154	TTA	2	6	17914	17919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
391	NC_006154	TA	3	6	17952	17957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
392	NC_006154	GA	3	6	17968	17973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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394	NC_006154	GCG	2	6	18054	18059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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397	NC_006154	C	6	6	18235	18240	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
398	NC_006154	AGA	2	6	18266	18271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_006154	A	6	6	18461	18466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
401	NC_006154	CT	3	6	18509	18514	0 %	50 %	0 %	50 %	51593970
402	NC_006154	TAA	2	6	18516	18521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593970
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407	NC_006154	TA	3	6	18721	18726	50 %	50 %	0 %	0 %	51593970
408	NC_006154	GA	3	6	18737	18742	50 %	0 %	50 %	0 %	51593970
409	NC_006154	TAC	2	6	18790	18795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593970
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411	NC_006154	CGG	2	6	18954	18959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593970
412	NC_006154	TTG	2	6	18987	18992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593970
413	NC_006154	CAT	2	6	19004	19009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593970
414	NC_006154	ACA	2	6	19045	19050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51593970
415	NC_006154	AAC	2	6	19066	19071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51593970
416	NC_006154	GAT	2	6	19157	19162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593970
417	NC_006154	AACTT	2	10	19248	19257	40 %	40 %	0 %	20 %	51593970
418	NC_006154	GAA	2	6	19286	19291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593970
419	NC_006154	TTAT	2	8	19292	19299	25 %	75 %	0 %	0 %	51593970
420	NC_006154	AGC	2	6	19330	19335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593970
421	NC_006154	TGA	2	6	19351	19356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593970
422	NC_006154	TGC	2	6	19363	19368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593970
423	NC_006154	GAA	2	6	19484	19489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593970
424	NC_006154	TTA	2	6	19496	19501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593970
425	NC_006154	TGA	2	6	19546	19551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593970
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428	NC_006154	TGA	2	6	19693	19698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593970
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431	NC_006154	AGT	2	6	19831	19836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593970
432	NC_006154	TA	3	6	19872	19877	50 %	50 %	0 %	0 %	51593970
433	NC_006154	TTG	2	6	19932	19937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593970
434	NC_006154	ATG	2	6	19938	19943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593970
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436	NC_006154	TTATT	2	10	20020	20029	20 %	80 %	0 %	0 %	51593970
437	NC_006154	CCT	2	6	20054	20059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51593970
438	NC_006154	TA	3	6	20069	20074	50 %	50 %	0 %	0 %	51593970
439	NC_006154	A	6	6	20126	20131	100 %	0 %	0 %	0 %	51593970
440	NC_006154	ATTC	2	8	20144	20151	25 %	50 %	0 %	25 %	51593970
441	NC_006154	AAG	2	6	20172	20177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593970
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444	NC_006154	AAG	2	6	20225	20230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593970
445	NC_006154	GAA	2	6	20246	20251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593970
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448	NC_006154	AAGA	2	8	20316	20323	75 %	0 %	25 %	0 %	51593971
449	NC_006154	A	6	6	20323	20328	100 %	0 %	0 %	0 %	51593971
450	NC_006154	ATT	2	6	20336	20341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593971
451	NC_006154	TTTA	2	8	20390	20397	25 %	75 %	0 %	0 %	51593971
452	NC_006154	AT	3	6	20491	20496	50 %	50 %	0 %	0 %	51593971
453	NC_006154	ATG	2	6	20515	20520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593971
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456	NC_006154	C	8	8	20558	20565	0 %	0 %	0 %	100 %	51593971
457	NC_006154	GGAT	2	8	20589	20596	25 %	25 %	50 %	0 %	51593971
458	NC_006154	ATC	3	9	20602	20610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593971
459	NC_006154	AAT	2	6	20679	20684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593971
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461	NC_006154	AAT	2	6	20801	20806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593971
462	NC_006154	T	6	6	20851	20856	0 %	100 %	0 %	0 %	51593971
463	NC_006154	A	7	7	20877	20883	100 %	0 %	0 %	0 %	51593971
464	NC_006154	TGA	2	6	20890	20895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593971
465	NC_006154	ATT	2	6	20922	20927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593971
466	NC_006154	TTC	2	6	20976	20981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593971
467	NC_006154	CTTT	2	8	21003	21010	0 %	75 %	0 %	25 %	51593971
468	NC_006154	AATA	2	8	21052	21059	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_006154	CGG	2	6	21305	21310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593972
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482	NC_006154	GCCA	2	8	21874	21881	25 %	0 %	25 %	50 %	51593972
483	NC_006154	A	6	6	21949	21954	100 %	0 %	0 %	0 %	51593972
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500	NC_006154	A	6	6	22732	22737	100 %	0 %	0 %	0 %	51593972

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