MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 chromosome

Total Repeats: 90548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
90501	NC_005810	AG	3	6	4592648	4592653	50 %	0 %	50 %	0 %	45443759
90502	NC_005810	T	7	7	4592659	4592665	0 %	100 %	0 %	0 %	45443759
90503	NC_005810	GCG	2	6	4592825	4592830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161511281
90504	NC_005810	CAA	2	6	4592831	4592836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161511281
90505	NC_005810	T	6	6	4592843	4592848	0 %	100 %	0 %	0 %	161511281
90506	NC_005810	AGAT	2	8	4592863	4592870	50 %	25 %	25 %	0 %	161511281
90507	NC_005810	GTT	2	6	4593019	4593024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161511281
90508	NC_005810	CTG	2	6	4593038	4593043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161511281
90509	NC_005810	ATG	2	6	4593121	4593126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161511281
90510	NC_005810	CAA	2	6	4593137	4593142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161511281
90511	NC_005810	CTT	2	6	4593187	4593192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161511281
90512	NC_005810	CAG	2	6	4593209	4593214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161511281
90513	NC_005810	ATC	2	6	4593326	4593331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161511281
90514	NC_005810	TCAG	2	8	4593357	4593364	25 %	25 %	25 %	25 %	161511281
90515	NC_005810	GCA	2	6	4593388	4593393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161511281
90516	NC_005810	TACGG	2	10	4593424	4593433	20 %	20 %	40 %	20 %	161511281
90517	NC_005810	CCA	2	6	4593463	4593468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161511281
90518	NC_005810	TCA	2	6	4593486	4593491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161511281
90519	NC_005810	TCC	2	6	4593510	4593515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161511281
90520	NC_005810	AGC	2	6	4593549	4593554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161511281
90521	NC_005810	AT	3	6	4593621	4593626	50 %	50 %	0 %	0 %	161511281
90522	NC_005810	ATAGC	2	10	4593678	4593687	40 %	20 %	20 %	20 %	161511281
90523	NC_005810	AAT	2	6	4593695	4593700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161511281
90524	NC_005810	TCGA	2	8	4593864	4593871	25 %	25 %	25 %	25 %	161511281
90525	NC_005810	GAT	2	6	4593899	4593904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161511281
90526	NC_005810	T	6	6	4593955	4593960	0 %	100 %	0 %	0 %	161511281
90527	NC_005810	TGT	2	6	4593999	4594004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161511281
90528	NC_005810	AAGA	2	8	4594017	4594024	75 %	0 %	25 %	0 %	161511281
90529	NC_005810	GTG	2	6	4594096	4594101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161511281
90530	NC_005810	CCA	2	6	4594188	4594193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161511281
90531	NC_005810	AAGG	2	8	4594229	4594236	50 %	0 %	50 %	0 %	161511281
90532	NC_005810	CAC	2	6	4594250	4594255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161511281
90533	NC_005810	TG	3	6	4594284	4594289	0 %	50 %	50 %	0 %	161511281
90534	NC_005810	CAA	2	6	4594315	4594320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161511281
90535	NC_005810	ATC	2	6	4594347	4594352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161511281
90536	NC_005810	CCG	2	6	4594548	4594553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161511281
90537	NC_005810	GGC	2	6	4594640	4594645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161511281
90538	NC_005810	CCA	2	6	4594662	4594667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161511281
90539	NC_005810	GAT	3	9	4594670	4594678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161511281
90540	NC_005810	TGGGG	2	10	4594747	4594756	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
90541	NC_005810	AGA	2	6	4594813	4594818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90542	NC_005810	TTTA	2	8	4594823	4594830	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90543	NC_005810	TTA	2	6	4594840	4594845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90544	NC_005810	TTA	2	6	4594852	4594857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90545	NC_005810	ATT	2	6	4594884	4594889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90546	NC_005810	AGG	2	6	4594912	4594917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90547	NC_005810	TGT	2	6	4594924	4594929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90548	NC_005810	GTT	2	6	4595006	4595011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.