MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 chromosome

Total Repeats: 90548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_005810	TCG	2	6	232579	232584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440091
4502	NC_005810	AG	3	6	232615	232620	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_005810	ACGC	2	8	232690	232697	25 %	0 %	25 %	50 %	45440092
4504	NC_005810	TAC	2	6	232817	232822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440092
4505	NC_005810	AAG	2	6	232838	232843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440092
4506	NC_005810	ATG	2	6	232976	232981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440092
4507	NC_005810	GCA	2	6	233004	233009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440092
4508	NC_005810	CGTGGT	2	12	233068	233079	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	45440092
4509	NC_005810	ATTC	2	8	233101	233108	25 %	50 %	0 %	25 %	45440092
4510	NC_005810	GAA	2	6	233110	233115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440092
4511	NC_005810	GTC	2	6	233132	233137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440092
4512	NC_005810	TAG	2	6	233141	233146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440092
4513	NC_005810	AGC	2	6	233190	233195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440092
4514	NC_005810	CGAT	2	8	233255	233262	25 %	25 %	25 %	25 %	45440092
4515	NC_005810	CCG	2	6	233277	233282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440092
4516	NC_005810	AGA	2	6	233355	233360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440092
4517	NC_005810	CGATC	2	10	233373	233382	20 %	20 %	20 %	40 %	45440092
4518	NC_005810	CTG	2	6	233383	233388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440092
4519	NC_005810	A	6	6	233515	233520	100 %	0 %	0 %	0 %	45440092
4520	NC_005810	TCTT	2	8	233559	233566	0 %	75 %	0 %	25 %	45440092
4521	NC_005810	CCA	2	6	233590	233595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440092
4522	NC_005810	GTC	2	6	233676	233681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440093
4523	NC_005810	CAG	2	6	233695	233700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440093
4524	NC_005810	ATC	2	6	233753	233758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440093
4525	NC_005810	GAC	2	6	233761	233766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440093
4526	NC_005810	CGAAAG	2	12	233772	233783	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	45440093
4527	NC_005810	GTT	2	6	233795	233800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440093
4528	NC_005810	TCG	2	6	233842	233847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440093
4529	NC_005810	GGT	2	6	233930	233935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440093
4530	NC_005810	AGTT	2	8	233997	234004	25 %	50 %	25 %	0 %	45440093
4531	NC_005810	TGC	2	6	234010	234015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440093
4532	NC_005810	AGT	2	6	234028	234033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440093
4533	NC_005810	TGC	2	6	234034	234039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440093
4534	NC_005810	A	7	7	234060	234066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_005810	T	7	7	234081	234087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_005810	CCA	2	6	234092	234097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4537	NC_005810	TAC	3	9	234125	234133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_005810	TTAA	2	8	234169	234176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_005810	GTT	2	6	234185	234190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_005810	TTAA	2	8	234207	234214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_005810	ATT	2	6	234234	234239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_005810	ATC	2	6	234261	234266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_005810	TTG	2	6	234285	234290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_005810	T	6	6	234399	234404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_005810	ATG	2	6	234423	234428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_005810	TAC	2	6	234550	234555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161511469
4547	NC_005810	ATG	2	6	234568	234573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161511469
4548	NC_005810	GAAC	2	8	234583	234590	50 %	0 %	25 %	25 %	161511469
4549	NC_005810	TGG	2	6	234594	234599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161511469
4550	NC_005810	ATT	2	6	234690	234695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161511469
4551	NC_005810	CAT	2	6	234718	234723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161511469
4552	NC_005810	AG	3	6	234792	234797	50 %	0 %	50 %	0 %	161511469
4553	NC_005810	TTG	2	6	234831	234836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161511469
4554	NC_005810	CGA	2	6	234851	234856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161511469
4555	NC_005810	AGA	2	6	234897	234902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161511469
4556	NC_005810	TTAA	2	8	234904	234911	50 %	50 %	0 %	0 %	161511469
4557	NC_005810	TAT	2	6	234958	234963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_005810	TAC	2	6	234989	234994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_005810	ACA	2	6	235009	235014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45440095
4560	NC_005810	GTA	2	6	235148	235153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440095
4561	NC_005810	CAAT	2	8	235174	235181	50 %	25 %	0 %	25 %	45440095
4562	NC_005810	T	6	6	235185	235190	0 %	100 %	0 %	0 %	45440095
4563	NC_005810	ACT	2	6	235191	235196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440095
4564	NC_005810	TCT	2	6	235228	235233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_005810	TG	3	6	235322	235327	0 %	50 %	50 %	0 %	45440096
4566	NC_005810	TAA	2	6	235337	235342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440096
4567	NC_005810	TTC	3	9	235400	235408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440096
4568	NC_005810	TTAAC	2	10	235435	235444	40 %	40 %	0 %	20 %	45440096
4569	NC_005810	TAC	2	6	235514	235519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440096
4570	NC_005810	GTG	2	6	235597	235602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440096
4571	NC_005810	ATA	2	6	235608	235613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440096
4572	NC_005810	GCA	2	6	235647	235652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45440096
4573	NC_005810	AAT	2	6	235655	235660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440096
4574	NC_005810	ATGA	2	8	235750	235757	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_005810	AAT	2	6	235772	235777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_005810	TAT	2	6	235781	235786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_005810	ATT	2	6	235811	235816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_005810	ATT	2	6	235860	235865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_005810	GAA	2	6	235874	235879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45440097
