MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 chromosome

Total Repeats: 90548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_005810	CCAT	2	8	566602	566609	25 %	25 %	0 %	50 %	45440381
11002	NC_005810	AGA	2	6	566634	566639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440381
11003	NC_005810	TTGA	2	8	566704	566711	25 %	50 %	25 %	0 %	45440381
11004	NC_005810	GTTG	2	8	566756	566763	0 %	50 %	50 %	0 %	45440381
11005	NC_005810	AGCTC	2	10	566769	566778	20 %	20 %	20 %	40 %	45440381
11006	NC_005810	AGA	2	6	566787	566792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440381
11007	NC_005810	GGGC	2	8	566917	566924	0 %	0 %	75 %	25 %	45440381
11008	NC_005810	CAA	2	6	566956	566961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45440381
11009	NC_005810	GCA	2	6	567003	567008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440381
11010	NC_005810	TCC	2	6	567144	567149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45440381
11011	NC_005810	ATGA	2	8	567203	567210	50 %	25 %	25 %	0 %	45440381
11012	NC_005810	TAT	2	6	567244	567249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45440382
11013	NC_005810	CT	3	6	567278	567283	0 %	50 %	0 %	50 %	45440382
11014	NC_005810	TTGA	2	8	567407	567414	25 %	50 %	25 %	0 %	45440382
11015	NC_005810	GAAA	2	8	567469	567476	75 %	0 %	25 %	0 %	45440382
11016	NC_005810	CTG	2	6	567489	567494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440382
11017	NC_005810	GCT	2	6	567508	567513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440382
11018	NC_005810	G	7	7	567517	567523	0 %	0 %	100 %	0 %	45440382
11019	NC_005810	TGT	2	6	567528	567533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440382
11020	NC_005810	CAG	2	6	567605	567610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440382
11021	NC_005810	GATC	2	8	567655	567662	25 %	25 %	25 %	25 %	45440382
11022	NC_005810	CGG	2	6	567669	567674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440382
11023	NC_005810	T	8	8	567723	567730	0 %	100 %	0 %	0 %	45440382
11024	NC_005810	ACCTT	2	10	567776	567785	20 %	40 %	0 %	40 %	45440382
11025	NC_005810	TCA	2	6	567856	567861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440382
11026	NC_005810	TGCC	2	8	567930	567937	0 %	25 %	25 %	50 %	45440382
11027	NC_005810	TG	3	6	567944	567949	0 %	50 %	50 %	0 %	45440382
11028	NC_005810	TCTG	2	8	567973	567980	0 %	50 %	25 %	25 %	45440382
11029	NC_005810	GATT	2	8	567985	567992	25 %	50 %	25 %	0 %	45440382
11030	NC_005810	AGTTC	2	10	568070	568079	20 %	40 %	20 %	20 %	45440382
11031	NC_005810	GTT	2	6	568130	568135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440382
11032	NC_005810	T	7	7	568187	568193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_005810	ACA	2	6	568233	568238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11034	NC_005810	CGT	2	6	568305	568310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440383
11035	NC_005810	TATT	2	8	568328	568335	25 %	75 %	0 %	0 %	45440383
11036	NC_005810	A	6	6	568397	568402	100 %	0 %	0 %	0 %	45440383
11037	NC_005810	TGT	2	6	568442	568447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440383
11038	NC_005810	AAT	2	6	568497	568502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440383
11039	NC_005810	GTA	2	6	568510	568515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440383
11040	NC_005810	GCA	2	6	568538	568543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440383
11041	NC_005810	TGA	2	6	568550	568555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440383
11042	NC_005810	ATG	2	6	568585	568590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_005810	GTTT	2	8	568662	568669	0 %	75 %	25 %	0 %	45440384
11044	NC_005810	ATTT	2	8	568709	568716	25 %	75 %	0 %	0 %	45440384
11045	NC_005810	TCT	2	6	568766	568771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440384
11046	NC_005810	CAC	2	6	568815	568820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440384
11047	NC_005810	TTG	2	6	568833	568838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440384
11048	NC_005810	GAA	2	6	568853	568858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440384
11049	NC_005810	GTC	2	6	568892	568897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440384
11050	NC_005810	TGAT	2	8	568962	568969	25 %	50 %	25 %	0 %	45440384
11051	NC_005810	CCG	2	6	569152	569157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440384
11052	NC_005810	AGC	2	6	569211	569216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440384
11053	NC_005810	GCG	2	6	569227	569232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440384
11054	NC_005810	ATT	2	6	569344	569349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45440384
11055	NC_005810	TGC	2	6	569455	569460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440384
11056	NC_005810	ATT	2	6	569510	569515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45440384
11057	NC_005810	TTA	2	6	569600	569605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45440384
11058	NC_005810	TTG	2	6	569624	569629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440384
11059	NC_005810	ATCG	2	8	569648	569655	25 %	25 %	25 %	25 %	45440384
11060	NC_005810	CCT	2	6	569780	569785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45440384
11061	NC_005810	CAGG	2	8	569786	569793	25 %	0 %	50 %	25 %	45440384
11062	NC_005810	TGG	2	6	569868	569873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440384
11063	NC_005810	CGT	2	6	569897	569902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440384
11064	NC_005810	TAAT	2	8	569944	569951	50 %	50 %	0 %	0 %	45440384
