MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 chromosome

Total Repeats: 90548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005810	GCC	2	6	27860	27865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_005810	T	6	6	27866	27871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_005810	TCT	2	6	27877	27882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_005810	GGC	2	6	27936	27941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_005810	TA	3	6	27985	27990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_005810	AGC	2	6	28032	28037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45439886
507	NC_005810	CAC	2	6	28047	28052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45439886
508	NC_005810	AGA	2	6	28097	28102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45439886
509	NC_005810	TGA	2	6	28111	28116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45439886
510	NC_005810	AGA	2	6	28149	28154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45439886
511	NC_005810	GCA	2	6	28197	28202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45439886
512	NC_005810	GTA	2	6	28248	28253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45439886
513	NC_005810	GAA	2	6	28349	28354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45439886
514	NC_005810	GCT	2	6	28393	28398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45439886
515	NC_005810	AGA	2	6	28432	28437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45439886
516	NC_005810	TGA	2	6	28507	28512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45439886
517	NC_005810	GAT	2	6	28517	28522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45439886
518	NC_005810	GAGAA	2	10	28530	28539	60 %	0 %	40 %	0 %	45439886
519	NC_005810	GGT	2	6	28606	28611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_005810	CTA	2	6	28625	28630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_005810	TTA	2	6	28652	28657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_005810	GGC	2	6	28668	28673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_005810	CGCAA	2	10	28677	28686	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
524	NC_005810	ACA	2	6	28717	28722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_005810	ATT	2	6	28826	28831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161511483
526	NC_005810	CAG	2	6	28900	28905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161511483
527	NC_005810	TGA	2	6	29022	29027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161511483
528	NC_005810	TGG	2	6	29033	29038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161511483
529	NC_005810	GCC	2	6	29065	29070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161511483
530	NC_005810	GTCAG	2	10	29084	29093	20 %	20 %	40 %	20 %	161511483
531	NC_005810	G	10	10	29105	29114	0 %	0 %	100 %	0 %	161511483
532	NC_005810	TGC	2	6	29162	29167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161511483
533	NC_005810	TTGAT	2	10	29399	29408	20 %	60 %	20 %	0 %	161511483
534	NC_005810	GCTGA	2	10	29464	29473	20 %	20 %	40 %	20 %	161511483
535	NC_005810	GCC	2	6	29524	29529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161511483
536	NC_005810	CGG	2	6	29561	29566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161511483
537	NC_005810	GCA	2	6	29586	29591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161511483
538	NC_005810	GGAT	2	8	29633	29640	25 %	25 %	50 %	0 %	161511483
539	NC_005810	GAT	2	6	29656	29661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161511483
540	NC_005810	CAG	2	6	29677	29682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161511483
541	NC_005810	TTGGG	2	10	29741	29750	0 %	40 %	60 %	0 %	161511483
542	NC_005810	AGC	2	6	29942	29947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161511483
543	NC_005810	ATT	2	6	29969	29974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161511483
544	NC_005810	GCT	2	6	29991	29996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161511483
545	NC_005810	TGG	2	6	30020	30025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161511483
546	NC_005810	C	6	6	30053	30058	0 %	0 %	0 %	100 %	161511483
547	NC_005810	GC	3	6	30118	30123	0 %	0 %	50 %	50 %	161511483
548	NC_005810	AGC	2	6	30125	30130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161511483
549	NC_005810	ACT	2	6	30203	30208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161511482
550	NC_005810	CAG	2	6	30258	30263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161511482
551	NC_005810	TGC	2	6	30267	30272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161511482
552	NC_005810	GGT	2	6	30306	30311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161511482
553	NC_005810	TGA	2	6	30358	30363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161511482
554	NC_005810	AACGC	2	10	30368	30377	40 %	0 %	20 %	40 %	161511482
555	NC_005810	AAT	2	6	30457	30462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161511482
556	NC_005810	CTT	2	6	30743	30748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161511482
557	NC_005810	CCCGA	2	10	30819	30828	20 %	0 %	20 %	60 %	161511482
558	NC_005810	A	7	7	30901	30907	100 %	0 %	0 %	0 %	161511482
559	NC_005810	GCC	2	6	31018	31023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161511482
560	NC_005810	TACCGG	2	12	31094	31105	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	161511482
561	NC_005810	GAG	2	6	31132	31137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161511482
562	NC_005810	ATA	2	6	31192	31197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161511482
563	NC_005810	ACTG	2	8	31212	31219	25 %	25 %	25 %	25 %	161511482
564	NC_005810	CGGG	2	8	31228	31235	0 %	0 %	75 %	25 %	161511482
565	NC_005810	TTG	3	9	31236	31244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161511482
566	NC_005810	TCG	2	6	31288	31293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161511482
