MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 chromosome

Total Repeats: 90548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_005810	TTA	2	6	181644	181649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45440028
3502	NC_005810	TAC	2	6	181718	181723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440028
3503	NC_005810	AT	3	6	181756	181761	50 %	50 %	0 %	0 %	45440028
3504	NC_005810	TAA	2	6	181778	181783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440028
3505	NC_005810	A	6	6	181782	181787	100 %	0 %	0 %	0 %	45440028
3506	NC_005810	TCA	2	6	181804	181809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440028
3507	NC_005810	TGG	2	6	181837	181842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440028
3508	NC_005810	GCCA	2	8	181867	181874	25 %	0 %	25 %	50 %	45440028
3509	NC_005810	G	6	6	181938	181943	0 %	0 %	100 %	0 %	45440028
3510	NC_005810	GT	3	6	182200	182205	0 %	50 %	50 %	0 %	45440028
3511	NC_005810	GAT	2	6	182276	182281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440028
3512	NC_005810	GCT	2	6	182298	182303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440028
3513	NC_005810	CGATAC	2	12	182384	182395	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	45440028
3514	NC_005810	ATGG	2	8	182454	182461	25 %	25 %	50 %	0 %	45440028
3515	NC_005810	GGC	2	6	182486	182491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440028
3516	NC_005810	GAT	2	6	182600	182605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440028
3517	NC_005810	CGG	2	6	182628	182633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440028
3518	NC_005810	CGG	2	6	182639	182644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440028
3519	NC_005810	AC	3	6	182712	182717	50 %	0 %	0 %	50 %	45440028
3520	NC_005810	GGC	2	6	182792	182797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440028
3521	NC_005810	TGT	2	6	182944	182949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440028
3522	NC_005810	CAG	2	6	183016	183021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440028
3523	NC_005810	CTA	2	6	183025	183030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440028
3524	NC_005810	A	6	6	183055	183060	100 %	0 %	0 %	0 %	45440028
3525	NC_005810	A	6	6	183167	183172	100 %	0 %	0 %	0 %	45440028
3526	NC_005810	ATA	2	6	183193	183198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440028
3527	NC_005810	GCG	2	6	183217	183222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440028
3528	NC_005810	G	6	6	183286	183291	0 %	0 %	100 %	0 %	45440028
3529	NC_005810	CCA	2	6	183327	183332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440028
3530	NC_005810	GTC	2	6	183438	183443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440028
3531	NC_005810	CAG	2	6	183458	183463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440028
3532	NC_005810	CT	3	6	183637	183642	0 %	50 %	0 %	50 %	45440028
3533	NC_005810	TAA	2	6	183716	183721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_005810	AACACC	2	12	183743	183754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3535	NC_005810	CGG	2	6	183772	183777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440029
3536	NC_005810	CAC	2	6	183924	183929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440029
3537	NC_005810	TTTA	2	8	183976	183983	25 %	75 %	0 %	0 %	45440029
3538	NC_005810	ATAG	2	8	184024	184031	50 %	25 %	25 %	0 %	45440029
3539	NC_005810	ATCA	2	8	184225	184232	50 %	25 %	0 %	25 %	45440029
3540	NC_005810	TGGC	2	8	184250	184257	0 %	25 %	50 %	25 %	45440029
3541	NC_005810	ATG	2	6	184258	184263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440029
3542	NC_005810	CA	3	6	184276	184281	50 %	0 %	0 %	50 %	45440029
3543	NC_005810	AACC	2	8	184300	184307	50 %	0 %	0 %	50 %	45440029
3544	NC_005810	AAT	2	6	184313	184318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440029
3545	NC_005810	TGC	2	6	184333	184338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440029
3546	NC_005810	TCG	2	6	184358	184363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440029
3547	NC_005810	GTT	2	6	184470	184475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440029
3548	NC_005810	TTCTGT	2	12	184486	184497	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	45440029
3549	NC_005810	A	6	6	184522	184527	100 %	0 %	0 %	0 %	45440029
3550	NC_005810	GGT	2	6	184543	184548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440029
3551	NC_005810	TA	3	6	184776	184781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_005810	GCC	2	6	184784	184789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_005810	GCT	2	6	184822	184827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_005810	TGC	2	6	184844	184849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_005810	TGT	2	6	184857	184862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_005810	TTG	2	6	184879	184884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_005810	A	7	7	184906	184912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_005810	ACAA	2	8	184924	184931	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3559	NC_005810	ACA	2	6	184965	184970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_005810	TCA	2	6	184989	184994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_005810	GTA	2	6	185033	185038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_005810	CCT	2	6	185039	185044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3563	NC_005810	CAA	2	6	185100	185105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_005810	CGA	2	6	185113	185118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_005810	CCG	2	6	185129	185134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3566	NC_005810	AAT	2	6	185235	185240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_005810	AGTT	2	8	185243	185250	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_005810	ATC	2	6	185262	185267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_005810	TGT	2	6	185295	185300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_005810	TAC	2	6	185304	185309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_005810	GTT	2	6	185325	185330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_005810	ATGG	2	8	185331	185338	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_005810	AGCTG	2	10	185387	185396	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3574	NC_005810	GCT	2	6	185488	185493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_005810	TCT	2	6	185503	185508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_005810	TTGC	2	8	185567	185574	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3577	NC_005810	