MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 chromosome

Total Repeats: 90548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_005810	CGA	2	6	259192	259197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440117
5002	NC_005810	T	6	6	259235	259240	0 %	100 %	0 %	0 %	45440117
5003	NC_005810	TGC	2	6	259251	259256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440117
5004	NC_005810	ACA	2	6	259283	259288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45440117
5005	NC_005810	GGA	2	6	259329	259334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45440117
5006	NC_005810	AAT	2	6	259458	259463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440117
5007	NC_005810	CCA	2	6	259525	259530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440117
5008	NC_005810	GAT	2	6	259604	259609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440117
5009	NC_005810	TC	3	6	259628	259633	0 %	50 %	0 %	50 %	45440117
5010	NC_005810	TTG	2	6	259671	259676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440117
5011	NC_005810	GGC	2	6	259702	259707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440117
5012	NC_005810	TGTT	2	8	259813	259820	0 %	75 %	25 %	0 %	45440118
5013	NC_005810	ATT	2	6	259861	259866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45440118
5014	NC_005810	GCG	2	6	259887	259892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440118
5015	NC_005810	ATA	2	6	259927	259932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440118
5016	NC_005810	ACA	2	6	259939	259944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45440118
5017	NC_005810	TGG	2	6	259999	260004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440118
5018	NC_005810	GGC	2	6	260028	260033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440118
5019	NC_005810	GGC	2	6	260046	260051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440118
5020	NC_005810	CTG	2	6	260139	260144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440118
5021	NC_005810	ACCA	2	8	260233	260240	50 %	0 %	0 %	50 %	45440118
5022	NC_005810	GTA	2	6	260274	260279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440118
5023	NC_005810	GA	3	6	260283	260288	50 %	0 %	50 %	0 %	45440118
5024	NC_005810	TGT	2	6	260537	260542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440118
5025	NC_005810	GAA	2	6	260547	260552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440118
5026	NC_005810	GGGTG	2	10	260728	260737	0 %	20 %	80 %	0 %	45440118
5027	NC_005810	AC	3	6	260748	260753	50 %	0 %	0 %	50 %	45440118
5028	NC_005810	GTG	2	6	260779	260784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440118
5029	NC_005810	TGAAT	2	10	260850	260859	40 %	40 %	20 %	0 %	45440118
5030	NC_005810	GT	3	6	260865	260870	0 %	50 %	50 %	0 %	45440118
5031	NC_005810	ATC	2	6	260893	260898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440118
5032	NC_005810	TGC	2	6	260909	260914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440118
5033	NC_005810	AAC	2	6	260960	260965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45440118
5034	NC_005810	GTT	2	6	260980	260985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440118
5035	NC_005810	TAC	2	6	260988	260993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440118
5036	NC_005810	TCG	2	6	261009	261014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440118
5037	NC_005810	AACGC	2	10	261090	261099	40 %	0 %	20 %	40 %	45440118
5038	NC_005810	TCA	2	6	261113	261118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440118
5039	NC_005810	AGTG	2	8	261160	261167	25 %	25 %	50 %	0 %	45440118
5040	NC_005810	TCA	2	6	261203	261208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440118
5041	NC_005810	TAA	2	6	261409	261414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440119
5042	NC_005810	TGC	2	6	261572	261577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440119
5043	NC_005810	GCAACC	2	12	261636	261647	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	45440119
5044	NC_005810	TCAAT	2	10	261649	261658	40 %	40 %	0 %	20 %	45440119
5045	NC_005810	T	6	6	261746	261751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_005810	CGG	2	6	261837	261842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_005810	ATA	2	6	261869	261874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_005810	CCG	2	6	261883	261888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5049	NC_005810	CAT	2	6	262089	262094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161511467
5050	NC_005810	TGCT	2	8	262143	262150	0 %	50 %	25 %	25 %	161511467
5051	NC_005810	TCA	2	6	262156	262161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161511467
5052	NC_005810	CTT	2	6	262223	262228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161511467
5053	NC_005810	AAT	2	6	262245	262250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161511467
5054	NC_005810	TTA	2	6	262297	262302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161511467
5055	NC_005810	CCA	3	9	262303	262311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161511467
5056	NC_005810	AGT	2	6	262369	262374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161511467
5057	NC_005810	ACA	2	6	262399	262404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161511467
5058	NC_005810	GTGCG	2	10	262454	262463	0 %	20 %	60 %	20 %	161511467
5059	NC_005810	TGAA	2	8	262576	262583	50 %	25 %	25 %	0 %	161511467
5060	NC_005810	TTCA	2	8	262587	262594	25 %	50 %	0 %	25 %	161511467
5061	NC_005810	TAA	2	6	262631	262636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161511467
5062	NC_005810	CGGCG	2	10	262775	262784	0 %	0 %	60 %	40 %	161511467
5063	NC_005810	AGC	2	6	262799	262804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161511467
5064	NC_005810	GGC	2	6	262807	262812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161511467
5065	NC_005810	TGC	2	6	262928	262933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440121
5066	NC_005810	C	6	6	262973	262978	0 %	0 %	0 %	100 %	45440121
5067	NC_005810	CT	3	6	263010	263015	0 %	50 %	0 %	50 %	45440121
5068	NC_005810	TGG	2	6	263055	263060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440121
5069	NC_005810	GACT	2	8	263321	263328	25 %	25 %	25 %	25 %	45440121
5070	NC_005810	T	7	7	263440	263446	0 %	100 %	0 %	0 %	45440121
5071	NC_005810	CAA	2	6	263449	263454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45440121
5072	NC_005810	TTA	2	6	263620	263625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_005810	TCAT	2	8	263682	263689	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5074	NC_005810	TCAA	2	8	263726	263733	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5075	NC_005810	ATGG	2	8	263897	263904	25 %	25 %	50 %	0 %	45440122