567	NC_005810	CGG	2	6	31346	31351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161511482
568	NC_005810	ATG	2	6	31378	31383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161511482
569	NC_005810	TTTG	2	8	31412	31419	0 %	75 %	25 %	0 %	161511482
570	NC_005810	CCAT	2	8	31432	31439	25 %	25 %	0 %	50 %	161511482
571	NC_005810	AAC	2	6	31462	31467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161511482
572	NC_005810	CAGT	2	8	31544	31551	25 %	25 %	25 %	25 %	161511482
573	NC_005810	GC	3	6	31552	31557	0 %	0 %	50 %	50 %	161511482
574	NC_005810	CGA	2	6	31589	31594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161511482
575	NC_005810	GT	3	6	31658	31663	0 %	50 %	50 %	0 %	161511481
576	NC_005810	GATA	2	8	31720	31727	50 %	25 %	25 %	0 %	161511481
577	NC_005810	GCC	2	6	31900	31905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161511481
578	NC_005810	CAG	2	6	31945	31950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161511481
579	NC_005810	TGA	2	6	32072	32077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161511481
580	NC_005810	AAT	2	6	32158	32163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161511481
581	NC_005810	TAA	2	6	32209	32214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161511481
582	NC_005810	TTG	2	6	32293	32298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161511481
583	NC_005810	CAA	2	6	32418	32423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161511481
584	NC_005810	CT	3	6	32468	32473	0 %	50 %	0 %	50 %	161511481
585	NC_005810	TAA	2	6	32506	32511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161511481
586	NC_005810	ATC	3	9	32596	32604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161511481
587	NC_005810	CAG	2	6	32608	32613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161511481
588	NC_005810	GAT	2	6	32776	32781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_005810	ACGAAA	2	12	32783	32794	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
590	NC_005810	A	6	6	32802	32807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_005810	CAA	2	6	32841	32846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_005810	GT	3	6	32869	32874	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
593	NC_005810	GCT	2	6	32877	32882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_005810	TCGC	2	8	32884	32891	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
595	NC_005810	ACGC	2	8	32971	32978	25 %	0 %	25 %	50 %	45439890
596	NC_005810	TCT	2	6	32987	32992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45439890
597	NC_005810	CAT	2	6	33021	33026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45439890
598	NC_005810	CCA	2	6	33038	33043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45439890
599	NC_005810	CTT	3	9	33120	33128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45439890
600	NC_005810	CGG	2	6	33130	33135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45439890
601	NC_005810	TGA	2	6	33183	33188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45439890
602	NC_005810	GCCA	2	8	33199	33206	25 %	0 %	25 %	50 %	45439890
603	NC_005810	GCG	2	6	33215	33220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45439890
604	NC_005810	CAA	2	6	33288	33293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45439890
605	NC_005810	TGG	2	6	33384	33389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45439890
606	NC_005810	TGA	2	6	33426	33431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45439890
607	NC_005810	CCG	2	6	33434	33439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45439890
608	NC_005810	GCC	2	6	33466	33471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45439890
609	NC_005810	TTA	2	6	33494	33499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45439890
610	NC_005810	TGCG	2	8	33589	33596	0 %	25 %	50 %	25 %	45439890
611	NC_005810	ACG	2	6	33608	33613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45439890
612	NC_005810	GTG	3	9	33700	33708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45439890
613	NC_005810	ACC	2	6	33716	33721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45439890
614	NC_005810	GGA	2	6	33782	33787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45439890
615	NC_005810	GCC	2	6	33832	33837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45439890
616	NC_005810	TGC	2	6	33903	33908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45439890
617	NC_005810	GAA	2	6	33934	33939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45439890
618	NC_005810	TTCTGG	2	12	33940	33951	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	45439890
619	NC_005810	AAC	2	6	33956	33961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45439890
620	NC_005810	GAA	2	6	34093	34098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45439890
621	NC_005810	CCA	2	6	34166	34171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45439890
622	NC_005810	GAG	2	6	34175	34180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45439890
623	NC_005810	CTT	2	6	34197	34202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45439890
624	NC_005810	GAA	2	6	34204	34209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45439890
625	NC_005810	TGA	2	6	34223	34228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45439890
626	NC_005810	TGC	2	6	34244	34249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45439890
627	NC_005810	CAA	2	6	34281	34286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45439890
628	NC_005810	GTC	3	9	34361	34369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_005810	GT	3	6	34384	34389	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
630	NC_005810	A	6	6	34437	34442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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671	NC_005810	AGC	2	6	36518	36523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45439892
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