MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 chromosome

Total Repeats: 90548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_005810	GCC	2	6	154540	154545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440003
3002	NC_005810	TTC	2	6	154625	154630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440003
3003	NC_005810	C	6	6	154654	154659	0 %	0 %	0 %	100 %	45440003
3004	NC_005810	TCA	2	6	154698	154703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440003
3005	NC_005810	GCTT	2	8	154753	154760	0 %	50 %	25 %	25 %	45440003
3006	NC_005810	CCA	2	6	154792	154797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440003
3007	NC_005810	ATTG	2	8	154965	154972	25 %	50 %	25 %	0 %	45440004
3008	NC_005810	ATC	2	6	155079	155084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440004
3009	NC_005810	ACAA	2	8	155086	155093	75 %	0 %	0 %	25 %	45440004
3010	NC_005810	TGC	2	6	155119	155124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440004
3011	NC_005810	TCT	2	6	155149	155154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440004
3012	NC_005810	TCA	2	6	155431	155436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440004
3013	NC_005810	CAG	2	6	155535	155540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440004
3014	NC_005810	CCAT	2	8	155545	155552	25 %	25 %	0 %	50 %	45440004
3015	NC_005810	G	6	6	155592	155597	0 %	0 %	100 %	0 %	45440004
3016	NC_005810	TCC	2	6	155612	155617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3017	NC_005810	TGG	2	6	155638	155643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_005810	CTAGC	2	10	155674	155683	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3019	NC_005810	CTG	2	6	155706	155711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_005810	GAT	2	6	155720	155725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_005810	AAG	2	6	155751	155756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440005
3022	NC_005810	G	6	6	155756	155761	0 %	0 %	100 %	0 %	45440005
3023	NC_005810	ATA	2	6	155792	155797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440005
3024	NC_005810	ATCC	2	8	155810	155817	25 %	25 %	0 %	50 %	45440005
3025	NC_005810	CGA	2	6	155820	155825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440005
3026	NC_005810	CAA	2	6	155846	155851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45440005
3027	NC_005810	GAC	2	6	155861	155866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440005
3028	NC_005810	A	6	6	155872	155877	100 %	0 %	0 %	0 %	45440005
3029	NC_005810	TAA	2	6	155989	155994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440005
3030	NC_005810	GGT	2	6	156100	156105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440005
3031	NC_005810	A	6	6	156138	156143	100 %	0 %	0 %	0 %	45440005
3032	NC_005810	ATG	2	6	156202	156207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440005
3033	NC_005810	TTC	2	6	156348	156353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440005
3034	NC_005810	GTT	2	6	156499	156504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440005
3035	NC_005810	ATTG	2	8	156506	156513	25 %	50 %	25 %	0 %	45440005
3036	NC_005810	AATA	2	8	156583	156590	75 %	25 %	0 %	0 %	45440005
3037	NC_005810	GT	3	6	156625	156630	0 %	50 %	50 %	0 %	45440005
3038	NC_005810	G	7	7	156641	156647	0 %	0 %	100 %	0 %	45440005
3039	NC_005810	TGC	2	6	156713	156718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440005
3040	NC_005810	TAA	2	6	156803	156808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440005
3041	NC_005810	CGA	2	6	156829	156834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440005
3042	NC_005810	AGGTT	2	10	156838	156847	20 %	40 %	40 %	0 %	45440005
3043	NC_005810	TCA	2	6	156882	156887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440005
3044	NC_005810	A	6	6	156897	156902	100 %	0 %	0 %	0 %	45440005
3045	NC_005810	T	7	7	156949	156955	0 %	100 %	0 %	0 %	45440005
3046	NC_005810	CCAG	2	8	157174	157181	25 %	0 %	25 %	50 %	45440005
3047	NC_005810	CAA	2	6	157220	157225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45440005
3048	NC_005810	CTT	2	6	157249	157254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440005
3049	NC_005810	TTC	2	6	157283	157288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440005
3050	NC_005810	AGC	2	6	157311	157316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440005
3051	NC_005810	TCT	2	6	157332	157337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440005
3052	NC_005810	TGA	2	6	157398	157403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440005
3053	NC_005810	CAT	2	6	157468	157473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440005
3054	NC_005810	AT	3	6	157485	157490	50 %	50 %	0 %	0 %	45440005
3055	NC_005810	ATA	2	6	157532	157537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440005
3056	NC_005810	ATTT	2	8	157543	157550	25 %	75 %	0 %	0 %	45440005
3057	NC_005810	ACTC	2	8	157733	157740	25 %	25 %	0 %	50 %	45440005
3058	NC_005810	GT	3	6	157763	157768	0 %	50 %	50 %	0 %	45440005
3059	NC_005810	GCT	2	6	157788	157793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440005
3060	NC_005810	GCG	2	6	157808	157813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440005
3061	NC_005810	CCA	2	6	157823	157828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440005
3062	NC_005810	CAG	2	6	157829	157834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440005
3063	NC_005810	CATCC	2	10	157889	157898	20 %	20 %	0 %	60 %	45440005
3064	NC_005810	A	6	6	157944	157949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_005810	TAA	2	6	157968	157973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_005810	TTC	2	6	158103	158108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_005810	GT	3	6	158109	158114	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_005810	CGC	2	6	158164	158169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3069	NC_005810	CA	3	6	158382	158387	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3070	NC_005810	ATA	2	6	158398	158403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_005810	ATA	2	6	158411	158416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_005810	GTGA	2	8	158454	158461	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_005810	TGA	2	6	158623	158628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440007
3074	NC_005810	GAA	2	6	158766	158771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440007
3075	NC_005810	TGA	2	6	158891	158896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440007
3076	NC_005810	ATG	2	6	158937	158942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440007
3077	NC_005810	T	7	7	158992	158998	0 %	100 %	0 %	0 %	45440007
