MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 chromosome

Total Repeats: 90548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_005810	CTT	2	6	642759	642764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440455
12502	NC_005810	ATG	2	6	642782	642787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440455
12503	NC_005810	AC	3	6	642798	642803	50 %	0 %	0 %	50 %	45440455
12504	NC_005810	ATGCG	2	10	642899	642908	20 %	20 %	40 %	20 %	45440455
12505	NC_005810	AC	3	6	642986	642991	50 %	0 %	0 %	50 %	45440455
12506	NC_005810	CTG	2	6	642998	643003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440455
12507	NC_005810	AGC	2	6	643034	643039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440455
12508	NC_005810	CAA	2	6	643092	643097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45440455
12509	NC_005810	TAT	2	6	643098	643103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45440455
12510	NC_005810	GGT	2	6	643128	643133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440455
12511	NC_005810	GAC	2	6	643185	643190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440455
12512	NC_005810	CCG	2	6	643259	643264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440455
12513	NC_005810	TTGAA	2	10	643292	643301	40 %	40 %	20 %	0 %	45440455
12514	NC_005810	TTA	2	6	643349	643354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45440455
12515	NC_005810	GTG	2	6	643372	643377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440455
12516	NC_005810	TGG	2	6	643403	643408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440455
12517	NC_005810	GTTGT	2	10	643474	643483	0 %	60 %	40 %	0 %	45440455
12518	NC_005810	TCAA	2	8	643519	643526	50 %	25 %	0 %	25 %	45440455
12519	NC_005810	TTG	2	6	643564	643569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440455
12520	NC_005810	CGA	2	6	643572	643577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440455
12521	NC_005810	GTG	2	6	643588	643593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440455
12522	NC_005810	TGAG	2	8	643658	643665	25 %	25 %	50 %	0 %	45440455
12523	NC_005810	CTT	2	6	643725	643730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440455
12524	NC_005810	TGG	2	6	643731	643736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440455
12525	NC_005810	CGG	2	6	643884	643889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440455
12526	NC_005810	TG	4	8	644000	644007	0 %	50 %	50 %	0 %	45440455
12527	NC_005810	ACCG	2	8	644037	644044	25 %	0 %	25 %	50 %	45440455
12528	NC_005810	CAG	2	6	644081	644086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440455
12529	NC_005810	CCGG	2	8	644253	644260	0 %	0 %	50 %	50 %	45440455
12530	NC_005810	CG	3	6	644293	644298	0 %	0 %	50 %	50 %	45440455
12531	NC_005810	CTG	2	6	644428	644433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440455
12532	NC_005810	CAA	2	6	644506	644511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45440455
12533	NC_005810	CGATAA	2	12	644535	644546	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	45440455
12534	NC_005810	GCC	2	6	644596	644601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440455
12535	NC_005810	A	6	6	644647	644652	100 %	0 %	0 %	0 %	45440455
12536	NC_005810	GGA	2	6	644691	644696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45440455
12537	NC_005810	GCA	2	6	644843	644848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440455
12538	NC_005810	GGC	2	6	644883	644888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440455
12539	NC_005810	TGG	2	6	644984	644989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440455
12540	NC_005810	GGC	2	6	645003	645008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440455
12541	NC_005810	ATG	2	6	645043	645048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440455
12542	NC_005810	GTT	2	6	645129	645134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440455
12543	NC_005810	GAC	2	6	645135	645140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440455
12544	NC_005810	TTG	2	6	645173	645178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440455
12545	NC_005810	TGG	3	9	645215	645223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440455
12546	NC_005810	TGA	2	6	645263	645268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440455
12547	NC_005810	CCGGTG	2	12	645314	645325	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	45440455
12548	NC_005810	ATT	2	6	645355	645360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45440455
12549	NC_005810	GGC	2	6	645361	645366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440455
12550	NC_005810	T	6	6	645394	645399	0 %	100 %	0 %	0 %	45440455
12551	NC_005810	T	6	6	645409	645414	0 %	100 %	0 %	0 %	45440455
12552	NC_005810	TCG	2	6	645423	645428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440455
12553	NC_005810	A	6	6	645447	645452	100 %	0 %	0 %	0 %	45440455
12554	NC_005810	GCT	2	6	645514	645519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440456
12555	NC_005810	TC	3	6	645533	645538	0 %	50 %	0 %	50 %	45440456
12556	NC_005810	AGC	2	6	645602	645607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440456
12557	NC_005810	GGC	2	6	645610	645615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440456
12558	NC_005810	AG	3	6	645679	645684	50 %	0 %	50 %	0 %	45440456
