MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 chromosome

Total Repeats: 90548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_005810	GGC	2	6	541621	541626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161511448
10503	NC_005810	CGG	2	6	541638	541643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161511448
10504	NC_005810	GAT	2	6	541648	541653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161511448
10505	NC_005810	TTG	2	6	541685	541690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161511448
10506	NC_005810	CTT	2	6	541702	541707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161511448
10507	NC_005810	TGT	2	6	541725	541730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161511448
10508	NC_005810	A	6	6	541749	541754	100 %	0 %	0 %	0 %	161511448
10509	NC_005810	TGG	2	6	541828	541833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161511448
10510	NC_005810	GAT	2	6	541988	541993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161511448
10511	NC_005810	GAT	2	6	542003	542008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161511448
10512	NC_005810	AGG	2	6	542017	542022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10513	NC_005810	TTA	2	6	542043	542048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10514	NC_005810	CTTT	2	8	542078	542085	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10515	NC_005810	A	7	7	542131	542137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10516	NC_005810	T	7	7	542143	542149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_005810	AAG	2	6	542171	542176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10518	NC_005810	TTAATC	2	12	542226	542237	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10519	NC_005810	AAG	2	6	542312	542317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440359
10520	NC_005810	CTG	2	6	542330	542335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440359
10521	NC_005810	CGT	2	6	542457	542462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440359
10522	NC_005810	GAA	2	6	542509	542514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440359
10523	NC_005810	TTG	2	6	542549	542554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440359
10524	NC_005810	CT	3	6	542568	542573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10525	NC_005810	TCT	2	6	542576	542581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10526	NC_005810	ACG	2	6	542637	542642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440360
10527	NC_005810	AAG	2	6	542832	542837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440360
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10529	NC_005810	CAT	2	6	542902	542907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440360
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10531	NC_005810	A	6	6	543002	543007	100 %	0 %	0 %	0 %	45440360
10532	NC_005810	CTGT	2	8	543008	543015	0 %	50 %	25 %	25 %	45440360
10533	NC_005810	AAG	2	6	543120	543125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440360
10534	NC_005810	GAA	2	6	543140	543145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440360
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10536	NC_005810	CATT	2	8	543261	543268	25 %	50 %	0 %	25 %	45440360
10537	NC_005810	TGC	2	6	543306	543311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440360
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10540	NC_005810	CGT	2	6	543458	543463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440360
10541	NC_005810	TGC	2	6	543471	543476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440360
10542	NC_005810	CTGGAA	2	12	543527	543538	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	45440360
10543	NC_005810	A	6	6	543537	543542	100 %	0 %	0 %	0 %	45440360
10544	NC_005810	GTT	2	6	543575	543580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440360
10545	NC_005810	CAA	2	6	543583	543588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45440360
10546	NC_005810	ACC	2	6	543593	543598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440360
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10550	NC_005810	TGAAA	2	10	543769	543778	60 %	20 %	20 %	0 %	45440360
10551	NC_005810	GAA	2	6	543781	543786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440360
10552	NC_005810	TGCA	2	8	543807	543814	25 %	25 %	25 %	25 %	45440360
10553	NC_005810	AGA	2	6	543829	543834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440360
10554	NC_005810	CGT	2	6	543838	543843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440360
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10556	NC_005810	TGCG	2	8	543939	543946	0 %	25 %	50 %	25 %	45440360
10557	NC_005810	GAA	2	6	543986	543991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440360
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10559	NC_005810	TCTGC	2	10	544112	544121	0 %	40 %	20 %	40 %	45440360
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10563	NC_005810	GGC	2	6	544214	544219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440360
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10566	NC_005810	ATG	2	6	544247	544252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440360
10567	NC_005810	AGT	2	6	544298	544303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10568	NC_005810	TTCT	2	8	544458	544465	0 %	75 %	0 %	25 %	45440361
10569	NC_005810	TATTC	2	10	544503	544512	20 %	60 %	0 %	20 %	45440361
