MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis KIM plasmid pMT-1

Total Repeats: 1894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004838	ACC	2	6	28704	28709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795371
502	NC_004838	ATCACT	2	12	28737	28748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795371
503	NC_004838	GAA	2	6	28812	28817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795371
504	NC_004838	ACC	2	6	28899	28904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795371
505	NC_004838	TGA	2	6	28967	28972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795371
506	NC_004838	GTTCA	2	10	28989	28998	20 %	40 %	20 %	20 %	31795371
507	NC_004838	GAC	2	6	29013	29018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795371
508	NC_004838	TC	3	6	29068	29073	0 %	50 %	0 %	50 %	31795371
509	NC_004838	ACTG	2	8	29111	29118	25 %	25 %	25 %	25 %	31795371
510	NC_004838	GT	3	6	29155	29160	0 %	50 %	50 %	0 %	31795371
511	NC_004838	CTGGT	2	10	29200	29209	0 %	40 %	40 %	20 %	31795371
512	NC_004838	GCG	2	6	29257	29262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795371
513	NC_004838	AAT	2	6	29302	29307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31795371
514	NC_004838	CT	3	6	29341	29346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
515	NC_004838	GAA	2	6	29404	29409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795372
516	NC_004838	CGG	2	6	29422	29427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795372
517	NC_004838	CATCC	2	10	29557	29566	20 %	20 %	0 %	60 %	31795372
518	NC_004838	ACTG	2	8	29590	29597	25 %	25 %	25 %	25 %	31795372
519	NC_004838	CAG	2	6	29609	29614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795372
520	NC_004838	TGAT	2	8	29637	29644	25 %	50 %	25 %	0 %	31795372
521	NC_004838	GCT	2	6	29778	29783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795373
522	NC_004838	TGCG	2	8	29834	29841	0 %	25 %	50 %	25 %	31795373
523	NC_004838	TCGC	2	8	29867	29874	0 %	25 %	25 %	50 %	31795373
524	NC_004838	CGGG	2	8	30104	30111	0 %	0 %	75 %	25 %	31795374
525	NC_004838	CAT	2	6	30199	30204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795374
526	NC_004838	GCA	2	6	30303	30308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795374
527	NC_004838	ACC	2	6	30359	30364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795374
528	NC_004838	TAA	2	6	30373	30378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31795374
529	NC_004838	CAC	2	6	30382	30387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795374
530	NC_004838	AAG	2	6	30480	30485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795374
531	NC_004838	GCT	2	6	30569	30574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795374
532	NC_004838	GAA	2	6	30583	30588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795374
533	NC_004838	GATG	2	8	30601	30608	25 %	25 %	50 %	0 %	31795374
534	NC_004838	GCC	2	6	30618	30623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795374
535	NC_004838	GGT	2	6	30677	30682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795374
536	NC_004838	GTG	2	6	30741	30746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795374
537	NC_004838	CTTG	2	8	30775	30782	0 %	50 %	25 %	25 %	31795374
538	NC_004838	ATC	2	6	30842	30847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795374
539	NC_004838	GCC	2	6	30851	30856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795374
540	NC_004838	GCC	2	6	30923	30928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795374
541	NC_004838	TGG	2	6	31056	31061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795374
542	NC_004838	CGG	2	6	31078	31083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795374
543	NC_004838	TGC	2	6	31105	31110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795374
544	NC_004838	CAG	2	6	31121	31126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795374
545	NC_004838	CGT	2	6	31141	31146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795374
546	NC_004838	GAA	2	6	31154	31159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795374
547	NC_004838	TGCG	2	8	31305	31312	0 %	25 %	50 %	25 %	31795374
548	NC_004838	CGC	2	6	31324	31329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795374
549	NC_004838	ATG	2	6	31337	31342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795374
550	NC_004838	CCT	2	6	31377	31382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31795374
551	NC_004838	TC	3	6	31427	31432	0 %	50 %	0 %	50 %	31795374
552	NC_004838	GCTT	2	8	31450	31457	0 %	50 %	25 %	25 %	31795374
553	NC_004838	CAT	2	6	31459	31464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795374
554	NC_004838	TTCG	2	8	31483	31490	0 %	50 %	25 %	25 %	31795374
555	NC_004838	TGGC	2	8	31550	31557	0 %	25 %	50 %	25 %	31795374
556	NC_004838	TGG	2	6	31605	31610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795374
557	NC_004838	GCA	2	6	31850	31855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795374
558	NC_004838	CGG	2	6	31983	31988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795374
559	NC_004838	CAG	2	6	32048	32053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795374
560	NC_004838	ACT	3	9	32079	32087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795374
561	NC_004838	GTT	2	6	32129	32134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31795374
562	NC_004838	GAA	2	6	32146	32151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795374
563	NC_004838	AAC	2	6	32173	32178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795374
564	NC_004838	AAG	2	6	32226	32231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795374
565	NC_004838	TCT	2	6	32274	32279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795374
566	NC_004838	AGG	2	6	32304	32309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31795374
