MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 chromosome

Total Repeats: 90548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_005810	GGC	2	6	592320	592325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440408
11502	NC_005810	CT	3	6	592378	592383	0 %	50 %	0 %	50 %	45440408
11503	NC_005810	CTGG	2	8	592431	592438	0 %	25 %	50 %	25 %	45440408
11504	NC_005810	TTGA	2	8	592504	592511	25 %	50 %	25 %	0 %	45440408
11505	NC_005810	CGT	2	6	592533	592538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440408
11506	NC_005810	AGA	2	6	592593	592598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440408
11507	NC_005810	GTG	2	6	592651	592656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440408
11508	NC_005810	TCA	2	6	592732	592737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440408
11509	NC_005810	TGG	2	6	592751	592756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440408
11510	NC_005810	CGG	2	6	592811	592816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440408
11511	NC_005810	TCTT	2	8	592897	592904	0 %	75 %	0 %	25 %	45440408
11512	NC_005810	TGC	2	6	592942	592947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440409
11513	NC_005810	CTG	2	6	592974	592979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440409
11514	NC_005810	CTG	2	6	592985	592990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440409
11515	NC_005810	CAC	2	6	593040	593045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440409
11516	NC_005810	ATA	2	6	593104	593109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440409
11517	NC_005810	GAT	2	6	593175	593180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440409
11518	NC_005810	CAT	2	6	593183	593188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440409
11519	NC_005810	GTC	2	6	593203	593208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440409
11520	NC_005810	GCTT	2	8	593236	593243	0 %	50 %	25 %	25 %	45440409
11521	NC_005810	ATCA	2	8	593250	593257	50 %	25 %	0 %	25 %	45440409
11522	NC_005810	CATT	2	8	593264	593271	25 %	50 %	0 %	25 %	45440409
11523	NC_005810	TGG	2	6	593363	593368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440409
11524	NC_005810	GGC	2	6	593410	593415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440409
11525	NC_005810	GTTG	2	8	593420	593427	0 %	50 %	50 %	0 %	45440409
11526	NC_005810	T	6	6	593491	593496	0 %	100 %	0 %	0 %	45440409
11527	NC_005810	AAT	2	6	593575	593580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440409
11528	NC_005810	TAG	2	6	593608	593613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_005810	TAAT	2	8	593616	593623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_005810	TAA	2	6	593627	593632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_005810	TTA	2	6	593633	593638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_005810	TGT	2	6	593650	593655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_005810	TGC	2	6	593669	593674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11534	NC_005810	GGA	2	6	593720	593725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_005810	TGATG	2	10	593811	593820	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_005810	GGA	2	6	593821	593826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_005810	ATGT	2	8	593875	593882	25 %	50 %	25 %	0 %	45440410
11538	NC_005810	CTG	2	6	594037	594042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440410
11539	NC_005810	GCA	2	6	594053	594058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11540	NC_005810	TCA	2	6	594143	594148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11541	NC_005810	GCG	2	6	594149	594154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11542	NC_005810	GTG	2	6	594176	594181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440411
11543	NC_005810	GCTG	2	8	594199	594206	0 %	25 %	50 %	25 %	45440411
11544	NC_005810	ATCT	2	8	594234	594241	25 %	50 %	0 %	25 %	45440411
11545	NC_005810	CGA	2	6	594257	594262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440411
11546	NC_005810	GCA	2	6	594317	594322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440411
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11550	NC_005810	CAA	2	6	594449	594454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45440411
11551	NC_005810	CAA	2	6	594527	594532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45440411
11552	NC_005810	CTG	2	6	594652	594657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440411
11553	NC_005810	CAC	2	6	594717	594722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440411
11554	NC_005810	TG	3	6	594766	594771	0 %	50 %	50 %	0 %	45440411
11555	NC_005810	GGA	2	6	594843	594848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45440411
11556	NC_005810	TCAA	2	8	594883	594890	50 %	25 %	0 %	25 %	45440411
11557	NC_005810	CTTG	2	8	594899	594906	0 %	50 %	25 %	25 %	45440411
11558	NC_005810	ATC	2	6	594951	594956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440411
11559	NC_005810	AAGAT	2	10	595003	595012	60 %	20 %	20 %	0 %	45440411
11560	NC_005810	GAA	2	6	595026	595031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440411
11561	NC_005810	AATA	2	8	595146	595153	75 %	25 %	0 %	0 %	45440411
11562	NC_005810	ACC	2	6	595269	595274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440411
