MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Yersinia pestis KIM plasmid pMT-1

Total Repeats: 1894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_004838	A	6	6	81595	81600	100 %	0 %	0 %	0 %	31795427
1502	NC_004838	CT	3	6	81686	81691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1503	NC_004838	TGGAT	2	10	81705	81714	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_004838	AT	3	6	81730	81735	50 %	50 %	0 %	0 %	31795428
1505	NC_004838	A	7	7	81737	81743	100 %	0 %	0 %	0 %	31795428
1506	NC_004838	ATT	2	6	81766	81771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31795428
1507	NC_004838	CAC	2	6	81814	81819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795428
1508	NC_004838	TTG	2	6	81834	81839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31795428
1509	NC_004838	AAGG	2	8	81866	81873	50 %	0 %	50 %	0 %	31795428
1510	NC_004838	CAATTA	2	12	81879	81890	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	31795428
1511	NC_004838	TTG	2	6	81921	81926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31795428
1512	NC_004838	GGC	2	6	81941	81946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795428
1513	NC_004838	ACC	2	6	82038	82043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795428
1514	NC_004838	TC	3	6	82089	82094	0 %	50 %	0 %	50 %	31795428
1515	NC_004838	CGT	2	6	82129	82134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795428
1516	NC_004838	GCA	2	6	82196	82201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795428
1517	NC_004838	GTAACC	2	12	82220	82231	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	31795428
1518	NC_004838	AAT	2	6	82242	82247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31795428
1519	NC_004838	ATA	2	6	82256	82261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_004838	AGG	2	6	82267	82272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_004838	TAT	2	6	82275	82280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_004838	CCT	2	6	82283	82288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_004838	ATA	2	6	82427	82432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_004838	AG	3	6	82450	82455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_004838	ATA	2	6	82467	82472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_004838	TAT	2	6	82525	82530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_004838	TGG	2	6	82532	82537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_004838	T	7	7	82541	82547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_004838	GAA	2	6	82606	82611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_004838	ATT	2	6	82632	82637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_004838	TTG	2	6	82650	82655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_004838	T	6	6	82668	82673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_004838	AAT	2	6	82682	82687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_004838	CCCT	2	8	82704	82711	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1535	NC_004838	TTTC	2	8	82721	82728	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1536	NC_004838	GAG	2	6	82747	82752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_004838	CAT	2	6	82768	82773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_004838	CAA	2	6	82785	82790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_004838	AGC	2	6	82791	82796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_004838	T	7	7	82816	82822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_004838	AGTG	2	8	82994	83001	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_004838	GCA	2	6	83033	83038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_004838	TTC	2	6	83131	83136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_004838	TGT	2	6	83145	83150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_004838	TGA	2	6	83337	83342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_004838	GATT	2	8	83373	83380	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_004838	CAA	2	6	83410	83415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_004838	CG	3	6	83442	83447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1549	NC_004838	ATT	2	6	83496	83501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_004838	GGC	2	6	83527	83532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_004838	TTG	2	6	83544	83549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_004838	GTT	2	6	83695	83700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_004838	AAG	3	9	83741	83749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_004838	GAA	2	6	83796	83801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_004838	CAC	2	6	83841	83846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1556	NC_004838	ATCA	2	8	83891	83898	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1557	NC_004838	AAT	2	6	83914	83919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_004838	CATC	2	8	84015	84022	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_004838	CAA	2	6	84029	84034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_004838	CAA	2	6	84124	84129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795430
1561	NC_004838	CTGAT	2	10	84131	84140	20 %	40 %	20 %	20 %	31795430
1562	NC_004838	T	6	6	84187	84192	0 %	100 %	0 %	0 %	31795430
1563	NC_004838	CTT	2	6	84217	84222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795430
1564	NC_004838	GAA	2	6	84227	84232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795430
1565	NC_004838	TGA	2	6	84352	84357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795430
1566	NC_004838	GA	3	6	84356	84361	50 %	0 %	50 %	0 %	31795430
1567	NC_004838	GTT	2	6	84365	84370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31795430
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1570	NC_004838	TTTC	2	8	84574	84581	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1571	NC_004838	GTA	3	9	84705	84713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795431
1572	NC_004838	GAT	2	6	84742	84747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795431
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1574	NC_004838	GAA	2	6	84852	84857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795431
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1577	NC_004838	CCTA	2	8	84974	84981	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1578	NC_004838	AC	3	6	85031	85036	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_004838	TAA	2	6	85056	85061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_004838	CGGCG	2	10	85213	85222	0 %	0 %	60 %	40 %	31795432
1581	NC_004838	GAC	2	6	85255	85260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795432
1582	NC_004838	GA	3	6	85357	85362	50 %	0 %	50 %	0 %	31795432
1583	NC_004838	CGT	2	6	85447	85452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795432