10570	NC_005810	TG	3	6	544513	544518	0 %	50 %	50 %	0 %	45440361
10571	NC_005810	T	7	7	544532	544538	0 %	100 %	0 %	0 %	45440361
10572	NC_005810	CAG	2	6	544593	544598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440361
10573	NC_005810	GCG	2	6	544604	544609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440361
10574	NC_005810	TCCA	2	8	544622	544629	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10575	NC_005810	ACCTC	2	10	544633	544642	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10576	NC_005810	T	6	6	544706	544711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10577	NC_005810	G	6	6	544722	544727	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10578	NC_005810	TTTG	2	8	544730	544737	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10579	NC_005810	TGC	2	6	544744	544749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10581	NC_005810	AAG	2	6	544899	544904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440362
10582	NC_005810	CTC	2	6	544989	544994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45440362
10583	NC_005810	CGG	2	6	545009	545014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440362
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10585	NC_005810	TCAGG	2	10	545101	545110	20 %	20 %	40 %	20 %	45440362
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10589	NC_005810	AGC	2	6	545160	545165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440362
10590	NC_005810	CTT	2	6	545214	545219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440362
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10592	NC_005810	TGGT	2	8	545249	545256	0 %	50 %	50 %	0 %	45440362
10593	NC_005810	T	6	6	545322	545327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10594	NC_005810	GCT	2	6	545369	545374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10595	NC_005810	AGC	2	6	545424	545429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10596	NC_005810	TTCA	2	8	545459	545466	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10597	NC_005810	AG	3	6	545516	545521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10598	NC_005810	CTTG	2	8	545546	545553	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10599	NC_005810	CCAC	2	8	545608	545615	25 %	0 %	0 %	75 %	45440363
10600	NC_005810	TCA	2	6	545669	545674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440363
10601	NC_005810	TCA	3	9	545686	545694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440363
10602	NC_005810	TAA	2	6	545743	545748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440363
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10604	NC_005810	CAC	2	6	545991	545996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440363
10605	NC_005810	CCG	2	6	546021	546026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440363
10606	NC_005810	TCC	2	6	546040	546045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45440363
10607	NC_005810	A	6	6	546104	546109	100 %	0 %	0 %	0 %	45440363
10608	NC_005810	GGC	2	6	546200	546205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440363
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10610	NC_005810	GC	3	6	546254	546259	0 %	0 %	50 %	50 %	45440363
10611	NC_005810	ACG	2	6	546289	546294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440363
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10613	NC_005810	TAA	2	6	546338	546343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440363
10614	NC_005810	TAA	2	6	546372	546377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440363
10615	NC_005810	CAA	2	6	546410	546415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45440363
10616	NC_005810	ACG	2	6	546444	546449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440363
10617	NC_005810	TTG	2	6	546462	546467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440363
10618	NC_005810	GTT	2	6	546536	546541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440363
10619	NC_005810	TCT	2	6	546550	546555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440363
10620	NC_005810	T	6	6	546590	546595	0 %	100 %	0 %	0 %	45440363
10621	NC_005810	TAC	2	6	546601	546606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10622	NC_005810	CAT	2	6	546622	546627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161511447
10623	NC_005810	TTA	2	6	546634	546639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161511447
10624	NC_005810	ACTG	2	8	546763	546770	25 %	25 %	25 %	25 %	161511447
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10627	NC_005810	GCCA	2	8	546984	546991	25 %	0 %	25 %	50 %	161511447
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10746	NC_005810	GTG	2	6	553251	553256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440372
10747	NC_005810	GC	3	6	553257	553262	0 %	0 %	50 %	50 %	45440372
10748	NC_005810	CAAC	2	8	553411	553418	50 %	0 %	0 %	50 %	45440372
10749	NC_005810	ACC	2	6	553466	553471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440372
10750	NC_005810	GACT	2	8	553646	553653	25 %	25 %	25 %	25 %	45440372
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10753	NC_005810	AACC	2	8	553778	553785	50 %	0 %	0 %	50 %	45440372
10754	NC_005810	CTC	2	6	553826	553831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45440372
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10774	NC_005810	CAT	3	9	554714	554722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440372
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