MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 chromosome

Total Repeats: 90548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_005810	TCA	2	6	668021	668026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440479
13002	NC_005810	AAT	2	6	668121	668126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440479
13003	NC_005810	CGG	2	6	668234	668239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440479
13004	NC_005810	CTCG	2	8	668283	668290	0 %	25 %	25 %	50 %	45440479
13005	NC_005810	GTG	2	6	668312	668317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440479
13006	NC_005810	CAG	2	6	668337	668342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440479
13007	NC_005810	TGG	2	6	668348	668353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440479
13008	NC_005810	GCG	2	6	668433	668438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440479
13009	NC_005810	TCA	2	6	668489	668494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440479
13010	NC_005810	TCT	2	6	668496	668501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440480
13011	NC_005810	GAA	2	6	668516	668521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440480
13012	NC_005810	GGC	2	6	668534	668539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440480
13013	NC_005810	GC	3	6	668550	668555	0 %	0 %	50 %	50 %	45440480
13014	NC_005810	CGT	2	6	668562	668567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440480
13015	NC_005810	CTG	2	6	668570	668575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440480
13016	NC_005810	GCG	2	6	668580	668585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440480
13017	NC_005810	TAA	2	6	668609	668614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440480
13018	NC_005810	GCCT	2	8	668632	668639	0 %	25 %	25 %	50 %	45440480
13019	NC_005810	GCA	2	6	668656	668661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440480
13020	NC_005810	TGTAGC	2	12	668713	668724	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	45440480
13021	NC_005810	CG	3	6	668759	668764	0 %	0 %	50 %	50 %	45440480
13022	NC_005810	CGG	2	6	668793	668798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440480
13023	NC_005810	GGCT	2	8	668910	668917	0 %	25 %	50 %	25 %	45440480
13024	NC_005810	TCA	2	6	668950	668955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440480
13025	NC_005810	CGCA	2	8	669063	669070	25 %	0 %	25 %	50 %	45440481
13026	NC_005810	GCG	2	6	669076	669081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440481
13027	NC_005810	GTGG	2	8	669083	669090	0 %	25 %	75 %	0 %	45440481
13028	NC_005810	CAG	2	6	669098	669103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440481
13029	NC_005810	CT	3	6	669108	669113	0 %	50 %	0 %	50 %	45440481
13030	NC_005810	TGT	2	6	669165	669170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440481
13031	NC_005810	TGT	2	6	669174	669179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440481
13032	NC_005810	CCA	2	6	669227	669232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440481
13033	NC_005810	GTAG	2	8	669244	669251	25 %	25 %	50 %	0 %	45440481
13034	NC_005810	ATGA	2	8	669302	669309	50 %	25 %	25 %	0 %	45440481
13035	NC_005810	TGG	2	6	669388	669393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440481
13036	NC_005810	GGC	2	6	669490	669495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440481
13037	NC_005810	AGCC	2	8	669501	669508	25 %	0 %	25 %	50 %	45440481
13038	NC_005810	TGT	2	6	669576	669581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440481
13039	NC_005810	GGT	2	6	669675	669680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440481
13040	NC_005810	CAT	2	6	669714	669719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440482
13041	NC_005810	CAC	2	6	669720	669725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440482
13042	NC_005810	GAAAA	2	10	669758	669767	80 %	0 %	20 %	0 %	45440482
13043	NC_005810	GCTG	2	8	669827	669834	0 %	25 %	50 %	25 %	45440482
13044	NC_005810	TGA	2	6	669839	669844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440482
13045	NC_005810	C	6	6	669888	669893	0 %	0 %	0 %	100 %	45440482
13046	NC_005810	CGT	2	6	669951	669956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13047	NC_005810	TAA	2	6	669969	669974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_005810	TATT	2	8	669982	669989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_005810	TATT	2	8	669999	670006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_005810	AACGT	2	10	670007	670016	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13051	NC_005810	TTA	2	6	670019	670024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45440483
13052	NC_005810	TGC	3	9	670048	670056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440483
13053	NC_005810	ATCAA	2	10	670119	670128	60 %	20 %	0 %	20 %	45440483
13054	NC_005810	TGT	2	6	670137	670142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440483
13055	NC_005810	GTG	2	6	670205	670210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440483
13056	NC_005810	GAA	2	6	670228	670233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440483
13057	NC_005810	CGC	2	6	670264	670269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440483
13058	NC_005810	GCC	2	6	670288	670293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440483
13059	NC_005810	GAT	2	6	670319	670324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440483
13060	NC_005810	AAC	2	6	670422	670427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45440483
13061	NC_005810	GTA	2	6	670466	670471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_005810	C	6	6	670495	670500	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13063	NC_005810	CAG	2	6	670551	670556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13064	NC_005810	CCTA	2	8	670587	670594	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13065	NC_005810	CTT	3	9	670707	670715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440484
13066	NC_005810	CGG	2	6	670769	670774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440484
13067	NC_005810	TCA	2	6	670874	670879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440484
13068	NC_005810	TAA	2	6	670898	670903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440484
13069	NC_005810	GCTGTA	2	12	670912	670923	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	45440484
13070	NC_005810	TGT	2	6	670950	670955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440484
