MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 chromosome

Total Repeats: 90548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_005810	G	7	7	79155	79161	0 %	0 %	100 %	0 %	45439933
1502	NC_005810	TAAT	2	8	79205	79212	50 %	50 %	0 %	0 %	45439933
1503	NC_005810	ATG	2	6	79296	79301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161511476
1504	NC_005810	AGA	2	6	79307	79312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161511476
1505	NC_005810	T	6	6	79386	79391	0 %	100 %	0 %	0 %	161511476
1506	NC_005810	GAA	2	6	79500	79505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161511476
1507	NC_005810	CAT	2	6	79757	79762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161511476
1508	NC_005810	G	6	6	79845	79850	0 %	0 %	100 %	0 %	161511476
1509	NC_005810	GTG	2	6	79945	79950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161511476
1510	NC_005810	TAC	2	6	79975	79980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161511476
1511	NC_005810	ACG	2	6	79998	80003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161511476
1512	NC_005810	AG	3	6	80039	80044	50 %	0 %	50 %	0 %	161511476
1513	NC_005810	GCA	2	6	80083	80088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161511476
1514	NC_005810	TTG	2	6	80143	80148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_005810	TC	3	6	80224	80229	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1516	NC_005810	CTG	2	6	80363	80368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45439935
1517	NC_005810	GTC	2	6	80478	80483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45439935
1518	NC_005810	TG	3	6	80505	80510	0 %	50 %	50 %	0 %	45439935
1519	NC_005810	ATA	2	6	80676	80681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45439935
1520	NC_005810	AAT	2	6	80741	80746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_005810	GCG	2	6	80797	80802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_005810	GT	3	6	80836	80841	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_005810	CCG	2	6	80972	80977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45439936
1524	NC_005810	ACG	2	6	81004	81009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45439936
1525	NC_005810	AT	3	6	81013	81018	50 %	50 %	0 %	0 %	45439936
1526	NC_005810	GCC	2	6	81020	81025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45439936
1527	NC_005810	TCG	2	6	81039	81044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45439936
1528	NC_005810	ATA	2	6	81077	81082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45439936
1529	NC_005810	GCA	2	6	81085	81090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45439936
1530	NC_005810	GCCA	2	8	81122	81129	25 %	0 %	25 %	50 %	45439936
1531	NC_005810	GCA	2	6	81147	81152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45439936
1532	NC_005810	A	6	6	81161	81166	100 %	0 %	0 %	0 %	45439936
1533	NC_005810	TCAG	2	8	81167	81174	25 %	25 %	25 %	25 %	45439936
1534	NC_005810	TTGA	2	8	81184	81191	25 %	50 %	25 %	0 %	45439936
1535	NC_005810	TGAA	2	8	81215	81222	50 %	25 %	25 %	0 %	45439936
1536	NC_005810	GTT	2	6	81264	81269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45439936
1537	NC_005810	AGT	2	6	81394	81399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45439936
1538	NC_005810	CAG	2	6	81418	81423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45439936
1539	NC_005810	TGA	2	6	81558	81563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45439936
1540	NC_005810	ACA	2	6	81579	81584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45439936
1541	NC_005810	CGG	2	6	81618	81623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45439936
1542	NC_005810	CAG	2	6	81724	81729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45439936
1543	NC_005810	TGC	2	6	81840	81845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45439936
1544	NC_005810	AG	3	6	81949	81954	50 %	0 %	50 %	0 %	45439936
1545	NC_005810	ACCC	2	8	82106	82113	25 %	0 %	0 %	75 %	45439937
1546	NC_005810	CAA	2	6	82137	82142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45439937
1547	NC_005810	TCC	2	6	82162	82167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45439937
1548	NC_005810	CAT	3	9	82248	82256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45439937
1549	NC_005810	CAA	2	6	82257	82262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45439937
1550	NC_005810	ATG	3	9	82306	82314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45439937
1551	NC_005810	TCA	2	6	82475	82480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45439937
1552	NC_005810	CGG	2	6	82610	82615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45439937
1553	NC_005810	GTG	2	6	82650	82655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45439937
1554	NC_005810	GTT	2	6	82689	82694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45439937
1555	NC_005810	CGA	2	6	82698	82703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45439937
1556	NC_005810	ATC	2	6	82724	82729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45439937
1557	NC_005810	TGT	2	6	82787	82792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45439937
1558	NC_005810	CAT	2	6	82812	82817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45439937
1559	NC_005810	CCAA	2	8	82863	82870	50 %	0 %	0 %	50 %	45439937
1560	NC_005810	AGC	2	6	82874	82879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45439937
1561	NC_005810	AGC	3	9	82910	82918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45439937
1562	NC_005810	TAA	2	6	82938	82943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45439937