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11565	NC_005810	GCC	2	6	595408	595413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440411
11566	NC_005810	GAA	2	6	595434	595439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440411
11567	NC_005810	A	7	7	595456	595462	100 %	0 %	0 %	0 %	45440411
11568	NC_005810	CGA	2	6	595506	595511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11569	NC_005810	AAGG	2	8	595528	595535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_005810	CA	3	6	595538	595543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11571	NC_005810	AGC	3	9	595718	595726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11572	NC_005810	AGC	3	9	595737	595745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11573	NC_005810	GGC	2	6	595775	595780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440412
11574	NC_005810	TGG	2	6	595841	595846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440412
11575	NC_005810	TTG	2	6	595927	595932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440412
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11580	NC_005810	ACA	2	6	596105	596110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45440412
11581	NC_005810	ACC	2	6	596114	596119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440412
11582	NC_005810	ACC	2	6	596176	596181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440412
11583	NC_005810	CTG	2	6	596190	596195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440412
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11585	NC_005810	GAA	2	6	596260	596265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440412
11586	NC_005810	TA	3	6	596287	596292	50 %	50 %	0 %	0 %	45440412
11587	NC_005810	GGAGA	2	10	596319	596328	40 %	0 %	60 %	0 %	45440412
11588	NC_005810	CGC	2	6	596365	596370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440412
11589	NC_005810	CGG	2	6	596379	596384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440412
11590	NC_005810	TAT	2	6	596385	596390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45440412
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11592	NC_005810	CA	3	6	596511	596516	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11593	NC_005810	ACT	2	6	596542	596547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11594	NC_005810	ATT	2	6	596598	596603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_005810	CTC	2	6	596621	596626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11596	NC_005810	TG	3	6	596704	596709	0 %	50 %	50 %	0 %	45440413
11597	NC_005810	GCC	2	6	596738	596743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440413
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11599	NC_005810	TGA	2	6	596821	596826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440413
11600	NC_005810	GC	3	6	596884	596889	0 %	0 %	50 %	50 %	45440413
11601	NC_005810	TTA	2	6	596896	596901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45440413
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11603	NC_005810	ATTG	2	8	596989	596996	25 %	50 %	25 %	0 %	45440413
11604	NC_005810	TGA	2	6	597340	597345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440413
11605	NC_005810	CCG	2	6	597361	597366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440413
11606	NC_005810	CCA	2	6	597375	597380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440413
11607	NC_005810	GGT	2	6	597394	597399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440413
11608	NC_005810	AG	3	6	597427	597432	50 %	0 %	50 %	0 %	45440413
11609	NC_005810	G	6	6	597490	597495	0 %	0 %	100 %	0 %	45440413
11610	NC_005810	ACC	2	6	597575	597580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440413
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11614	NC_005810	CTATT	2	10	597910	597919	20 %	60 %	0 %	20 %	45440413
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11616	NC_005810	TTC	2	6	598082	598087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440413
11617	NC_005810	CT	3	6	598186	598191	0 %	50 %	0 %	50 %	45440413
11618	NC_005810	TGG	2	6	598220	598225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440413
11619	NC_005810	G	6	6	598224	598229	0 %	0 %	100 %	0 %	45440413
11620	NC_005810	TCG	2	6	598236	598241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440413
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11622	NC_005810	G	7	7	598476	598482	0 %	0 %	100 %	0 %	45440414
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11624	NC_005810	GCC	2	6	598525	598530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440414
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11993	NC_005810	ACT	2	6	618687	618692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440433
11994	NC_005810	TGTT	2	8	618732	618739	0 %	75 %	25 %	0 %	45440433
11995	NC_005810	T	6	6	618756	618761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11996	NC_005810	TTAA	2	8	618873	618880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11997	NC_005810	TAA	2	6	618903	618908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161511441
11998	NC_005810	TGA	2	6	619014	619019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161511441
11999	NC_005810	ACA	2	6	619023	619028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161511441
12000	NC_005810	GTT	2	6	619060	619065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161511441

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