3078	NC_005810	TGA	2	6	159030	159035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_005810	ATTT	2	8	159054	159061	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_005810	T	6	6	159075	159080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_005810	A	7	7	159096	159102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_005810	GAT	2	6	159106	159111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_005810	ATC	2	6	159118	159123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_005810	T	6	6	159127	159132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_005810	GCT	2	6	159152	159157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_005810	GCCCG	2	10	159264	159273	0 %	0 %	40 %	60 %	229220787
3087	NC_005810	ATCA	2	8	159300	159307	50 %	25 %	0 %	25 %	229220787
3088	NC_005810	GGT	3	9	159325	159333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229220787
3089	NC_005810	GCTG	2	8	159388	159395	0 %	25 %	50 %	25 %	229220787
3090	NC_005810	TGC	2	6	159455	159460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229220787
3091	NC_005810	TCA	2	6	159481	159486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229220787
3092	NC_005810	CCG	2	6	159571	159576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229220787
3093	NC_005810	CCAG	2	8	159624	159631	25 %	0 %	25 %	50 %	229220787
3094	NC_005810	CGT	2	6	159726	159731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229220787
3095	NC_005810	GTC	2	6	159816	159821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229220787
3096	NC_005810	CAT	2	6	159920	159925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229220787
3097	NC_005810	TGA	2	6	159938	159943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229220787
3098	NC_005810	AGG	2	6	160013	160018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229220787
3099	NC_005810	T	6	6	160198	160203	0 %	100 %	0 %	0 %	229220787
3100	NC_005810	GCC	2	6	160205	160210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229220787
3101	NC_005810	CGG	2	6	160292	160297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229220787
3102	NC_005810	CTA	2	6	160385	160390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229220787
3103	NC_005810	AGCC	2	8	160455	160462	25 %	0 %	25 %	50 %	229220787
3104	NC_005810	ATC	2	6	160470	160475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229220787
3105	NC_005810	T	6	6	160524	160529	0 %	100 %	0 %	0 %	229220787
3106	NC_005810	GGACC	2	10	160532	160541	20 %	0 %	40 %	40 %	229220787
3107	NC_005810	TGC	2	6	160604	160609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229220787
3108	NC_005810	CAGC	2	8	160613	160620	25 %	0 %	25 %	50 %	229220787
3109	NC_005810	ACT	2	6	160654	160659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229220787
3110	NC_005810	GCC	2	6	160819	160824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229220787
3111	NC_005810	ATC	2	6	160897	160902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229220787
3112	NC_005810	CCA	2	6	160967	160972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229220787
3113	NC_005810	AGC	2	6	161035	161040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229220787
3114	NC_005810	ATC	2	6	161119	161124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229220787
3115	NC_005810	CTT	2	6	161153	161158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229220787
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3119	NC_005810	TGA	2	6	161434	161439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229220787
3120	NC_005810	TCT	2	6	161455	161460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229220787
3121	NC_005810	TGG	2	6	161487	161492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229220787
3122	NC_005810	ACG	2	6	161517	161522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229220787
3123	NC_005810	AT	3	6	161629	161634	50 %	50 %	0 %	0 %	229220787
3124	NC_005810	GCT	2	6	161656	161661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229220787
3125	NC_005810	AC	3	6	161676	161681	50 %	0 %	0 %	50 %	229220787
3126	NC_005810	A	6	6	161692	161697	100 %	0 %	0 %	0 %	229220787
3127	NC_005810	AAC	2	6	161753	161758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_005810	GTA	2	6	161765	161770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3209	NC_005810	TTAA	2	8	165992	165999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3210	NC_005810	TCCC	2	8	166029	166036	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3211	NC_005810	ACG	2	6	166037	166042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3213	NC_005810	GGCGG	2	10	166156	166165	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3214	NC_005810	GTC	2	6	166264	166269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440015
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3217	NC_005810	A	6	6	166554	166559	100 %	0 %	0 %	0 %	45440015
3218	NC_005810	GAA	2	6	166635	166640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440015
3219	NC_005810	AAG	2	6	166760	166765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3220	NC_005810	GCC	2	6	166832	166837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440016
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3224	NC_005810	TAC	2	6	167068	167073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440016
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3230	NC_005810	CCG	2	6	167208	167213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440016
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3232	NC_005810	C	6	6	167299	167304	0 %	0 %	0 %	100 %	45440016
3233	NC_005810	TGGCT	2	10	167320	167329	0 %	40 %	40 %	20 %	45440016
3234	NC_005810	CAT	2	6	167347	167352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440016
3235	NC_005810	TTC	2	6	167366	167371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440016
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3239	NC_005810	TGC	2	6	167470	167475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440016
3240	NC_005810	TGA	2	6	167476	167481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440016
3241	NC_005810	AG	3	6	167488	167493	50 %	0 %	50 %	0 %	45440016
3242	NC_005810	GC	4	8	167498	167505	0 %	0 %	50 %	50 %	45440016
3243	NC_005810	TGC	2	6	167587	167592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440016
3244	NC_005810	CGT	2	6	167621	167626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440016
3245	NC_005810	CT	3	6	167636	167641	0 %	50 %	0 %	50 %	45440016
3246	NC_005810	CA	3	6	167733	167738	50 %	0 %	0 %	50 %	45440016
3247	NC_005810	A	6	6	167750	167755	100 %	0 %	0 %	0 %	45440016
3248	NC_005810	TCA	2	6	167923	167928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3249	NC_005810	TCA	2	6	167938	167943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3251	NC_005810	TGT	2	6	167998	168003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3372	NC_005810	AGT	2	6	174282	174287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440022
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3374	NC_005810	ATT	2	6	174375	174380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45440023
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