MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis KIM 10 chromosome

Total Repeats: 90465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_004088	GAT	2	6	1115829	1115834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124890
21503	NC_004088	GGA	2	6	1115898	1115903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22124890
21504	NC_004088	TGTGG	2	10	1115962	1115971	0 %	40 %	60 %	0 %	22124890
21505	NC_004088	AGC	2	6	1116022	1116027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21506	NC_004088	T	7	7	1116060	1116066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21507	NC_004088	ATA	2	6	1116078	1116083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21508	NC_004088	GTTG	2	8	1116201	1116208	0 %	50 %	50 %	0 %	22124891
21509	NC_004088	CGC	2	6	1116220	1116225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124891
21510	NC_004088	GCC	2	6	1116280	1116285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124891
21511	NC_004088	CGAT	2	8	1116410	1116417	25 %	25 %	25 %	25 %	22124891
21512	NC_004088	ATG	2	6	1116610	1116615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124891
21513	NC_004088	TGG	2	6	1116626	1116631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124891
21514	NC_004088	TAT	2	6	1116659	1116664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124891
21515	NC_004088	TAC	2	6	1116723	1116728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124891
21516	NC_004088	CATT	2	8	1116805	1116812	25 %	50 %	0 %	25 %	22124891
21517	NC_004088	ATA	2	6	1116889	1116894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21518	NC_004088	CGC	2	6	1116908	1116913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21519	NC_004088	TTAA	2	8	1116963	1116970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21520	NC_004088	CTTAAT	2	12	1116981	1116992	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21521	NC_004088	AAC	2	6	1116994	1116999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21522	NC_004088	GATT	2	8	1117005	1117012	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21523	NC_004088	AGT	2	6	1117013	1117018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21524	NC_004088	GATT	2	8	1117024	1117031	25 %	50 %	25 %	0 %	22124892
21525	NC_004088	AGC	2	6	1117042	1117047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124892
21526	NC_004088	CAT	2	6	1117065	1117070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124892
21527	NC_004088	CAG	2	6	1117110	1117115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124892
21528	NC_004088	ATA	2	6	1117267	1117272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124892
21529	NC_004088	GTG	2	6	1117305	1117310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124892
21530	NC_004088	CTT	2	6	1117320	1117325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124892
21531	NC_004088	GTTG	2	8	1117486	1117493	0 %	50 %	50 %	0 %	22124892
21532	NC_004088	ATC	2	6	1117543	1117548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124892
21533	NC_004088	ATT	2	6	1117555	1117560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124892
21534	NC_004088	GAA	2	6	1117564	1117569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124892
21535	NC_004088	ACC	2	6	1117589	1117594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124892
21536	NC_004088	CGA	2	6	1117650	1117655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124892
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21538	NC_004088	GT	3	6	1117663	1117668	0 %	50 %	50 %	0 %	22124892
21539	NC_004088	CGA	2	6	1117734	1117739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124892
21540	NC_004088	CGG	2	6	1117755	1117760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124892
21541	NC_004088	CGG	2	6	1117960	1117965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124892
21542	NC_004088	CGG	2	6	1118043	1118048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124892
21543	NC_004088	CAGT	2	8	1118049	1118056	25 %	25 %	25 %	25 %	22124892
21544	NC_004088	GCT	2	6	1118078	1118083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124892
21545	NC_004088	GGT	2	6	1118257	1118262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124892
21546	NC_004088	T	8	8	1118359	1118366	0 %	100 %	0 %	0 %	22124892
21547	NC_004088	TAA	2	6	1118505	1118510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124892
21548	NC_004088	C	10	10	1118549	1118558	0 %	0 %	0 %	100 %	22124893
21549	NC_004088	ACT	2	6	1118584	1118589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124893
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21551	NC_004088	CCTG	2	8	1118814	1118821	0 %	25 %	25 %	50 %	22124894
21552	NC_004088	TCA	2	6	1118837	1118842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124894
21553	NC_004088	GCA	2	6	1118850	1118855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124894
21554	NC_004088	GCT	2	6	1118864	1118869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21555	NC_004088	A	6	6	1118885	1118890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21556	NC_004088	AC	3	6	1118927	1118932	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21557	NC_004088	AAT	3	9	1118934	1118942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21558	NC_004088	ATT	3	9	1118953	1118961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21559	NC_004088	T	6	6	1118978	1118983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21560	NC_004088	ATG	2	6	1119079	1119084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21561	NC_004088	A	7	7	1119113	1119119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21562	NC_004088	ACTG	2	8	1119134	1119141	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21563	NC_004088	TTA	2	6	1119181	1119186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22124895
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21569	NC_004088	AAAGT	2	10	1119644	1119653	60 %	20 %	20 %	0 %	22124895
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21573	NC_004088	AATA	2	8	1119874	1119881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21574	NC_004088	TGT	2	6	1120098	1120103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22124896
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21577	NC_004088	TCT	2	6	1120143	1120148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124896
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21581	NC_004088	GAA	2	6	1120360	1120365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124896
21582	NC_004088	GC	3	6	1120406	1120411	0 %	0 %	50 %	50 %	22124896
21583	NC_004088	CAT	2	6	1120535	1120540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124896
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21585	NC_004088	CAG	2	6	1120613	1120618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124896
21586	NC_004088	AGC	2	6	1120634	1120639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124896
21587	NC_004088	CAC	2	6	1120688	1120693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124896
21588	NC_004088	CAGC	2	8	1120713	1120720	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21589	NC_004088	GCC	2	6	1120740	1120745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21590	NC_004088	GCA	2	6	1120816	1120821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21592	NC_004088	CTG	2	6	1121031	1121036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124897
21593	NC_004088	AAT	2	6	1121043	1121048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124897
21594	NC_004088	GTG	2	6	1121089	1121094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124897
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21601	NC_004088	CAT	2	6	1121537	1121542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124897
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21603	NC_004088	CGTT	2	8	1121643	1121650	0 %	50 %	25 %	25 %	22124897
21604	NC_004088	TTC	2	6	1121694	1121699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22124897
21605	NC_004088	ACCT	2	8	1121770	1121777	25 %	25 %	0 %	50 %	22124897
21606	NC_004088	CAG	2	6	1121841	1121846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124897
21607	NC_004088	T	6	6	1121867	1121872	0 %	100 %	0 %	0 %	22124897
21608	NC_004088	TCA	2	6	1121893	1121898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124897
21609	NC_004088	T	6	6	1121961	1121966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21610	NC_004088	ACA	2	6	1121996	1122001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21611	NC_004088	A	6	6	1122048	1122053	100 %	0 %	0 %	0 %	22124898
21612	NC_004088	GC	3	6	1122061	1122066	0 %	0 %	50 %	50 %	22124898
21613	NC_004088	CCG	2	6	1122067	1122072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124898
21614	NC_004088	GCGTG	2	10	1122091	1122100	0 %	20 %	60 %	20 %	22124898
21615	NC_004088	GAA	2	6	1122161	1122166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22124898
21616	NC_004088	CCAGG	2	10	1122224	1122233	20 %	0 %	40 %	40 %	22124898
21617	NC_004088	CGG	2	6	1122301	1122306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22124898
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21620	NC_004088	TGA	2	6	1122457	1122462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124898
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21978	NC_004088	GTTG	2	8	1143481	1143488	0 %	50 %	50 %	0 %	22124924
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21981	NC_004088	T	6	6	1143597	1143602	0 %	100 %	0 %	0 %	22124924
21982	NC_004088	GCT	2	6	1143632	1143637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124924
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