12559	NC_005810	GCC	2	6	645752	645757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440456
12560	NC_005810	CAA	3	9	645826	645834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45440456
12561	NC_005810	ATTT	2	8	645891	645898	25 %	75 %	0 %	0 %	45440456
12562	NC_005810	A	7	7	645902	645908	100 %	0 %	0 %	0 %	45440456
12563	NC_005810	AGA	2	6	645949	645954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440456
12564	NC_005810	GCG	2	6	645956	645961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440456
12565	NC_005810	ACC	2	6	645965	645970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440456
12566	NC_005810	GGC	2	6	646015	646020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440456
12567	NC_005810	ATT	2	6	646033	646038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45440456
12568	NC_005810	GCG	2	6	646130	646135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440456
12569	NC_005810	ATCA	2	8	646149	646156	50 %	25 %	0 %	25 %	45440456
12570	NC_005810	TGG	2	6	646221	646226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440456
12571	NC_005810	GCA	2	6	646238	646243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440456
12572	NC_005810	TCA	2	6	646281	646286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440456
12573	NC_005810	TGT	2	6	646317	646322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440456
12574	NC_005810	GCCAAT	2	12	646367	646378	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	45440456
12575	NC_005810	TTC	2	6	646400	646405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440456
12576	NC_005810	CAG	2	6	646438	646443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440456
12577	NC_005810	AAC	2	6	646656	646661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45440456
12578	NC_005810	GCA	2	6	646664	646669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440456
12579	NC_005810	GGC	3	9	646684	646692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440456
12580	NC_005810	ATAC	2	8	646740	646747	50 %	25 %	0 %	25 %	45440456
12581	NC_005810	GGT	2	6	646853	646858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440456
12582	NC_005810	T	6	6	646889	646894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12583	NC_005810	TAA	2	6	646959	646964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12584	NC_005810	TTA	2	6	647001	647006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12585	NC_005810	AAGGC	2	10	647013	647022	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12586	NC_005810	GAT	2	6	647173	647178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440457
12587	NC_005810	GATCA	2	10	647200	647209	40 %	20 %	20 %	20 %	45440457
12588	NC_005810	TCT	2	6	647273	647278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440457
12589	NC_005810	GCA	2	6	647314	647319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440457
12590	NC_005810	TCT	2	6	647345	647350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440457
12591	NC_005810	GAGC	2	8	647351	647358	25 %	0 %	50 %	25 %	45440457
12592	NC_005810	AACTTC	2	12	647407	647418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440457
12593	NC_005810	TGA	2	6	647423	647428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440457
12594	NC_005810	CGG	2	6	647592	647597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440457
12595	NC_005810	TTCA	2	8	647665	647672	25 %	50 %	0 %	25 %	45440457
12596	NC_005810	CAC	2	6	647710	647715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440457
12597	NC_005810	GCT	2	6	647725	647730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440457
12598	NC_005810	ATAA	2	8	647806	647813	75 %	25 %	0 %	0 %	45440457
12599	NC_005810	CTG	2	6	647822	647827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440457
12600	NC_005810	GCC	2	6	647831	647836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440457
12601	NC_005810	TCC	2	6	647908	647913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45440457
12602	NC_005810	GAT	2	6	647930	647935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440458
12603	NC_005810	TCCA	2	8	647983	647990	25 %	25 %	0 %	50 %	45440458
12604	NC_005810	GGC	2	6	648000	648005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440458
12605	NC_005810	GGCTG	2	10	648075	648084	0 %	20 %	60 %	20 %	45440458
12606	NC_005810	GCA	2	6	648121	648126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440458
12607	NC_005810	AAT	2	6	648127	648132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440458
12608	NC_005810	TCG	2	6	648161	648166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440458
12609	NC_005810	TCAA	2	8	648259	648266	50 %	25 %	0 %	25 %	45440458
12610	NC_005810	CGT	2	6	648269	648274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440458
12611	NC_005810	TTG	2	6	648303	648308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440458
12612	NC_005810	AGCA	2	8	648332	648339	50 %	0 %	25 %	25 %	45440458
12613	NC_005810	GAA	2	6	648373	648378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440458
12614	NC_005810	ATA	2	6	648400	648405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440458
12615	NC_005810	ACC	2	6	648496	648501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440458
12616	NC_005810	TGG	2	6	648548	648553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440458