11065	NC_005810	AAT	2	6	569983	569988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_005810	GGC	2	6	570003	570008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11067	NC_005810	TCTT	2	8	570106	570113	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11068	NC_005810	CTT	2	6	570131	570136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11069	NC_005810	GAA	2	6	570156	570161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11070	NC_005810	AGA	2	6	570172	570177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_005810	TAA	2	6	570211	570216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440385
11072	NC_005810	AGC	2	6	570242	570247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440385
11073	NC_005810	AAT	3	9	570248	570256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440385
11074	NC_005810	GGC	2	6	570257	570262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440385
11075	NC_005810	ATA	3	9	570276	570284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440385
11076	NC_005810	GGT	2	6	570287	570292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440385
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11081	NC_005810	TGT	2	6	570436	570441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440385
11082	NC_005810	TGT	2	6	570445	570450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440385
11083	NC_005810	AAG	2	6	570486	570491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440385
11084	NC_005810	GTG	2	6	570498	570503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440385
11085	NC_005810	GCCTG	2	10	570541	570550	0 %	20 %	40 %	40 %	45440385
11086	NC_005810	CGTG	2	8	570601	570608	0 %	25 %	50 %	25 %	45440385
11087	NC_005810	ACAG	2	8	570746	570753	50 %	0 %	25 %	25 %	45440385
11088	NC_005810	GTG	2	6	570762	570767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440385
11089	NC_005810	GAA	2	6	570845	570850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440385
11090	NC_005810	GCT	2	6	570902	570907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440385
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11092	NC_005810	TGA	2	6	570937	570942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440385
11093	NC_005810	TGC	2	6	570949	570954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440385
11094	NC_005810	AAC	2	6	570966	570971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45440385
11095	NC_005810	AGA	2	6	571045	571050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440385
11096	NC_005810	TGC	2	6	571116	571121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440385
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11098	NC_005810	TGC	2	6	571257	571262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440385
11099	NC_005810	TGC	2	6	571273	571278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440385
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11102	NC_005810	CAG	2	6	571333	571338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440385
11103	NC_005810	CAA	2	6	571340	571345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45440385
11104	NC_005810	GA	3	6	571441	571446	50 %	0 %	50 %	0 %	45440385
11105	NC_005810	T	6	6	571465	571470	0 %	100 %	0 %	0 %	45440386
11106	NC_005810	TCG	2	6	571476	571481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440386
11107	NC_005810	CTTCG	2	10	571501	571510	0 %	40 %	20 %	40 %	45440386
11108	NC_005810	AGA	2	6	571522	571527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440386
11109	NC_005810	TGC	2	6	571545	571550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440386
11110	NC_005810	GTGATA	2	12	571569	571580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440386
11111	NC_005810	GAA	2	6	571702	571707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440386
11112	NC_005810	TTG	2	6	571716	571721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440386
11113	NC_005810	GGT	3	9	571775	571783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440386
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11116	NC_005810	CTG	2	6	571977	571982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440386
11117	NC_005810	GGC	2	6	572041	572046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440386
11118	NC_005810	CTG	2	6	572094	572099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440386
11119	NC_005810	CGT	2	6	572153	572158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440386
11120	NC_005810	TGCG	2	8	572193	572200	0 %	25 %	50 %	25 %	45440386
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11122	NC_005810	TGCG	2	8	572346	572353	0 %	25 %	50 %	25 %	45440386
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11245	NC_005810	T	6	6	578968	578973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11246	NC_005810	TCTG	2	8	579138	579145	0 %	50 %	25 %	25 %	161511444
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11492	NC_005810	G	7	7	592078	592084	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11493	NC_005810	AATT	2	8	592133	592140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11494	NC_005810	TGA	2	6	592151	592156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11495	NC_005810	ATA	2	6	592176	592181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11496	NC_005810	G	6	6	592186	592191	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11497	NC_005810	ATG	2	6	592192	592197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440408
11498	NC_005810	AGGC	2	8	592226	592233	25 %	0 %	50 %	25 %	45440408
11499	NC_005810	GAT	2	6	592291	592296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440408
11500	NC_005810	CGG	2	6	592307	592312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440408

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