MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 chromosome

Total Repeats: 90548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_005810	GT	3	6	53809	53814	0 %	50 %	50 %	0 %	45439907
1002	NC_005810	AGCC	2	8	53850	53857	25 %	0 %	25 %	50 %	45439907
1003	NC_005810	TTC	2	6	53878	53883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45439907
1004	NC_005810	A	7	7	53906	53912	100 %	0 %	0 %	0 %	45439907
1005	NC_005810	GGCGG	2	10	53945	53954	0 %	0 %	80 %	20 %	45439907
1006	NC_005810	G	6	6	54012	54017	0 %	0 %	100 %	0 %	45439907
1007	NC_005810	CTT	2	6	54030	54035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45439907
1008	NC_005810	ATTT	2	8	54083	54090	25 %	75 %	0 %	0 %	45439907
1009	NC_005810	AT	3	6	54104	54109	50 %	50 %	0 %	0 %	45439907
1010	NC_005810	GTT	2	6	54146	54151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45439907
1011	NC_005810	GATG	2	8	54158	54165	25 %	25 %	50 %	0 %	45439907
1012	NC_005810	CCA	2	6	54167	54172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45439907
1013	NC_005810	GCAA	2	8	54173	54180	50 %	0 %	25 %	25 %	45439907
1014	NC_005810	GGGTG	2	10	54185	54194	0 %	20 %	80 %	0 %	45439907
1015	NC_005810	TCTCCG	2	12	54234	54245	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	45439907
1016	NC_005810	CAA	2	6	54292	54297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45439907
1017	NC_005810	TGT	2	6	54383	54388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45439907
1018	NC_005810	CAC	2	6	54415	54420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45439907
1019	NC_005810	AGG	2	6	54457	54462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45439907
1020	NC_005810	GGCA	2	8	54481	54488	25 %	0 %	50 %	25 %	45439907
1021	NC_005810	GGT	2	6	54590	54595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45439907
1022	NC_005810	TGA	2	6	54620	54625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45439907
1023	NC_005810	TCG	2	6	54635	54640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45439907
1024	NC_005810	G	6	6	54882	54887	0 %	0 %	100 %	0 %	45439907
1025	NC_005810	GGC	2	6	54897	54902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45439907
1026	NC_005810	GGC	2	6	54909	54914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45439907
1027	NC_005810	TTAA	2	8	54942	54949	50 %	50 %	0 %	0 %	45439907
1028	NC_005810	TTA	2	6	54966	54971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45439907
1029	NC_005810	A	6	6	55024	55029	100 %	0 %	0 %	0 %	45439907
1030	NC_005810	AGC	2	6	55054	55059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45439907
1031	NC_005810	GTTG	2	8	55072	55079	0 %	50 %	50 %	0 %	45439907
1032	NC_005810	GTT	2	6	55101	55106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45439907
1033	NC_005810	CCA	2	6	55159	55164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45439907
1034	NC_005810	T	6	6	55205	55210	0 %	100 %	0 %	0 %	45439907
1035	NC_005810	GTT	2	6	55260	55265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45439907
1036	NC_005810	TCC	2	6	55288	55293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_005810	CAGG	2	8	55335	55342	25 %	0 %	50 %	25 %	45439908
1038	NC_005810	TGA	2	6	55385	55390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45439908
1039	NC_005810	TAATGA	2	12	55394	55405	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	45439908
1040	NC_005810	GCG	2	6	55421	55426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45439908
1041	NC_005810	TTTC	2	8	55481	55488	0 %	75 %	0 %	25 %	45439908
1042	NC_005810	GTA	2	6	55526	55531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45439908
1043	NC_005810	CCA	2	6	55534	55539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45439908
1044	NC_005810	CGG	2	6	55556	55561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45439908
1045	NC_005810	AAT	2	6	55572	55577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45439908
1046	NC_005810	AAT	2	6	55614	55619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45439908
1047	NC_005810	TCA	2	6	55676	55681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45439908
1048	NC_005810	GGT	2	6	55695	55700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45439908
1049	NC_005810	CGA	2	6	55718	55723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45439908
1050	NC_005810	CCAA	2	8	55749	55756	50 %	0 %	0 %	50 %	45439908
1051	NC_005810	AAT	3	9	55818	55826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45439908
1052	NC_005810	GGC	2	6	55847	55852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45439908
1053	NC_005810	AAT	2	6	55896	55901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45439908
1054	NC_005810	GTTA	2	8	56014	56021	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_005810	CATT	2	8	56041	56048	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1056	NC_005810	ATTT	2	8	56051	56058	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_005810	A	7	7	56063	56069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_005810	TCA	2	6	56111	56116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_005810	AAT	2	6	56211	56216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_005810	AATC	2	8	56227	56234	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_005810	T	6	6	56293	56298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_005810	TCAA	2	8	56359	56366	50 %	25 %	0 %	25 %	45439909
1063	NC_005810	CAT	2	6	56451	56456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45439909
1064	NC_005810	GGC	3	9	56465	56473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45439909
1065	NC_005810	CTT	2	6	56480	56485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45439909
1066	NC_005810	TCT	2	6	56486	56491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45439909
1067	NC_005810	TGT	2	6	56498	56503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45439909