567	NC_004838	ACG	2	6	32334	32339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795374
568	NC_004838	GAC	2	6	32354	32359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795374
569	NC_004838	GAA	2	6	32362	32367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795374
570	NC_004838	GCT	2	6	32371	32376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795374
571	NC_004838	TCT	2	6	32444	32449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795374
572	NC_004838	GAA	2	6	32506	32511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795374
573	NC_004838	GCA	2	6	32547	32552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795374
574	NC_004838	GCG	2	6	32624	32629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795374
575	NC_004838	GAC	2	6	32680	32685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795374
576	NC_004838	GGC	2	6	32692	32697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795374
577	NC_004838	ATC	2	6	32801	32806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795374
578	NC_004838	CT	3	6	32860	32865	0 %	50 %	0 %	50 %	31795374
579	NC_004838	CGA	2	6	32878	32883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795374
580	NC_004838	TGC	2	6	32890	32895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795374
581	NC_004838	CGC	2	6	32902	32907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795374
582	NC_004838	GCA	3	9	32933	32941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795374
583	NC_004838	AGGA	2	8	32990	32997	50 %	0 %	50 %	0 %	31795374
584	NC_004838	GGC	2	6	33019	33024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795374
585	NC_004838	TC	3	6	33110	33115	0 %	50 %	0 %	50 %	31795374
586	NC_004838	ACC	2	6	33122	33127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795374
587	NC_004838	TCA	2	6	33168	33173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795374
588	NC_004838	GAT	2	6	33181	33186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795374
589	NC_004838	CGA	2	6	33229	33234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795374
590	NC_004838	CCG	2	6	33253	33258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795374
591	NC_004838	GAT	2	6	33271	33276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795374
592	NC_004838	CAT	2	6	33304	33309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795374
593	NC_004838	TGG	2	6	33456	33461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795374
594	NC_004838	GGCA	2	8	33463	33470	25 %	0 %	50 %	25 %	31795374
595	NC_004838	TCA	2	6	33480	33485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795374
596	NC_004838	TGGGGA	2	12	33708	33719	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	31795374
597	NC_004838	CGA	2	6	33834	33839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795374
598	NC_004838	CAG	2	6	33881	33886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795374
599	NC_004838	CAAC	2	8	33909	33916	50 %	0 %	0 %	50 %	31795374
600	NC_004838	TCT	2	6	33996	34001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795374
601	NC_004838	TGG	3	9	34138	34146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795374
602	NC_004838	TCC	2	6	34169	34174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31795374
603	NC_004838	CAA	2	6	34192	34197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795374
604	NC_004838	GGC	2	6	34226	34231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795374
605	NC_004838	GGC	2	6	34259	34264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795374
606	NC_004838	GGC	3	9	34430	34438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795374
607	NC_004838	GCGCA	2	10	34529	34538	20 %	0 %	40 %	40 %	31795374
608	NC_004838	TAAC	2	8	34612	34619	50 %	25 %	0 %	25 %	31795374
609	NC_004838	GACT	2	8	34667	34674	25 %	25 %	25 %	25 %	31795375
610	NC_004838	AGA	2	6	34788	34793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795375
611	NC_004838	TCA	2	6	34826	34831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795375
612	NC_004838	CG	3	6	34858	34863	0 %	0 %	50 %	50 %	31795375
613	NC_004838	TAT	2	6	35029	35034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_004838	GAA	2	6	35076	35081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795376
615	NC_004838	ACC	2	6	35160	35165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795376
616	NC_004838	GT	3	6	35230	35235	0 %	50 %	50 %	0 %	31795376
617	NC_004838	TGG	2	6	35365	35370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795376
618	NC_004838	CAT	2	6	35378	35383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795376
619	NC_004838	TCG	2	6	35482	35487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795376
620	NC_004838	AGA	2	6	35491	35496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795376
621	NC_004838	ATC	2	6	35577	35582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795376
622	NC_004838	AAC	2	6	35649	35654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795376
623	NC_004838	ACC	2	6	35661	35666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795376
624	NC_004838	ACGC	2	8	35710	35717	25 %	0 %	25 %	50 %	31795376
625	NC_004838	ACT	2	6	35722	35727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795376
626	NC_004838	ATCT	2	8	35824	35831	25 %	50 %	0 %	25 %	39980770
627	NC_004838	CGAA	2	8	35852	35859	50 %	0 %	25 %	25 %	39980770
628	NC_004838	TAC	2	6	35880	35885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39980770
629	NC_004838	GAC	2	6	35959	35964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39980770
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754	NC_004838	GCG	2	6	43012	43017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795381
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