ATG	2	6	185621	185626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_005810	CA	3	6	185633	185638	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3579	NC_005810	CCATA	2	10	185694	185703	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3580	NC_005810	ATG	2	6	185769	185774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_005810	AGC	2	6	185904	185909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_005810	CCA	2	6	185953	185958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3583	NC_005810	GTC	2	6	185965	185970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_005810	CTG	2	6	186011	186016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_005810	AGT	2	6	186089	186094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_005810	AAT	2	6	186156	186161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_005810	GGC	2	6	186173	186178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_005810	GTT	2	6	186218	186223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_005810	AAT	2	6	186279	186284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_005810	TCA	2	6	186412	186417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_005810	GTCT	2	8	186423	186430	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3592	NC_005810	GAG	2	6	186577	186582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_005810	CT	3	6	186765	186770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3594	NC_005810	CTG	2	6	186879	186884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440030
3595	NC_005810	TGT	2	6	186909	186914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440030
3596	NC_005810	AAC	2	6	186916	186921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45440030
3597	NC_005810	AAC	2	6	187013	187018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45440030
3598	NC_005810	GGC	2	6	187058	187063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440030
3599	NC_005810	A	6	6	187086	187091	100 %	0 %	0 %	0 %	45440030
3600	NC_005810	CCA	2	6	187185	187190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440030
3601	NC_005810	TTC	2	6	187196	187201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440030
3602	NC_005810	GTC	2	6	187289	187294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440030
3603	NC_005810	A	6	6	187296	187301	100 %	0 %	0 %	0 %	45440030
3604	NC_005810	CAGA	2	8	187313	187320	50 %	0 %	25 %	25 %	45440030
3605	NC_005810	GTT	2	6	187396	187401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_005810	GAA	2	6	187424	187429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_005810	ATA	2	6	187465	187470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_005810	TCT	2	6	187547	187552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_005810	GCA	2	6	187557	187562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_005810	TA	3	6	187658	187663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_005810	CCTCAG	2	12	187683	187694	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3612	NC_005810	CAGC	2	8	187764	187771	25 %	0 %	25 %	50 %	45440031
3613	NC_005810	TC	3	6	187879	187884	0 %	50 %	0 %	50 %	45440031
3614	NC_005810	GTG	2	6	188131	188136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440031
3615	NC_005810	CTG	2	6	188175	188180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440031
3616	NC_005810	CAAT	2	8	188324	188331	50 %	25 %	0 %	25 %	45440031
3617	NC_005810	T	6	6	188331	188336	0 %	100 %	0 %	0 %	45440031
3618	NC_005810	GCT	2	6	188409	188414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440031
3619	NC_005810	CGG	2	6	188566	188571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440031
3620	NC_005810	GTG	2	6	188595	188600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440031
3621	NC_005810	ACA	2	6	188696	188701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45440031
3622	NC_005810	TTTC	2	8	188827	188834	0 %	75 %	0 %	25 %	45440031
3623	NC_005810	TGA	2	6	188837	188842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440031
3624	NC_005810	GGC	2	6	188848	188853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440031
3625	NC_005810	GCA	3	9	188913	188921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440031
3626	NC_005810	CAAT	2	8	188932	188939	50 %	25 %	0 %	25 %	45440031
3627	NC_005810	GAT	2	6	188969	188974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440031
3628	NC_005810	CGG	2	6	189004	189009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440031
3629	NC_005810	G	6	6	189008	189013	0 %	0 %	100 %	0 %	45440031
3630	NC_005810	CGA	2	6	189067	189072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440031
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3642	NC_005810	CTG	2	6	189506	189511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440032
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3870	NC_005810	CGCC	2	8	200828	200835	0 %	0 %	25 %	75 %	45440043
3871	NC_005810	TACGT	2	10	200896	200905	20 %	40 %	20 %	20 %	45440044
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3880	NC_005810	GGC	2	6	201184	201189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440044
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3921	NC_005810	TGC	2	6	202880	202885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3986	NC_005810	ATGG	2	8	206337	206344	25 %	25 %	50 %	0 %	45440047
3987	NC_005810	ATGGC	2	10	206371	206380	20 %	20 %	40 %	20 %	45440047
3988	NC_005810	CAT	2	6	206381	206386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440047
3989	NC_005810	T	7	7	206386	206392	0 %	100 %	0 %	0 %	45440047
3990	NC_005810	CAG	2	6	206568	206573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440047
3991	NC_005810	A	6	6	206687	206692	100 %	0 %	0 %	0 %	45440047
3992	NC_005810	ATC	2	6	206731	206736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3993	NC_005810	TGAC	2	8	206785	206792	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3994	NC_005810	ACCT	2	8	206825	206832	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3995	NC_005810	GAC	2	6	206928	206933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3996	NC_005810	ATG	2	6	206947	206952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440048
3997	NC_005810	GCC	2	6	206958	206963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440048
3998	NC_005810	TGC	2	6	206972	206977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440048
3999	NC_005810	CAG	2	6	207037	207042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440048
4000	NC_005810	TCA	2	6	207102	207107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440048

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