MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 chromosome

Total Repeats: 90548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_005810	CAC	2	6	516237	516242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440334
10002	NC_005810	CCA	2	6	516257	516262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440334
10003	NC_005810	CGA	3	9	516271	516279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440334
10004	NC_005810	TC	3	6	516461	516466	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10005	NC_005810	GGCG	2	8	516470	516477	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10006	NC_005810	GTT	2	6	516491	516496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_005810	CCA	2	6	516623	516628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440335
10008	NC_005810	CGG	2	6	516640	516645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440335
10009	NC_005810	TTC	2	6	516668	516673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440335
10010	NC_005810	TCA	2	6	516714	516719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440335
10011	NC_005810	GTG	2	6	516734	516739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440335
10012	NC_005810	ATC	2	6	516849	516854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440335
10013	NC_005810	CAGC	2	8	516941	516948	25 %	0 %	25 %	50 %	45440336
10014	NC_005810	AACC	2	8	516958	516965	50 %	0 %	0 %	50 %	45440336
10015	NC_005810	TGA	2	6	517054	517059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440336
10016	NC_005810	CTTG	2	8	517060	517067	0 %	50 %	25 %	25 %	45440336
10017	NC_005810	TCA	2	6	517069	517074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440336
10018	NC_005810	CGG	2	6	517123	517128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440336
10019	NC_005810	TTC	2	6	517149	517154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440336
10020	NC_005810	GCA	2	6	517163	517168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440336
10021	NC_005810	TG	3	6	517201	517206	0 %	50 %	50 %	0 %	45440336
10022	NC_005810	TGG	2	6	517216	517221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440336
10023	NC_005810	CAT	2	6	517290	517295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440336
10024	NC_005810	CG	3	6	517298	517303	0 %	0 %	50 %	50 %	45440336
10025	NC_005810	GATT	2	8	517359	517366	25 %	50 %	25 %	0 %	45440336
10026	NC_005810	CATC	2	8	517436	517443	25 %	25 %	0 %	50 %	45440336
10027	NC_005810	CGC	2	6	517449	517454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440336
10028	NC_005810	CCT	2	6	517535	517540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45440336
10029	NC_005810	AAT	2	6	517560	517565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440336
10030	NC_005810	GTTT	2	8	517633	517640	0 %	75 %	25 %	0 %	45440336
10031	NC_005810	CAGT	2	8	517685	517692	25 %	25 %	25 %	25 %	45440336
10032	NC_005810	GCC	2	6	517725	517730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440336
10033	NC_005810	GGC	2	6	517770	517775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440336
10034	NC_005810	CGC	2	6	517857	517862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440336
10035	NC_005810	CGTGC	2	10	517971	517980	0 %	20 %	40 %	40 %	45440336
10036	NC_005810	CTC	2	6	518022	518027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10037	NC_005810	GCC	2	6	518125	518130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440337
10038	NC_005810	GTT	2	6	518141	518146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440337
10039	NC_005810	T	6	6	518163	518168	0 %	100 %	0 %	0 %	45440337
10040	NC_005810	GCC	2	6	518169	518174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440337
10041	NC_005810	CGG	2	6	518213	518218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440337
10042	NC_005810	ATCA	2	8	518220	518227	50 %	25 %	0 %	25 %	45440337
10043	NC_005810	CCG	2	6	518312	518317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440337
10044	NC_005810	TG	3	6	518320	518325	0 %	50 %	50 %	0 %	45440337
10045	NC_005810	CCAT	2	8	518348	518355	25 %	25 %	0 %	50 %	45440337
10046	NC_005810	ACC	2	6	518383	518388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440337
10047	NC_005810	TGG	2	6	518471	518476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440337
10048	NC_005810	GCC	2	6	518505	518510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440337
10049	NC_005810	CCCT	2	8	518571	518578	0 %	25 %	0 %	75 %	45440337
10050	NC_005810	GCCAT	2	10	518605	518614	20 %	20 %	20 %	40 %	45440337
10051	NC_005810	GCA	2	6	518627	518632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440337
10052	NC_005810	TTCAA	2	10	518653	518662	40 %	40 %	0 %	20 %	45440337
10053	NC_005810	GTT	2	6	518750	518755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440337
10054	NC_005810	ACG	2	6	518766	518771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440337
10055	NC_005810	GCC	2	6	518814	518819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440337
10056	NC_005810	TGG	2	6	518855	518860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440337
10057	NC_005810	TGT	2	6	518938	518943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440338
10058	NC_005810	TTC	2	6	519042	519047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440338
10059	NC_005810	CAG	2	6	519048	519053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440338
10060	NC_005810	GTCG	2	8	519102	519109	0 %	25 %	50 %	25 %	45440338
10061	NC_005810	AAG	2	6	519193	519198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440338
10062	NC_005810	AAT	2	6	519237	519242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440338
10063	NC_005810	TCA	2	6	519265	519270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440338
10064	NC_005810	TGGA	2	8	519381	519388	25 %	25 %	50 %	0 %	45440338
10065	NC_005810	GGC	2	6	519419	519424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440338
10066	NC_005810	GGC	2	6	519426	519431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440338
10067	NC_005810	TGA	2	6	519539	519544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440338
10068	NC_005810	G	6	6	519575	519580	0 %	0 %	100 %	0 %	45440338
10069	NC_005810	GT	3	6	519596	519601	0 %	50 %	50 %	0 %	45440338
10070	NC_005810	GA	3	6	519764	519769	50 %	0 %	50 %	0 %	45440338
10071	NC_005810	T	6	6	519804	519809	0 %	100 %	0 %	0 %	45440338
10072	NC_005810	GC	3	6	519855	519860	0 %	0 %	50 %	50 %	45440338
10073	NC_005810	GC	3	6	519966	519971	0 %	0 %	50 %	50 %	45440338
10074	NC_005810	CCG	2	6	520003	520008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440338
10075	NC_005810	CAT	2	6	520043	520048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440338
10076	NC_005810	CAG	2	6	520057	520062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440338