1584	NC_004838	CA	3	6	85464	85469	50 %	0 %	0 %	50 %	31795432
1585	NC_004838	TTC	2	6	85558	85563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795432
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1587	NC_004838	GAA	2	6	85618	85623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795432
1588	NC_004838	GCT	2	6	85726	85731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795432
1589	NC_004838	ATC	2	6	85791	85796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795432
1590	NC_004838	CGA	2	6	85851	85856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795432
1591	NC_004838	GAC	3	9	85900	85908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795432
1592	NC_004838	AAG	2	6	85919	85924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795432
1593	NC_004838	ATG	2	6	85925	85930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795432
1594	NC_004838	AGA	2	6	85935	85940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795432
1595	NC_004838	GAT	2	6	86074	86079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795432
1596	NC_004838	GAC	2	6	86104	86109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795432
1597	NC_004838	GGT	2	6	86113	86118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795432
1598	NC_004838	GAG	2	6	86248	86253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31795432
1599	NC_004838	GGA	2	6	86388	86393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31795432
1600	NC_004838	CGA	2	6	86409	86414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795432
1601	NC_004838	GAA	2	6	86419	86424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795432
1602	NC_004838	CCA	2	6	86459	86464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795432
1603	NC_004838	TTGA	2	8	86536	86543	25 %	50 %	25 %	0 %	31795432
1604	NC_004838	TCTG	2	8	86670	86677	0 %	50 %	25 %	25 %	31795432
1605	NC_004838	TTC	2	6	86685	86690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795432
1606	NC_004838	GAGC	2	8	86710	86717	25 %	0 %	50 %	25 %	31795432
1607	NC_004838	AGTTC	2	10	86736	86745	20 %	40 %	20 %	20 %	31795432
1608	NC_004838	ACG	2	6	86804	86809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795432
1609	NC_004838	AAGA	2	8	86824	86831	75 %	0 %	25 %	0 %	31795432
1610	NC_004838	CAG	2	6	86860	86865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795432
1611	NC_004838	GGC	2	6	86890	86895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795432
1612	NC_004838	CAT	2	6	86967	86972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795432
1613	NC_004838	TGC	2	6	87050	87055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795432
1614	NC_004838	GGA	2	6	87198	87203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31795432
1615	NC_004838	A	7	7	87205	87211	100 %	0 %	0 %	0 %	31795432
1616	NC_004838	TGC	2	6	87243	87248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795432
1617	NC_004838	CTGA	2	8	87334	87341	25 %	25 %	25 %	25 %	31795432
1618	NC_004838	CAC	2	6	87344	87349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795432
1619	NC_004838	CTA	2	6	87354	87359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795432
1620	NC_004838	AGA	2	6	87387	87392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795432
1621	NC_004838	GTC	2	6	87406	87411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795432
1622	NC_004838	A	6	6	87455	87460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_004838	TTAC	2	8	87468	87475	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1624	NC_004838	AT	3	6	87487	87492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_004838	TA	3	6	87494	87499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_004838	ACGA	2	8	87511	87518	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1627	NC_004838	AAG	2	6	87561	87566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795433
1628	NC_004838	GTG	2	6	87595	87600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795433
1629	NC_004838	TGGACG	2	12	87678	87689	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	31795433
1630	NC_004838	GTG	2	6	87692	87697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795433
1631	NC_004838	TC	3	6	87735	87740	0 %	50 %	0 %	50 %	31795433
1632	NC_004838	TGG	2	6	87858	87863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795433
1633	NC_004838	GCT	2	6	87874	87879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795433
1634	NC_004838	AC	3	6	87945	87950	50 %	0 %	0 %	50 %	31795433
1635	NC_004838	GAA	3	9	87976	87984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795433
1636	NC_004838	ATG	2	6	88025	88030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795433
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1638	NC_004838	CTG	2	6	88109	88114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795433
1639	NC_004838	GAA	2	6	88154	88159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795433
1640	NC_004838	CTCG	2	8	88181	88188	0 %	25 %	25 %	50 %	31795433
1641	NC_004838	GCTGGC	2	12	88219	88230	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	31795433
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1650	NC_004838	GCT	3	9	88642	88650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795433
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1653	NC_004838	AGA	2	6	88758	88763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795433
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1655	NC_004838	CCA	2	6	88860	88865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1656	NC_004838	GA	3	6	89032	89037	50 %	0 %	50 %	0 %	31795434
1657	NC_004838	CTG	2	6	89049	89054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795434
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1661	NC_004838	AG	3	6	89200	89205	50 %	0 %	50 %	0 %	31795434
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1666	NC_004838	GGA	2	6	89462	89467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31795434
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1744	NC_004838	AT	3	6	94027	94032	50 %	50 %	0 %	0 %	31795437
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1752	NC_004838	AAGT	2	8	94504	94511	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1753	NC_004838	TAT	2	6	94519	94524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1757	NC_004838	TG	3	6	94861	94866	0 %	50 %	50 %	0 %	39980779
1758	NC_004838	CAA	2	6	94901	94906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39980779
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1882	NC_004838	TTA	2	6	100435	100440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1883	NC_004838	TTA	2	6	100442	100447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1884	NC_004838	GAT	2	6	100521	100526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39980781
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