5076	NC_005810	TTTG	2	8	263942	263949	0 %	75 %	25 %	0 %	45440122
5077	NC_005810	TAT	2	6	263959	263964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45440122
5078	NC_005810	G	7	7	264002	264008	0 %	0 %	100 %	0 %	45440122
5079	NC_005810	GCT	2	6	264039	264044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440122
5080	NC_005810	GTG	2	6	264118	264123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440122
5081	NC_005810	CTA	2	6	264176	264181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440122
5082	NC_005810	TGGC	2	8	264235	264242	0 %	25 %	50 %	25 %	45440122
5083	NC_005810	TGGC	2	8	264411	264418	0 %	25 %	50 %	25 %	45440122
5084	NC_005810	GTC	3	9	264564	264572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440122
5085	NC_005810	AAT	2	6	264708	264713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_005810	AAT	2	6	264724	264729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_005810	TC	3	6	264750	264755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5088	NC_005810	CCATAT	2	12	264858	264869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_005810	GGC	3	9	264915	264923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_005810	TGC	2	6	264930	264935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_005810	TAGG	2	8	264994	265001	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_005810	GTT	2	6	265030	265035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_005810	CTG	2	6	265054	265059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440123
5094	NC_005810	TTC	2	6	265096	265101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440123
5095	NC_005810	GAC	2	6	265122	265127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440123
5096	NC_005810	AAC	2	6	265204	265209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45440123
5097	NC_005810	CGC	2	6	265278	265283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440123
5098	NC_005810	ATC	2	6	265309	265314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440123
5099	NC_005810	ACA	2	6	265505	265510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45440123
5100	NC_005810	TGT	2	6	265535	265540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440123
5101	NC_005810	GCC	2	6	265552	265557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440123
5102	NC_005810	GCC	2	6	265632	265637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440123
5103	NC_005810	AGA	2	6	265699	265704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440123
5104	NC_005810	TCT	2	6	265753	265758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440123
5105	NC_005810	CTG	2	6	265763	265768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440123
5106	NC_005810	ATG	2	6	265837	265842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440123
5107	NC_005810	GAA	2	6	265851	265856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440123
5108	NC_005810	TGA	2	6	265910	265915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440123
5109	NC_005810	ATC	2	6	265936	265941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440123
5110	NC_005810	AAT	2	6	265944	265949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440123
5111	NC_005810	ATG	2	6	265963	265968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440123
5112	NC_005810	AAG	3	9	266032	266040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440123
5113	NC_005810	CGG	3	9	266042	266050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45440123
5114	NC_005810	CCA	2	6	266073	266078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440123
5115	NC_005810	CCA	2	6	266120	266125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440123
5116	NC_005810	AGT	2	6	266141	266146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440123
5117	NC_005810	CCAG	2	8	266148	266155	25 %	0 %	25 %	50 %	45440123
5118	NC_005810	TTC	2	6	266220	266225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440123
5119	NC_005810	ACC	2	6	266227	266232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440123
5120	NC_005810	CAC	2	6	266357	266362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440123
5121	NC_005810	TTG	2	6	266421	266426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440123
5122	NC_005810	TCA	2	6	266432	266437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440123
5123	NC_005810	ACT	2	6	266459	266464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_005810	T	6	6	266482	266487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_005810	TCA	2	6	266498	266503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5127	NC_005810	GCTT	2	8	266620	266627	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5128	NC_005810	TTTA	2	8	266685	266692	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5130	NC_005810	A	6	6	266753	266758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_005810	A	6	6	266846	266851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_005810	TG	3	6	266876	266881	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_005810	TGA	2	6	266938	266943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5135	NC_005810	AATTTA	2	12	267003	267014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5140	NC_005810	GTT	2	6	267140	267145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5167	NC_005810	CTGA	2	8	268729	268736	25 %	25 %	25 %	25 %	45440125
5168	NC_005810	GTCT	2	8	268778	268785	0 %	50 %	25 %	25 %	45440125
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5281	NC_005810	T	8	8	274286	274293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5287	NC_005810	AG	3	6	275038	275043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5288	NC_005810	TGGTTA	2	12	275059	275070	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5290	NC_005810	GCA	2	6	275324	275329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5292	NC_005810	AAAT	2	8	275433	275440	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5364	NC_005810	CAAT	2	8	278588	278595	50 %	25 %	0 %	25 %	45440131
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5372	NC_005810	TAAG	2	8	278784	278791	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5373	NC_005810	AAC	2	6	278816	278821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5374	NC_005810	GGCT	2	8	278851	278858	0 %	25 %	50 %	25 %	45440132
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5377	NC_005810	T	6	6	279005	279010	0 %	100 %	0 %	0 %	45440132
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5393	NC_005810	ATC	2	6	279782	279787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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