12617	NC_005810	CAG	2	6	648599	648604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440458
12618	NC_005810	TTTACG	2	12	648732	648743	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	45440458
12619	NC_005810	CTT	2	6	648764	648769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440458
12620	NC_005810	GGCG	2	8	648806	648813	0 %	0 %	75 %	25 %	45440458
12621	NC_005810	ATC	2	6	648819	648824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440458
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12624	NC_005810	GAT	2	6	648977	648982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12626	NC_005810	TCT	2	6	649068	649073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440459
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12652	NC_005810	A	7	7	650871	650877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12653	NC_005810	AG	3	6	650879	650884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12654	NC_005810	GAC	3	9	650887	650895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12870	NC_005810	GGT	2	6	661630	661635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440471
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12872	NC_005810	GTC	2	6	661890	661895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440471
12873	NC_005810	G	7	7	661911	661917	0 %	0 %	100 %	0 %	45440471
12874	NC_005810	GT	3	6	661989	661994	0 %	50 %	50 %	0 %	45440471
12875	NC_005810	A	6	6	661999	662004	100 %	0 %	0 %	0 %	45440471
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12888	NC_005810	TCG	2	6	662966	662971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440473
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12898	NC_005810	CTCG	2	8	663252	663259	0 %	25 %	25 %	50 %	45440473
12899	NC_005810	AGC	2	6	663268	663273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440473
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12902	NC_005810	GAT	2	6	663357	663362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440473
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12912	NC_005810	GTAA	2	8	663961	663968	50 %	25 %	25 %	0 %	45440474
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12924	NC_005810	TGG	2	6	664634	664639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440474
12925	NC_005810	TGTTT	2	10	664651	664660	0 %	80 %	20 %	0 %	45440474
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12930	NC_005810	GGCT	2	8	664840	664847	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12931	NC_005810	TTC	2	6	664911	664916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440475
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12934	NC_005810	CAG	2	6	665013	665018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440475
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12957	NC_005810	CATC	2	8	665921	665928	25 %	25 %	0 %	50 %	45440477
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12960	NC_005810	TGT	2	6	665986	665991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440477
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12962	NC_005810	GGGCA	2	10	666042	666051	20 %	0 %	60 %	20 %	45440477
12963	NC_005810	CAT	2	6	666096	666101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440477
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12967	NC_005810	GATCT	2	10	666333	666342	20 %	40 %	20 %	20 %	45440477
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12974	NC_005810	GAT	3	9	666734	666742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440478
12975	NC_005810	GAT	2	6	666752	666757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440478
12976	NC_005810	GAA	2	6	666764	666769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440478
12977	NC_005810	GA	3	6	666882	666887	50 %	0 %	50 %	0 %	45440478
12978	NC_005810	CAC	2	6	667023	667028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440478
12979	NC_005810	ATCG	2	8	667132	667139	25 %	25 %	25 %	25 %	45440478
12980	NC_005810	TTC	2	6	667150	667155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440478
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12982	NC_005810	CAG	2	6	667249	667254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440478
12983	NC_005810	TCA	2	6	667262	667267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440478
12984	NC_005810	TTG	2	6	667279	667284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440478
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12987	NC_005810	G	6	6	667437	667442	0 %	0 %	100 %	0 %	45440478
12988	NC_005810	GCG	2	6	667446	667451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440478
12989	NC_005810	GGT	2	6	667615	667620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440478
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12992	NC_005810	TCA	2	6	667719	667724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440478
12993	NC_005810	CTG	2	6	667747	667752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440478
12994	NC_005810	ATCG	2	8	667768	667775	25 %	25 %	25 %	25 %	45440478
12995	NC_005810	CGC	2	6	667796	667801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440478
12996	NC_005810	GCG	2	6	667823	667828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440478
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