1068	NC_005810	CTT	2	6	56615	56620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45439909
1069	NC_005810	GCT	2	6	56714	56719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45439909
1070	NC_005810	TGC	2	6	56736	56741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45439909
1071	NC_005810	CAG	2	6	56834	56839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45439909
1072	NC_005810	TCA	2	6	56887	56892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45439909
1073	NC_005810	AACT	2	8	56922	56929	50 %	25 %	0 %	25 %	45439909
1074	NC_005810	TGC	2	6	57176	57181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45439909
1075	NC_005810	ATC	2	6	57184	57189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45439909
1076	NC_005810	AAAGA	2	10	57206	57215	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_005810	G	6	6	57217	57222	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_005810	CAG	2	6	57322	57327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45439910
1079	NC_005810	AGC	2	6	57332	57337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45439910
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1081	NC_005810	GTTG	2	8	57398	57405	0 %	50 %	50 %	0 %	45439910
1082	NC_005810	GAA	2	6	57444	57449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45439910
1083	NC_005810	GC	3	6	57537	57542	0 %	0 %	50 %	50 %	45439910
1084	NC_005810	TGG	2	6	57680	57685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45439910
1085	NC_005810	GTG	2	6	57706	57711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45439910
1086	NC_005810	TGC	2	6	57791	57796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45439910
1087	NC_005810	TGTC	2	8	57799	57806	0 %	50 %	25 %	25 %	45439910
1088	NC_005810	AGA	2	6	57848	57853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45439910
1089	NC_005810	TGA	2	6	57883	57888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45439910
1090	NC_005810	GAT	2	6	57902	57907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45439910
1091	NC_005810	GAA	2	6	57948	57953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45439910
1092	NC_005810	GGC	2	6	58013	58018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45439910
1093	NC_005810	TTA	2	6	58034	58039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_005810	T	7	7	58057	58063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_005810	TTA	2	6	58156	58161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_005810	GGAGA	2	10	58181	58190	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_005810	TTC	2	6	58297	58302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45439911
1098	NC_005810	GTT	2	6	58311	58316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45439911
1099	NC_005810	TGC	3	9	58356	58364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45439911
1100	NC_005810	ACA	2	6	58432	58437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45439911
1101	NC_005810	CCG	2	6	58439	58444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45439911
1102	NC_005810	CAT	2	6	58459	58464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45439911
1103	NC_005810	AAG	2	6	58496	58501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45439911
1104	NC_005810	GAT	2	6	58567	58572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45439911
1105	NC_005810	CCG	2	6	58580	58585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45439911
1106	NC_005810	TGA	2	6	58646	58651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45439911
1107	NC_005810	GCGTGG	2	12	58671	58682	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	45439911
1108	NC_005810	ATG	2	6	58751	58756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45439911
1109	NC_005810	TGG	2	6	58799	58804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45439911
1110	NC_005810	TAA	2	6	58855	58860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_005810	TC	3	6	58931	58936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_005810	CAAT	2	8	58997	59004	50 %	25 %	0 %	25 %	45439912
1113	NC_005810	GAAC	2	8	59050	59057	50 %	0 %	25 %	25 %	45439912
1114	NC_005810	CAA	2	6	59088	59093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45439912
1115	NC_005810	TCA	2	6	59113	59118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45439912
1116	NC_005810	CAG	2	6	59298	59303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45439912
1117	NC_005810	GCT	2	6	59437	59442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45439912
1118	NC_005810	GCG	2	6	59461	59466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45439912
1119	NC_005810	GTA	2	6	59476	59481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45439912
1120	NC_005810	TTTTCT	2	12	59560	59571	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	45439912
1121	NC_005810	TAA	2	6	59606	59611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_005810	GGC	2	6	59651	59656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_005810	T	6	6	59669	59674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_005810	GGTT	2	8	59692	59699	0 %	50 %	50 %	0 %	45439913
1125	NC_005810	ACC	2	6	59722	59727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45439913
1126	NC_005810	GCT	2	6	59835	59840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45439913
1127	NC_005810	GTT	2	6	60011	60016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45439913
1128	NC_005810	T	7	7	60144	60150	0 %	100 %	0 %	0 %	45439913
1129	NC_005810	CAT	2	6	60151	60156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45439913
1130	NC_005810	TC	3	6	60223	60228	0 %	50 %	0 %	50 %	161511480
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1498	NC_005810	AAATA	2	10	79062	79071	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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