10077	NC_005810	CATCAA	2	12	520103	520114	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	45440338
10078	NC_005810	GCA	2	6	520227	520232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440339
10079	NC_005810	CGG	2	6	520290	520295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440339
10080	NC_005810	CA	3	6	520405	520410	50 %	0 %	0 %	50 %	45440339
10081	NC_005810	GCC	2	6	520436	520441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440339
10082	NC_005810	CGA	2	6	520444	520449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440339
10083	NC_005810	ACA	2	6	520510	520515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45440339
10084	NC_005810	GGC	2	6	520550	520555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440339
10085	NC_005810	TAA	2	6	520624	520629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440339
10086	NC_005810	AGCG	2	8	520653	520660	25 %	0 %	50 %	25 %	45440339
10087	NC_005810	ATA	2	6	520752	520757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440339
10088	NC_005810	TGC	2	6	520807	520812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440339
10089	NC_005810	CTG	2	6	520820	520825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440339
10090	NC_005810	GTG	2	6	520834	520839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440339
10091	NC_005810	GCA	2	6	520887	520892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440339
10092	NC_005810	GGC	2	6	520910	520915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440339
10093	NC_005810	CCA	2	6	520951	520956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440339
10094	NC_005810	CTG	2	6	520964	520969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440339
10095	NC_005810	GTA	2	6	521100	521105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440339
10096	NC_005810	AAT	2	6	521169	521174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440339
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10099	NC_005810	CTG	2	6	521297	521302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440339
10100	NC_005810	CAAAA	2	10	521381	521390	80 %	0 %	0 %	20 %	45440339
10101	NC_005810	TGGT	2	8	521523	521530	0 %	50 %	50 %	0 %	45440339
10102	NC_005810	ATA	2	6	521573	521578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440339
10103	NC_005810	TGT	2	6	521746	521751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440340
10104	NC_005810	CGA	2	6	521786	521791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440340
10105	NC_005810	TCA	2	6	521797	521802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440340
10106	NC_005810	GAAAGT	2	12	521836	521847	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_005810	GGC	2	6	521873	521878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10108	NC_005810	A	8	8	521932	521939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_005810	TCA	2	6	521983	521988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10110	NC_005810	CTG	2	6	521989	521994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_005810	T	6	6	522079	522084	0 %	100 %	0 %	0 %	45440341
10112	NC_005810	CAT	3	9	522146	522154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440341
10113	NC_005810	AGA	2	6	522178	522183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440341
10114	NC_005810	TTTG	2	8	522268	522275	0 %	75 %	25 %	0 %	45440341
10115	NC_005810	GAT	2	6	522284	522289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440341
10116	NC_005810	TCCC	2	8	522385	522392	0 %	25 %	0 %	75 %	45440341
10117	NC_005810	GAT	2	6	522554	522559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440341
10118	NC_005810	CATTGC	2	12	522648	522659	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	45440341
10119	NC_005810	A	6	6	522679	522684	100 %	0 %	0 %	0 %	45440341
10120	NC_005810	TCA	2	6	522742	522747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440341
10121	NC_005810	TG	3	6	522789	522794	0 %	50 %	50 %	0 %	45440341
10122	NC_005810	TTTA	2	8	522823	522830	25 %	75 %	0 %	0 %	45440341
10123	NC_005810	ATTA	2	8	522978	522985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10143	NC_005810	CAC	2	6	523915	523920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10147	NC_005810	AAT	2	6	524020	524025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10152	NC_005810	TGT	2	6	524229	524234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229220785
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10167	NC_005810	TGA	2	6	525147	525152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10233	NC_005810	AT	3	6	527943	527948	50 %	50 %	0 %	0 %	45440347
10234	NC_005810	TGA	2	6	528022	528027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440347
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10243	NC_005810	TA	3	6	528234	528239	50 %	50 %	0 %	0 %	45440347
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10365	NC_005810	CTA	2	6	534805	534810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440352
10366	NC_005810	ATCCA	2	10	534825	534834	40 %	20 %	0 %	40 %	45440352
10367	NC_005810	GCG	2	6	534851	534856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440352
10368	NC_005810	TGCG	2	8	534858	534865	0 %	25 %	50 %	25 %	45440352
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10370	NC_005810	CTGC	2	8	534941	534948	0 %	25 %	25 %	50 %	45440352
10371	NC_005810	G	6	6	534957	534962	0 %	0 %	100 %	0 %	45440352
10372	NC_005810	TAA	2	6	535009	535014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440352
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10487	NC_005810	TGC	2	6	541040	541045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10488	NC_005810	ATG	2	6	541056	541061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10489	NC_005810	ACC	2	6	541092	541097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10490	NC_005810	GAT	2	6	541115	541120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10492	NC_005810	GAT	2	6	541180	541185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10493	NC_005810	TAA	2	6	541224	541229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10494	NC_005810	CAC	2	6	541262	541267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10495	NC_005810	TAG	2	6	541273	541278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10496	NC_005810	G	6	6	541296	541301	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10497	NC_005810	TGA	2	6	541396	541401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440357
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10499	NC_005810	TCA	2	6	541494	541499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440357
10500	NC_005810	CTG	3	9	541532	541540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440357

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