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13072	NC_005810	GCG	2	6	671004	671009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440484
13073	NC_005810	T	6	6	671050	671055	0 %	100 %	0 %	0 %	45440484
13074	NC_005810	GGC	2	6	671136	671141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440484
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13078	NC_005810	ATC	2	6	671383	671388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440484
13079	NC_005810	T	6	6	671485	671490	0 %	100 %	0 %	0 %	45440484
13080	NC_005810	ATT	2	6	671590	671595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45440484
13081	NC_005810	TTG	2	6	671611	671616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440484
13082	NC_005810	CTC	3	9	671620	671628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45440484
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13085	NC_005810	CGT	2	6	671994	671999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440484
13086	NC_005810	TTA	2	6	672077	672082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45440484
13087	NC_005810	TCA	2	6	672113	672118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440484
13088	NC_005810	TGG	2	6	672129	672134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440484
13089	NC_005810	CCA	2	6	672137	672142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440484
13090	NC_005810	TGGC	2	8	672149	672156	0 %	25 %	50 %	25 %	45440484
13091	NC_005810	GGC	2	6	672209	672214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440484
13092	NC_005810	ATCA	2	8	672265	672272	50 %	25 %	0 %	25 %	45440484
13093	NC_005810	GAA	2	6	672292	672297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440484
13094	NC_005810	CGC	2	6	672330	672335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440484
13095	NC_005810	CAC	2	6	672349	672354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440484
13096	NC_005810	CAA	2	6	672393	672398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45440484
13097	NC_005810	TTG	2	6	672443	672448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440484
13098	NC_005810	CAG	2	6	672460	672465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440484
13099	NC_005810	TTGCT	2	10	672473	672482	0 %	60 %	20 %	20 %	45440484
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13101	NC_005810	TGC	2	6	672718	672723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440484
13102	NC_005810	GC	3	6	672722	672727	0 %	0 %	50 %	50 %	45440484
13103	NC_005810	TCA	2	6	672752	672757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440484
13104	NC_005810	ACT	2	6	672788	672793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440484
13105	NC_005810	CCG	2	6	672819	672824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13106	NC_005810	GCA	2	6	672850	672855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13107	NC_005810	ACT	2	6	672896	672901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13108	NC_005810	TA	3	6	672932	672937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_005810	TTG	2	6	672977	672982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_005810	T	6	6	673185	673190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_005810	TCACC	2	10	673212	673221	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
13112	NC_005810	CCG	2	6	673252	673257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440485
13113	NC_005810	TCC	2	6	673266	673271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45440485
13114	NC_005810	GC	3	6	673314	673319	0 %	0 %	50 %	50 %	45440485
13115	NC_005810	CCA	2	6	673333	673338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440485
13116	NC_005810	TGAC	2	8	673350	673357	25 %	25 %	25 %	25 %	45440485
13117	NC_005810	AGC	3	9	673455	673463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440485
13118	NC_005810	GCA	3	9	673474	673482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440485
13119	NC_005810	GCGATA	2	12	673491	673502	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	45440485
13120	NC_005810	TTC	2	6	673902	673907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440485
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13122	NC_005810	GGGT	2	8	674050	674057	0 %	25 %	75 %	0 %	45440486
13123	NC_005810	GTT	2	6	674183	674188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440486
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13248	NC_005810	ATT	2	6	680833	680838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13249	NC_005810	TAA	2	6	680911	680916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13250	NC_005810	TTCT	2	8	680917	680924	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13251	NC_005810	AAC	2	6	681024	681029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45440491
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13265	NC_005810	CGTT	2	8	681514	681521	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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13268	NC_005810	T	6	6	681577	681582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13269	NC_005810	TTAC	2	8	681620	681627	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13270	NC_005810	CGTT	2	8	681662	681669	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13271	NC_005810	TGC	2	6	681670	681675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13275	NC_005810	CGTT	2	8	681811	681818	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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13339	NC_005810	TGT	2	6	686063	686068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13363	NC_005810	CTTG	2	8	687331	687338	0 %	50 %	25 %	25 %	45440495
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13368	NC_005810	TC	4	8	687669	687676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13369	NC_005810	ACG	2	6	687687	687692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13370	NC_005810	GTT	2	6	687715	687720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13372	NC_005810	ATG	2	6	687805	687810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13497	NC_005810	CTGA	2	8	695158	695165	25 %	25 %	25 %	25 %	45440500
13498	NC_005810	TCA	2	6	695183	695188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440500
13499	NC_005810	ATG	2	6	695189	695194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440500
13500	NC_005810	G	6	6	695202	695207	0 %	0 %	100 %	0 %	45440500

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