MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis KIM 10 chromosome

Total Repeats: 90465

< Previous12...3435363738394041424344...180181Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_004088	GCA	2	6	987942	987947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19002	NC_004088	AAT	2	6	987961	987966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19003	NC_004088	CAT	2	6	988000	988005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19004	NC_004088	ATT	2	6	988006	988011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19005	NC_004088	GT	3	6	988028	988033	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19006	NC_004088	CAT	2	6	988049	988054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19007	NC_004088	CAT	2	6	988060	988065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19008	NC_004088	CCG	2	6	988114	988119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124789
19009	NC_004088	GGT	2	6	988146	988151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124789
19010	NC_004088	ATC	2	6	988167	988172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124789
19011	NC_004088	GAT	2	6	988200	988205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124789
19012	NC_004088	CAT	2	6	988255	988260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124789
19013	NC_004088	AG	3	6	988321	988326	50 %	0 %	50 %	0 %	22124789
19014	NC_004088	TCCC	2	8	988348	988355	0 %	25 %	0 %	75 %	22124789
19015	NC_004088	GC	3	6	988369	988374	0 %	0 %	50 %	50 %	22124789
19016	NC_004088	ACG	2	6	988377	988382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124789
19017	NC_004088	TAA	2	6	988418	988423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124789
19018	NC_004088	CGC	2	6	988427	988432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22124789
19019	NC_004088	CGA	2	6	988477	988482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124789
19020	NC_004088	GAC	2	6	988514	988519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124789
19021	NC_004088	GAAA	2	8	988544	988551	75 %	0 %	25 %	0 %	22124789
19022	NC_004088	AG	3	6	988594	988599	50 %	0 %	50 %	0 %	22124789
19023	NC_004088	GCT	2	6	988730	988735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124789
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19026	NC_004088	A	6	6	988904	988909	100 %	0 %	0 %	0 %	22124789
19027	NC_004088	CAC	2	6	988961	988966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22124789
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19029	NC_004088	CAT	2	6	989081	989086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124789
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19032	NC_004088	TAA	2	6	989164	989169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22124789
19033	NC_004088	ATG	2	6	989268	989273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124789
19034	NC_004088	GGT	2	6	989327	989332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124789
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19037	NC_004088	T	7	7	989398	989404	0 %	100 %	0 %	0 %	22124789
19038	NC_004088	A	6	6	989484	989489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19039	NC_004088	T	6	6	989501	989506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19040	NC_004088	TGC	2	6	989625	989630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22124790
19041	NC_004088	CTA	2	6	989681	989686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124790
19042	NC_004088	GCA	2	6	989690	989695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124790
19043	NC_004088	ATTT	2	8	989700	989707	25 %	75 %	0 %	0 %	22124790
19044	NC_004088	G	6	6	989713	989718	0 %	0 %	100 %	0 %	22124790
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19049	NC_004088	TGGTT	2	10	990084	990093	0 %	60 %	40 %	0 %	22124790
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19052	NC_004088	GAT	2	6	990198	990203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124790
19053	NC_004088	AG	3	6	990312	990317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19054	NC_004088	TGA	2	6	990335	990340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124791
19055	NC_004088	AGC	3	9	990359	990367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22124791
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19058	NC_004088	TGG	2	6	990488	990493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124791
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19063	NC_004088	CG	3	6	990830	990835	0 %	0 %	50 %	50 %	22124791
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19078	NC_004088	GTAA	2	8	991519	991526	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19079	NC_004088	ATGA	2	8	991535	991542	50 %	25 %	25 %	0 %	22124792
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19089	NC_004088	CTTC	2	8	992116	992123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19090	NC_004088	GAA	2	6	992125	992130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19097	NC_004088	GGT	2	6	992451	992456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22124793
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19108	NC_004088	TGATT	2	10	993020	993029	20 %	60 %	20 %	0 %	22124793
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19119	NC_004088	TGA	2	6	993677	993682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124793
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19489	NC_004088	TAC	2	6	1013417	1013422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22124813
19490	NC_004088	AG	3	6	1013536	1013541	50 %	0 %	50 %	0 %	22124813
19491	NC_004088	AGT	2	6	1013577	1013582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22124813
19492	NC_004088	TCA	2	6	1013585	1013590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19493	NC_004088	T	7	7	1013641	1013647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19494	NC_004088	ACG	2	6	1013705	1013710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19495	NC_004088	AGC	2	6	1013724	1013729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19496	NC_004088	CT	3	6	1013887	1013892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19497	NC_004088	TGC	2	6	1013927	1013932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19498	NC_004088	GGT	2	6	1013950	1013955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19499	NC_004088	TTG	2	6	1014022	1014027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19500	NC_004088	CCGC	2	8	1014074	1014081	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

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