1563	NC_005810	GACC	2	8	83019	83026	25 %	0 %	25 %	50 %	45439937
1564	NC_005810	CTTTTT	2	12	83044	83055	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	45439937
1565	NC_005810	CTT	2	6	83106	83111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45439937
1566	NC_005810	CCA	2	6	83206	83211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45439937
1567	NC_005810	TGT	2	6	83255	83260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45439937
1568	NC_005810	CGT	2	6	83389	83394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45439937
1569	NC_005810	CG	3	6	83517	83522	0 %	0 %	50 %	50 %	45439938
1570	NC_005810	CAG	2	6	83601	83606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45439938
1571	NC_005810	GAC	2	6	83669	83674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45439938
1572	NC_005810	GC	3	6	83711	83716	0 %	0 %	50 %	50 %	45439938
1573	NC_005810	TTG	2	6	83730	83735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45439938
1574	NC_005810	GCG	2	6	83754	83759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45439938
1575	NC_005810	CG	3	6	83766	83771	0 %	0 %	50 %	50 %	45439938
1576	NC_005810	ATC	2	6	83817	83822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45439938
1577	NC_005810	CAT	2	6	83943	83948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45439938
1578	NC_005810	CAT	2	6	84005	84010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45439938
1579	NC_005810	CAA	2	6	84042	84047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45439938
1580	NC_005810	TCA	3	9	84076	84084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45439938
1581	NC_005810	CT	3	6	84116	84121	0 %	50 %	0 %	50 %	45439938
1582	NC_005810	GCAG	2	8	84214	84221	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1583	NC_005810	ACA	2	6	84290	84295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45439939
1584	NC_005810	GTTC	2	8	84313	84320	0 %	50 %	25 %	25 %	45439939
1585	NC_005810	TTC	2	6	84325	84330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45439939
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1588	NC_005810	ACA	2	6	84348	84353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45439939
1589	NC_005810	GAT	3	9	84388	84396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45439939
1590	NC_005810	CAG	2	6	84455	84460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45439939
1591	NC_005810	CGA	2	6	84565	84570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45439939
1592	NC_005810	GCT	2	6	84572	84577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45439939
1593	NC_005810	GCA	2	6	84724	84729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45439939
1594	NC_005810	CAG	2	6	84735	84740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45439939
1595	NC_005810	CTT	2	6	84747	84752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45439939
1596	NC_005810	AAGT	2	8	84761	84768	50 %	25 %	25 %	0 %	45439939
1597	NC_005810	AGT	3	9	84766	84774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45439939
1598	NC_005810	ATG	2	6	84830	84835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_005810	T	7	7	84842	84848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_005810	TTG	2	6	85031	85036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_005810	ATG	2	6	85075	85080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_005810	TCA	2	6	85091	85096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_005810	TGGC	2	8	85102	85109	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1604	NC_005810	CTT	2	6	85232	85237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45439940
1605	NC_005810	AATA	2	8	85300	85307	75 %	25 %	0 %	0 %	45439940
1606	NC_005810	TGG	2	6	85332	85337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45439940
1607	NC_005810	TGC	2	6	85375	85380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45439940
1608	NC_005810	AGG	2	6	85454	85459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45439941
1609	NC_005810	ATC	2	6	85472	85477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45439941
1610	NC_005810	AAC	2	6	85488	85493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45439941
1611	NC_005810	C	6	6	85499	85504	0 %	0 %	0 %	100 %	45439941
1612	NC_005810	ACG	2	6	85505	85510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45439941
1613	NC_005810	CT	3	6	85511	85516	0 %	50 %	0 %	50 %	45439941
1614	NC_005810	CTG	2	6	85555	85560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45439941
1615	NC_005810	GCC	2	6	85572	85577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45439941
1616	NC_005810	AAC	2	6	85639	85644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45439941
1617	NC_005810	ACG	2	6	85684	85689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45439941
1618	NC_005810	CCGTAC	2	12	85861	85872	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	45439941
1619	NC_005810	GCTG	2	8	85880	85887	0 %	25 %	50 %	25 %	45439941
1620	NC_005810	CCAG	2	8	85899	85906	25 %	0 %	25 %	50 %	45439941
1621	NC_005810	GTTG	2	8	85941	85948	0 %	50 %	50 %	0 %	45439941
1622	NC_005810	CTG	2	6	85999	86004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45439941
1623	NC_005810	ATT	2	6	86046	86051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45439941
1624	NC_005810	AGCG	2	8	86073	86080	25 %	0 %	50 %	25 %	45439941
1625	NC_005810	CAT	2	6	86121	86126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45439941
1626	NC_005810	GAG	2	6	86194	86199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45439941
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