4580	NC_005810	TTGG	2	8	235885	235892	0 %	50 %	50 %	0 %	45440097
4581	NC_005810	AAC	2	6	235893	235898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45440097
4582	NC_005810	T	6	6	235919	235924	0 %	100 %	0 %	0 %	45440097
4583	NC_005810	ATT	2	6	235938	235943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45440097
4584	NC_005810	AAT	2	6	235982	235987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440097
4585	NC_005810	C	6	6	235996	236001	0 %	0 %	0 %	100 %	45440097
4586	NC_005810	GTT	2	6	236019	236024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440097
4587	NC_005810	TGG	2	6	236027	236032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440097
4588	NC_005810	TCA	2	6	236079	236084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440097
4589	NC_005810	TGC	2	6	236190	236195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440097
4590	NC_005810	T	6	6	236270	236275	0 %	100 %	0 %	0 %	45440097
4591	NC_005810	ATA	2	6	236307	236312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440097
4592	NC_005810	TCA	3	9	236319	236327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440097
4593	NC_005810	TTC	2	6	236366	236371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440097
4594	NC_005810	ACC	3	9	236522	236530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45440097
4595	NC_005810	ACTC	2	8	236572	236579	25 %	25 %	0 %	50 %	45440097
4596	NC_005810	A	6	6	236612	236617	100 %	0 %	0 %	0 %	45440097
4597	NC_005810	TCA	2	6	236622	236627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440097
4598	NC_005810	AAT	2	6	236636	236641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440097
4599	NC_005810	GCC	2	6	236753	236758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45440097
4600	NC_005810	TAG	2	6	236760	236765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45440097
4601	NC_005810	CTG	2	6	236773	236778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440097
4602	NC_005810	GTT	2	6	236863	236868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440097
4603	NC_005810	TA	3	6	236930	236935	50 %	50 %	0 %	0 %	45440097
4604	NC_005810	AAT	2	6	236976	236981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440097
4605	NC_005810	GGCA	2	8	236995	237002	25 %	0 %	50 %	25 %	45440097
4606	NC_005810	TCA	2	6	237015	237020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440097
4607	NC_005810	TAC	2	6	237101	237106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440097
4608	NC_005810	CACC	2	8	237181	237188	25 %	0 %	0 %	75 %	45440097
4609	NC_005810	TGCCC	2	10	237216	237225	0 %	20 %	20 %	60 %	45440097
4610	NC_005810	AAT	2	6	237230	237235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440097
4611	NC_005810	T	6	6	237303	237308	0 %	100 %	0 %	0 %	161511468
4612	NC_005810	AGA	2	6	237323	237328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161511468
4613	NC_005810	GCT	2	6	237373	237378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161511468
4614	NC_005810	GTA	2	6	237379	237384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161511468
4615	NC_005810	CTG	2	6	237435	237440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161511468
4616	NC_005810	CCA	2	6	237487	237492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161511468
4617	NC_005810	GGC	2	6	237590	237595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161511468
4618	NC_005810	TCA	2	6	237751	237756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161511468
4619	NC_005810	CCAA	2	8	237909	237916	50 %	0 %	0 %	50 %	161511468
4620	NC_005810	GAT	2	6	237932	237937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161511468
4621	NC_005810	ATG	2	6	238041	238046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161511468
4622	NC_005810	TGC	2	6	238102	238107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161511468
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4624	NC_005810	TTG	2	6	238203	238208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161511468
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4884	NC_005810	GTG	2	6	252516	252521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45440109
4885	NC_005810	TGC	2	6	252552	252557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440109
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4888	NC_005810	CTGA	2	8	252669	252676	25 %	25 %	25 %	25 %	45440109
4889	NC_005810	TCA	2	6	252694	252699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45440109
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4922	NC_005810	TG	3	6	254493	254498	0 %	50 %	50 %	0 %	45440111
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4924	NC_005810	GGA	2	6	254875	254880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4925	NC_005810	TATT	2	8	254881	254888	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4932	NC_005810	ATG	2	6	255290	255295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4953	NC_005810	GCGTT	2	10	256438	256447	0 %	40 %	40 %	20 %	45440114
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4967	NC_005810	CT	3	6	257533	257538	0 %	50 %	0 %	50 %	45440116
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4981	NC_005810	TTA	2	6	258076	258081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4982	NC_005810	GTC	2	6	258105	258110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4983	NC_005810	TG	3	6	258165	258170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4984	NC_005810	GTT	2	6	258225	258230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4985	NC_005810	CT	3	6	258399	258404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4986	NC_005810	CT	3	6	258414	258419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4987	NC_005810	CATGC	2	10	258458	258467	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4988	NC_005810	AAT	2	6	258584	258589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45440117
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4991	NC_005810	TTC	2	6	258698	258703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45440117
4992	NC_005810	GCT	2	6	258718	258723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440117
4993	NC_005810	TTG	2	6	258881	258886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45440117
4994	NC_005810	TG	3	6	258885	258890	0 %	50 %	50 %	0 %	45440117
4995	NC_005810	TGC	2	6	258981	258986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45440117
4996	NC_005810	T	7	7	258995	259001	0 %	100 %	0 %	0 %	45440117
4997	NC_005810	AC	3	6	259025	259030	50 %	0 %	0 %	50 %	45440117
4998	NC_005810	TAT	2	6	259037	259042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45440117
4999	NC_005810	G	6	6	259114	259119	0 %	0 %	100 %	0 %	45440117
5000	NC_005810	AT	3	6	259133	259138	50 %	50 %	0 %	0 %	45440117

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